共 157 篇

Respiratory Chain Analysis of Zymomonas mobilis Mutants Producing High Levels of Ethanol

Applied and Environmental Microbiology · 2012 · 10.1128/AEM.00733-12 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明Zymomonas mobilis高乙醇产量呼吸缺陷突变株的呼吸链缺陷类型及其对好氧生长、乙醇生产和耐热性的影响。

关键发现:RDM-4、RDM-5、RDM-8、RDM-9、RDM-11等NADH脱氢酶缺陷株在好氧条件下表现出更高的生长和乙醇产量,其中RDM-9的酒精脱氢酶活性较野生型提高70倍。ndh基因突变包括G541A(Gly181Ser)、T857C(Leu286Pro)、391-1057缺失及GAAGA插入... 等 2 条

代谢工程/发酵工程 NADH dehydrogenaseZymomonas mobilisethanol productionrespiratory chainthermotolerance Zymomonas mobilis ZM6... Zymomonas mobilis ZM6... Zymomonas mobilis ZM6...

Alternative biotransformation of retinal to retinoic acid or retinol with cofactor switch by aldehyde dehydrogenase from Bacillus cereus

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.00848-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:目前视黄酸仅通过化学合成生产,缺乏有效的生物催化路线,且尚未发现可将视黄醛转化为视黄酸的细菌乙醛脱氢酶。

关键发现:BcALDH氧化视黄醛的Km为7 μM,kcat/Km为40 mM⁻¹min⁻¹ 等 5 条

代谢工程 Bacillus cereusaldehyde dehydrogenasebiotransformationcofactor switchretinalretinoic acid Escherichia coli ER2566 Escherichia coli ER2566 Escherichia coli ER2566

Identification of Isopentenol Biosynthetic Genes from Bacillus subtilis by a Screening Method Based on Isoprenoid Precursor Toxicity

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.00861-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:传统基于序列相似性发现萜烯合酶基因的方法局限于植物来源,缺乏适用于微生物的通用筛选方法,难以发现非植物、序列不保守的萜烯合酶基因。

关键发现:混合培养实验中,表达ADS的细胞在10 mM甲羟戊酸条件下8.5小时内从50%富集至约96%(约4.5倍富集),而对照菌落数由600±40降至21±2 等 3 条

代谢工程 Bacillus subtilisisopentenolisoprenoidmevalonate pathwayprenyl diphosphate toxicityscreening method Escherichia coli DH10B Escherichia coli DH10B Escherichia coli DH10B

A fatty acyl-CoA reductase promotes wax ester accumulation in Rhodococcus jostii RHA1

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.00902-17 · 含路线图 · 有原文

核心问题:红球菌RHA1中蜡酯从头合成的关键酶不明确,且蜡酯产量低;需要鉴定参与蜡酯合成的脂肪酸酰基-CoA还原酶并验证其作用,以提高蜡酯产量。

关键发现:野生型RHA1在指数期(碳限制培养基)积累蜡酯2.2±0.2 μg/g CDW,氮限制条件下为0.6±0.2 μg/g CDW 等 3 条

代谢工程 代谢工程红球菌脂肪酸酰基-CoA还原酶脂质积累蜡酯 Rhodococcus jostii RHA1

Identification and Characterization of a Mucilaginibacter sp. Strain QM49 β-Glucosidase and Its Use in the Production of the Pharmaceutically Active Minor Ginsenosides (S)-Rh1 and (S)-Rg2

Applied and Environmental Microbiology · 2013 · 10.1128/AEM.01150-13 · 含路线图 · 有原文

核心问题:稀有皂苷 (S)-Rh1 和 (S)-Rg2 在天然人参中含量极低(低于干重的0.034%),现有物理化学方法产率低、产物为立体异构混合物且难分离,缺乏高效、可规模化的生物转化方法,制约其药理研究和商业化应用。

关键发现:bglQM 全长 2346 bp,编码 781 个氨基酸残基,预测分子量 等 11 条

代谢工程 (S)-Rg2(S)-Rh1Mucilaginibacterbiotransformationginsenosideglycoside hydrolase family 3 Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Regulation of Carotenogenesis and Secondary Metabolism by Nitrogen in Wild-Type Fusarium fujikuroi and Carotenoid-Overproducing Mutants

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01089-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:研究氮素可利用性对野生型藤仓镰孢霉(Fusarium fujikuroi)及其类胡萝卜素超量生产突变体(carS)中类胡萝卜素生成、赤霉素和比卡维林生物合成的调控作用,并探讨CarS突变对氮调控的次级代谢网络的影响。

关键发现:低氮培养基中野生型菌株15天类胡萝卜素产量为48 μg/g,而高氮中为10 μg/g,表明高氮抑制类胡萝卜素合成;carS突变体在低氮中的类胡萝卜素含量约为高氮的5倍。 等 7 条

代谢工程 Fusarium fujikuroibikaverincarS mutantscarotenoid biosynthesisgibberellinsnitrogen regulation Fusarium fujikuroi (I... Fusarium fujikuroi (I... Fusarium fujikuroi

Acetolactate Synthase from Bacillus subtilis Serves as a 2-Ketoisovalerate Decarboxylase for Isobutanol Biosynthesis in Escherichia coli

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01160-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在大肠杆菌异丁醇生物合成中,2-酮酸脱羧酶(Kdc)通常被认为必不可少,但研究发现不含Kdc的菌株仍能产异丁醇,需要阐明其机制并鉴定替代酶。

关键发现:原始含Kdc途径的大肠杆菌菌株24小时产6.8 g/L异丁醇,112小时超过20 g/L。仅过表达alsS、ilvC和ilvD(无kdc)的菌株仍产生异丁醇,其中单独过表达alsS即可产生异丁醇,而单独过表达ilvC和ilvD不产生 等 4 条

代谢工程 2-ketoisovalerate decarboxylaseBacillus subtilisEscherichia coliacetolactate synthaseisobutanol Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Identification, Cloning, and Characterization of a Novel Keteoreductase from the Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain PCC 7942V

Applied and Environmental Microbiology · 2008 · 10.1128/AEM.00925-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:工业生物催化中缺乏能够高对映选择性还原前手性酮(特别是氟代酮类)以制备手性醇的酶,现有工业酶如Lactobacillus brevis来源的醇脱氢酶对全氟代苯乙酮的对映选择性不足(43.3% S)。

关键发现:鉴定的酮还原酶(KR)为同源四聚体,单体分子量25.5 kDa 等 7 条

应用微生物学 / 酶工程 FabGSynechococcus不对称合成五氟苯乙酮手性醇酮还原酶 Synechococcus sp. PCC... Escherichia coli Tune...

Acute limonene toxicity in Escherichia coli is caused by limonene-hydroperoxide and alleviated by a point mutation in alkyl hydroperoxidase (AhpC)

Applied and Environmental Microbiology · 2015 · 10.1128/AEM.01102-15 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析柠檬烯对大肠杆菌产生急性毒性的分子机制,并寻找可缓解毒性的遗传改造靶点。

关键发现:FM003突变株可在含高达5% v/v柠檬烯的液体培养基中生长 等 9 条

代谢工程 biofuel tolerancelaboratory evolutionlimonenelimonene-hydroperoxidemonoterpenesoxidative stress Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113

Heat Stress Modulates Mycelium Growth, Heat Shock Protein Expression, Ganoderic Acid Biosynthesis, and Hyphal Branching of Ganoderma lucidum via Cytosolic Ca2+

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.01036-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:热应激如何通过胞质Ca2+信号调控灵芝的菌丝生长、菌丝分支、灵芝酸生物合成和热休克蛋白表达。

关键发现:热应激(42°C)抑制灵芝菌丝生长:60、90、120 min处理使菌丝生长速率分别降低35%、50%、55% 等 5 条

代谢工程 Ganoderma lucidumcytosolic Ca2+ganoderic acid biosynthesisheat shock proteinsheat stresshyphal branching 灵芝(Ganoderma lucidum) 灵芝(Ganoderma lucidum) 灵芝(Ganoderma lucidum)

Adjustment of Trehalose Metabolism in Wine Saccharomyces cerevisiae Strains To Modify Ethanol Yields

Applied and Environmental Microbiology · 2013 · 10.1128/AEM.00964-13 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何在葡萄酒发酵中通过调整海藻糖代谢来降低乙醇产量,同时避免发酵停滞和不良副产物积累

关键发现:通过筛选66株EUROSCARF缺失突变体,鉴定出5个与乙醇产量显著相关的基因:TPS1、TDH3、ZWF1、ACO1和ACO2。其中tps1Δ和tdh3Δ乙醇产量降低,zwf1Δ、aco1Δ和aco2Δ乙醇产量升高。在工业菌株VIN13中,利用DUT1启动子驱动TPS1表达在指数期比野生型高... 等 3 条

代谢工程 / 发酵工程 乙醇产量代谢工程海藻糖代谢葡萄酒发酵酿酒酵母 酿酒酵母BY4742 酿酒酵母BY4742 酿酒酵母BY4742

Five-Carbon Alcohols are Produced from Isopentenyl Diphosphate using a Synthetic Pathway

Applied and Environmental Microbiology · 2012 · 10.1128/AEM.01175-12 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从异戊烯基二磷酸(IPP)出发构建合成途径生产三种五碳醇(3-甲基-3-丁烯醇、3-甲基-2-丁烯醇和3-甲基丁醇),需要发现能够催化新反应(IPP/DMAPP去磷酸化、3-甲基-2-丁烯醇还原)的酶,并解决与内源途径竞争共同底物IPP和DMAPP的问题。

关键发现:从36个候选酶(23个HAD样磷酸酶和13个Nudix水解酶)中筛选出7个酶(HAD4、HAD10、NudB、NudF、NudI、NudJ、NudM)能催化IPP去磷酸化产生3-甲基-3-丁烯醇 等 7 条

代谢工程 五碳醇代谢工程合成生物学异戊烯基二磷酸酶家族 Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Light-controlled cell factories - Employing photocaged IPTG for light-mediated optimization of lac-based gene expression and (+)-valence biosynthesis in Corynebacterium glutamicum

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.01457-16 · 含路线图 · 有原文

核心问题:谷氨酸棒状杆菌中常规IPTG诱导系统存在诱导性差、表达异质性等缺点,限制了有毒化合物(+)-瓦伦烯的高效生产;需要建立精确、均一且非侵入性的诱导方法。

关键发现:在BHI培养基中,光诱导在指数中后期明显优于IPTG,最高可达6倍表达量;在CGXII培养基中可达3-4倍。动态范围在CGXII中为239倍(clPTG)对比46倍(IPTG)。单细胞分析表明光诱导产生均一表达,而IPTG诱导产生异质性。通过光笼IPTG诱导结合dxs、idi过表达和密码子优化... 等 4 条

代谢工程 (+)-瓦伦烯光控基因表达光笼IPTG光遗传学谷氨酸棒状杆菌 Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta...

Use of Transposon Promoter-Probe Vectors in the Metabolic Engineering of the Obligate Methanotroph Methylomonas sp. Strain 16a for Enhanced C40 Carotenoid Synthesis

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.01332-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在严格甲烷氧化菌Methylomonas sp. strain 16a中,如何鉴定支持外源基因高表达的染色体位点,以实现C40类胡萝卜素(角黄素和虾青素)的高效、稳定合成,同时消除对抗生素抗性标记的依赖。

关键发现:通过无启动子转座子筛选,在Methylomonas sp. strain 16a中鉴定出fliCS、hsdM、ccp-3、cysH和nirS五个染色体区域,这些区域能使总类胡萝卜素产量提高10-20倍(与氯霉素启动子对照相比)。最优菌株MCIS1801(Tn334插入fliS)总类胡萝卜素滴度... 等 2 条

代谢工程 C40类胡萝卜素Methylomonas sp. 16a代谢工程染色体整合虾青素角黄素 Methylomonas sp. stra... Methylomonas sp. stra... Methylomonas sp. stra...

Deletion of Genes Encoding Cytochrome Oxidases and Quinol Monooxygenase Blocks the Aerobic-Anaerobic Shift in Escherichia coli K-12 MG1655

Applied and Environmental Microbiology · 2010 · 10.1128/AEM.01178-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:去除大肠杆菌末端细胞色素氧化酶和奎醇单加氧酶后,菌株无法进行有氧-无氧代谢转换,其代谢和调控机制不清。

关键发现:敲除cydAB、cyoABCD、cbdAB和ygiN后,氧摄取率降至野生型的约1/60(0.21±0.16 vs 16.49±0.67 mmol/g DCW/h) 等 8 条

代谢工程 ArcAD-lactateEscherichia coliaerobic-anaerobic shiftcytochrome oxidasemenaquinone Escherichia coli K-12... Escherichia coli K-12... Escherichia coli K-12...

Ornithine Decarboxylase-Mediated Production of Putrescine Influences Ganoderic Acid Biosynthesis by Regulating Reactive Oxygen Species in Ganoderma lucidum

Applied and Environmental Microbiology · 2017 · 10.1128/AEM.01289-17 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明鸟氨酸脱羧酶(ODC)介导的腐胺产生如何通过调控活性氧(ROS)影响灵芝酸(GA)的生物合成

关键发现:['ODC沉默菌株ODCi3和ODCi4的ODC转录水平分别下降88%和94%,腐胺含量分别下降约67%和79%', '外源8 mM H2O2和3.5 mM KO2处理后,ODC转录水平分别增加1.3倍和3.4倍 等 4 条

代谢工程 Ganoderma lucidumODCROSganoderic acidputrescine Ganoderma lucidum Ganoderma lucidum Ganoderma lucidum

Improved Squalene Production via Modulation of the Methylerythritol 4-Phosphate Pathway and Heterologous Expression of Genes from Streptomyces peucetius ATCC 27952 in Escherichia coli

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01402-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:角鲨烯是工业上重要的化合物,传统来源(鲨鱼肝油、植物)存在污染物、纯化困难、供应不稳定等问题,急需开发可持续的微生物生产方法。

关键发现:单独表达hopA或hopB可在大肠杆菌中检测到角鲨烯 等 3 条

代谢工程 hopanoid生物合成大肠杆菌异源表达波赛链霉菌甲基赤藓醇4-磷酸途径角鲨烯 Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Improved Fermentation Performance of a Lager Yeast after Repair of Its AGT1 Maltose and Maltotriose Transporter Genes

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01558-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:拉格酵母的AGT1基因因含有一个提前终止密码子而无法编码功能性麦芽糖/麦芽三糖转运蛋白,导致高浓度(VHG)麦汁发酵缓慢、不完全,残留麦芽糖尤其是麦芽三糖含量高。

关键发现:修复AGT1并组成型表达后,葡萄糖生长细胞的麦芽糖转运活性从1.6 U/g干酵母提高到5.1-10.3 U/g干酵母 等 2 条

代谢工程 AGT1发酵性能拉格酵母高浓度酿造麦芽三糖转运麦芽糖转运 拉格酵母A15(菌株A63015) 拉格酵母A15 艾尔酵母A60

Cloning of a Novel Pyrethroid-Hydrolyzing Carboxylesterase Gene from Sphingobium sp. Strain JZ-1 and Characterization of the Gene Product

Applied and Environmental Microbiology · 2009 · 10.1128/AEM.01298-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:拟除虫菊酯农药在环境中残留造成生态与健康风险,需要获得能够高效、广谱降解此类污染物的新型酯酶。

关键发现:从Sphingobium sp. JZ-1克隆到840 bp的酯酶基因pyTH,编码280个氨基酸;PyTH与α/β水解酶折叠蛋白同源性为20-24%,含Ser78、Asp202、His230催化三联体和GHSLG保守序列。重组PyTH为单体,分子量约31 kDa,pI 等 4 条

酶工程 Sphingobiumbiodegradationcarboxylesteraseesterasepyrethroid Sphingobium sp. JZ-1 Escherichia coli BL21...

Efficient Production of L-Lactic Acid from Xylose by Pichia stipitis

Applied and Environmental Microbiology · 2007 · 10.1128/AEM.01311-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何利用能天然发酵木糖的酵母Pichia stipitis实现从木糖及木质纤维素混合糖高效生产L-乳酸,以降低乳酸生产成本并充分利用可再生原料中的五碳糖。

关键发现:在含101 g/L木糖的CaCO3缓冲YNB培养基中,P. stipitis ldhL菌株产生58 g/L乳酸,得率0.58 g/g 等 5 条

代谢工程/发酵工程 L-lactic acidPichia stipitislactate dehydrogenaselignocellulosic biomassmetabolic engineeringxylose Pichia stipitis CBS60... Pichia stipitis