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The Putative Mevalonate Diphosphate Decarboxylase from Picrophilus torridus Is in Reality a Mevalonate-3-Kinase with High Potential for Bioproduction of Isobutene

作者
Luca Rossoni, Stephen J. Hall, Graham Eastham, Peter Licence, Gill Stephens
单位
Department of Chemical and Environmental Engineering, Biorenewables and Bioprocessing Research Group, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom; Lucite International, Wilton Centre, Wilton, United Kingdom; School of Chemistry, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom
杂志
Applied and Environmental Microbiology(2015)
DOI
10.1128/AEM.04033-14
所属领域
代谢工程
关键词
Picrophilus torridusbioproductionisobutenemevalonate pathwaymevalonate-3-kinase
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解决的核心问题

重新鉴定来自Picrophilus torridus的推定甲羟戊酸二磷酸脱羧酶(MVD)的真实功能,并评估其在异丁烯生物生产中的应用潜力。

研究策略

通过序列分析、底物特异性测试、产物鉴定(ESI-MS和NMR)确定酶的真实分类,并比较该酶与酿酒酵母MVD在整细胞、粗提物和纯酶水平上的异丁烯生成速率。

研究路线图

100%
研究问题:重新鉴定PtMVD真实功能及异丁烯生产潜力
结论:PtM3K是异丁烯生物生产重要候选酶
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核心内容

来自嗜热古菌Picrophilus torridus的推定甲羟戊酸二磷酸脱羧酶基因PTO1356经克隆表达与纯化后,通过底物特异性测试和产物ESI-MS及NMR鉴定,证实其真实功能为甲羟戊酸-3-激酶(PtM3K),而非脱羧酶。该酶催化甲羟戊酸(MVA)磷酸化生成MVA-3P,对MVA的Km为131±18 μM,kcat为1.9 s⁻¹,活性为3 U/mg;对3-羟基异戊酸的催化效率约低1000倍。在异丁烯生成方面,全细胞表达PtM3K的速率为507±137 pmol min⁻¹ g cells⁻¹,纯酶在50°C下达2880 pmol min⁻¹ mg protein⁻¹,较30°C提高110倍,且比酿酒酵母MVD纯酶高11倍。PtM3K不能磷酸化3-羟基丙酸,可磷酸化3-羟基丁酸但不产生丙烯。该工作首次明确PtM3K属于新发现的古菌MVA途径,其通过生成不稳定中间体3-磷酸异戊酸实现异丁烯生成,且效率显著优于酵母MVD,是异丁烯生物生产的重要候选酶。

创新点

首次纯化并表征了P. torridus推定MVD,证明其实际为甲羟戊酸-3-激酶(M3K)而非脱羧酶;揭示了其通过生成不稳定中间体3-磷酸异戊酸实现异丁烯生成的新机制;异丁烯生成速率显著高于以往报道。

研究对象(2)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli BL21(DE3)pLysS 甲羟戊酸(MVA)途径 PTO1356 (ptm3k) PtM3K(甲羟戊酸-3-激酶) 催化 来自Picrophilus torridus,实际为M3K,催化MVA磷酸化生成MVA-3P,并可催化3-HIV生成不稳定中间体3-磷酸异戊酸,进而自发脱羧生成异丁烯。
Escherichia coli BL21(DE3)pLysS 甲羟戊酸(MVA)途径 ScMVD (ERG19) 酿酒酵母甲羟戊酸二磷酸脱羧酶(ScMVD) 催化 作为对照酶,催化MVAPP脱羧生成IPP,也可催化3-HIV生成异丁烯,但效率远低于PtM3K。

关键发现

  1. PtM3K催化甲羟戊酸(MVA)磷酸化生成MVA-3P,对MVA的Km为131±18 μM,kcat为1.9 s-1,活性为3 U/mg
  2. 对3-羟基异戊酸(3-HIV)的Km为2,348±574 μM,kcat为0.1 s-1,催化效率比MVA低约1000倍
  3. 全细胞表达PtM3K的异丁烯生成速率为507±137 pmol min-1 g cells-1,纯酶在50°C下达到2,880 pmol min-1 mg protein-1,比30°C时高110倍,比ScMVD纯酶高11倍
  4. PtM3K不能催化3-羟基丙酸磷酸化,能磷酸化3-羟基丁酸但不产生丙烯。

研究结论

P. torridus的推定MVD实际上是一种甲羟戊酸-3-激酶(PtM3K),属于新发现的古菌MVA途径;PtM3K比酿酒酵母MVD具有更高的异丁烯生成效率,是异丁烯生物生产的重要候选酶。