核心问题：研究木糖利用酵母 Pichia stipitis 中 SHAM 敏感替代呼吸途径的生理作用，通过阻断细胞色素呼吸链考察其对细胞生长和木糖转化乙醇的影响
关键发现：PsCYC1 开放阅读框长333 bp，与 ScCYC1 和 ScCYC7 在DNA水平分别有74%和69%同源性 等 7 条
核心问题：开发一种间接优化方法，将非线性生化系统（如米氏方程或GMA模型）的优化问题转化为S-系统的线性规划问题，并应用于酿酒酵母中乙醇、甘油和碳水化合物生产效率的最大化
关键发现：以乙醇生产最大化为目标，S-系统优化使乙醇速率提高3.2倍，需调控6种酶（X6,X7,X8,X9,X10,X13），GMA和MM模型分别提高3.14倍和3.48倍 等 4 条
核心问题：建立重组毕赤酵母Mut+以甲醇为碳源的非结构化生长模型，量化甲醇浓度与比生长速率、底物消耗和产物形成的关系，并用于优化肉毒杆菌神经毒素A型重链片段C(BoNT/A(Hc))的生产。
关键发现：模型预测最大比生长速率μ'_m=0.08 h^-1，对应甲醇浓度3.65 g/L 等 3 条
核心问题：长春花吲哚生物碱代谢工程中缺乏对途径限速步骤的认识，特别是长春蔓花碱合成至文多灵的分支通量调控问题
关键发现：['毛状根中荷哈默里辛和洛奇内辛的联合比产率是他波宁的5-15倍', '他波宁水平在培养稳定期下降，而洛奇内辛和荷哈默里辛积累，洛奇内辛积累水平高于他波宁和荷哈默里辛', '光适应培养中ajmalicine和serpentine比产率增加，而他波宁水平较暗培养对照降低', '前体饲喂：loga...
核心问题：开发一种能够同时通过化学趋化和生物靶向（CD44）双重靶向肿瘤细胞的细菌驱动微珠药物递送系统，以提高抗癌治疗效果并减少副作用。
关键发现：PLGA-DTX纳米粒平均粒径为277±5.38 nm，zeta电位为-1.58±5.28 mV，DTX包封率为87.5% 等 2 条
核心问题：使工业酿酒酵母菌株能够利用蜜二糖（melibiose），并减轻葡萄糖阻遏对半乳糖代谢的影响，以提高工业过程中糖的利用效率。
关键发现：所有菌株在葡萄糖上的最大比摄取速率比半乳糖高2.5-3.3倍 等 4 条
核心问题：阐明MEP途径最后步骤中GcpE酶的性质及其催化机制，特别是其辅基和还原需求。
关键发现：His-GcpE纯化后纯度为95%，分子量约43 kDa 等 4 条
核心问题：奶酪乳清中乳糖利用率低，尤其是含盐乳清（可达6% NaCl）中缺乏能同时发酵乳糖和耐盐的酵母菌株，导致乳清废弃物造成环境污染。
关键发现：获得57个融合子，其中18个DNA含量高于亲本；SK-35的DNA含量为亲本K. lactis的1.87倍，SK-53为亲本S. cerevisiae的2.23倍；SK-1核直径0.00140 mm，显著高于亲本（K. lactis 等 5 条
核心问题：解析IspH蛋白催化HMBPP还原脱水生成IPP和DMAPP的反应机制，验证C1位是否参与反应，区分两种机理模型。
关键发现：利用[1,1-2H2]-1（总产率34%）测定IspH动力学，未观察到一级KIE，动力学参数与天然底物1完全相同 等 4 条
核心问题：IspH蛋白催化的非甲羟戊酸途径最后一步反应——烯丙醇的还原性脱羟基——的结构与机制尚不清楚，需要阐明其催化机理、铁硫簇的作用以及构象变化的动态过程。
关键发现：IspH蛋白将HMBPP(6)转化为6:1的IPP与DMAPP混合物，而热力学平衡比为1:3 等 9 条
核心问题：揭示细菌中吲哚萜类生物碱（如xiamycin和sespenine）生物合成的分子机制及其独特环化序列
关键发现：异源表达pXU472在S. albus中产生xiamycin A（2，C23H25NO3，m/z 等 6 条
核心问题：鉴定恶臭假单胞菌KT2440中CYP238A1（PP1955）的底物特异性及其天然电子传递伙伴，并解析该P450酶参与萜烯醇氧化的分子机制。
关键发现：CYP238A1可结合多种单萜和倍半萜醇，其中cis-nerolidol诱导55%高自旋血红素，结合常数Kd为1.96 ± 等 4 条
核心问题：阐明混合培养条件下两种虾青素产生菌（雨生红球藻和法夫酵母）代谢通量分布的变化，揭示混合培养促进虾青素合成的机制。
关键发现：在混合培养中，P. rhodozyma中流向虾青素合成的碳通量增加20%，这可能归因于H. pluvialis光合作用释放的氧气和升高的氧消耗 等 4 条
核心问题：在大肠杆菌中异源表达CYP725A4时，主要形成非天然副产物OCT和iso-OCT，目标产物紫杉二烯-5α-醇（T5α-ol）产量很低，制约了紫杉醇前体的微生物合成。
关键发现：大肠杆菌中TS的主要产物为endotaxadiene（87-94%），次要产物为exotaxadiene（5-13%） 等 6 条
核心问题：如何在植物和微生物中重建类黄酮和芪类化合物的多酶合成途径，以提高这些具有健康益处的天然产物的产量。
关键发现：在大肠杆菌中，利用4CL和RS可将p-香豆酸转化为白藜芦醇，产量约100 μg/mL培养液 等 4 条
核心问题：如何通过微生物代谢工程高效生产C3至C5高级醇，以替代化石燃料并降低CO2排放。
关键发现：在E. coli中，利用alsS、ilvCD和Kivd/ADH2生产异丁醇，最高产量22 g/L（理论产率的86%） 等 5 条
核心问题：评估四种微生物宿主（Escherichia coli、Saccharomyces cerevisiae、Pichia pastoris和Yarrowia lipolytica）作为全细胞催化剂表达人细胞色素P450 2D6（CYP2D6）及其还原酶（CPR）的性能，以确定最适合生产药物代谢物的系统。
关键发现：P. pastoris菌株5x2D6/1xCPR表达CYP2D6达660 pmol/mg总膜蛋白，为微生物系统最高 等 5 条
核心问题：如何利用合成生物学方法拓展谷氨酸棒杆菌的底物利用范围并生产非天然产品，同时开发适用于工业生产的底盘菌株。
关键发现：GABA最高产量约39 g/L 等 10 条
核心问题：在酵母中异源表达紫杉醇生物合成相关的细胞色素P450酶时，需要合适的NADPH:细胞色素P450还原酶进行电子传递以支持羟化酶活性，而内源酵母还原酶效率较低，需要克隆并利用同源的紫杉（Taxus）还原酶来增强P450羟基化效率。
关键发现：克隆的T. cuspidata还原酶cDNA全长2941 bp，ORF 2154 bp，编码717个氨基酸，基因组中为单拷贝 等 4 条
核心问题：定量研究酿酒酵母中高水平人超氧化物歧化酶（SOD）合成对代谢网络的影响，并解析重组蛋白合成造成的代谢负担。
关键发现：重组菌株P+在葡萄糖和乙醇上的比生长速率分别比野生型P-降低34%和53%（原文摘要中为54%，结论中为53%，以结论为准）；P-的菌体/底物产率分别比P+高49%（葡萄糖）和38%（乙醇）；P-的ATP合成通量和ATP/底物产率均比P+高约50%；P+在葡萄糖生长期间64%的能量来自底物水平... 等 4 条