共 157 篇

Functional Assembly of Minicellulosomes on the Saccharomyces cerevisiae Cell Surface for Cellulose Hydrolysis and Ethanol Production

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01538-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在酿酒酵母细胞表面功能性组装微型纤维小体,解决纤维素水解与乙醇发酵一体化(CBP)的问题。

关键发现:['在酿酒酵母表面成功展示了含三个cohesin域(分别来自Clostridium thermocellum、Clostridium cellulolyticum和Ruminococcus flavefaciens)的脚手架蛋白Scaf-ctf,并能与E. coli细胞裂解液中的对应docke...

代谢工程 / 合成生物学 cellulosic ethanolcohesin-dockerinconsolidated bioprocessingminicellulosomeyeast surface display Saccharomyces cerevis... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Transformation of the Green Alga Haematococcus pluvialis with a Phytoene Desaturase for Accelerated Astaxanthin Biosynthesis

Applied and Environmental Microbiology · 2006 · 10.1128/AEM.01461-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:开发雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)的稳定核遗传转化系统,并通过工程化八氢番茄红素脱氢酶(Pds)加速虾青素的生物合成。

关键发现:突变的Pds-L504R仍具催化活性,体外抑制常数Ki从野生型的0.14 μM增加到5.98 μM,抗性提高43倍 等 8 条

代谢工程 八氢番茄红素脱氢酶抗除草剂类胡萝卜素生物合成虾青素遗传转化雨生红球藻 Haematococcus pluvialis

Phylogenetic and Kinetic Characterization of a Suite of Dehydrogenases from a Newly Isolated Bacterium, Strain SG61-1L, That Catalyze the Turnover of Guaiacylglycerol-β-Guaiacyl Ether Stereoisomers

Applied and Environmental Microbiology · 2015 · 10.1128/AEM.01573-15 · 含路线图 · 有原文

核心问题:新分离菌株SG61-1L能快速降解木质素模型化合物GGE,但其分子机制尚不清楚,特别是催化第一步氧化反应的脱氢酶的种类和动力学特性。

关键发现:SG61-1L在75小时内完全降解200μM GGE,而SYK-6需要160小时以上 等 4 条

代谢工程 SG61-1Ldehydrogenaseligninstereoisomersβ-O-4 linkage Sphingobium sp. SYK-6 Sphingobium sp. SYK-6 Sphingobium sp. SYK-6

Resistance of Saccharomyces cerevisiae to High Concentrations of Furfural Is Based on NADPH-Dependent Reduction by at Least Two Oxireductases

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01649-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明酿酒酵母对高浓度糠醛(木质纤维素水解液中的关键毒性化合物)的天然耐受及进化获得的高水平耐受的分子机制,特别是还原糠醛所需的辅因子来源及关键酶。

关键发现:在15 mM糠醛下,NADH依赖的氧化还原酶足以完成糠醛还原 等 3 条

代谢工程 ADH7NADPHYKL071W代谢通量分析恒化培养戊糖磷酸途径 Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae

Novel Activity of Rhodobacter sphaeroides Spheroïdene Monooxygenase CrtA Expressed in Escherichia coli

Applied and Environmental Microbiology · 2010 · 10.1128/AEM.01606-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:研究Rhodobacter sphaeroides的螺菌黄质单加氧酶CrtA在大肠杆菌中表达时对非天然底物的新型催化活性,并确定其是否为P450酶。

关键发现:从大肠杆菌(pAC-CrtECrtBCrtI14, pUC-CrtA)中分离出3种新的氧化类胡萝卜素T2 ([M+]=564.4)、D1 ([M+]=566.4)和T3 ([M+]=582.4),推测为1-OH-四脱氢番茄红素-2-酮、1-OH-二脱氢番茄红素-2-酮和1,1'-(OH)2-四... 等 2 条

代谢工程 CrtARhodobacter sphaeroides单加氧酶大肠杆菌氧化类胡萝卜素类胡萝卜素 Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Effects of Trichothecene Production on the Plant Defense Response and Fungal Physiology: Overexpression of the Trichoderma arundinaceum tri4 Gene in T. harzianum

Applied and Environmental Microbiology · 2015 · 10.1128/AEM.01626-15 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究单端孢霉烯(trichothecene)中间产物12,13-epoxytrichothec-9-ene(EPT)对植物防御反应和真菌生理的影响,并解析不同结构中间体的生物活性差异。

关键发现:tri4 转化株 T34-5.27-tri4.1 在8天培养中 EPT 产量达 等 11 条

农业微生物学 / 植物病原互作 / 真菌代谢工程 EPTTrichodermaantifungal activityphytotoxicityplant defensetri4 Trichoderma harzianum... Trichoderma harzianum... Trichoderma harzianum...

LplR, a Repressor Belonging to the TetR Family, Regulates Expression of the L-Pantoyl Lactone Dehydrogenase Gene in Rhodococcus erythropolis

Applied and Environmental Microbiology · 2012 · 10.1128/AEM.01583-12 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明Rhodococcus erythropolis AKU2103中L-泛解酸内酯脱氢酶基因(lpldh)的表达调控机制,尤其是1,2-丙二醇诱导lpldh表达的分子机理,并构建高效LPLDH重组菌用于D-泛解酸内酯的生产。

关键发现:敲除lplR后,lpldh表达量在无1,2-PD诱导下比野生型高22.8倍 等 7 条

代谢工程 D-PL生产L-pantoyl lactone dehydrogenaseLplRRhodococcus erythropolisTetR family转录调控 Rhodococcus erythropo... Rhodococcus erythropo... Rhodococcus erythropo...

The Pseudomonas aeruginosa Isohexenyl Glutaconyi Coenzyme A Hydratase (AtuE) Is Upregulated in Citronellate-Grown Cells and Belongs to the Crotonase Family

Applied and Environmental Microbiology · 2015 · 10.1128/AEM.01686-15 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析铜绿假单胞菌中异己烯基戊二酰辅酶A水合酶(AtuE)的结构与功能,阐明其在无环萜类分解代谢中的作用。

关键发现:蛋白质组学共鉴定到1,640个蛋白(占预测蛋白质组的29%),其中187个蛋白在香茅酸培养细胞中丰度增加≥3倍 等 2 条

代谢工程 AtuEPseudomonas aeruginosaacyclic terpene utilizationcrotonase familycrystal structureisohexenyl glutaconyl coenzyme A hydratase Pseudomonas aeruginos... Pseudomonas aeruginos... Pseudomonas aeruginos...

Transposon mutagenesis identifies genes critical for growth of Pseudomonas nitroreducens TX1 on octylphenol polyethoxylates

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.01907-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定Pseudomonas nitroreducens TX1在辛基酚聚氧乙烯醚(OPEO_n)为唯一碳源生长时的关键基因,并阐明其降解机制。

关键发现:构建了30,000个Tn5插入突变体,筛出93个(0.31%)不能利用OPEO_n的突变体,鉴定出42个独立基因、3个非编码序列和1个23S rRNA。aceA(异柠檬酸裂解酶)和aceB(苹果酸合酶)缺失突变体无法在OPEO_n上生长,回补后恢复 等 3 条

代谢工程 Pseudomonas nitroreducens TX1乙醛酸循环生物降解转座子诱变辛基酚聚氧乙烯醚 Pseudomonas nitroredu... Pseudomonas nitroredu... Pseudomonas nitroredu...

Directed Evolution of Methanococcus jannaschii Citramalate Synthase for Biosynthesis of 1-Propanol and 1-Butanol by Escherichia coli

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.02046-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过定向进化提高异源来源的柠檬酸合酶(CimA)在大肠杆菌中的活性、解除异亮氨酸反馈抑制,从而增强2-酮丁酸供应,实现1-丙醇和1-丁醇的高效生产。

关键发现:进化得到的CimA3.7在30°C下kcat为0.84 s^-1,K_m(乙酰辅酶A)为105 μM,kcat/K_m较野生型提高6.7倍 等 5 条

代谢工程 1-butanol1-propanol2-keto acid pathwaybiofuelscitramalate synthasedirected evolution Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Bioprospecting for Trichothecene 3-O-Acetyltransferases in the Fungal Genus Fusarium Yields Functional Enzymes with Different Abilities To Modify the Mycotoxin Deoxynivalenol

Applied and Environmental Microbiology · 2011 · 10.1128/AEM.01738-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)是常见谷物真菌毒素,威胁人畜健康。需要发现更高效稳定的单端孢霉烯3-O-乙酰转移酶,用于开发抗赤霉病作物或改良发酵菌株,降低DON污染。

关键发现:从7种镰刀菌中克隆的TRI101/TRI201基因,其DNA序列一致性为66%~98%。在酵母喂食实验中,所有酶均能乙酰化DON,DON转化为3ADON的比例范围为50.5%~100.0%,其中FfTRI201在10.3h和15.1h分别达到50%和90%的转化,前8h平均转化率为30.8%±... 等 4 条

代谢工程 3-O-乙酰转移酶TRI101TRI201单端孢霉烯真菌毒素脱氧雪腐镰刀菌烯醇 酿酒酵母RW2802 酿酒酵母RW2802 酿酒酵母RW2802

Isolation and Characterization of Brewer's Yeast Variants with Improved Fermentation Performance under High-Gravity Conditions

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.02109-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:高浓度酿造中啤酒酵母(Saccharomyces pastorianus)发酵效率低,常出现发酵迟缓或不完全,酵母存活率下降,限制了更高浓度麦汁的使用。

关键发现:筛选出两个高浓度发酵性能优良的变异株GT336(自发)和GT344(UV诱导),在超高浓度麦汁中发酵速率和最终衰减度均优于对照 等 8 条

发酵工程 UV诱变发酵性能啤酒酵母基因表达高浓度酿造 Saccharomyces pastori... Saccharomyces pastori... Saccharomyces pastori...

Characterisation of CYP101J2, CYP101J3 and CYP101J4, three 1,8-cineole-hydroxylating cytochrome P450 monooxygenases from Sphingobium yanoikuyae strain B2

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.02067-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从Sphingobium yanoikuyae B2中鉴定和表征能够羟基化1,8-桉叶素的新型细胞色素P450酶,为合成羟基化1,8-桉叶素衍生物提供新的生物催化剂。

关键发现:成功分离并表征了来自S. yanoikuyae B2的三个新P450:CYP101J2、CYP101J3和CYP101J4。在E. coli BL21(DE3)中异源表达并纯化,产量分别为>30 mg/L(CYP101J2和J3)和约1.5 mg/L(CYP101J4)。光谱表征显示典型P45...

代谢工程 1,8-cineoleCYP101J2CYP101J3CYP101J4Sphingobium yanoikuyaecytochrome P450 Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Fermentation of High Concentrations of Maltose by Saccharomyces cerevisiae Is Limited by the COMPASS Methylation Complex

Applied and Environmental Microbiology · 2006 · 10.1128/AEM.01704-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:高浓度麦芽糖发酵不彻底,发现COMPASS甲基化复合物通过端粒沉默在发酵后期抑制麦芽糖利用基因的表达,导致发酵效率低下。

关键发现:缺失COMPASS各亚基(SWD1、SWD3、SDC1、SET1、BRE2、SPP1)后,22°P麦芽糖发酵的最终衰减度明显提高,乙醇产量较野生型最多增加29%(野生型57 g/L,swd1和swd3为74 g/L,sdc1、bre2、set1为70 g/L,spp1为68 g/L) 等 2 条

发酵工程 COMPASS复合物端粒沉默组蛋白甲基化酿酒酵母麦芽糖发酵 酿酒酵母 (Saccharomyces c... 酿酒酵母 (Saccharomyces c... 酿酒酵母 (Saccharomyces c...

Synthesis of heterologous mevalonic acid pathway enzymes in Clostridium ljungdahlii for the conversion of fructose and of syngas to mevalonate and isoprene

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.01723-17 · 含路线图 · 有原文

核心问题:实现利用廉价底物(果糖和合成气)在产乙酸菌 Clostridium ljungdahlii 中生产高需求化学品异戊二烯及其前体甲羟戊酸

关键发现:pJF100 转化株在果糖培养时产生约 等 3 条

代谢工程 Clostridium ljungdahliiWood-Ljungdahl pathwayacetogenic bacteriabioenergeticsfructoseisoprene Clostridium ljungdahlii Clostridium ljungdahlii Clostridium ljungdahlii

The Aspergillus aquaglyceroporin gene AgGlpF confers high osmosis tolerance in heterologous organisms

Applied and Environmental Microbiology · 2015 · 10.1128/AEM.02127-15 · 含路线图 · 有原文

核心问题:真菌水甘油通道蛋白 AgGlpF 的生物学功能不明,且缺乏其异源表达提高生物高渗胁迫耐受性的研究

关键发现:AgGlpF cDNA 全长 1218 bp,ORF 861 bp,编码 287 个氨基酸,分子量 等 5 条

合成生物学 AgGlpFAspergillus glaucusaquaglyceroporindrought toleranceheterologous expressionosmosis tolerance Aspergillus glaucus Xenopus laevis oocytes Saccharomyces cerevisiae

Engineering of 2,3-Butanediol Dehydrogenase To Reduce Acetoin Formation by Glycerol-Overproducing, Low-Alcohol Saccharomyces cerevisiae

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.02157-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:甘油过量生产的酿酒酵母菌株在降低乙醇产量的同时积累大量acetoin,影响葡萄酒感官品质,需要将acetoin转化为感官中性的2,3-丁二醇。

关键发现:['敲除BDH1后,V5 bdh1菌株不再产生(2R,3R)-2,3-BD,总2,3-BD产量仅为野生型的约15%(84 vs 553 mg/liter),并积累约401 mg/liter acetoin,双乙酰产量提高约2倍(15.8 vs 7.9 μg/liter)', '在含50 g/l... 等 3 条

代谢工程 2,3-butanediol dehydrogenaseNADH/NADPH cofactor engineeringSaccharomyces cerevisiaeacetoinglycerol overproductionlow-alcohol wine Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Novel Redox Potential-Based Screening Strategy for Rapid Isolation of Klebsiella pneumoniae Mutants with Enhanced 1,3-Propanediol-Producing Capability

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.02857-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:1,3-丙二醇缺乏特异性紫外吸收峰且与底物甘油及副产物(乙醇、乳酸、乙酸等)化学结构相似,难以基于产物直接检测建立高通量筛选方法;同时,对1,3-丙二醇的耐受性与产量无直接关联。因此需要开发一种快速有效的基于生物合成机制的筛选策略,以获得1,3-丙二醇高产突变株。

关键发现:在-280 mV ORP筛选实验中,11株分离菌中有4株被认定为阳性突变株 等 5 条

代谢工程 1,3-propanediolKlebsiella pneumoniaemetabolic flux analysismutant screeningredox potential Klebsiella pneumoniae... Klebsiella pneumoniae...

LacI Transcriptional Regulatory Networks in Clostridium thermocellum DSM1313

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.02751-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析Clostridium thermocellum DSM1313中三个LacI家族转录调控因子(GlyR1、GlyR2、GlyR3)的调控网络,揭示其对木质纤维素降解酶基因的调控机制。

关键发现:敲除glyR1、glyR2或glyR3后,在纤维二糖或预处理柳枝稷上生长无显著差异。RNA-seq显示三个LacI均为局部调控因子,各自调控少数基因。ΔglyR1菌株中Clo1313_2022(licB)显著去抑制,log2倍数变化在早对数期、晚对数期和稳定期分别为4.33、4.44和6.64... 等 5 条

合成生物学 Clostridium thermocellumLacI转录因子RNA-seq半纤维素酶基因调控网络纤维素降解 Clostridium thermocel... Clostridium thermocel... Clostridium thermocel...

High-Level Production of Beta-Carotene in Saccharomyces cerevisiae by Successive Transformation with Carotenogenic Genes from Xanthophyllomyces dendrorhous

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.02759-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在酿酒酵母中实现β-胡萝卜素的高效异源生产,解决游离表达载体不稳定、类胡萝卜素合成通量不足及八氢番茄红素脱饱和瓶颈等问题。

关键发现:游离型表达crtYB和crtI时总类胡萝卜素仅3 μg/g dw 等 3 条

代谢工程 HMG-CoA还原酶β-胡萝卜素代谢工程类胡萝卜素合成基因红法夫酵母酿酒酵母 Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae