Rapid Strain Improvement Through Optimized Evolution in the Cytostat
- 作者
- Alan Gilbert, Dipen P. Sangurdekar, Friedrich Sricne
- 单位
- Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Minnesota; BioTechnology Institute, University of Minnesota
- 杂志
- Biotechnology and Bioengineering(2009)
- DOI
- 10.1002/bit.22272
- 所属领域
- 代谢工程
- 关键词
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解决的核心问题
木质纤维素水解液中乙酸等抑制剂抑制酵母生长,需要快速获得耐受高浓度乙酸的工业菌株
研究策略
利用cytostat(恒化器优化进化)技术,在低细胞密度和明确选择压力下连续培养,富集并分离乙酸耐受的酵母突变株
研究路线图
核心内容
本研究利用cytostat(恒化器优化进化)技术,在低细胞密度和明确乙酸选择压力下连续培养酿酒酵母S288c,旨在快速获得耐受木质纤维素水解液中高浓度乙酸的工业菌株。通过不到5天的连续进化,成功分离出多个乙酸耐受突变株。在20 g/L乙酸条件下,突变株AG3、AG4、AG5的比生长速率约为0.26 h⁻¹,较野生型(0.15 h⁻¹)提升超过70%;二倍体杂交株AG4×AG5的比生长速率达0.33 h⁻¹,较单倍体突变株快27%,较野生型快120%。在含20 g/L乙酸和100 g/L葡萄糖的批式培养中,突变株AG4的乙醇收率最高达0.41,而野生型仅为0.32,且工业菌株Ethanol Red的产乙醇量仅为AG4×AG5的88%,所需时间多27%。基因扩增分析揭示,AG3中LPP1基因平均扩增2.5倍,AG4和AG5中ENA1、ENA2、ENA5基因扩增超过2倍,表明脂质磷酸磷酸酶和钠泵P型ATPase的拷贝数增加是乙酸耐受性的关键机制。有益突变概率估计大于10⁻⁸(细胞·倍增时间)⁻¹。该研究证明cytostat技术能在数天内高效筛选出性能优于亲本和工业菌株的乙酸耐受酵母,为木质纤维素乙醇生产提供了优良菌株候选。
创新点
采用cytostat在最短时间内(<5天)分离乙酸耐受突变株;通过基因扩增分析鉴定耐受相关基因;证明LPP1和ENA基因扩增赋予耐受性
研究对象(5)
| 底盘细胞 | 代谢通路 | 基因 | 蛋白 | 功能 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|
| Saccharomyces cerevisiae S288c | 乙酸耐受 | LPP1 | 脂质磷酸磷酸酶 | 催化 | 在突变株AG3中扩增2.5倍,过表达LPP1增强乙酸耐受 |
| Saccharomyces cerevisiae S288c | 乙酸耐受 | ENA1 | P型ATPase钠泵 | 转运 | 在突变株AG4和AG5中扩增,与乙酸、盐和渗透压耐受相关 |
| Saccharomyces cerevisiae S288c | 乙酸耐受 | ENA2 | P型ATPase钠泵 | 转运 | 在突变株AG4和AG5中扩增,与ENA1、ENA5协同作用 |
| Saccharomyces cerevisiae S288c | 乙酸耐受 | ENA5 | P型ATPase钠泵 | 转运 | 在突变株AG4和AG5中扩增,与ENA1、ENA2协同作用 |
| Saccharomyces cerevisiae X2180-1A | 乙酸耐受 | — | — | 调控 | 作为亲本分离突变株AG5,与AG4杂交得到二倍体AG4×AG5 |
关键发现
- 在20 g/L乙酸条件下,突变株AG3、AG4、AG5的比生长速率约为0.26 h⁻¹,比野生型S288c(0.15 h⁻¹)快70%以上
- 二倍体AG4×AG5在20 g/L乙酸下比生长速率为0.33 h⁻¹,比单倍体突变株快27%,比野生型快120%
- 在含20 g/L乙酸、100 g/L葡萄糖的批式培养中,突变株乙醇收率最高达0.41(AG4),而野生型为0.32,工业菌株Ethanol Red产乙醇量仅为AG4×AG5的88%且需多27%的时间
- AG3中LPP1基因平均扩增2.5倍,AG4和AG5中ENA1、ENA2、ENA5基因扩增超过2倍
- 有益突变概率估计大于10⁻⁸(细胞·倍增时间)⁻¹
研究结论
Cytostat技术能够在几天内快速筛选出乙酸耐受的酵母突变株,基因扩增(LPP1、ENA)是耐受性的关键机制,所得突变株在乙酸胁迫下乙醇产量和产率优于亲本和工业菌株,为木质纤维素乙醇生产提供了优良菌株