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Engineered Biosynthesis of Bacteriochlorophyll gF in Rhodobacter sphaeroides

作者
Marcia Ortega-Ramos, Daniel P. Canniffe, Matthew Radle, C. Neil Hunter, Donald A. Bryant, John H. Golbeck
单位
Department of Biochemistry and Molecular Biology, The Pennsylvania State University; Department of Chemistry, The Pennsylvania State University; Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Sheffield; Department of Chemistry and Biochemistry, Montana State University
杂志
Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics(2018)
DOI
10.1016/j.bbabio.2018.02.006
所属领域
代谢工程
关键词
Heliobacteriabacteriochlorophyll gbiosynthetic pathwayphotosynthesispurple bacteria
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解决的核心问题

在异源宿主中工程化合成嗜热杆菌的独特光合色素BChl gF,为在紫色细菌中组装最简单的I型光反应中心(HbRC)提供前提条件。

研究策略

以Rhodobacter sphaeroides为底盘,先构建产生BChl bP的菌株(ΔbciA/bchXYZ^Bv),再依次删除bchF(阻断C3-乙烯基水合)、crtE(减少C20 GGPP供应),并用来自Hba. modesticaldum的bchG替换内源bchG,最后删除bchP(防止法尼基尾巴还原),从而将内源BChl aP生物合成途径和类异戊二烯途径改造成BChl gF合成途径。

研究路线图

100%
研究问题:异源合成BChl gF
底盘构建:Rba. sphaeroides + ΔbciA/bchXYZ^Bv
敲除bchF:阻断C3-乙烯基水合
敲除crtE:减少C20 GGPP供应
替换bchG^Hm:法尼基酯化偏好
敲除bchP:保留法尼基尾巴
关键验证:BChl gP检测 (m/z 893.6, 752nm)
结果:BChl gF与天然色素一致 (m/z 819.5)
结论:HbRC组装平台
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核心内容

该研究以紫色光合细菌Rhodobacter sphaeroides为底盘,通过系统改造细菌叶绿素和类异戊二烯两条生物合成途径,首次实现了嗜热杆菌独特光合色素BChl gF的异源工程化合成。研究中依次敲除bciA、bchF和crtE基因,引入来自Heliobacterium modesticaldum的bchG替换内源同源基因,并删除bchP,逐步将内源BChl aP途径重定向为BChl gF合成途径。通过质谱和吸收光谱验证,最终菌株产生的色素与天然BChl gF保留时间和吸收峰完全一致,同时检测到少量8^1-OH-Chl aF副产物。中间实验还证明BchP能够还原法尼基尾巴,且敲除crtE可显著减少C20侧链供应,使WT株仅积累约20%的BChl aP。该工程菌株虽无法光合自养生长,但为在紫色细菌中组装来自Heliobacterium的最简单I型光反应中心提供了关键前体色素平台,也为研究色素-蛋白复合物组装机制和拓展光能捕获范围奠定了基础。

创新点

首次在紫色光合细菌中实现工程化合成BChl gF;通过系统敲除和替换bchF、crtE、bchG、bchP四个基因,将四吡咯和类异戊二烯途径同时改造;证明BchP能还原法尼基尾巴;构建的菌株可作为组装最简单光反应中心的平台。

研究对象(7)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Rhodobacter sphaeroides 细菌叶绿素生物合成途径 bchF BchF(3-乙烯基-细菌脱镁叶绿酸a水合酶) 催化 催化C3-乙烯基的水合;删除后导致3-乙烯基-细菌脱镁叶绿酸a(3V-BChlide a)积累,在BChl b背景下产生BChl gP。
Rhodobacter sphaeroides 细菌叶绿素生物合成途径 bchXYZ 叶绿素ide a氧化还原酶(COR) 催化 来自Blastochloris viridis的bchXYZ编码CORb,用于生产BChl b;CORb将8V-Chlide a直接还原为BChlide g。
Rhodobacter sphaeroides 细菌叶绿素生物合成途径 bciA 8-乙烯基还原酶(8VR) 催化 删除以消除8-乙烯基还原活性,使C8位保留乙烯基/亚乙基,是产生BChl b/g的必要条件。
Rhodobacter sphaeroides 类异戊二烯生物合成途径 crtE 香叶基香叶基焦磷酸合酶(GGPP合酶) 催化 催化FPP加IPP生成GGPP;删除后减少C20异戊二烯供应,但仍有少量BChl aP/BChl gP产生,说明存在替代途径。
Rhodobacter sphaeroides 细菌叶绿素生物合成途径 bchG^Rs 细菌叶绿素合酶(BchG) 催化 内源BchG优先酯化GGPP(C20);被来自Hba. modesticaldum的bchG替换。
Heliobacterium modesticaldum 细菌叶绿素生物合成途径 bchG^Hm 细菌叶绿素合酶(BchG) 催化 来源于Hba. modesticaldum,与Rba. sphaeroides BchG仅有39%同源性,优先酯化FPP(C15),也能使用C20底物。
Rhodobacter sphaeroides 细菌叶绿素生物合成途径 bchP 香叶基香叶基还原酶(BchP) 催化 催化C20香叶基香叶基尾巴逐步还原为植基(phytyl);也能还原C15法尼基尾巴,删除后获得保留法尼基的BChl gF。

关键发现

  1. 在ΔbchF/ΔbciA/bchXYZ^Bv菌株中检测到BChl gP(m/z
  2. 6,吸收峰752 nm);敲除crtE后WT积累BChl aTHF(m/z 841)和约20%的BChl aP,但ΔcrtE/ΔbchF/ΔbciA/bchXYZ^Bv仍产生BChl gP;用bchG^Hm替换内源bchG后,WT中BChl aP产量仅为野生型的约15%,在ΔcrtE/ΔbchF/ΔbciA/bchXYZ^Bv背景下产生BChl gTHF(m/z
  3. 5);再敲除bchP后,最终菌株ΔbchP/ΔcrtE/ΔbchF/ΔbciA/bchXYZ^Bv/bchG^Hm产生与Hba. modesticaldum天然BChl gF(m/z
  4. 5)保留时间和吸收光谱完全一致的色素,同时检测到少量8^1-OH-Chl aF。

研究结论

通过联合改造Rba. sphaeroides的细菌叶绿素和类异戊二烯生物合成途径,成功实现了BChl gF的异源生产。该菌株无法光合自养生长,但为后续组装Heliobacterium的I型反应中心(HbRC)奠定了关键基础,也为研究色素-蛋白复合物组装和拓宽光能捕获范围提供了新平台。