核心问题：DXP途径第一步由Dxs酶催化丙酮酸和甘油醛-3-磷酸缩合，损失1/6的碳，且Dxs受多种调控机制限制。需要寻找从戊糖磷酸直接生成DXP的新途径，以提高萜烯产量并规避调控。
关键发现：['通过筛选dxs缺失菌株在木糖上的生长恢复，分离出两个nDXP途径：yajO过表达和ribB基因突变（S89R、G92D、T106I等）', '体外实验证实YajO和RibB(G108S)能催化Ru5P生成DXP', '表达yajO或ribB(G108S)使bisabolene产量提高2-3...
核心问题：乳酸乳球菌在热胁迫下生长和乳酸发酵效率低下，需要提高其对温度、盐、酸、乙醇等多重胁迫的耐受性。
关键发现：在40°C热胁迫下，NZ-EDnaK菌株6h活菌数较0h增加13.5倍，而NZ-Vector降低4.6倍；有nisin时40°C下NZ-EDnaK最大OD600为NZ-Vector的6.24倍；在3% NaCl、5%乙醇、0.5%乳酸胁迫下，NZ-EDnaK的世代时间分别缩短2.11、1.29... 等 5 条
核心问题：微生物对丁醇和异丁醇的耐受性有限，限制了生物丁醇的生产，需要寻找和鉴定高耐受菌株并理解其耐受机制。
关键发现：从环境样品中分离出16株能耐受大于2.0%(vol/vol)丁醇和异丁醇的好氧和厌氧细菌 等 6 条
核心问题：Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4在37°C培养温度下生长和丁醇生产提前停止，原因不明，限制其工业应用
关键发现：37°C培养时，最大OD600仅为4.4±0.0（30°C为12.4±2.0），丁醇产量仅3.9±0.2 g/L（30°C为11.7±0.2 g/L）。补充250 mg/L腺嘌呤后，37°C下最大OD600升至4.5±0.1，丁醇产量升至8.7±1.0 g/L 等 3 条
核心问题：揭示蜜环菌（Armillaria mellea）中melleolide类毒素氯化修饰的生化与遗传基础，首次对担子菌卤化酶进行表征。
关键发现：五个黄素依赖性卤化酶ArmH1–ArmH5均在体外催化melleolide F的单氯化，HR-ESIMS检测到[M-H]⁻分别为435.1581（ArmH1）、435.1595（ArmH2）、435.1600（ArmH3）、435.1584（ArmH4）、435.1579（ArmH5），与6'... 等 3 条
核心问题：如何在酿酒酵母中有效异源生产植物单萜（芳樟醇），并通过宿主筛选和甲羟戊酸途径工程提高产量。
关键发现：在实验室菌株BQS252和BQS253中表达LIS，芳樟醇产量平均为21.92±1.75 μg/L 等 5 条
核心问题：鉴定樟脑降解途径中为2,5-和3,6-二酮樟脑单加氧酶提供还原型FMN的黄素还原酶（Fred）的真实身份，并实现该双组分酶系统的功能性重组表达。
关键发现：纯化的Fred为同源二聚体，亚基分子量约18,000，天然分子量37,200，对FMN的Km为3.6 μM、kcat为283 s-1，对FAD的Km为19 μM、kcat为128 s-1，NADH的Km为32 μM 等 6 条
核心问题：古菌寡糖转移酶AglB如何应对不同脂质连接聚糖底物的多样性，即其是否具有底物混杂性及底物特异性程度如何。
关键发现：Hfx. volcanii AglB与Har. marismortui、Hbt. salinarum、Hfx. mediterranei AglB的序列同一性分别为43%、47%、72% 等 5 条
核心问题：E. coli KO11 无法发酵纤维二糖和果胶，导致木质纤维素生物质（如甜菜粕）的乙醇生产需要大量昂贵的外源酶，且纤维二糖积累会抑制纤维素酶活性，增加工艺成本。
关键发现：['LY40A、JP07、JP07C 和 JP08C 均具有纤维二糖酶活性，比活在 等 10 条
核心问题：清酒酵母已具有极高的乙醇发酵速率，如何进一步提升其发酵性能。
关键发现：['在清酒酿造中，野生型清酒酵母发生Atg32依赖的线粒体自噬，而atg32Δ突变株中不发生。', '实验室BY4743 atg32Δ菌株的最大CO2产生速率较亲本提高7.50%（11.0±0.146 vs 等 5 条
核心问题：解决α,β-不饱和醛酮选择性还原为α,β-不饱和醇的难题，化学催化剂易于还原C=C键，现有生物催化剂存在酶稳定性差、底物抑制等问题，需要发现更稳健的烯丙基/苄基醇脱氢酶。
关键发现：分离得到Yokenella sp. WZY002，在30°C、pH 等 4 条
核心问题：从土壤中筛选具有人参皂苷化合物K脱糖活性的微生物，鉴定其新型脱糖酶并阐明其脱糖机制，以高效制备稀有人参皂苷元。
关键发现：筛选到Rhizobium sp. GIN611，其16S rRNA与Rhizobium sp. R-31762有99%同源性（99.2% identity, 1073/1081） 等 8 条
核心问题：在底盘细胞中重构异源萜类（多聚异戊二烯）生物合成途径，实现紫杉醇前体等化合物的异源生产，解决天然产物来源受限和化学合成困难的问题。
关键发现：通过MEP途径的过表达和上下游通量平衡，紫杉二烯产量达到约300 mg/L 等 4 条
核心问题：克隆并表征樟脑代谢途径中的2-氧代-Δ3-4,5,5-三甲基环戊烯基乙酰辅酶A单加氧酶(OTEMO)，解析其三维结构，阐明其底物特异性和对映选择性，并扩展I型Baeyer-Villiger单加氧酶的催化谱系。
关键发现：克隆并表达了来源于Pseudomonas putida ATCC 17453的OTEMO，纯化得到同源二聚体蛋白（分子量118,000），解析了FAD结合形式（1.95 Å）和FAD/NADP+结合形式（2.0 Å）的晶体结构。OTEMO对2-正己基环戊酮催化效率最高（kcat/Km=4.3×...
核心问题：重新鉴定来自Picrophilus torridus的推定甲羟戊酸二磷酸脱羧酶（MVD）的真实功能，并评估其在异丁烯生物生产中的应用潜力。
关键发现：PtM3K催化甲羟戊酸（MVA）磷酸化生成MVA-3P，对MVA的Km为131±18 μM，kcat为1.9 s-1，活性为3 U/mg 等 4 条
核心问题：阐明Zymomonas mobilis核糖醇脱氢酶（ZmRDH）辅因子特异性的分子决定因素，为通过蛋白质工程调控辅因子偏好提供理论依据。
关键发现：野生型ZmRDH偏好NAD+，催化效率比(kcat/Km,NAD)/(kcat/Km,NADP)=2.36 等 5 条
核心问题：从海洋细菌Brevundimonas sp. strain SD212中分离并鉴定类胡萝卜素生物合成基因簇，特别是发现编码2,2'-β-羟化酶的新基因crtG，并利用组合生物合成产生结构新颖或稀有的叶黄素类化合物。
关键发现：基因簇长度为11,991 bp，包含12个ORFs，其中7个已知基因(crtW, crtY, crtI, crtB, crtE, idi, crtZ)和1个新基因crtG（ORF11）。CrtG由257个氨基酸组成，与动物甾醇-C5-脱饱和酶在51-233位有28%的氨基酸同一性。在大肠杆菌中... 等 2 条
核心问题：传统单萜环化酶依赖焦磷酸活化的线性前体（牻牛儿基焦磷酸），限制了其工业应用。本文旨在发现能够催化非活化单萜底物（如香茅醛）环化的新型生物催化剂。
关键发现：静息细胞表达ZMO1548-Shc可从20 mM香茅醛生成5 mM异胡薄荷醇（25%产率） 等 6 条
核心问题：在非类胡萝卜素产生菌解脂耶氏酵母（Yarrowia lipolytica）中实现番茄红素的高效异源生产，并解决产物储存和产量限制问题。
关键发现：单独表达crtB和crtI的菌株（H222 ΔBI）在YPD摇瓶中96 h产番茄红素142 μg/g DCW 等 4 条
核心问题：异丁烯是重要的石油基化工原料，目前完全依赖石油生产，不可再生；缺乏高效的生物合成途径，已知的P450rm活性太低且难以异源表达。因此需要发现新的可催化异丁烯生成的酶并加以改造。
关键发现：表达His6-ScMDD的大肠杆菌全细胞能以154 pmol h^-1 g cells^-1的速率将3-HMB转化为异丁烯；纯化的His6-ScMDD体外活性为1.33 pmol min^-1 mg^-1 protein。通过易错PCR获得的两个突变体ScMDD1（I145F）和ScMDD2（... 等 3 条