共 167 篇

A tandem array of UDP-glycosyltransferases from the UGT73C subfamily glycosylate sapogenins, forming a spectrum of mono-and bisdesmosidic saponins

Plant Molecular Biology · 2018 · 10.1007/s11103-018-0723-z · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定 Barbarea vulgaris 中负责皂苷多样化糖基化的 UDP-糖基转移酶,解释单糖基和双糖基皂苷的形成机制,并探索相关 UGT73C 亚家族的基因组组织与进化。

关键发现:筛选了 20 个 UGT 基因,其中 6 个(BvUGT73C21、22、23、25、26、27)均能以 10 μM 皂苷元(齐墩果酸、常春藤皂苷元)为底物进行糖基化,但产物谱不同:BvUGT73C21/26 仅糖基化 3 位 等 5 条

代谢工程 Barbarea vulgarisBisdesmosidic triterpenoid saponinsEvolution of plant chemical defense compoundsTandem repeatUDP-glucosyltransferases Escherichia coli (异源表... Escherichia coli; Nic... Escherichia coli; Nic...

Metabolic alteration of Catharanthus roseus cell suspension cultures overexpressing geraniol synthase in the plastids or cytosol

Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) · 2018 · 10.1007/s11240-018-1398-5 · 含路线图 · 有原文

核心问题:长春花细胞培养中香叶醇前体供应不足限制单萜吲哚生物碱(TIA)合成,试图通过在不同亚细胞区室过表达香叶醇合酶(CrGES)来增强前体供应并促进TIA积累。

关键发现:成功建立质体和胞质表达CrGES的转基因长春花细胞系 等 5 条

代谢工程 AlkaloidsCatharanthus roseusGeraniol synthaseMetabolic engineeringMetabolomicsPlant cell culture Catharanthus roseus c... Catharanthus roseus c...

Extending our tools and resources in the non-conventional industrial yeast Xanthophyllomyces dendrorhous through the application of metabolite profiling methodologies

Metabolomics · 2018 · 10.1007/s11306-017-1313-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:开发适用于非常规工业酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的代谢物谱分析方法,以支持其作为高价值萜类化合物生产平台的菌株改良和系统代谢工程研究。

关键发现:所有淬灭方法回收率在0.77–1.22之间,其中NaCl洗涤法检出的目标化合物数量最多(>90个) 等 2 条

代谢工程 CarotenoidsGC-MSMetabolite profilingXanthophyllomyces dendrorhous Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den...

Biotechnological approaches for artemisinin production in Artemisia

World Journal of Microbiology and Biotechnology · 2018 · 10.1007/s11274-018-2432-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:青蒿素及其衍生物在天然来源青蒿属植物中含量极低,化学合成不经济,急需通过生物技术手段提高其产量以满足全球抗疟疾需求。

关键发现:青蒿素在植物干重中的含量为0.1%-0.8%,最高可达1.5%;用0.1mg/L TDZ再生植株青蒿素含量为3.36μg/mg干重(比体外植株高2倍);COS上调ADS 等 4 条

代谢工程 ArtemisiaArtemisininBiotechnologyCell culturesHairy rootsTransgenics Artemisia annua Artemisia annua Artemisia annua

Rate-limiting steps in the Saccharomyces cerevisiae ergosterol pathway: towards improved ergosta-5,7-dien-3β-ol accumulation by metabolic engineering

World Journal of Microbiology and Biotechnology · 2018 · 10.1007/s11274-018-2440-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:通过代谢工程改造酿酒酵母麦角固醇生物合成途径,提高维生素D4前体麦角-5,7-二烯-3β-醇的积累效率。

关键发现:敲除erg5后,酿酒酵母BY4741菌株在YPD培养基中培养48小时,麦角-5,7-二烯-3β-醇产量达到4.12±0.06 mg/g DCW,占总游离甾醇的86.6% 等 5 条

代谢工程 Ergosta-5,7-dien-3β-olErgosterol synthesis pathwayRate-limiting stepsSaccharomyces cerevisiaeUpc2-1 Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Proteome analysis reveals global response to deletion of mrflbA in Monascus ruber<sup>S</sup>

The Journal of Microbiology · 2018 · 10.1007/s12275-018-7425-8 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明红曲霉中推定G蛋白α亚基调控因子mrflbA缺失后,在蛋白质组水平上引发的全局响应及其与菌丝自溶、色素和毒素产量降低等表型之间的关联

关键发现:2-DE分析发现ΔmrflbA菌株中178个蛋白点显著变化(111个上调,67个下调),其中82个点强度≥2.0,33个蛋白获得高置信度鉴定 等 5 条

蛋白质组学 Monascus rubercomparative proteomicsdevelopmentmodulationregulator of G protein a subunitsecondary metabolites Monascus ruber Monascus ruber Monascus ruber

The acyl-CoA binding protein affects Monascus pigment production in Monascus ruber CICC41233

3 Biotech · 2018 · 10.1007/s13205-018-1147-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究酰基辅酶A结合蛋白(ACBP)是否影响Monascus ruber CICC41233中红曲色素(MPs)的生产及其机制,并确定MrACBP对脂酰辅酶A的结合偏好。

关键发现:MST结合实验显示,MBP-MrACBP对myristoyl-CoA的Kd值为88.16 nM,对palmitoyl-CoA为136.07 nM,对octanoyl-CoA为270.9 nM,表明MrACBP对肉豆蔻酰辅酶A具有最高亲和力。在M. ruber ACBP5中,6天后总红曲色素、水... 等 2 条

代谢工程 Acyl-coenzyme A binding proteinMicroscale thermophoresis binding assayMonascus pigmentsMonascus ruberMyristoyl-CoA Monascus ruber CICC41233 Escherichia coli Rose... Monascus ruber CICC41233

In Vivo Platforms for Terpenoid Overproduction and the Generation of Chemical Diversity

Methods in Enzymology · 2018 · 10.1016/bs.mie.2018.04.025 · 含路线图 · 有原文

核心问题:萜类化合物天然产量低、成本高,以及新萜类化合物发现效率低的问题

关键发现:体外重构动力学分析表明,单独提高Idi浓度可17倍增加法尼烯初始速率,协同提高Idi、ERG13、ERG8和AFS可使产量提高5倍 等 3 条

代谢工程/合成生物学 MVA pathwayastaxanthinfarnesenegenome miningin vitro reconstitutionlycopene E. coli BL21(DE3) E. coli K12 MG1655(DE3) E. coli BL21(DE3)

Identification of Enzymes Involved in Sesterterpene Biosynthesis in Marine Fungi

Methods in Enzymology · 2018 · 10.1016/bs.mie.2018.04.023 · 含路线图 · 有原文

核心问题:海洋真菌中参与 C25 骨架 sesterterpene(如 ophiobolin)生物合成的酶及其基因的鉴定方法

关键发现:Aspergillus ustus 094102 基因组大小为 40.09 Mb,由 301 个 contigs 和 174 个 scaffolds 组装而成,预测含 13,982 个蛋白编码基因,通过 antiSMASH 预测到 11 个萜烯基因簇,并利用保守基序(DDXX(D/E) 和 N... 等 4 条

合成生物学 GC-MSGene knockoutGenome miningHPLCMarine fungiOphiobolin Aspergillus ustus 094102 Aspergillus ustus 094102 Aspergillus ustus 094102

Characterization of santalene synthases using an inorganic pyrophosphatase coupled colorimetric assay

Analytical Biochemistry · 2018 · 10.1016/j.ab.2018.02.002 · 含路线图 · 有原文

核心问题:现有GC-MS等方法表征萜烯合酶活性存在耗时长、成本高、需标准品、低浓度产物难以定量等问题,且文献中檀香烯合酶(如SaSSy)的动力学参数存在巨大争议(kcat相差达40倍)。

关键发现:建立了焦磷酸标准曲线(1-60 μM),斜率是磷酸标准曲线的2倍 等 7 条

代谢工程/酶学分析 Terpene synthaseTerpenoidcolorimetric assayinorganic pyrophosphatasepyrophosphatesantalene synthase Escherichia coli BL21... Escherichia coli Arct... Escherichia coli Arct...

Molecular cloning and functional characterization of three terpene synthases from unripe fruit of black pepper (Piper nigrum)

Archives of Biochemistry and Biophysics · 2018 · 10.1016/j.abb.2017.12.011 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定黑胡椒未成熟果实中负责风味相关倍半萜生物合成的萜烯合酶基因

关键发现:转录组获得49,413,668条clean reads,组装出66,787个unigenes,其中三个全长TPS。PnTPS1(石竹烯合酶)体外主产物β-caryophyllene占97%,humulene占3% 等 4 条

代谢工程 Piper nigrum二代测序大牻牛儿烯D合酶杜松醇/杜松烯合酶石竹烯合酶黑胡椒 Escherichia coli Rose... 酿酒酵母EPY300 Escherichia coli Rose...

Engineered Biosynthesis of Bacteriochlorophyll gF in Rhodobacter sphaeroides

Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics · 2018 · 10.1016/j.bbabio.2018.02.006 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在异源宿主中工程化合成嗜热杆菌的独特光合色素BChl gF,为在紫色细菌中组装最简单的I型光反应中心(HbRC)提供前提条件。

关键发现:在ΔbchF/ΔbciA/bchXYZ^Bv菌株中检测到BChl gP(m/z 等 4 条

代谢工程 Heliobacteriabacteriochlorophyll gbiosynthetic pathwayphotosynthesispurple bacteria Rhodobacter sphaeroides Rhodobacter sphaeroides Rhodobacter sphaeroides

Biosynthetic machinery for \mathbf{C}_{25},\mathbf{C}_{25}-diether archaeal lipids from the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix

Biochemical and Biophysical Research Communications · 2018 · 10.1016/j.bbrc.2018.02.028 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析超嗜热古菌Aeropyrum pernix中C25,C25-二醚古菌脂质(extended diether lipids)生物合成所涉及的酶,并实现在大肠杆菌中的异源重构。

关键发现:APE_0621催化[14C]GFPP与G1P生成GFGP(产物Rf=0.77),而S. solfataricus GGGP合酶不能利用GFPP;APE_0159以GFPP和GFGP为最适底物,产物Rf=0.33,而用GGPP/GFGP或GFPP/GGGP时产物量较低;在E. coli中表达G... 等 3 条

合成生物学 ArchaeaArchaeal lipidHyperthermophileIsoprenoidPhenyltransferasePhospholipid Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Production of xylitol by expressing xylitol dehydrogenase and alcohol dehydrogenase from Gluconobacter thailandicus and co-biotransformation of whole cells

Bioresource Technology · 2018 · 10.1016/j.biortech.2018.02.095 · 含路线图 · 有原文

核心问题:D-阿拉伯醇生物转化生产木糖醇过程中,XDH需要NADH作为辅因子,但重组菌株无法有效再生NADH,需添加外源NADH,导致成本高、效率低。

关键发现:['克隆的xdh和adh基因长度分别为0.8 kb和0.4 kb,编码266和134个氨基酸 等 6 条

代谢工程 Alcohol dehydrogenaseCo-biotransformationGluconobacter thailandicusXylitolXylitol dehydrogenase E. coli BL21(DE3) E. coli BL21(DE3) G. thailandicus CGMCC...

Enhancing oleanolic acid production in engineered Saccharomyces cerevisiae

Bioresource Technology · 2018 · 10.1016/j.biortech.2018.02.096 · 含路线图 · 有原文

核心问题:酿酒酵母中齐墩果酸生物合成产量低,难以满足工业化生产需求。

关键发现:初始菌株OA01齐墩果酸产量仅2.5±0.2 mg/L 等 6 条

代谢工程 Galactose metabolic networkOleanolic acidOxidation-reduction system 酿酒酵母 (Saccharomyces c... 酿酒酵母 (Saccharomyces c... 酿酒酵母 (Saccharomyces c...

Combined effect of inorganic salts with calcium peroxide pretreatment for kenaf core biomass and their utilization for 2,3-butanediol production

Bioresource Technology · 2018 · 10.1016/j.biortech.2018.02.115 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何高效利用红麻芯生物质生产2,3-丁二醇,解决预处理过程中木质素去除不彻底和糖组分流失的问题

关键发现:最大葡萄糖产率98%(30 FPU/g酶解),水解产率80.5% 等 7 条

发酵工程 2,3-Butanediol productionCalcium peroxide pretreatmentEnzymatic hydrolysisKenaf core powderKlebsiella pneumoniae KMK05 Klebsiella pneumoniae... Trichoderma reesei

High-efficient production of biobutanol by a novel Clostridium sp. strain WST with uncontrolled pH strategy

Bioresource Technology · 2018 · 10.1016/j.biortech.2018.02.077 · 含路线图 · 有原文

核心问题:生物丁醇生产中产量低、依赖pH控制、副产物多等问题阻碍工业化,需要开发高产、低成本的新菌株和发酵策略。

关键发现:利用30 g/L葡萄糖时,丁醇产量达16.62 g/L,产率0.54 g/g,生物氢12.08 L/L,最大OD600为8.95 等 3 条

发酵工程 ButanolClostridium sp.High yieldMicrobial fermentationpH control Clostridium sp. WST Clostridium sp. WST

Biosynthesis and Activity of Prenylated FMN Cofactors

Cell Chemical Biology · 2018 · 10.1016/j.chembiol.2018.02.007 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析异戊二烯化FMN(prFMN)辅因子在E. coli中的生物合成来源(特别是DMAP的产生途径)、游离prFMN的生化特性及其对UbiD家族脱羧酶的激活机制。

关键发现:系统发育分析显示UbiX家族包含超过9000个序列,分为5个主要簇 等 9 条

合成生物学 DMAP生物合成UbiD脱羧酶UbiX家族异戊二烯化FMN辅因子辅因子表征 E. coli BL21(DE3) E. coli BL21(DE3) E. coli BL21(DE3)

Characterization of two styrene monooxygenases from marine microbes

酶与微生物技术 · 2018 · 10.1016/j.enzmictec.2018.02.001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:已有的苯乙烯单加氧酶(SMO)来源有限,主要来自假单胞菌和红球菌,缺乏来自海洋微生物的SMO,需要挖掘新酶以扩大酶工具箱。

关键发现:两个SMO(PaSMO和MiSMO)最适反应条件均为30°C和pH 等 3 条

酶工程 不对称合成全细胞生物催化剂单加氧酶氧化环氧化 Escherichia coli BL21...

Roles of the Skn7 response regulator in stress resistance, cell wall integrity and GA biosynthesis in Ganoderma lucidum

Fungal Genetics and Biology · 2018 · 10.1016/j.fgb.2018.03.002 · 含路线图 · 有原文

核心问题:灵芝中Skn7响应调节因子在应激抗性、细胞壁完整性和灵芝酸(GA)生物合成中的功能及其调控机制尚未明确,尤其是在大型担子菌中缺乏研究。

关键发现:获得两个沉默菌株Skn7i-5和Skn7i-7,Skn7表达量分别降低88%和90% 等 10 条

代谢工程/合成生物学 Cell wall integrityGancoderic acidsGanoderma lucidumReactive oxygen species Ganoderma lucidum Ganoderma lucidum Ganoderma lucidum