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Cloning and Characterization of the Gene Encoding Alpha-Pinene Oxide Lyase Enzyme (Prα-POL) from Pseudomonas rhodesiae CIP 107491 and Production of the Recombinant Protein in Escherichia coli

作者
Pascal Dubessay, Christian Larroche, Pierre Fontanille
DOI
10.1007/s12010-017-2685-z
所属领域
代谢工程
关键词
Alpha-pinene oxide lyaseBioconversionIsonovalalOrphan enzymePseudomonas
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解决的核心问题

鉴定α-蒎烯氧化物裂解酶(Prα-POL)的编码基因,并在大肠杆菌中实现重组表达,以提高异诺瓦醛(isonovalal)的生物转化生产效率。

研究策略

基于蛋白N端及内部肽段序列设计简并引物,通过PCR扩增部分基因片段;结合反向PCR(iPCR)和限制性酶切作图定位并克隆完整基因;构建pET28a载体在大肠杆菌BL21(DE3)中表达天然及His标签融合蛋白,并进行生物转化和酶动力学分析。

研究路线图

100%
研究问题:鉴定Prα-POL编码基因并在大肠杆菌中高效表达
策略:简并引物PCR扩增部分基因片段
关键改造:反向PCR+酶切图谱克隆完整基因
关键改造:构建pET28a载体并表达天然及His标签蛋白
关键改造:双相系统生物转化生产异诺瓦醛
结果:基因609bp,编码202个氨基酸,蛋白23.7kDa
结果:比生产速率较原菌提高40倍,浓度达540g/L
结果:C端His标签比酶活373.30 μmol/min/mg,纯化后546.37
结论:成功克隆并高活性表达,属NTF2超家族,为酶工程奠定基础
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核心内容

该研究从Pseudomonas rhodesiae CIP 107491中鉴定并克隆了编码α-蒎烯氧化物裂解酶(Prα-POL)的基因,并在大肠杆菌中实现了重组表达。利用基于蛋白N端及内部肽段序列设计的简并引物,通过PCR扩增部分基因片段,结合反向PCR和限制性酶切作图成功分离完整基因。该基因长度为609 bp,编码202个氨基酸,预测分子量23.7 kDa,属于NTF2蛋白超家族。将基因构建至pET28a载体并在大肠杆菌BL21(DE3)中表达天然及His标签融合蛋白,重组菌在双相系统中比生产速率达260 g异诺瓦醛 h⁻¹ g生物量⁻¹,较原菌提高约40倍,最大产物浓度达540 g/L。纯化后的N端His标签重组酶比酶活为546.37 μmol min⁻¹ mg⁻¹,接近天然酶的600 μmol min⁻¹ mg⁻¹。该工作首次报道了α-蒎烯氧化物裂解酶基因,为异诺瓦醛的高效生物转化生产及后续酶工程改造奠定了基础。

创新点

首次报道了α-蒎烯氧化物裂解酶基因的鉴定与克隆;利用反向PCR策略从Pseudomonas rhodesiae中成功分离该基因;在大肠杆菌中实现高活性重组表达,比生产速率较原菌提高约40倍。

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Pseudomonas rhodesiae CIP 107491 α-蒎烯降解途径 prα-POL Prα-POL 催化 天然的α-蒎烯氧化物裂解酶,催化α-蒎烯氧化物开环生成异诺瓦醛
Escherichia coli BL21(DE3) 异源表达 prα-POL 重组Prα-POL 催化 在E. coli中重组表达,用于生物转化生产异诺瓦醛;比生产速率较原菌提高约40倍
Pseudomonas rhodesiae CIP 107491 α-蒎烯降解途径相关基因簇 GST 谷胱甘肽S-转移酶 催化 与Prα-POL位于同一基因簇,推测参与芳香族化合物降解,但具体功能未在本研究验证
Pseudomonas rhodesiae CIP 107491 α-蒎烯降解途径相关基因簇 CALDH 松柏醛脱氢酶 催化 与Prα-POL位于同一基因簇,可能参与其他代谢途径,如丁香酚降解

关键发现

  1. Prα-POL基因长度为609 bp,编码202个氨基酸,预测蛋白分子量23.7 kDa,理论等电点5.23
  2. 重组大肠杆菌在双相系统中比生产速率约为260 g异诺瓦醛 h⁻¹ g生物量⁻¹,是P. rhodesiae(6.4 g h⁻¹ g⁻¹)的40倍
  3. 最大异诺瓦醛浓度达540 g/L
  4. 可溶组分中天然Prα-POL比酶活为98.57 μmol min⁻¹ mg⁻¹,N端His标签为134.15 μmol min⁻¹ mg⁻¹,C端His标签为373.30 μmol min⁻¹ mg⁻¹
  5. 纯化后N端His标签比酶活为546.37 μmol min⁻¹ mg⁻¹,接近天然P. rhodesiae酶的600 μmol min⁻¹ mg⁻¹,C端His标签为482.06 μmol min⁻¹ mg⁻¹
  6. Prα-POL与Solimonas soli的推定蛋白具有64%的氨基酸序列一致性。

研究结论

成功克隆了α-蒎烯氧化物裂解酶基因,并在大肠杆菌中实现了高活性重组表达,显著提高了异诺瓦醛的生产效率。该酶属于NTF2蛋白超家族,为后续酶工程改造和α-蒎烯降解途径研究奠定了基础。