共 480 篇
核心问题:克隆并表征地衣芽孢杆菌的meso-2,3-丁二醇脱氢酶(B/BDH),解析其酶学性质,为定向改造地衣芽孢杆菌生产手性2,3-丁二醇提供理论依据。
关键发现:B/BDH在NADH存在下催化双乙酰还原为(3S)-乙偶姻(97.3% ee),进一步还原为(2S,3S)-2,3-丁二醇(97.3% ee, 96.5% de)。对双乙酰还原和2,3-丁二醇氧化的最适pH分别为5.0和10.0
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代谢工程
Bacillus licheniformisCharacterizationExpressionmeso-2,3-Butanediol dehydrogenase
Bacillus licheniformis
Escherichia coli BL21...
核心问题:提高甘油脱水酶(GDHt)的活性和表达量,并探究其再激活因子(GDHtR)与配体的结合模式,以降低酶法生产1,3-丙二醇和3-羟基丙醛的成本。
关键发现:克隆的gldABC基因全长2735 bp,α/β/γ亚基分别编码1668/585/426 bp。胞外表达酶活为6.8 U/mg,胞内为3.2 U/mg,分别约为野生型的6倍和3倍。以甘油为底物时,1 min内G/P比值2.45,10 min后降至0.53,表明甘油导致酶快速失活。GDHt的Co...
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代谢工程
Cellular and extracellular expressionGDHtGDHtRMolecular DOCKMolecular chaperone
Klebsiella pneumoniae...
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:α-humulene合酶是zerumbone生物合成中的关键酶,但其关键酶学性质(温度、pH、动力学参数)此前未被表征,限制了其生物催化生产α-humulene的应用。
关键发现:重组α-humulene合酶以FDP为底物时产物为α-humulene(~94.5%)和β-caryophyllene(~5.5%)
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代谢工程
Enzyme activityHumulenePurificationRecombinant expressionSesquiterpeneTerpene synthase
Escherichia coli BL21...
核心问题:鉴定α-蒎烯氧化物裂解酶(Prα-POL)的编码基因,并在大肠杆菌中实现重组表达,以提高异诺瓦醛(isonovalal)的生物转化生产效率。
关键发现:Prα-POL基因长度为609 bp,编码202个氨基酸,预测蛋白分子量23.7 kDa,理论等电点5.23
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代谢工程
Alpha-pinene oxide lyaseBioconversionIsonovalalOrphan enzymePseudomonas
Pseudomonas rhodesiae...
Escherichia coli BL21...
Pseudomonas rhodesiae...
核心问题:鉴定氧化葡萄糖杆菌中的两个旧黄酶同源物(GYE1和GYE2),并研究其对柠檬醛的加氢还原能力,特别是立体选择性还原柠檬醛顺式异构体(neral)为香茅醛。
关键发现:GYE1和GYE2与酵母OYE1的序列一致性分别为30%和31%,相似性分别为43.5%和44%
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生物催化
CitralCitronellalGluconobacter oxydansNADH FMN- oxidoreductaseOld yellow enzyme
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:已有的木糖还原酶(XR)催化效率普遍不高,且多数C. tropicalis来源的XR为NADPH依赖型,限制了以木糖为底物发酵生产木糖醇的效率;需要筛选并表征具有高催化效率和合适辅酶特异性的新型XR。
关键发现:自C. tropicalis SCTCC 300249克隆到975 bp的xyl1基因(GenBank登录号EU273285),在E. coli BL21(DE3)中可实现溶表达,约占细胞总蛋白的50%
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发酵工程
Candida tropicaliscatalytic efficiencycoenzyme specificityxylose reductase
Candida tropicalis SC...
Escherichia coli BL21...
Saccharomyces cerevis...
核心问题:高效生物转化主要人参皂苷(Rb1、Rb2、Rc、Rd)为稀有人参皂苷F2,并表征相关β-葡萄糖苷酶。
关键发现:BglAch基因长1260bp,编码419个氨基酸,理论分子量45.8kDa,SDS-PAGE表观分子量43.7kDa
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代谢工程
Arthrobacter chlorophenolicusβ-葡萄糖苷酶生物转化稀有人参皂苷重组酶
Arthrobacter chloroph...
Escherichia coli BL21...
核心问题:解析奇楠种质(Aquilaria sinensis)中倍半萜合酶基因AsSS15的分子特征与创伤诱导表达特性,阐明其在沉香倍半萜生物合成中的作用。
关键发现:AsSS15基因全长1812 bp,编码603个氨基酸,蛋白分子量69.16 kDa,等电点5.92
等 8 条
代谢工程
Chi-Nan germplasmGene cloningInduction characteristicsProkaryotic expressionSesquiterpene synthase
Escherichia coli BL21...
核心问题:虎奶菇(Lignosus rhinocerus)作为传统药用真菌,其次生代谢产物研究不足,且野生资源稀缺。需要从基因组中挖掘未表征的倍半萜合酶基因,通过功能表征揭示其产物结构,以理解其生物活性的化学基础。
关键发现:虎奶菇TM02基因组大小为34.3 Mb,编码10,742个推定基因
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合成生物学
Heterologous expressionLignosus rhinocerus (Cooke) RyvardenSesquiterpene synthaseTiger Milk Mushroom
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:首次鉴定出一个以法尼基二磷酸为底物主要产生δ-cadinol的倍半萜合酶,该酶可能参与担子菌Boreostereum vibrans中boreovibrins的生物合成;此前尚无主要形成δ-cadinol的合酶报道。
关键发现:克隆的BvCS基因开放阅读框长1182 bp
等 3 条
合成生物学
BiosynthesisDelta-cadinolFungiGC-MSSesquiterpene synthase
Escherichia coli BL21...
核心问题:类胡萝卜素脱氢酶(特别是八氢番茄红素脱氢酶)是膜结合酶,难以在体外检测活性和纯化;同时不同来源的酶催化步数不同,需要有效的异源表达和功能表征体系。本文旨在建立通过光合细菌Rhodobacter capsulatus进行功能互补表达和从过表达菌株纯化CrtI蛋白的方法。
关键发现:R. capsulatus CrtI催化八氢番茄红素三步脱氢生成神经孢菌素
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代谢工程
光合细菌八氢番茄红素脱氢酶异源表达类胡萝卜素生物合成蛋白纯化
Rhodobacter capsulatu...
Rhodobacter capsulatu...
Rhodobacter capsulatu...
核心问题:在E. coli中直接表达具有催化活性的菠菜乙醇酸氧化酶(GAO),避免此前融合蛋白不溶或截短失活的问题,以获得足够量的活性酶用于结构与功能研究
关键发现:GAO在大肠杆菌中表达量约占可溶蛋白的1%,比酿酒酵母系统高约15倍
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酶工程 / 蛋白质表达
E. coliEnzyme expressionExpression comparisonGlycolate oxidase
Escherichia coli BL21...
Saccharomyces cerevisiae
核心问题:在E. coli中利用T7 RNA聚合酶系统表达哺乳动物肝糖酵解/糖异生酶时,可溶活性酶回收率极低(通常小于1 mg/L培养物),大量蛋白以无活性或包涵体形式累积。
关键发现:在37°C诱导4h时,6PF-2-K/Fru-2,6-P2ase总蛋白积累达45 mg/L,但活性酶仅占总表达蛋白的0.6%-0.8%(约0.5 mg/L)
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蛋白质表达/代谢工程
6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphataseE. coli expressionT7 RNA polymerase systemactive enzyme recoveryfructose-1,6-bisphosphataseglucokinase
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:解析多重产物倍半萜合酶δ-selinene synthase与γ-humulene synthase通过两个DDxxD基序等结构元件产生数十种倍半萜烯产物的分子基础,并通过定点突变和截短改变产物形成谱。
关键发现:γ-humulene synthase(γHS)和δ-selinene synthase(δSS)分别产生>50种和>30种倍半萜烯。γHS第一个DDxxD基序第一个天冬氨酸D343突变为丙氨酸(D343A)后,烯烃产物kcat降低>3000倍,无法获得可靠动力学数据
等 2 条
合成生物学
Aspartate-rich motifFarnesyl diphosphate cyclizationNerolidyl diphosphate cyclizationSesquiterpene cyclasesSite-directed mutagenesis
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:鉴定和表征参与platensimycin(PTM)和platencin(PTN)生物合成的新型细菌二萜合酶(DTS),并建立系统的体内外研究方法。
关键发现:ΔptmT3突变完全消除PTM产生但不影响PTN产生
等 3 条
合成生物学
Streptomyces platensisbacterial diterpene synthasesditerpenoid biosynthesisplatencinplatensimycin
Streptomyces platensi...
Streptomyces platensi...
Streptomyces platensi...
核心问题:MEP途径中间体在生物样品中含量低且缺乏合适的内标,难以准确测定其浓度,需要开发灵敏、准确的定量方法。
关键发现:在E. coli BL21(DE3)中,MEP代谢物在生长5-6小时、OD600
等 10 条
代谢工程
Isoprenoid biosynthesisLC-MS/MSMetabolite quantificationMethylerythritol phosphate (MEP) pathwayStable isotope-labeled internal standards
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:如何生成并功能评价具有特定产物特异性的单萜合酶突变体,以满足合成生物学对高价值单萜的生产需求。
关键发现:野生型伪成熟酶R58催化产物中(-)-柠檬烯占96%
等 5 条
代谢工程/合成生物学
Enzyme engineeringKinetic analysisMonoterpene synthaseProtein purificationSite-directed mutagenesisSynthetic biology
Escherichia coli BL21...
核心问题:现有萜烯合酶产物分析流程繁琐、耗时长、通量低,无法满足大规模突变体文库的高通量功能表征需求,且定量能力有限。
关键发现:开发了单管GC-MS分析萜烯合酶的方法
等 7 条
代谢工程
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:难以直接测量细胞内异戊烯基二磷酸(IDP)及其异构体二甲基烯丙基二磷酸(DMADP)的浓度和比例,现有方法只能分别测定总量或单一物质,缺乏同时定量 IDP 和 DMADP 并计算比值的方法。
关键发现:体外平衡 DMADP/IDP 比为
等 9 条
代谢工程
Dimethylallyl diphosphate (DMADP)Isomerase equilibriumIsopentenyldiphosphate (IDP)IsoprenoidsRecombinant enzyme
Escherichia coli FM5
Escherichia coli FM5
Escherichia coli FM5
核心问题:现有GC-MS等方法表征萜烯合酶活性存在耗时长、成本高、需标准品、低浓度产物难以定量等问题,且文献中檀香烯合酶(如SaSSy)的动力学参数存在巨大争议(kcat相差达40倍)。
关键发现:建立了焦磷酸标准曲线(1-60 μM),斜率是磷酸标准曲线的2倍
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代谢工程/酶学分析
Terpene synthaseTerpenoidcolorimetric assayinorganic pyrophosphatasepyrophosphatesantalene synthase
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli Arct...
Escherichia coli Arct...