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核心问题：使用YIp356/YEp356R系列经典酵母载体进行启动子表征时，ARG2启动子表现出强烈的碳源调控，需确定该调控是否真实以及其分子机制。
关键发现：在非葡萄糖碳源上，ARG2启动子驱动的lacZ表达比葡萄糖培养高5-10倍（半乳糖）至40倍（乙醇）
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代谢工程
YEp356glucose repressionlacZ fusion reporter plasmid
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：开发一种间接优化方法，将非线性生化系统（如米氏方程或GMA模型）的优化问题转化为S-系统的线性规划问题，并应用于酿酒酵母中乙醇、甘油和碳水化合物生产效率的最大化
关键发现：以乙醇生产最大化为目标，S-系统优化使乙醇速率提高3.2倍，需调控6种酶（X6,X7,X8,X9,X10,X13），GMA和MM模型分别提高3.14倍和3.48倍
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代谢工程
OptimizationS-system representationSaccharomyces cerevisiaecarbohydratesethanolglycerol
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题：开发一种能够同时通过化学趋化和生物靶向（CD44）双重靶向肿瘤细胞的细菌驱动微珠药物递送系统，以提高抗癌治疗效果并减少副作用。
关键发现：PLGA-DTX纳米粒平均粒径为277±5.38 nm，zeta电位为-1.58±5.28 mV，DTX包封率为87.5%
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合成生物学
CD44 targetingSalmonella Typhimuriumbacteriobotschemotaxisdocetaxelhyaluronic acid
Salmonella Typhimuriu...
核心问题：使工业酿酒酵母菌株能够利用蜜二糖（melibiose），并减轻葡萄糖阻遏对半乳糖代谢的影响，以提高工业过程中糖的利用效率。
关键发现：所有菌株在葡萄糖上的最大比摄取速率比半乳糖高2.5-3.3倍
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代谢工程
GAL80MEL1MIG1S. cerevisiaegalactoseglucose repression
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：奶酪乳清中乳糖利用率低，尤其是含盐乳清（可达6% NaCl）中缺乏能同时发酵乳糖和耐盐的酵母菌株，导致乳清废弃物造成环境污染。
关键发现：获得57个融合子，其中18个DNA含量高于亲本；SK-35的DNA含量为亲本K. lactis的1.87倍，SK-53为亲本S. cerevisiae的2.23倍；SK-1核直径0.00140 mm，显著高于亲本（K. lactis
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代谢工程
乙醇乳清乳糖乳酸克鲁维酵母原生质体融合酿酒酵母
Saccharomyces cerevis...
Kluyveromyces lactis ...
Kluyveromyces lactis ...
核心问题：识别丙酮丁醇梭菌从酸生成转向溶剂生成过程中特异性诱导的蛋白质，理解代谢转换的分子机制。
关键发现：在分析的130个蛋白中，溶剂生成期有52个蛋白合成增加超过2倍，34个蛋白降至不足酸生成期的一半；7个蛋白（spots 18, 28, 30, 36, 37, Adc I, 118）诱导超过10倍。乙酰乙酸脱羧酶（Adc）合成诱导率36.2倍，丰度增加10.9倍；DnaK合成诱导3.7倍，GroEL
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代谢工程
Clostridium acetobutylicumN-Terminal sequencingProteome analysisSolventogenesisTwo-dimensional electrophoresis
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
核心问题：利用甲醇诱导型AOX1启动子在巴斯德毕赤酵母中分泌生产单链抗体片段时，存在分泌延迟（诱导后约14小时产物才出现）以及高纯氧需求的问题，导致生产效率低、成本高。
关键发现：短时甘油补料（2 h）时scFv在诱导后14 h才开始在上清积累，延长至18 h后诱导立即出现产物
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发酵工程
AOX1启动子单链抗体片段巴斯德毕赤酵母过程优化重组蛋白生产
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)
核心问题：阐明混合培养条件下两种虾青素产生菌（雨生红球藻和法夫酵母）代谢通量分布的变化，揭示混合培养促进虾青素合成的机制。
关键发现：在混合培养中，P. rhodozyma中流向虾青素合成的碳通量增加20%，这可能归因于H. pluvialis光合作用释放的氧气和升高的氧消耗
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代谢工程
AstaxanthinHaematococcus pluvialisMetabolic flux analysisMixed culturePhaffia rhodozyma
Phaffia rhodozyma
Phaffia rhodozyma
Phaffia rhodozyma
核心问题：如何利用生物技术高效生产生物丁醇，以替代石油基燃料并减少二氧化碳排放
关键发现：丁醇热值为29.2 MJ/L，高于乙醇(21.2 MJ/L)，低于汽油(32.5 MJ/L)
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代谢工程
BiobutanolBiofuelButanolClostridium acetobutylicumSolvents
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
核心问题：探讨如何利用合成生物学的新工具（如RNA调控器件、启动子工程、非天然氨基酸等）拓展酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）代谢工程的能力。
关键发现：酿酒酵母中删除GDH1使cubebol产量提高85%，但比生长速率下降，过表达GDH2可恢复
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代谢工程与合成生物学
Industrial biotechnologyMetabolic engineeringSaccharomyces cerevisiaeSynthetic biologyYeast
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题：评估工程化酿酒酵母DA24-16（可同时利用纤维二糖和木糖）在同步糖化发酵（SSF）中取代外源β-葡萄糖苷酶的能力，并比较SSF与分步水解发酵（SHF）的工艺性能。
关键发现：DA24-16菌株在SSF中140 h仅实现10%纤维素转化（有木糖时25%），而非CDT菌株补充β-葡萄糖苷酶在90 h达到近100%转化
等 5 条
代谢工程
Biochemical engineeringBiofuelsCellobioseCelluloseSaccharomyces
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：如何利用合成生物学方法拓展谷氨酸棒杆菌的底物利用范围并生产非天然产品，同时开发适用于工业生产的底盘菌株。
关键发现：GABA最高产量约39 g/L
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代谢工程
BiosensorChassis organismCorynebacterium glutamicumIsoprenoidsSynthetic biology
Corynebacterium gluta...
Corynebacterium gluta...
Corynebacterium gluta...
核心问题：如何通过代谢工程改造酿酒酵母，实现异戊二烯类化合物（从香料、药物到先进生物燃料）的高效生产，以克服植物提取和化学合成的局限性。
关键发现：植物提取效率低（青蒿素仅占黄花蒿干重0.44%）
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代谢工程
BiofuelsIsoprenoidsMetabolic engineeringMicrobial cell factoriesSaccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题：酿酒酵母谷胱甘肽产量有限，传统筛选方法效率低，需要开发新的高产菌株筛选策略
关键发现：经100代进化，丙烯醛浓度从0.2 mM提升至0.4 mM，其中A4-100和572m-100群体谷胱甘肽含量约3%
等 4 条
代谢工程
acroleinadaptive laboratory evolutionglutathioneglutathione disulfideγ-glutamyl-L-cysteinylglycine
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题：在酸性发酵条件下，乳酸毒性抑制酿酒酵母生长，导致D-乳酸产量和产率低，需要提高菌株的乳酸耐受性和生产效率。
关键发现：JHY5610相比JHY5210，葡萄糖摄取提高18%，D-乳酸产量提高44%（JHY5610在50 g/L葡萄糖下消耗38.8 g/L葡萄糖，产D-LA
等 5 条
代谢工程
Adaptive evolutionD-lactic acidLactic acid toleranceMetabolic engineeringSaccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：Shewanella oneidensis 等产电菌无法直接利用甘油作为碳源，导致甘油难以在微生物燃料电池中高效转化为电能。
关键发现：工程联合体 (ETK.pneumoniae-ETS.oneidensis) 在 100 mM 甘油条件下最大功率密度为
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合成生物学
GlycerolKlebsiella pneumoniae- Shewanella oneidensisMicrobial consortiumMicrobial fuel cellSynthetic biology
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
核心问题：大肠杆菌PTS系统在葡萄糖转运时消耗磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)，不利于需要PEP为前体的产物合成；本研究旨在通过非PTS途径恢复葡萄糖转运并提高糖酵解通量。
关键发现：VH32（PTS-）在葡萄糖上μ仅0.03 h^-1；表达galP(trc1)后μ为0.55 h^-1，达W3110(0.62 h^-1)的89%。单独表达glk无改善，同时表达galP和glk的菌株μ可达0.59-0.64 h^-1，与W3110相当。启动子强度范围为野生型trc1的8%至8...
等 6 条
代谢工程
Escherichia coli VH32
Escherichia coli VH32
Escherichia coli VH32
核心问题：在汉逊酵母DL-1中利用甲醇诱导MOX启动子高效分泌表达重组人血清白蛋白，解决表达效率受5'UTR、基因拷贝数和宿主甲醇氧化酶竞争等限制的问题。
关键发现：去除5'-UTR后HSA表达效率提高至少5倍
等 6 条
代谢工程
5'-untranslated regionHansenula polymorphaMOX promotercopy numberhuman serum albuminmethanol oxidase-deficient phenotype
Hansenula polymorpha ...
Hansenula polymorpha ...
Hansenula polymorpha ...
核心问题：定量研究酿酒酵母中高水平人超氧化物歧化酶（SOD）合成对代谢网络的影响，并解析重组蛋白合成造成的代谢负担。
关键发现：重组菌株P+在葡萄糖和乙醇上的比生长速率分别比野生型P-降低34%和53%（原文摘要中为54%，结论中为53%，以结论为准）；P-的菌体/底物产率分别比P+高49%（葡萄糖）和38%（乙醇）；P-的ATP合成通量和ATP/底物产率均比P+高约50%；P+在葡萄糖生长期间64%的能量来自底物水平...
等 4 条
代谢工程
S. cerevisiaehuman SODmetabolic flux analysisrecombinant protein
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题：微好氧条件下ArcA和FNR对大肠杆菌氧调控和糖酵解途径相关基因表达的影响，以及乳酸通量升高的分子机制。
关键发现：ArcA对fnr表达有负效应，arcA突变体中fnr表达比野生型最高高2倍
等 8 条
代谢工程
QRT-PCRfermentative geneslactatemicroaerobic conditionspyruvate metabolism
Escherichia coli MG1655
Escherichia coli MG1655
Escherichia coli MG1655