共 560 篇
核心问题:稀有或新型类胡萝卜素的结构多样性与可用性有限,需要异源表达和组合生物合成来生产,并解决前体供应不足的问题。
关键发现:['已鉴定的天然类胡萝卜素超过600种。', '八氢番茄红素脱氢酶的脱氢产物可具有2至5个额外双键。', '通过组合生物合成,获得的1-羟基化无环类胡萝卜素具有最多13个共轭双键。', '对来自两种Erwinia的八氢番茄红素脱氢酶基因进行shuffling,得到的重组酶可引入6个双键(野生型...
合成生物学
antioxidantscarotenoidscarotogenic genesmetabolic engineeringterpenoids
Escherichia coli
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题:开发一种能够同时通过化学趋化和生物靶向(CD44)双重靶向肿瘤细胞的细菌驱动微珠药物递送系统,以提高抗癌治疗效果并减少副作用。
关键发现:PLGA-DTX纳米粒平均粒径为277±5.38 nm,zeta电位为-1.58±5.28 mV,DTX包封率为87.5%
等 2 条
合成生物学
CD44 targetingSalmonella Typhimuriumbacteriobotschemotaxisdocetaxelhyaluronic acid
Salmonella Typhimuriu...
核心问题:自然界是否存在酶催化的Diels-Alder反应?系统总结推测经由Diels-Alder反应生成的天然产物及其生物合成证据。
关键发现:通过亚培养筛选获得的Aspergillus terreus MF4845菌株使洛伐他汀产量提高至200 mg/L
等 6 条
合成生物学
Diels-AlderaseDiels-Alder反应天然产物生物合成生物碱聚酮化合物
Aspergillus terreus
Aspergillus terreus
Alternaria solani
核心问题:系统总结近年来发现的非经典萜类环化酶(TCs),这些酶在蛋白结构和催化机制上不同于经典的I类和II类TCs,挑战了传统分类,并探讨其催化机制对仿生合成的启示。
关键发现:CVBPO晶体结构解析至2.3 Å分辨率,亚基含595个氨基酸,六个同二聚体形成十二聚体
等 7 条
合成生物学
biomimetic synthesisterpene cyclasesterpenoid biosynthesisunconventional cyclases
Corallina officinalis
Streptomyces aculeola...
Streptomyces sp. CNH-189
核心问题:揭示细菌中吲哚萜类生物碱(如xiamycin和sespenine)生物合成的分子机制及其独特环化序列
关键发现:异源表达pXU472在S. albus中产生xiamycin A(2,C23H25NO3,m/z
等 6 条
合成生物学
alkaloidsindole oxygenaseindolosesquiterpenesterpene cyclasexiamycin
Streptomyces sp. HKI0576
Streptomyces sp. HKI0576
Streptomyces sp. HKI0576
核心问题:解析2-甲基异冰片(2-MIB)生物合成途径中阳离子中间体的详细机制与立体化学。
关键发现:在2-MIB产生菌中检测到多种同源单萜(m/z 150)及同源单萜醇(m/z 168)副产物,其中12-15和18为新天然产物。对Micromonospora olivasterospora喂养[1-13C]-1-脱氧-D-木酮糖后,GC-MS显示2-MIB占挥发性物质64%,2-亚甲基莰烷1...
等 2 条
合成生物学
2-methylisoborneolbiosynthesisstereochemistryterpenesvolatiles
Nannocystis exedens
Streptomyces coelicol...
Micromonospora olivas...
核心问题:解析并体外重构海洋细菌Streptomyces sp. CNH-189中merochlorin A和B的完整生物合成途径,揭示聚酮-萜烯杂合中间体形成的酶学机制以及氧化氯化/环化反应的催化剂。
关键发现:Mcl17催化丙二酰CoA生成THN (3)的比活力为2.4±0.3 mU/mg(kcat
等 4 条
合成生物学
biosynthesisenzyme catalysisnatural productspolyketidesterpenoids
Streptomyces sp. CNH-189
Streptomyces sp. CNH-189
Streptomyces sp. CNH-189
核心问题:植物来源二萜类化合物结构复杂、天然丰度低,难以工业化利用,而化学合成路线效率低且难以控制立体化学,亟需开发能够立体选择性合成结构多样二萜类化合物的生物合成方法。
关键发现:构建了51个类I和类II二萜合酶功能组合,其中41个为“新-自然”组合
等 8 条
合成生物学
biocatalysisbiosynthesiscombinatorial biosynthesiscyclizationsterpenes
Nicotiana benthamiana...
Nicotiana benthamiana...
Nicotiana benthamiana...
核心问题:阐明二萜环化酶CotB2催化生成具有特殊5-8-5并环结构的环辛-9-烯-7-醇的复杂环化反应机制
关键发现:通过[U-13C6]葡萄糖喂养实验,观察到七个C-C偶联(C1-C2、C3-C18、C5-C6、C7-C19、C11-C20、C13-C14、C15-C16)存在,而预期的C9-C10偶联缺失,表明C8/C9碳碳键发生重排。氘代底物实验表明:(9,9-D2)-GGDP转化为(8,8-D2)-环...
等 3 条
合成生物学
biosynthesisenzyme catalysisreaction mechanismterpenes
Streptomyces albus
Streptomyces albus
Streptomyces albus
核心问题:发现并表征新型嵌合二萜合酶EvVS,并通过结构域交换将其功能转化为二倍半萜合酶,以产生新的萜类化合物。
关键发现:通过基因组挖掘和异源表达,从Emericella varicolor中鉴定出新型嵌合萜类合酶EvVS,其催化产生新型三环二萜varideine (1, C20H32, m/z 272)。体外实验表明,EvVS以DMAPP和IPP为底物可同时产生二萜1和二倍半萜2
等 2 条
合成生物学
biosynthesisdomain swappingprenyltransferasessesterterpenoidsterpene cyclases
Aspergillus oryzae
Escherichia coli
核心问题:揭示放线菌Kitasatospora setae中一个功能未知的倍半萜环化酶(YP_004903082)的催化产物,阐明其生物合成机制。
关键发现:重组corvol ether synthase以FPP为底物主要生成两种产物corvol ether A(1)和B(2),比例约1:3(2为主产物)
等 7 条
合成生物学
NMR spectroscopybiosynthesisenzyme mechanismsisotopic labelingterpenoids
Escherichia coli
Kitasatospora setae
核心问题:鉴定细菌和真菌中新的二萜环化酶,特别是UbiA超家族中负责cyathane等骨架形成的环化酶,并揭示其多样性。
关键发现:鉴定出EriG为猴头菌中负责cyathane骨架环化的二萜环化酶,催化GGPP生成(-)-cyatha-3,12-diene,Km=99.6 μM,最大速率4.0 nmol min^-1 mg^-1,在工程大肠杆菌中产量为3 mg/L。利用EriG序列进行基因组挖掘,发现UbiA超家族中新的二...
合成生物学
UbiAbiosynthesiscyclasesditerpenesnatural products
E. coli BL21(DE3) / E...
E. coli BW25113 (engi...
E. coli BW25113 (engi...
核心问题:天然产物中新骨架多环萜类化合物的结构测定(尤其是未功能化烃类的绝对构型)和其复杂环化机制的阐明。
关键发现:从Emericella varicelolor NBRC 32302中克隆并异源表达了一个编码716个氨基酸的双功能萜烯合酶EvAS,在Aspergillus oryzae中产生了新倍半萜烃astellifadiene (1),其m/z为340 [M]+,分子式为C25H40,具有六个不饱和度...
等 3 条
合成生物学
biosynthesiscrystal growthnatural productsstructure elucidationterpenoids
Aspergillus oryzae NSAR1
Emericella varicelolo...
Escherichia coli
核心问题:两种细菌二萜环化酶(spiroviolene synthase和tsukubadiene synthase)的环化机制尚不明确,需阐明其碳正离子环化级联反应及立体化学过程。
关键发现:从S. violens中克隆的SvS催化GGPP生成单一产物(-)-spiroviolene (1),比旋光度[α]D^12=-5.6 (c=0.2, C6D6),绝对构型为(3R,6R,10S,11R,14R)
等 6 条
合成生物学
NMR spectroscopybiosynthesisisotopesreaction mechanismsterpenes
Escherichia coli
Escherichia coli
Streptomyces cyaneofu...
核心问题:海洋动物来源的meroterpene类天然产物产量低且难以获取,其生物合成酶未知,需要寻找可培养细菌作为替代来源。
关键发现:从Scytonema sp. PCC 10023中分离到merosterol A和B,分子式分别为C28H32Cl2O8和C29H34Cl2O8
等 4 条
合成生物学
biosynthesismeroterpenoidnatural productsstructure elucidationterpenoids
Scytonema sp. PCC 10023
Scytonema sp. PCC 10023
Scytonema sp. PCC 10023
核心问题:阐明黄单胞菌(Myxococcus xanthus)中异戊酰辅酶A生物合成关键酶AibA/AibB催化无辅因子脱羧反应的分子机制,此前该酶被误注释为CoA转移酶,且活性位点半胱氨酸的作用存在争议。
关键发现:可溶性AibA/AibB产量达2.5 mg/L大肠杆菌培养(较之前几微克显著提高)
等 6 条
合成生物学
生物合成结构生物学脱羧反应蛋白质表达酶
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题:青蒿素合成中关键中间体二氢青蒿醛(DHAAl)的高效制备问题
关键发现:ADS可将12-羟基法尼基焦磷酸(7)转化为(11S)-和(11R)-二氢青蒿醛的混合物(NMR显示3:2,GC-MS显示7:2),并伴有约10%的烯醇副产物
等 3 条
合成生物学
artemisininchemoenzymatic synthesissesquiterpenoidssubstrate engineeringsynthetic biology
核心问题:评估真菌meroterpenoid环化酶的底物混杂性,以扩展真菌meroterpenoid的化学空间,并阐明其催化机制。
关键发现:通过化学酶法获得了12种非天然meroterpenoid,其中8种为新化合物
等 5 条
合成生物学
chemoenzymatic synthesiscombinatorial biosynthesiscrystalline-sponge X-ray diffractionmeroterpenoid cyclasemeroterpenoids
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题:表征海洋细菌 Streptomyces xinghaiensis 中一种多功能萜类合酶,揭示其广谱底物特异性、产物结构、催化机制,特别是金属辅因子依赖性及其分子基础。
关键发现:SpS可接受FPP、GGPP、GFPP和14,15-二氢GGPP,但不接受GPP。以GGPP为底物时主产物spata-13,17-diene(1)分离得6 mg(产率14%),副产物2和3分别得0.6 mg(1%)和0.8 mg(2%)。以GFPP为底物得prenylspata-13,17-d...
等 2 条
合成生物学
同位素生物合成萜类酶机制金属辅因子
大肠杆菌(Escherichia coli)
无细胞体系(体外酶促反应)
大肠杆菌(Escherichia coli)
核心问题:植物中二倍半萜合成酶功能表征稀少,其碳正离子环化路径多样性和分子机制尚不明确,特别是产生新骨架的环化途径有待揭示。
关键发现:新合酶催化产生m/z=340的二倍半萜产物2-8,其中3a/3b具有6/11/5骨架,4-8具有6/6/7/5骨架
等 5 条
合成生物学
cyclization mechanismnatural productsquantum chemical calculationssesterterpene biosynthesisterpene synthases
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana