共 560 篇

The microbial biosynthesis of noncanonical terpenoids

Applied Microbiology and Biotechnology · 2024 · 10.1007/s00253-024-13048-y · 含路线图 · 有原文

核心问题:非经典萜类(碳骨架不符合五碳单元规律)的微生物生物合成途径尚不清楚,需要系统总结其生物合成机制与相关酶系,以指导新化合物的发现与异源生产。

关键发现:IPPMT(来自Streptomyces monomycini)以IPP为底物可合成C6和C7异戊烯基焦磷酸,主要产物为(E)-4-甲基-IPP,次要产物包括(Z)-4-甲基-IPP、4-甲基-DMAPP及C7化合物4,4-二甲基-IPP和4,4-二甲基-DMAPP 等 10 条

合成生物学 BiosynthesisCarbon skeletonFive carbon unitsNoncanonical terpenoidsTerpenoids Streptomyces monomycini Rhodococcus fascians Streptomyces coelicolor

Identifying setterterpenoids via feature-based molecular networking and small-scale fermentation

Applied Microbiology and Biotechnology · 2024 · 10.1007/s00253-024-13299-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:天然产物中低丰度新化合物(尤其是微量二倍半萜类)的快速发现与鉴定,传统化学分析常忽略低产量天然产物。

关键发现:从1 g大米培养基发酵得到1.7 mg粗提物,FBMN在m/z 300-500范围内共356个节点;分离得到fusoxyoridenoind A (1 等 7 条

合成生物学 Aspergillus oryzaeBifunctional terpene synthasesCytochrome P450Feature-based molecular networkingHeterologous expression Aspergillus oryzae NSAR1 Aspergillus oryzae NSAR1 Aspergillus oryzae NSAR1

Engineered CRISPR/Cas9 System for Transcriptional Gene Silencing in Arthrobacter Species Indicates Bacterioruberin is Indispensable for Growth at Low Temperatures

Current Microbiology · 2022 · 10.1007/s00284-022-02887-5 · 含路线图 · 有原文

核心问题:Arthrobacter属缺乏快速高效的基因编辑/基因沉默工具,且细菌视紫红素(bacterioruberin)在低温生长中的作用尚未通过基因敲除验证。

关键发现:pCasiART系统成功沉默了Arthrobacter agilis和Arthrobacter bussei的crtB基因,细菌视紫红素含量降至检测限0.2 μg/g细胞干重以下 等 3 条

合成生物学 ArthrobacterCRISPR/Cas9bacterioruberincold adaptationgene silencing Arthrobacter agilis D... Arthrobacter bussei D... Arthrobacter agilis

Transcriptome Profiling, Cloning, and Characterization of AnGlu04478, a Ginsenoside Hydrolyzing β-Glucosidase from Aspergillus niger NG1306

Current Microbiology · 2024 · 10.1007/s00284-024-04012-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:挖掘并表征一种能同时催化人参皂苷Rb1、Rb2、Rb3和Rc的C3位葡萄糖水解的β-葡萄糖苷酶,以制备多种稀有人参皂苷。

关键发现:Anglu04478基因长1455 bp,编码484个氨基酸,预测分子量54.54 kDa,pI 5.1 等 8 条

合成生物学 Aspergillus niger NG1306 Escherichia coli BL21...

Inducibility of three salinity/abscisic acid-regulated promoters in transgenic rice with gusA reporter gene

Plant Cell Reports · 2011 · 10.1007/s00299-011-1072-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:评估三种盐胁迫/ABA诱导启动子(天然Rab16A启动子与两个合成启动子4X ABRE、2X ABRC)在不同浓度NaCl和ABA处理下的诱导模式,为单子叶作物逆境胁迫下的转基因表达提供可选启动子。

关键发现:所有三种启动子的GUS表达随NaCl和ABA浓度升高而增强,ABA比NaCl诱导效果更强。qRT-PCR显示,Rab p(T2/20)在150 mM NaCl和100 μM ABA下分别诱导8.2倍和10倍 等 5 条

合成生物学 Abiotic stressAbscisic acidSalt stressStress-inducible promotersTransgenic riceβ-Glucuronidase 水稻(Oryza sativa cv. K... 水稻(Oryza sativa cv. K... 水稻(Oryza sativa cv. K...

Flavodoxin displays dose-dependent effects on photosynthesis and stress tolerance when expressed in transgenic tobacco plants

Planta · 2012 · 10.1007/s00425-012-1695-x · 含路线图 · 有原文

核心问题:确定提高叶绿体中异源黄素氧还蛋白(Fld)表达量是否能够进一步增强转基因烟草的光合性能和胁迫耐受性,以及过高表达是否会产生不利影响。

关键发现:获得的烟草株系Fld水平为0.3、1.3、2.6和10.8 μmol m^-2,内源Fd约3 μmol m^-2。当Fld为1.3-2.6 μmol m^-2时,叶绿素a含量较野生型增加9-19%,类胡萝卜素增加 等 5 条

合成生物学 FerredoxinFlavodoxinOxidative stressTransgenic plantsTransplastomic transformation 烟草(Nicotiana tabacum ... 烟草(Nicotiana tabacum ... 烟草(Nicotiana tabacum)

Efficient chimeric plant promoters derived from plant infecting viral promoter sequences

Planta · 2013 · 10.1007/s00425-013-1973-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:开发高效、可诱导的植物嵌合启动子,以满足植物基因工程中对强启动子及序列多样性的需求,解决常用CaMV35S启动子活性不足和基因叠加时的序列同源问题。

关键发现:P9(−353~+24)是PCISV-Flt启动子的最强核心片段,瞬转活性比P8高1.3倍,稳定表达高1.62倍 等 5 条

合成生物学 Chimeric promoterFMVGFPGUSMMVPCISV 烟草 烟草 烟草

Engineering modular diterpene biosynthetic pathways in Physcomitrella patens

Planta · 2018 · 10.1007/s00425-018-3053-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在小立碗藓中建立模块化的二萜生物合成途径,以异源表达现代陆生植物的二萜合酶组合,生产工业相关二萜类化合物,并探索新的基因组整合位点(逆转座子位点)以克服单一中性位点的限制。

关键发现:在Pp108位点,模块M1(CfTPS2/SsSCS)积累13R-(+)-manoyl oxide、13S-(+)-manoyl oxide、(+)-manool、(+)-abienol和(+)-sclareol多种产物;M2(TwTPS21/EpTPS1)单一积累13R-ent-manoyl... 等 3 条

合成生物学 DiterpenoidsHomologous recombinationNeutral locusPhotosynthetic productionRetrotransposonSynthetic biology Physcomitrella patens... Physcomitrella patens... Physcomitrella patens...

An in-silico insight into the substrate binding characteristics of the active site of amorpha-4, 11-diene synthase, a key enzyme in artemisinin biosynthesis

Journal of Molecular Modeling · 2017 · 10.1007/s00894-017-3374-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析青蒿素生物合成关键酶amorphadiene synthase (ADS)活性位点的底物结合特征,为酶工程改造以提高青蒿素产量提供结构基础。

关键发现:鉴定出DDTYD(299-303)和NDLMT(443-447)为金属结合基序 等 5 条

合成生物学 Amorpha-4,11-diene synthaseArtemisininHomology modelingMolecular dynamicsSubstrate binding site

Bioluminescent bioreporter integrated-circuit sensing of microbial volatile organic compounds

Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology · 2003 · 10.1007/s10295-003-0093-6 · 含路线图 · 有原文

核心问题:构建能够快速、灵敏检测微生物挥发性有机化合物(MVOC)p-cymene的生物发光报告菌株,并与集成电路微光度计结合,实现封闭空间内真菌污染的远程实时监测。

关键发现:报告菌株UT93在0.02–850 ppm p-cymene浓度范围内产生生物发光,响应时间小于1.5小时 等 3 条

合成生物学 BBICBioluminescenceBioreporterMVOCluxp-cymene Pseudomonas putida UT93 Pseudomonas putida UT93 Pseudomonas putida F1

CRISPR/Cas9-mediated efficient editing in phytoene desaturase (PDS) demonstrates precise manipulation in banana cv. Rasthali genome

Functional & Integrative Genomics · 2017 · 10.1007/s10142-017-0577-5 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在香蕉(cv. Rasthali)基因组中实现高效精确的基因编辑,以八氢番茄红素脱氢酶(PDS)为靶标验证CRISPR/Cas9系统的可行性和效率。

关键发现:在22个PCR阳性植株中,13个确认发生 indel 突变,突变频率为59% 等 4 条

合成生物学 基因组编辑突变类胡萝卜素胚性细胞悬浮系香蕉转化 香蕉cv. Rasthali胚性细胞悬浮系... 香蕉cv. Rasthali胚性细胞悬浮系... 香蕉cv. Rasthali胚性细胞悬浮系...

Identification and activation of novel biosynthetic gene clusters by genome mining in the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365

Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology · 2015 · 10.1007/s10295-015-1685-7 · 含路线图 · 有原文

核心问题:系统挖掘并激活kirromycin产生菌Streptomyces collinus Tü 365中尚未表征的次级代谢生物合成基因簇,鉴定其对应产物。

关键发现:S. collinus Tü 365基因组大小为8.37 Mb,G+C含量72.6%,编码7193个蛋白质,长末端反向重复区长度为630 kb;antiSMASH预测共32个次级代谢基因簇,约占基因组14%,其中3个基因簇(lanthipeptide、atypical NRPS、kirromy... 等 5 条

合成生物学 Deoxydehydroshoric acidGenome miningIsoreniteraeneNatural productsSecondary metabolitesStreptomyces Streptomyces collinus... Streptomyces collinus... Streptomyces collinus...

Surface display of active lipase in Pichia pastoris using Sed1 as an anchor protein

Biotechnology Letters · 2010 · 10.1007/s10529-010-0270-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在毕赤酵母表面展示活性脂肪酶,以提高酶稳定性并降低游离酶成本

关键发现:展示CALB的毕赤酵母全细胞水解活性在120 h培养后超过220 U/g干细胞 等 3 条

合成生物学 Candida antarctica lipase BImmunofluorescence microscopyLipasePichia pastorisYeast surface display Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115

Stable plastid transformation in lettuce (Lactuca sativa L.)

Plant Molecular Biology · 2005 · 10.1007/s11103-005-7704-8 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在生菜(Lactuca sativa L.)中建立稳定的质体转化系统,以获得可育、同质化的转质体植株,并评估生菜质体作为人类治疗蛋白生产和递送系统的潜力。

关键发现:从总共5.6×10^6个可存活原生质体中再生出9个壮观霉素抗性细胞系,转化频率估计为1-2个抗性细胞系/10^6个原生质体 等 9 条

合成生物学 PEGaadAlettuceplastid transformationtrnI/trnA 生菜(Lactuca sativa L.)... 生菜(Lactuca sativa L.)... 生菜(Lactuca sativa L.)...

Ectopic expression of a conifer Abscisic Acid Insensitive3 transcription factor induces high-level synthesis of recombinant human α-L-iduronidase in transgenic tobacco leaves

Plant Molecular Biology · 2007 · 10.1007/s11103-006-9122-y · 含路线图 · 有原文

核心问题:在转基因烟草叶片中组成型表达人α-L-艾杜糖苷酶(IDUA)时酶活性极低(0.04-0.34 pmol/min/mg TSP),且蛋白易降解;需要一种能在植物营养组织中高效、稳定生产该重组酶的策略。

关键发现:组成型表达35S-hIDUA的5个转基因株系叶片中IDUA活性仅为0.04–0.34 pmol/min/mg TSP,并出现蛋白降解片段 等 7 条

合成生物学 Abscisic Acid Insensitive3 geneMolecular pharmingRecombinant human α-L-iduronidaseTransactivationTransgenic tobacco 转基因烟草(Nicotiana tabacum) 转基因烟草(Nicotiana tabacum) 转基因烟草(Nicotiana tabacum)

An improved chemically inducible gene switch that functions in the monocotyledonous plant sugar cane

Plant Molecular Biology · 2013 · 10.1007/s11103-013-0140-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:原始的alc乙醇诱导基因开关在单子叶植物甘蔗中功能无效,需要改进使其能在这一重要作物中有效工作,以支持基础研究和作物生物技术应用。

关键发现:原始alc开关在21个转基因甘蔗中经2%或10%乙醇诱导均未检测到GUS。优化后的var4在2%乙醇处理下80%植物(8/10)显示GUS染色,var5和var9在1%乙醇下分别有63%和41%植物诱导。var4、var5和var9均含五个串联AlcR反向重复结合位点。单拷贝转基因甘蔗中,va...

合成生物学 Ethanol inducibleGene expressionMonocotSaccharumSugar canealc gene switch 甘蔗(Saccharum officina... 甘蔗(Saccharum officina... 甘蔗(Saccharum officina...

Ectopic expression of a hot pepper bZIP-like transcription factor in potato enhances drought tolerance without decreasing tuber yield

Plant Molecular Biology · 2015 · 10.1007/s11103-015-0378-y · 含路线图 · 有原文

核心问题:过表达A组bZIP转录因子虽能提高植物非生物胁迫耐受性,但通常导致产量下降。需要找到既能提高作物抗旱性又不造成产量损失的基因或策略。

关键发现:CaBZ1在ABA、甘露醇(150 mM)、NaCl(150 mM)和低温胁迫下表达上调,ABA处理3小时即快速诱导,甘露醇处理12-24小时,盐处理24-48小时 等 10 条

合成生物学 Drought stressPotatoStress-responsive geneTranscription factorTuber yieldbZIP 马铃薯 (Solanum tuberosu... 马铃薯 (Solanum tuberosu... 马铃薯 (Solanum tuberosu...

Constitutive expression of CaPLA1 conferred enhanced growth and grain yield in transgenic rice plants

Plant Molecular Biology · 2016 · 10.1007/s11103-016-0440-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究辣椒磷脂酶A1(CaPLA1)在水稻中的过表达是否能增强生长和提高籽粒产量,并揭示其作用机制。

关键发现:转基因幼苗根长约为野生型3.5倍,茎长约为1.5倍,根冠比约为野生型2倍;4周龄时转基因根长7.1-7.8 cm(野生型5.9 cm),茎长27.7-27.8 cm(野生型22.5 cm);叶鞘表皮细胞数增加1.4-1.8倍,细胞长度从94.0 μm缩短至约50 μm;细胞周期基因CycA2.... 等 3 条

合成生物学 Enhanced growthGrain yieldMembrane peroxidationOryza sativaPhospholipase A1Transgenic rice plant 水稻 (Oryza sativa L. s... 水稻 (Oryza sativa L. s... 水稻 (Oryza sativa L. s...

Engineering a carotenoid-binding site in Dokdonia sp. PRO95 Na+-translocating rhodopsin by a single amino acid substitution

· 2017 · 10.1007/s11120-017-0453-0 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究钠离子转运视紫红质(NaR)缺乏类胡萝卜素光捕获天线的结构基础,并通过单氨基酸替换重建其天线功能。

关键发现:Thr216Gly突变使NaR在类胡萝卜素合成的大肠杆菌中表达时,紧密结合canthaxanthin和echinone,吸收光谱出现430、458和485 nm特征峰 等 5 条

合成生物学 CanthaxanthinCarotenoid antennaEchinoneNa+ pumpRhodopsinXanthorhodopsin Escherichia coli / E.... Dokdonia sp. PRO95 Escherichia coli (pAC...

Perspectives of cyanobacterial cell factories

Photosynthesis Research · 2023 · 10.1007/s11120-023-01056-4 · 含路线图 · 有原文

核心问题:利用蓝细菌作为光合细胞工厂,解决异戊二烯类化合物和高价值重组蛋白生产中的产量低、异源蛋白不稳定、产物分离困难等问题,并探索放大生产途径。

关键发现:异戊二烯产量达12.5 mg/g biomass 等 8 条

合成生物学 Biopharmaceutical proteinsFusion constructsPhycocyaninPlant essential oilsProtein overexpressionSynechocystis sp. PCC 6803 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...