共 844 篇

Genetic analysis around aminoalcohol dehydrogenase gene of Rhodococcus erythropolis MAK154: a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation

Applied Microbiology and Biotechnology · 2010 · 10.1007/s00253-010-2924-5 · 含路线图 · 有原文

核心问题:Rhodococcus erythropolis MAK154中氨基酸醇脱氢酶(AADH)表达水平低,限制了其作为生物催化剂生产手性氨基醇(如d-伪麻黄碱)的应用,需要揭示其调控机制并提高表达。

关键发现:在野生型MAK154中,添加1-氨基-2-丙醇诱导后AADH活性可产生约1 mg/ml EPE(产物),而敲除orfE的ΔorfE菌株无论是否诱导均产生约7 mg/ml EPE,AADH活性显著高于诱导的野生型 等 3 条

代谢工程 Aminoalcohol dehydrogenaseAminoalcohol metabolismGntR family transcriptional regulatorRhodococcus erythropolis Rhodococcus erythropo... Rhodococcus erythropo... Rhodococcus erythropo...

Functional characterization of Edwardsiella tarda twin-arginine translocation system and its potential use as biological containment in live attenuated vaccine of marine fish

Applied Microbiology and Biotechnology · 2012 · 10.1007/s00253-012-4462-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)双精氨酸转运(Tat)系统的生物学功能,并探索将其作为海洋鱼类减毒活疫苗(LAV)生物遏制系统的可行性。

关键发现:E. tarda Tat系统功能正常,ssTorA::GFP在野生株中成熟转运至周质,在ΔtatABCD中滞留于胞质。 等 7 条

合成生物学 Biological containmentEdwardsiella tardaMarine fish vaccinologyTat system Edwardsiella tarda EI... Edwardsiella tarda EI... Edwardsiella tarda EI...

Enhanced production of poly(lactate-co-3-hydroxybutyrate) from xylose in engineered Escherichia coli overexpressing a galactitol transporter

Applied Microbiology and Biotechnology · 2014 · 10.1007/s00253-013-5401-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:以木糖为底物在工程大肠杆菌中提高乳酸基共聚物聚(乳酸-co-3-羟基丁酸酯)[P(LA-co-3HB)]的生产率和乳酸(LA)单元比例,解决LA富集型(>50 mol%)共聚物产量低的问题。

关键发现:在20 g/L木糖下,ΔpflA、Δpta和Δdld单敲除菌株的LA比例分别提高至60、58和66 mol%(BW25113为56 mol%) 等 4 条

代谢工程 Biobased plasticLactate-based polymerLignocellulosic biomassPolyhydroxyalkanoate Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113

Metabolic engineering of Escherichia coli to enhance hydrogen production from glycerol

Applied Microbiology and Biotechnology · 2014 · 10.1007/s00253-014-5600-3 · 含路线图 · 有原文

核心问题:以甘油为底物时,此前从葡萄糖产氢的工程菌株效果不佳(氢气产量仅提高1.8倍且生长减慢),需要重新设计大肠杆菌代谢网络,通过靶向基因敲除增强甘油产氢。

关键发现:最佳七基因敲除菌株(BW25113ΔfrdC ldhA fdnG ppc narG mgsA hycA)的氢气产量为158±2 μmol/mg protein,是野生型(28.8±0.3 μmol/mg protein)的5.5倍 等 2 条

代谢工程 Anaerobic fermentationEscherichia coliGlycerolHydrogenMetabolic engineering Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113 Escherichia coli BW25113

Engineering of Corynebacterium glutamicum for growth and L-lysine and lycopene production from N-acetyl-glucosamine

Applied Microbiology and Biotechnology · 2014 · 10.1007/s00253-014-5676-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)无法利用N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)作为碳源,其基因组缺乏功能性GlcNAc摄取系统;需要引入外源摄取系统并增强内源代谢基因表达,以实现以GlcNAc为原料生产L-赖氨酸和番茄红素。

关键发现:在测试的17株棒杆菌中仅C. glycinophilum DSM45794能以GlcNAc为唯一碳源生长,其在GlcNAc和葡萄糖上的比生长速率分别为0.14±0.01和0.15±0.02 h^-1,最终OD600分别为7.9±0.7和8.2±1.1 等 6 条

代谢工程 L-赖氨酸N-乙酰氨基葡萄糖NagANagEPTS嗜甘氨酸棒杆菌 Corynebacterium gluta... Corynebacterium glyci... Escherichia coli LR2-168

Enhancement of glycerol utilization ability of Ralstonia eutropha H16 for production of polyhydroxyalkanoates

Applied Microbiology and Biotechnology · 2014 · 10.1007/s00253-014-5831-3 · 含路线图 · 有原文

核心问题:野生型Ralstonia eutropha H16在甘油上生长极慢,难以利用廉价甘油高效生产聚羟基脂肪酸酯(PHA),需要增强其甘油同化能力。

关键发现:H16_glpK和H16_glpFK在甘油上的比生长速率达0.15 h^-1(果糖为0.28 h^-1),72 h产P(3HB) 等 4 条

代谢工程 GlycerolMetabolic engineeringPolyhydroxyalkanoateRalstonia eutropha H16 Ralstonia eutropha H16 Ralstonia eutropha H1... Ralstonia eutropha H16

Experimental design-aided systematic pathway optimization of glucose uptake and deoxyxylulose phosphate pathway for improved amorphadiene production

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-6463-y · 含路线图 · 有原文

核心问题:在大肠杆菌中生产青蒿素前体紫穗槐二烯(AD)时,DXP途径两种前体甘油醛-3-磷酸(GAP)和丙酮酸(PYR)不平衡,限制了AD的产量;同时,葡萄糖摄取途径对前体供给有重要影响,需要系统优化以提高产量。

关键发现:敲除PTS并过表达GGS系统(菌株PGG)使AD产量从11 mg/L提高到60 mg/L,提高约5倍 等 6 条

代谢工程 AmorphadieneDeoxyxylulose phosphate pathwayExperimental design-aided systematic pathway optimizationMultivariate-modular approachThe phosphotransferase system Escherichia coli K12 ... Escherichia coli K12 ... Escherichia coli K12 ...

Improvement of acetic acid tolerance of Saccharomyces cerevisiae using a zinc-finger-based artificial transcription factor and identification of novel genes involved in acetic acid tolerance

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-014-6343-x · 含路线图 · 有原文

核心问题:提高酿酒酵母对纤维素水解液中乙酸抑制剂的耐受性,并鉴定参与乙酸耐受性的新基因。

关键发现:从ZFP-TF文库筛得乙酸耐受突变株Sc4126-M01,在5 g/L乙酸存在下其过氧化氢酶(CAT)活性显著高于对照菌株 等 4 条

代谢工程 Acetic acid toleranceArtificial transcription factor (ATF)Ethanol productionQDR3Saccharomyces cerevisiaeZinc finger protein (ZFP) Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae

Pseudomonas putida—a versatile host for the production of natural products

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-6745-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:系统综述恶臭假单胞菌 (Pseudomonas putida) 作为重组宿主用于多种天然产物(鼠李糖脂、萜类、聚酮/非核糖体肽、氨基酸衍生物等)异源生物合成的应用潜力与工程策略。

关键发现:P. putida 已成功实现多种天然产物的异源合成:鼠李糖脂最高产量达7.3 g/L(C yield 等 3 条

代谢工程 Heterologous pathway expressionNatural productsPseudomonas putidaRecombinant biosynthesis Pseudomonas putida KT... Pseudomonas putida KT... Pseudomonas putida KT...

Metabolic engineering of Escherichia coli to enhance acetol production from glycerol

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-6732-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:大肠杆菌利用甘油生产羟基丙酮(acetol)时,甘油消耗速率低且NADPH供应不足,导致产量偏低。需要代谢工程改造以提高甘油利用率和NADPH可用性。

关键发现:与对照HJ01相比,替换glpK的HJ02使acetol产量提高5.5倍(从0.08 g/L升至0.44 g/L),甘油消耗速率提高53.4%。添加葡萄糖使HJ02的acetol浓度提高61%至0.71 g/L,NADPH水平提高1.72倍、NADPH/NADP+提高1.43倍。进一步敲除pt... 等 2 条

代谢工程 AcetolGapAGlpKGlycerolNADPH Escherichia coli BW25113 Escherichia coli HJ02 Escherichia coli BW25...

Improving furfural tolerance of Zymomonas mobilis by rewiring a sigma factor RpoD protein

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-6577-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:木质纤维素水解液中的糠醛是生物乙醇发酵的关键抑制剂,严重抑制运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)的生长和乙醇生产,需要有效提高其糠醛耐受性。

关键发现:从易错PCR文库中筛选到三个RpoD突变株(ZM4-MF1、ZM4-MF2、ZM4-MF3),在3 g/L糠醛下,最佳突变株ZM4-MF2最大细胞密度OD600约2.0(约30 h),而对照ZM4-rpoD仅约1.3 等 5 条

代谢工程 Error-prone PCREthanol productionFurfural toleranceGlobal transcription machinery engineeringRpoD proteinSigma factor Zymomonas mobilis ZM4 Zymomonas mobilis ZM4 Zymomonas mobilis ZM4

Enhanced production of leech hyaluronidase by optimizing secretion and cultivation in Pichia pastoris

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-7056-5 · 含路线图 · 有原文

核心问题:水蛭透明质酸酶(LHAase)在毕赤酵母中分泌表达水平不足,需要提高其产量以满足工业生产需求。

关键发现:初始LHAase产量为8.42×10^5 U/ml 等 5 条

代谢工程 Amphipathic peptidesLeech hyaluronidaseN-terminal engineeringPichia pastorisSignal peptidesVariable temperature control strategy Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115

Engineering Rhodosporidium toruloides with a membrane transporter facilitates production and separation of carotenoids and lipids in a bi-phasic culture

Applied Microbiology and Biotechnology · 2015 · 10.1007/s00253-015-7102-3 · 含路线图 · 有原文

核心问题:红冬孢酵母中类胡萝卜素和脂质均定位于细胞膜,导致产物收获与分离困难,传统提取方法步骤多、成本高且使用有机溶剂不环保。

关键发现:Pdr10菌株在双相培养基中总类胡萝卜素产量从野生型的1.9 μg/mg提高到2.9 μg/mg 等 6 条

代谢工程 ABC transporterCarotenoidsExtractionLipidsRhodosporidium toruloidesSeparation Rhodosporidium torulo... Saccharomyces cerevisiae Rhodosporidium torulo...

Metabolic flux analysis model for optimizing xylose conversion into ethanol by the natural C5-fermenting yeast Candida shehatae

Applied Microbiology and Biotechnology · 2016 · 10.1007/s00253-015-7085-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:木糖向乙醇转化过程中氧气的定量作用不明确,缺乏对Candida shehatae代谢通量分布和理论乙醇产率的系统描述,导致难以优化木糖发酵产乙醇。

关键发现:构建的Candida shehatae代谢模型包含137个代谢物和122个胞内反应,模型验证中生物量和CO2速率的平均二次偏差分别为3.5%和0.1% 等 7 条

代谢工程 Candida shehatae metabolismEthanol productionMetabolic flux analysisRatio oxygen/xylose Candida shehatae ATCC... Candida shehatae ATCC... Candida shehatae ATCC...

RNA binding protein Pub1p regulates glycerol production and stress tolerance by controlling Gpd1p activity during winemaking

Applied Microbiology and Biotechnology · 2016 · 10.1007/s00253-016-7340-z · 含路线图 · 有原文

核心问题:揭示RNA结合蛋白Pub1p在葡萄酒发酵过程中如何通过调控Gpd1p活性来影响甘油产量和酵母胁迫耐受性,并阐明其与TOR1/Sch9营养信号通路在寿命调控中的关系。

关键发现:pub1Δ突变体在第1天细胞内甘油含量比野生型高5倍,且整个发酵期间均维持较高水平 等 6 条

发酵工程 GlycerolGpd1pPeroxisomesPub1pSaccharomyces cerevisiaeTOR1/Sch9 nutrient signaling pathway 酿酒酵母 EC1118 酿酒酵母 EC1118 酿酒酵母 EC1118

Thraustochytrids as production organisms for docosahexaenoic acid (DHA), squalene, and carotenoids

Applied Microbiology and Biotechnology · 2017 · 10.1007/s00253-016-7498-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:综述破囊壶菌生产DHA、角鲨烯和类胡萝卜素的研究进展,分析工艺优化与菌株改良的现状和瓶颈。

关键发现:高产能破囊壶菌4天内细胞密度可达100 g/L以上(干重),脂质含量为细胞干重的50-70%,DHA占总脂肪酸30-70%。文献报道的最高DHA体积产率为7-8 g/L/d(Schizochytrium sp. S31在150 g/L CDW 等 4 条

代谢工程 AstaxanthinBiosynthesisDHAGenetic toolsProcess developmentSqualene Schizochytrium sp. S31 Aurantiochytrium lima... Thraustochytrids(通用)

Biotechnological production of limonene in microorganisms

Applied Microbiology and Biotechnology · 2017 · 10.1007/s00253-016-7337-7 · 含路线图 · 有原文

核心问题:柠檬烯目前主要作为柑橘汁工业的副产物获得,但产量和品质波动,且可能无法满足新型大宗应用(如生物材料、溶剂、燃料)的需求,因此需要开发微生物发酵生产柠檬烯的替代途径,并解决产量低和毒性等问题。

关键发现:['目前最高柠檬烯产量为E. coli中达到1.35 g/L(Willrodt et al. 2014)', '去除柠檬烯合酶转运肽可使酵母中柠檬烯产量提高4至8倍', '表达Alcanivorax borkumensis外排泵使E. coli柠檬烯产量提高30%', '使用邻苯二甲酸二丁酯覆...

代谢工程 BiomaterialLimoneneMetabolic engineeringMicrobial productionMonoterpeneToxicity Escherichia coli BLR(... Escherichia coli DH1 ... Escherichia coli DH1

Characterization of Clostridium ljungdahlii OTA1: a non-autotrophic hyper ethanol-producing strain

Applied Microbiology and Biotechnology · 2017 · 10.1007/s00253-016-7978-6 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析C. ljungdahlii自发突变株OTA1高产乙醇但丧失自养生长的遗传与代谢机制

关键发现:OTA1在混养培养基中乙醇产量为0.24 g/g,是WT(0.06 g/g)的4倍(摘要表述为2倍以上);乙酸产量为0.50 g/g,约为WT(0.83 g/g)的一半;异养条件下乙醇产量0.35 g/g vs WT 等 6 条

代谢工程 Acetyl-CoACarbon monoxide dehydrogenaseClostridium ljungdahliiEthanolWood-Ljungdahl pathway Clostridium ljungdahl... Clostridium ljungdahl... Clostridium ljungdahl...

Metabolically engineered Saccharomyces cerevisiae for enhanced isoamyl alcohol production

Applied Microbiology and Biotechnology · 2017 · 10.1007/s00253-016-7970-1 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解决酿酒酵母中异戊醇产量低、副产物(异丁醇和2-甲基-1-丁醇)大量生成的问题,通过重建亮氨酸生物合成途径耦合Ehrlich降解途径并结合线粒体区室化与转运蛋白工程,实现异戊醇的高效生产。

关键发现:最优菌株MC5a(染色体整合亮氨酸途径+质粒表达ARO10/ADH7)在摇管条件下异戊醇产量达467.83 mg/L,同时异丁醇438.59 mg/L、2-甲基-1-丁醇181.70 mg/L。进一步过表达OAC1后,MC5b菌株异戊醇产量提高至561.21 mg/L,异丁醇降至321.64 ...

代谢工程 2-isopropylmalate transporterEhrlich degradation pathwayIsoamyl alcoholLeucine biosynthetic pathwayPathway assemblySaccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Genome-guided exploration of metabolic features of Streptomyces peucetius ATCC 27952: past, current, and prospect

Applied Microbiology and Biotechnology · 2018 · 10.1007/s00253-018-8957-x · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析Streptomyces peucetius ATCC 27952的完整基因组,系统挖掘其次级代谢产物生物合成基因簇和生物催化酶资源,为菌株代谢工程改造和生物催化应用提供基因组学基础。

关键发现:基因组大小8,023,114 bp,G+C含量70.6%,约87%为蛋白编码区,包含7187个蛋白编码基因、18个rRNA、66个tRNAs和3个非编码RNA 等 9 条

代谢工程 Cytochrome P450Genome explorationGenome miningMethyltransferaseRegulatory genesStreptomyces peucetius ATCC 27952 Streptomyces peucetiu... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...