共 844 篇
核心问题：在大肠杆菌中通过乌枪法鉴定增强番茄红素积累的基因，特别是寻找除已知的dxs和rpoS之外的新调控基因。
关键发现：['从基因组文库筛选中获得6个阳性克隆（L4, H36, H39, H70, H72, H90），共含13个基因。', '通过BLAST鉴定，dxs、appY、crl和rpoS是增强番茄红素生产的主要基因，其中appY和crl为新发现。', '单独表达appY或dxs均可使番茄红素产量达2.8...
代谢工程
AppYCrlcolorimetric screeninglycopene
Escherichia coli DH5α
Escherichia coli DH5α
Escherichia coli DH5α
核心问题：如何通过磷酸盐限制培养提高工程大肠杆菌莽草酸产量并降低副产物，同时评估细胞生理变化和工艺可行性
关键发现：磷酸盐限制下莽草酸产量为0.059±0.012 c-mol/c-mol葡萄糖，高于碳限制的0.024±0.005
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代谢工程
Escherichia colicarbon limitationcell physiologychemostatphosphate limitationshikimic acid
Escherichia coli W311...
Escherichia coli W311...
Escherichia coli W311...
核心问题：生物柴油生产产生大量副产甘油，价格低廉且过剩，但大肠杆菌传统上被认为不能在无外部电子受体时发酵甘油，急需开发甘油发酵平台以利用这一丰富的碳源。
关键发现：pH 6时约9 g/L甘油被发酵（初始10 g/L），最大细胞浓度486.2 mg/L
等 3 条
代谢工程
Escherichia colibacteriaglycerol fermentationmetabolic engineering
Escherichia coli MG1655
Escherichia coli MG1655
Escherichia coli MG1655
核心问题：大型生物反应器中葡萄糖与溶解氧梯度导致大肠杆菌混合酸发酵代谢快速响应，产生乙酸、甲酸等副产物，降低过程效率；现有研究未能解耦两种梯度，且采样时间分辨率不足。
关键发现：在葡萄糖限制恒化器（D=0.1 h^-1）稳态下，生物量2.79±0.03 g/L，残余葡萄糖0.14±0.01 mM，qS=1.35±0.04 mmol/g h，qO2=3.78±0.14 mmol/g h。有氧葡萄糖脉冲后，qS升至15±1 mmol/g h（约11倍），qO2升至16 m...
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发酵工程
BioScopeEscherichia coliglucose gradientmixed-acid fermentationscale-down
Escherichia coli K-12...
Escherichia coli K-12...
Escherichia coli K-12...
核心问题：木质纤维素水解液中乙酸等抑制剂抑制酵母生长，需要快速获得耐受高浓度乙酸的工业菌株
关键发现：在20 g/L乙酸条件下，突变株AG3、AG4、AG5的比生长速率约为0.26 h⁻¹，比野生型S288c（0.15 h⁻¹）快70%以上
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代谢工程
Saccharomyces cerevisiaecytostatevolutionlignocellulosic ethanolrobust strains
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：Zymomonas mobilis的细胞代谢机制尚不清楚，阻碍了其在生物乙醇生产中的实际应用。
关键发现：iZM363模型包含704个代谢物和747个反应（363个ORFs）
等 6 条
代谢工程
Zymomonas mobilisbioethanolconstraints-based flux analysisgenome-scale metabolic networkindustrial systems biotechnology
Zymomonas mobilis ZM4
Zymomonas mobilis ZM4
Zymomonas mobilis ZM4
核心问题：CYP153A6催化(S)-柠檬烯羟化制备(S)-紫苏醇过程中存在底物传质限制和副产物（紫苏醛、紫苏酸）形成问题，导致产率和选择性下降。
关键发现：P. putida KT2440（pGEc47ΔB）（pCom8-PFR1500）两相体系中副产物紫苏醛和紫苏酸占总氧化萜烯的26%
等 6 条
代谢工程
C-H-oxyfunctionalizationcytochrome P450 monooxygenaseouter membrane protein AlkLsubstrate uptaketwo-liquid phase biotransformationswhole-cell biocatalysis
Pseudomonas putida KT...
Escherichia coli W3110
Escherichia coli W3110
核心问题：Na+/Ca2+交换对细胞生理和代谢很重要，但其在真菌次级代谢生物合成中的作用尚不清楚。本研究旨在阐明Na+（而非K+）通过钙调磷酸酶信号转导调控灵芝酸生物合成的机制，并开发简单有效的诱导策略。
关键发现：添加100 mM Na+（培养初期）使总灵芝酸产量提高2.8倍
等 4 条
发酵工程
Ganoderma lucidumcalcineurin signalcalcium sensorganoderic acid productionmedicinal mushroom fermentationsecondary metabolism
Ganoderma lucidum CGM...
Ganoderma lucidum CGM...
Ganoderma lucidum CGM...
核心问题：Mn2+在蘑菇次级代谢中的作用尚不清楚，通过添加Mn2+提高抗肿瘤灵芝酸（GAs）产量并阐明其调控机制。
关键发现：添加10 mM Mn2+使总灵芝酸产量提高2.2倍
等 6 条
代谢工程
Ganoderma lucidumantitumor triterpenoidcalcineurin signalmedicinal mushroom fermentationsecondary metabolism
Ganoderma lucidum
Ganoderma lucidum
Ganoderma lucidum
核心问题：在工业酿酒酵母中实现高效纤维二糖利用，以解决纤维素生物燃料生产中的瓶颈问题，核心是平衡和增加异源途径的通量以达到高产量和高生产率。
关键发现：最终菌株#9-1-18与亲本相比，纤维二糖消耗率提高6.41倍（从0.388 g/L/h提高到2.50 g/L/h），乙醇生产率提高6.36倍（从0.137 g/L/h提高到0.89 g/L/h）。第一轮进化菌株#9的纤维二糖消耗率和乙醇生产率分别为2.24 g/L/h和0.77 g/L/h，...
等 3 条
代谢工程
cellobiose utilizationdirected evolutionmetabolic engineeringpathway optimizationpromoter engineering
工业酿酒酵母 (Saccharomyces...
工业酿酒酵母 (Saccharomyces...
核心问题：植物和微生物天然合成萜类产量低且为混合物，化学合成成本高、选择性差，需要构建高效、通用的微生物细胞工厂来生产单一萜类化合物。
关键发现：成功构建了萜类生产平台。突变株ZX178-08积累法尼醇(FOH)大于100 mg/L；表达HPS后prennaspirodiene产量达116±23.64 mg/L，亲本BY4741仅10.94±3.12 mg/L（约10倍差）；共表达截短型HMRG后prennaspirodiene进一步提...
等 3 条
代谢工程
genetic screensisoprenoid metabolismmetabolic engineeringyeast
Saccharomyces cerevis...
BY4741来源的SUE突变株
ZX178-08 (erg9敲除的SUE突变株)
核心问题：大肠杆菌中紫穗槐二烯（青蒿素前体）的生产受限于产物胞内积累，需要找到并工程化内源转运蛋白促进产物外排以提高产量。
关键发现：敲除tolC导致胞内紫穗槐二烯特异性产量增加8.2倍，胞外产量降低90%
等 2 条
代谢工程
TolCamorphadieneartemisininefflux pumplipopolysaccharide transport systemtransporter engineering
Escherichia coli
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题：解决有毒、挥发性和低溶解度中间体/产物在微生物全细胞合成中的挑战，特别是葡萄糖合成紫苏醇乙酸酯(perillyl acetate)过程中，柠檬烯(limonene)的挥发和原位萃取导致其难以被氧化功能化的问题。
关键发现：['优化P450基因表达后，双液相分批培养中POHAc产量达到6.20 ±
等 6 条
代谢工程
cytochrome P450fermentationindustrial biotechnologylimonenemetabolic and reaction engineeringoxygenated monoterpenoids
E. coli BL21(DE3)
E. coli BL21(DE3)
E. coli MG1655
核心问题：Clostridium tyrobutyricum中葡萄糖介导的碳分解代谢物阻抑（CCR）阻碍木质纤维素水解液中木糖的有效利用，导致底物利用不完全和丁醇产量低。
关键发现：与仅表达adhE2的Ct(Δack)-pM2相比，Ct(Δack)-pTBA在葡萄糖-木糖混合发酵中木糖消耗率更高，能同时以相似速率（葡萄糖1.03 g/L·h，木糖1.05 g/L·h）消耗两种糖，木糖总消耗率达87.3%（对照仅10.6%）。Ct(Δack)-pTBA的丁醇产量从3.2 g...
等 2 条
代谢工程
Clostridium tyrobutyricumbutanolcarbon catabolite repressionmetabolic engineeringsoybean hull hydrolysatexylose
Clostridium tyrobutyr...
Clostridium tyrobutyr...
Clostridium tyrobutyr...
核心问题：利用基因工程酵母将乳糖发酵为乙醇，并解决重组质粒在发酵过程中不稳定、易丢失的问题。
关键发现：13B菌株在摇瓶中培养82代（163 h）后100%细胞仍含质粒，平均乙醇比生产力为7.74×10^-11 g乙醇/细胞·h
等 3 条
发酵工程
Saccharomycesglucose fermentationlactose fermentationreverse osmosis membrane
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：解释微好氧连续乙醇发酵中比乙醇生产率随供氧率变化（先升后降）的代谢机制，以及ATP产量变化、消泡剂影响和生物量突变等现象的生化基础。
关键发现：当进料氧从0.38%降至0.024%时，比乙醇生产率增加超过50%
等 3 条
发酵工程
ATPNADHSaccharomyces cerevisiaeantifoamchemostatenzyme assays
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题：在重组酿酒酵母培养中，高浓度乙醇会抑制克隆基因的表达；需要同时将葡萄糖和乙醇浓度控制在低水平以提高α-淀粉酶产量。
关键发现：在分批培养中，乙醇浓度控制在2-5 g/L时，基因表达水平比20 g/L时高2倍
等 4 条
发酵工程
PGK promoterSUC2 promotereffect of ethanol on cloned gene expressionfuzzy controlleron-line glucose-ethanol analyzerrecombinant Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：溶剂梭菌对五碳糖（木糖）利用效率低，严重阻碍了以木质纤维素为原料的可持续生物丁醇生产平台的发展；需要解析高效木糖利用菌株的分子机制。
关键发现：BOH3菌株可同时利用葡萄糖和木糖，丁醇产量>15 g/L
等 8 条
代谢工程
BOH3ClostridiumbiofuelsiTRAQproteome dynamics
Clostridium sp. strai...
Clostridium sp. strai...
Clostridium sp. strai...
核心问题：解决大肠杆菌作为工业宿主生产异戊二烯类化合物时存在的问题：无法利用蔗糖、缺乏对有毒甲羟戊酸（MVA）途径中间体的内源控制、以及异源途径在染色体上整合与优化困难。
关键发现：将cscAKB整合后，DH1衍生菌株DS能以蔗糖为碳源生长并利用质粒表达MVA途径生产bisabolene，产量约1 g/L
等 4 条
代谢工程
CRISPR-Cas9Chromosomal engineeringE. coli DH1biofuelmevalonate pathwaysucrose utilization
Escherichia coli DH1
Escherichia coli DH1
Escherichia coli DH1
核心问题：在无需外部诱导剂和补料操作的简单分批培养中，实现细胞生长与重组蛋白表达的解耦，以提高蛋白产量并简化工艺。
关键发现：WGM在葡萄糖+甘油混合培养中μ=0.41±0.00 h^-1，接近野生型W3110（0.46±0.01），但葡萄糖摄取速率降至5.3±3.3 mmolC g^-1 h^-1
等 4 条
代谢工程 / 合成生物学
C-source mixturesbioprocess intensificationgenetic circuitgrowth decouplingmicrobial engineering
大肠杆菌W3110
大肠杆菌W3110
大肠杆菌W3110