核心问题：地衣芽孢杆菌WX-02利用甘油作为唯一碳源的能力较弱，导致γ-聚谷氨酸（γ-PGA）产量不高，需要解析其甘油代谢途径并进行代谢工程改造以提高甘油利用效率和γ-PGA产量。
关键发现：基因敲除实验表明ΔglpK和ΔglpD突变株在好氧和厌氧条件下均不能利用甘油，而ΔgldA1、ΔgldA2和ΔdhaK突变株生长正常，说明GlpK途径是唯一功能性甘油分解途径。用P43、PytzE和PbacA启动子替换glpFK天然启动子后，突变株WX02-P43glpFK、WX02-Pytz...
核心问题：Oenococcus oeni在葡萄酒高乙醇浓度下苹果酸乳酸发酵（MLF）易停滞、不可靠的问题
关键发现：连续培养290天，乙醇浓度从0逐步升至15% (v/v)，生长速率从0.10 h⁻¹降至0.05 h⁻¹ 等 6 条
核心问题：解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)代谢工程中传统基因操作工具（URA blast、Cre/LoxP、TALENs等）效率低、耗时长，难以满足高效、高通量基因组编辑的需求。
关键发现：过表达ACC1和DGA1使脂质含量达41.4%（亲本株的4.7倍），引入醛脱氢酶基因后脂质含量最高达90% 等 12 条
核心问题：如何利用酵母高效生物转化富含果胶的农业工业残留物，主要挑战包括酵母对水解液中D-半乳糖醛酸和L-阿拉伯糖等主要糖类的天然利用能力不足、碳代谢物阻遏效应以及乙酸、甲醇、重金属等抑制物的毒性作用。
关键发现：果胶占残留物干重的12–35%，D-半乳糖醛酸约占果胶重量的70%。甜菜浆果胶乙酰化程度达10–20%，柑橘类为3%，苹果为4% 等 4 条
核心问题：解析Pseudomonas putida GS1对单萜类化合物高耐受性的分子机制，并探究该机制对单萜生物转化过程的影响。
关键发现：['野生型P. putida GS1可耐受200 mM的烃类单萜（月桂烯、α-萜品烯、γ-萜品烯）和100 mM的酯类单萜（香叶醇乙酸酯、甲酸香叶酯、α-萜品醇乙酸酯），生长不受明显影响。', '马鞭草酮（35 mM）、α-松油醇（60 mM）和4-萜品醇（80 mM）对P. putida G... 等 2 条
核心问题：MK-7的氧化活性对微生物自身的积累产生抑制作用，限制了其在工业化生产中的产量，需要提高底盘细胞对维生素K的耐受性。
关键发现：BS012对VK3的耐受浓度从6.0 mg/L提高到60.0 mg/L 等 7 条
核心问题：红光照条件下盐生杜氏藻（Dunaliella salina）中类胡萝卜素合成的调控机制尚不清楚；本研究旨在解析新型转录因子DsGATA1在红光下调控类胡萝卜素合成的分子机制。
关键发现：DsGATA1基因CDS长1080 bp，编码360个氨基酸。过表达株OE1、OE2、OE3中DsGATA1表达量分别为野生型的6.3、2.3、3.6倍 等 10 条
核心问题：酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）不能利用木糖，需要构建重组菌株并研究不同碳源共底物对木糖利用的影响
关键发现：在复杂培养基中木糖消耗速率（0.41 g L⁻¹ h⁻¹）比确定培养基（0.15 g L⁻¹ h⁻¹）高两倍以上 等 5 条
核心问题：解析酿酒酵母高乙醇耐受性的遗传决定因素及毒性机制，并探讨提高工业酵母乙醇耐受性的策略。
关键发现：已有超过200个基因被鉴定与乙醇耐受性相关 等 7 条
核心问题：鉴定Blakeslea trispora中参与胡萝卜素合成和交配的基因，以及交配过程中基因表达调控的机制。
关键发现：交配培养中β-胡萝卜素含量最高约8 mg/g干重，是单培养平均值的40倍 等 4 条
核心问题：在Pichia pastoris中异源表达Trametes versicolor的laccase基因lcc1，以获得有活性的重组漆酶，用于生物漂白和废物处理等应用
关键发现：RNA-PCR获得1585 bp的lcc1 cDNA，编码498 aa漆酶和22 aa信号肽。在P. pastoris中表达，天然信号肽构建体活性比α-factor分泌信号构建体高7倍 等 5 条
核心问题：酿酒酵母不能利用或转运纤维二糖，需表达分泌具有葡萄糖耐受性的β-葡萄糖苷酶，以实现纤维素同步糖化发酵（SSF）生产燃料乙醇。
关键发现：在酿酒酵母中，含adh1启动子和蔗糖酶（Suc2）分泌信号的重组菌株pVBG-D活性最高，全细胞β-葡萄糖苷酶活性为298 μU/ml，裂解液为340 μU/ml 等 3 条
核心问题：蓝桉（Eucalyptus globulus）再生和遗传转化困难，阻碍了利用基因工程改良这一重要的纸浆用经济林木；需要建立高效转化方法并导入耐盐基因，以扩大其可种植区域。
关键发现：['改良MS培养基（5 mM NH4+，15 mM NO3-）添加1.0 mg/L zeatin和0.05 mg/L NAA时，下胚轴芽再生频率最高达60%（12/20）', '带茎尖下胚轴的转化频率最高为7.4%（17/230），平均3.98%（48/1206），是不带茎尖下胚轴（0.33%... 等 3 条
核心问题：在类胡萝卜素池有限的白色玉米品系中，通过表达拟南芥OR基因促进类胡萝卜素积累，并明确AtOR在不同遗传背景下增强类胡萝卜素积累的条件和机制。
关键发现：['在白色玉米M37W中过表达AtOR，最佳系OR2在30 DAP时总类胡萝卜素含量约为25 μg/g DW，比野生型提高32倍，且不改变类胡萝卜素组成。', 'OR2中玉米黄质、花药黄质、叶黄素、紫黄质分别增加约30倍、170倍、23倍和15倍。', '将OR2与低酮类胡萝卜素系KETO1杂... 等 2 条
核心问题：利用本氏烟草瞬时表达系统高效生产萜类化合物，克服天然产物来源有限和化学合成困难的问题。
关键发现：在本氏烟草中瞬时表达成功生产多种萜类：costunolide通过线粒体靶向产量达60 ng/g FW，比胞质提高15倍 等 14 条
核心问题：解析转基因植物中不寻常单烯脂肪酸（unusual monoenoic fatty acids）产量普遍低于内源物种的原因，寻找限制其在油料种子中高效积累的关键因素。
关键发现：在强种子特异性启动子控制下，三种异源酰基-ACP去饱和酶在拟南芥种子中的不寻常单烯脂肪酸积累量仅为1-15%：Δ4 16:0-ACP去饱和酶产物（16:1Δ4和18:1Δ6）占0.5-1% 等 4 条
核心问题：确定提高叶绿体中异源黄素氧还蛋白（Fld）表达量是否能够进一步增强转基因烟草的光合性能和胁迫耐受性，以及过高表达是否会产生不利影响。
关键发现：获得的烟草株系Fld水平为0.3、1.3、2.6和10.8 μmol m^-2，内源Fd约3 μmol m^-2。当Fld为1.3-2.6 μmol m^-2时，叶绿素a含量较野生型增加9-19%，类胡萝卜素增加 等 5 条
核心问题：解析Ludisia discolor的基因组结构、重复序列和基因注释，明确其在兰科中的系统发育位置，并揭示与药用代谢物合成和环境适应性相关的进化特征。
关键发现：基因组组装大小为696.37 Mb，scaffold N50为33.14 Mb，BUSCO完整性为94.55%，91.86%序列锚定到22条染色体 等 6 条
核心问题：鉴定并解析Fusarium fujikuroi中carS基因的功能，阐明其作为类胡萝卜素生物合成负调控因子的分子机制，并探索其调控网络。
关键发现：carS基因编码547个氨基酸的RING-finger蛋白，与F. oxysporum直系同源物在DNA和蛋白水平分别有93%和95%的一致性。在6个独立carS突变体中鉴定到不同等位基因突变，如SG1(Trp169→amber)、SF4(Trp169→opal)、SG36(Gly330→As...
核心问题：明确RpoS在最小培养基（葡萄糖M63）中的全局基因表达调控作用，特别是与丰富培养基（LB）条件下的差异，以及其在慢生长/营养限制环境下的调控网络。
关键发现：在葡萄糖最小培养基中，指数期有200个基因受RpoS调控（88个正调控，112个负调控，FDR=1.6%），稳定期225个（203个正调控，22个负调控，FDR=0.6%），两个时期仅有48个共同基因。鞭毛基因如flhDC在指数期MER为-410/-172，稳定期为-160/-50 等 6 条