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Metabolic engineering of Clostridium tyrobutyricum for n-butanol production through co-utilization of glucose and xylose

作者
Le Yu, Mengmeng Xu, I-Ching Tang, Shang-Tian Yang
单位
William G. Lowrie Department of Chemical and Biomolecular Engineering, The Ohio State University, 151 West Woodruff Ave., Columbus, Ohio 43210, USA; Bioprocessing Innovative Company, 4734 Bridle Path Ct., Dublin, OH 43017, USA
杂志
Biotechnology and Bioengineering(2015)
DOI
10.1002/bit.25613
所属领域
代谢工程
关键词
Clostridium tyrobutyricumbutanolcarbon catabolite repressionmetabolic engineeringsoybean hull hydrolysatexylose
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解决的核心问题

Clostridium tyrobutyricum中葡萄糖介导的碳分解代谢物阻抑(CCR)阻碍木质纤维素水解液中木糖的有效利用,导致底物利用不完全和丁醇产量低。

研究策略

在C. tyrobutyricum(Δack)中共过表达来自C. acetobutylicum的木糖代谢基因xylT(木糖质子共转运体)、xylA(木糖异构酶)、xylB(木酮糖激酶)及醛/醇脱氢酶基因adhE2,构建重组菌株Ct(Δack)-pTBA,增强木糖转运和初始代谢,解除CCR,实现葡萄糖和木糖同步利用。

研究路线图

核心问题:CCR阻抑木糖利用,丁醇产量低
策略:共过表达xylT/xylA/xylB + adhE2于Δack菌株
关键改造①:异源表达木糖转运体(xylT)
关键改造②:木糖异构酶(xylA)+ 木酮糖激酶(xylB)
关键改造③:醛/醇脱氢酶(adhE2)+ 敲除ack
结果①:葡萄糖/木糖同步消耗(1.03 vs 1.05 g/L·h),木糖利用率87.3%
结果②:丁醇12 g/L(+275%),得率0.12 g/g,生产力0.17 g/L·h
结果③:SHH中丁醇15.7 g/L(+MV),得率0.24 g/g
结论:强化木糖转运与代谢可解除CCR,实现木质纤维素高效产丁醇
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核心内容

针对Clostridium tyrobutyricum中葡萄糖介导的碳分解代谢物阻抑(CCR)导致木糖利用受限的问题,本研究在敲除乙酸激酶(Δack)的底盘菌株中共过表达来自C. acetobutylicum的木糖转运及代谢基因xylT、xylA、xylB以及醛/醇脱氢酶基因adhE2,构建重组菌株Ct(Δack)-pTBA。该策略在不破坏CcpA等全局调控因子的前提下强化木糖摄取和初始代谢,有效解除了CCR。在葡萄糖-木糖混合发酵中,重组菌能以相似速率(葡萄糖1.03 g/L·h,木糖1.05 g/L·h)同步消耗两种糖,木糖总消耗率达87.3%,而对照仅10.6%;丁醇产量从3.2 g/L提高到12.0 g/L,得率和生产力分别提升至0.12 g/g和0.17 g/L·h。在大豆壳水解液中,添加500 μM甲基紫精后丁醇产量达15.7 g/L,得率0.24 g/g。该研究证明了强化木糖转运和代谢关键步骤即可破除CCR,为利用木质纤维素原料生产生物丁醇提供了可行途径。

创新点

['首次在C. tyrobutyricum中通过异源表达xylT、xylA、xylB与adhE2,实现葡萄糖和木糖的同步高效共利用,显著减轻CCR。', '在无需破坏CcpA或PTS等全局调控因子的情况下,仅强化木糖转运和代谢关键步骤即可破除CCR。', '在大豆壳水解液(SHH)中实现高丁醇产量(15.7 g/L),展示了利用廉价木质纤维素原料的工业潜力。']

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 (Δack) 丁醇合成途径 adhE2 醛/醇脱氢酶 催化 来自C. acetobutylicum ATCC 824,催化丁酰-CoA转化为丁醇,在Ct(Δack)-pTBA中组成型表达
Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 (Δack) 木糖代谢途径 xylT (CAC1345) 木糖质子共转运体 转运 来自C. acetobutylicum ATCC 824,负责木糖跨膜转运
Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 (Δack) 木糖代谢途径 xylA (CAC2610) 木糖异构酶 催化 来自C. acetobutylicum ATCC 824,催化木糖异构化为木酮糖
Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 (Δack) 木糖代谢途径 xylB (CAC2612) 木酮糖激酶 催化 来自C. acetobutylicum ATCC 824,催化木酮糖磷酸化为木酮糖-5-磷酸
Clostridium tyrobutyricum ATCC 25755 乙酸合成途径 ack 乙酸激酶 催化 敲除此基因以阻断乙酸生成,增加丁酸/丁醇代谢通量

关键发现

  1. 与仅表达adhE2的Ct(Δack)-pM2相比,Ct(Δack)-pTBA在葡萄糖-木糖混合发酵中木糖消耗率更高,能同时以相似速率(葡萄糖1.03 g/L·h,木糖1.05 g/L·h)消耗两种糖,木糖总消耗率达87.3%(对照仅10.6%)。Ct(Δack)-pTBA的丁醇产量从3.2 g/L提高到12.0 g/L(提高275%),丁醇得率从0.07 g/g提高到0.12 g/g,生产力从0.07 g/L·h提高到0.17 g/L·h。在SHH中,Ct(Δack)-pTBA木糖消耗率为1.21 g/L·h,木糖消耗92.7%,但丁醇产量8.1 g/L(得率0.10 g/g)
  2. 添加500 μM甲基紫精后丁醇产量达15.7 g/L,得率0.24 g/g,生产力0.29 g/L·h。不同葡萄糖:木糖比例(3:1至1:2)下均能共利用,木糖摄取速率随木糖比例增加从0.14 g/L·h升至0.45 g/L·h。

研究结论

过表达xylT、xylA和xylB能有效解除C. tyrobutyricum中葡萄糖介导的碳分解代谢物阻抑,实现葡萄糖和木糖的同步高效利用,显著提高丁醇产量。Ct(Δack)-pTBA可利用大豆壳水解液等木质纤维素原料,具有工业生物丁醇生产潜力。

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