高级醇 · 代谢工程文献库
共 30 篇

Isolation, characterization and long term preservation of mutant strains of Xanthophyllomyces dendrorhous

Journal of Basic Microbiology · 2009 · 10.1002/jobm.200800096 · 含路线图 · 有原文

核心问题：Xanthophyllomyces dendrorhous是产虾青素的重要工业酵母，但遗传学研究受限于突变体不稳定和菌株难以长期保存。需要分离具有营养缺陷型标记的突变体以用于类胡萝卜素合成途径和有性周期的遗传分析，并建立简便、有效的实验室菌株保存方法。

关键发现：['经NTG和制霉菌素处理后，从CBS 7918菌株获得的营养缺陷型突变频率为2×10^-2，而从ATCC 24230菌株为2.4×10^-4，前者比后者高约100倍。', '分离获得多种营养缺陷型突变体，包括A4-69（白化、精氨酸和甲硫氨酸双重缺陷）和A3-2（亮氨酸缺陷、无担孢子但形成h... 等 3 条

微生物学 Xanthophyllomyces dendrorhous酵母保存长期保存 Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den...

The Bacillus subtilis menCD promoter is responsive to extracellular pH

Applied Microbiology and Biotechnology · 1990 · 10.1007/BF00249005 · 含路线图 · 有原文

核心问题：解析枯草芽孢杆菌menCD启动子响应细胞外pH的调控机制，理解甲基萘醌生物合成基因在环境酸化和孢子形成过程中的表达调控。

关键发现：在含0.1%葡萄糖的未缓冲2×NS培养基中，野生型menCD启动子活性（β-半乳糖苷酶报告）在指数生长结束后约0.5小时（T0.5）达到峰值，至T4.0时降至最大活性的<10%；培养基pH在T0.25降至5.7，随后回升至7.0。在citK、citB、sdhC等TCA循环突变株中，pH持续保持... 等 5 条

微生物学 Bacillus subtilisMenaquinonePromotermen genespH Bacillus subtilis Bacillus subtilis Bacillus subtilis

Regulation of the ribA gene encoding GTP cyclohydrolase II by the soxRS locus in Escherichia coli

· 1996 · 10.1007/BF02173649 · 含路线图 · 有原文

核心问题：鉴定受超氧化物应激调控的新基因并阐明其调控机制，重点研究大肠杆菌中受soxRS调节子调控的ribA基因及其在氧化应激中的作用。

关键发现：从启动子文库中筛选到2个对100μM百草枯诱导超过2.5倍的启动子克隆，其中一个为ribA启动子 等 7 条

微生物学 Escherichia coliGTP cyclohydrolase IIOxidative stressribAsoxRS regulon Escherichia coli (GC4... Escherichia coli Escherichia coli

Characterisation of oxidative stress-resistant mutants of Streptococcus thermophilus CNRZ368

Archives of Microbiology · 2004 · 10.1007/s00203-004-0712-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题：鉴定 Streptococcus thermophilus CNRZ368 中参与氧化应激防御的基因，并表征其抗性突变体。

关键发现：从2112个插入突变体中筛选到8个甲萘醌抗性克隆（osrA-osrH），鉴定出8个基因座：deoB、gst、rggC、osrD、osrE、osrF、osrG和orfP。所有突变体在空气暴露320 min后存活率至少比野生型高2倍。gst、rggC、osrG和orfP突变体对甲基紫精和H2O2的... 等 4 条

微生物学 Oxidative stressReal-time quantitative RT-PCRStreptococcus thermophilus Streptococcus thermop... Streptococcus thermop... Streptococcus thermop...

Inducible expression of choline sulfate and its regulator BetR in Pseudomonas sp. ATCC19151

Archives of Microbiology · 2011 · 10.1007/s00203-011-0685-x · 含路线图 · 有原文

核心问题：阐明 Pseudomonas sp. ATCC19151 中胆碱硫酸酯酶（betC）及其调控因子 BetR 的转录调控机制，并探究该基因簇是否参与渗透压保护。

关键发现：克隆并测序了 8,161 bp 的 KpnI-NotI 片段，包含 betC、betD、betE 和 betR 基因 等 7 条

微生物学 Choline sulfateateOsmostroceptionPseudomonasTranscriptional regulation of gene expression Pseudomonas sp. ATCC1... Pseudomonas sp. ATCC1... Pseudomonas sp. ATCC1...

Diverse inhibitors of aflatoxin biosynthesis

Applied Microbiology and Biotechnology · 2008 · 10.1007/s00253-008-1362-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题：黄曲霉毒素（AF）污染粮食和坚果造成严重的食品安全问题，但缺乏有效且廉价的防控策略；需要系统梳理已报道的AF生物合成抑制剂及其作用机制，为抗黄曲霉污染提供理论依据和潜在方案。

关键发现：汇总了多种AF合成抑制剂的IC50值：Aflastatin A在平板和液体培养基中IC50分别小于0.05 μM和0.1 μM 等 12 条

微生物学 AspergillusHost resistanceOxidative stressSecondary metabolism Aspergillus parasiticus Aspergillus parasiticus Aspergillus parasiticus

Relationship between acid tolerance and cell membrane in Bifidobacterium, revealed by comparative analysis of acid-resistant derivatives and their parental strains grown in medium with and without Tween 80

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-6447-y · 含路线图 · 有原文

核心问题：双歧杆菌作为益生菌需要耐受酸性环境，但其酸耐受性较弱，限制其应用。本研究旨在探索细胞膜与酸耐受性之间的关系，以理解酸耐受机制并开发增强策略。

关键发现：在含Tween 80培养基中，B. longum JDY1017dpH和B. breve BB8dpH的酸耐受性比亲本株高10^4~10^5倍 等 2 条

微生物学 Acid toleranceBifidobacteriaCell membraneTween 80 Bifidobacterium longu... Bifidobacterium breve... 双歧杆菌细胞

An RND transporter in the monoterpene metabolism of Castellaniella defragrans

Biodegradation · 2018 · 10.1007/s10532-018-9857-6 · 含路线图 · 有原文

核心问题：揭示 C. defragrans 中与单萜代谢相关的 RND 外排转运蛋白 AmeABCD 的功能及其在单萜耐受中的作用

关键发现：ΔameABCD 突变株在柠檬烯、α-萜品烯等非功能化单萜为唯一碳源时生长显著低于野生型 等 5 条

微生物学 Anaerobic metabolismCastellaniella defragransMonoterpeneRND efflux pumpToxicity Castellaniella defrag... Castellaniella defrag... Castellaniella defrag...

Methylovorus sp. MP688 exopolysaccharides contribute to oxidative defense and bacterial survival under adverse condition

World Journal of Microbiology and Biotechnology · 2013 · 10.1007/s11274-013-1391-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题：阐明甲基营养菌Methylovorus sp. MP688胞外多糖(EPS)的生化组成及其在氧化应激和碳源缺乏条件下的生理功能

关键发现：EPS在体外对DPPH、羟基自由基和超氧阴离子具有浓度依赖性清除活性，其中羟基自由基清除能力优于抗坏血酸（最大清除率95% vs 60%） 等 6 条

微生物学 Methylovorus sp. MP688 Methylovorus sp. MP688 Methylovorus sp. MP688

SsrA (tmRNA) acts as an antisense RNA to regulate Staphylococcus aureus pigment synthesis by base pairing with crtMN mRNA

FEBS Letters · 2010 · 10.1016/j.febslet.2010.09.024 · 含路线图 · 有原文

核心问题：SsrA(tmRNA)除传统功能外，是否具有调控金黄色葡萄球菌色素合成的新作用机制

关键发现：ΔssrA菌株金黄色色素明显增加 等 7 条

微生物学 PigmentStaphylococcus aureuscrtMNssrA Staphylococcus aureus... Staphylococcus aureus... Staphylococcus aureus...

Carotenoid production and phenotypic variation in Azospirillum brasilense

Research in Microbiology · 2017 · 10.1016/j.resmic.2017.02.008 · 含路线图 · 有原文

核心问题：评估巴西固氮螺菌（Azospirillum brasilense）在丰富培养基中生长时发生表型变异（菌落色素改变和胞外多糖过量产生）的频率，并解析其遗传基础，特别是类胡萝卜素合成调控相关基因的突变。

关键发现：Sp7菌株白色变粉色的频率为0.009%-0.026%（三个实验分别为0.009%、0.026%、0.009%） 等 4 条

微生物学 Anti-sigma factorAzospirillumCarotenoidsExtracellular polysaccharidesPhase variationPhenotypic variation Azospirillum brasilen... Azospirillum brasilen... Azospirillum brasilen...

Biodegradation and Metabolism of Unusual Carbon Compounds by Anoxygenic Phototrophic Bacteria

Advances in Applied Microbiology · 1997 · 10.1016/S0065-2911(08)60020-X · 含路线图 · 有原文

核心问题：系统综述厌氧光合细菌（APB）利用非常规碳源（芳香族化合物、醇类、一碳化合物、脂肪酸、聚合物等）进行生长和代谢的能力、生化途径、调控因素及生物技术应用。

关键发现：苯甲酸光代谢关键酶苯甲酰CoA连接酶分子量60 kDa，氧不稳定，对苯甲酸和2-氟苯甲酸活性最高，邻位取代基降低反应速率。 等 11 条

微生物学 anoxygenic phototrophic bacteriaaromatic compoundsbiodegradationpolyhydroxyalkanoatesunusual carbon compounds Rhodopseudomonas palu... Rhodopseudomonas palu... Rhodopseudomonas palu...

Specialized activities and expression differences for Clostridium thermocellum biofilm and planktonic cells

Scientific Reports · 2017 · 10.1038/srep43583 · 含路线图 · 有原文

核心问题：比较 Clostridium thermocellum 在纤维素发酵过程中附着态（生物膜）和浮游态细胞的基因表达差异，揭示两种细胞群体对底物可利用性的生理适应及其在生物转化和培养生长中的贡献。

关键发现：4% 的蛋白编码基因（2356个）在两种细胞群体间显著差异表达 等 3 条

微生物学 Clostridium thermocel... Clostridium thermocel... Clostridium thermocel...

Stress induction of the Bacillus subtilis clpP gene encoding a homologue of the proteolytic component of the Clp protease and the involvement of ClpP and ClpX in stress tolerance

Molecular Microbiology · 1998 · 10.1046/j.1365-2958.1998.00840.x · 含路线图 · 有原文

核心问题：解析枯草芽孢杆菌clpP基因的克隆、序列及其胁迫诱导表达调控机制，并阐明ClpP和ClpX在应激耐受中的生理功能。

关键发现：热激(48°C)6分钟后clpP mRNA水平增加近30倍 等 3 条

微生物学 Bacillus subtilisClpPClpXheat shocksigma factor Asigma factor B Bacillus subtilis Bacillus subtilis Bacillus subtilis

σ^R, an RNA polymerase sigma factor that modulates expression of the thioredoxin system in response to oxidative stress in Streptomyces coelicolor A3(2)

The EMBO Journal · 1998 · 10.1093/emboj/17.19.5776 · 含路线图 · 有原文

核心问题：鉴定σ^R在链霉菌响应氧化应激中调控硫氧还蛋白系统的分子机制

关键发现：sigR缺失导致突变体对diamide、menadione和plumbagin敏感 等 6 条

微生物学 disulfide bond formationoxidative stresssigma factorsstreptomycesthioredoxin Streptomyces coelicol... Streptomyces coelicol... Streptomyces coelicol...

Analysis of Bacillus subtilis tag gene expression using transcriptional fusions

Journal of General Microbiology · 1994 · 10.1099/13500872-140-9-2279 · 含路线图 · 有原文

核心问题：解析枯草芽孢杆菌主要磷壁酸poly(glycerol phosphate)合成基因tagAB和tagDEF两个双向操纵子（divergon）的表达调控机制，及其在磷酸盐限制、芽孢形成/萌发和DNA损伤等条件下的响应。

关键发现：磷酸盐限制（1 mM降至220 μM）时，tagA和tagD的β-半乳糖苷酶活性在约7 h内降至初始值的约60% 等 8 条

微生物学 Bacillus subtilislacZ transcriptional fusionspoly(ribitol phosphate)tag gene expressionteichoic acids Bacillus subtilis 168 Bacillus subtilis 168 Bacillus subtilis 168

Carotenoids of Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes): identification of a novel carotenoid, deoxyscillor 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2'-dirhamnoside

Microbiology · 2010 · 10.1099/mic.0.034249-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题：鉴定 Gemmatimonas aurantiaca 中的类胡萝卜素及其糖苷衍生物，并基于基因组信息提出其生物合成途径。

关键发现：共分离出3种类胡萝卜素，其中主要成分为 (2S,2'S)-oscillol 2,2'-二-(α-L-鼠李糖苷)，占总量的88% 等 2 条

微生物学 Gemmatimonas aurantiacabiosynthetic pathwaycarotenoidsdeoxyscillor 2-rhamnosideoscillol 2,2'-dirhamnoside Gemmatimonas aurantiaca Gemmatimonas aurantiaca Gemmatimonas aurantiaca

ompW is cooperatively up-regulated by MarA and SoxS in response to menadione.

Microbiology · 2013 · 10.1099/mic.0.066050-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题：阐明甲萘醌（menadione）胁迫下鼠伤寒沙门氏菌 ompW 基因的表达调控机制，特别是转录因子 MarA 和 SoxS 的作用及其协同性。

关键发现：在野生型中，50 μM menadione处理20 min使ompW转录水平升高20.22±1.70倍 等 4 条

微生物学 marA/rob/soxS regulonoxidative stressregulation transcriptional Salmonella enterica s... Salmonella enterica s... Salmonella enterica s...

HmgR, a key enzyme in the mevalonate pathway for isoprenoid biosynthesis, is essential for growth of Listeria monocytogenes EGDe

Microbiology · 2012 · 10.1099/mic.0.056069-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题：尽管单核细胞增生李斯特菌同时拥有完整的甲羟戊酸途径和MEP途径，但确定哪条途径对细菌生长是必需的，以及hmgR基因在生长和感染中的作用。

关键发现：ΔhmgR突变体在无外源甲羟戊酸的BHI中仅能生长至OD620约0.2后停止 等 6 条

微生物学 HmgRMEP途径单核细胞增生李斯特菌异戊二烯生物合成毒力甲羟戊酸途径 Listeria monocytogene... Listeria monocytogene... Listeria monocytogene...

A constitutively expressed pair of rpoE2-chrR2 in Azospirillum brasilense Sp7 is required for survival under antibiotic and oxidative stress

Microbiology · 2012 · 10.1099/mic.0.061937-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题：在巴西固氮螺菌Sp7中，第二个ECF sigma因子/抗sigma因子对RpoE2-ChrR2在氧化胁迫和抗生素压力下的作用与调控机制未知，本研究对其进行了表征。

关键发现：rpoE2启动子活性在无胁迫条件下比rpoE1启动子高35%-40% 等 4 条

微生物学 Azospirillum brasilenseECF sigma factorantibiotic resistancecarotenoid biosynthesischrR2oxidative stress Azospirillum brasilen... Azospirillum brasilen... Azospirillum brasilen...