共 145 篇

Eubacterial Diterpene Cyclase Genes Essential for Production of the Isoprenoid Antibiotic Terpentecin

Journal of Bacteriology · 2001 · 10.1128/JB.183.20.6085-6094.2001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:真细菌中是否存在二萜环化酶(DC)?本研究旨在鉴定产萜类抗生素terpentecin的链霉菌中负责二萜骨架形成的环化酶基因,并证明其功能。

关键发现:ORF11和ORF12基因中断突变株完全丧失terpentecin(TP)产生能力,互补后恢复 等 5 条

代谢工程 terpentecin二萜环化酶基因簇萜类抗生素链霉菌香叶基香叶基焦磷酸 Streptomyces griseolo... Streptomyces griseolo... Streptomyces lividans...

Peroxisomal Catalase in the Methylotrophic Yeast Candida boidinii: Transport Efficiency and Metabolic Significance

Journal of Bacteriology · 2001 · 10.1128/JB.183.21.6372-6383.2001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:过氧化物酶体过氧化氢酶Cta1p的PTS1信号(-NKF)转运效率低下,导致其在甲醇生长细胞中呈胞质/过氧化物酶体双定位,论文旨在阐明这种低效转运的机制及其代谢意义。

关键发现:CTA1编码504个氨基酸,蛋白分子量57,092 Da。野生型菌株中过氧化氢酶活性在甲醇、油酸、D-丙氨酸和葡萄糖培养下分别为2,530、1,010、117和10.2 U/mg蛋白。cta1Δ菌株在甲醇中培养110 h后H2O2积累至0.67 mM。甲醇生长细胞中约40%的GFP-Cta1p...

代谢工程 Candida boidiniiGFPPTS1甲醇代谢蛋白转运过氧化氢酶 Candida boidinii Candida boidinii Candida boidinii

Isoprenoid Biosynthesis in Synechocystis sp. Strain PCC6803 Is Stimulated by Compounds of the Pentose Phosphate Cycle but Not by Pyruvate or Deoxyxylulose-5-Phosphate

Journal of Bacteriology · 2002 · 10.1128/JB.184.18.5045-5051.2002 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究光合蓝藻 Synechocystis sp. PCC6803 在光合条件下类异戊二烯生物合成是否遵循大肠杆菌中定义的 MEP 途径,以及丙酮酸和脱氧木酮糖-5-磷酸等初始底物是否参与该过程。

关键发现:体外无细胞体系中,1 mM GA3P 或 500 μM DHAP 单独添加均可显著刺激 [14C]IPP 掺入,GA3P 与 DHAP 联合刺激效果更强 等 4 条

代谢工程 IPP isomeraseMEP pathwaySynechocystis sp. PCC6803fosmidomycinisoprenoid biosynthesispentose phosphate cycle Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Cloning and Characterization of 1-Deoxy-d-Xylulose 5-Phosphate Synthase from Streptomyces sp. Strain CL190, Which Uses both the Mevalonate and Nonmevalonate Pathways for Isopentenyl Diphosphate Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2000 · 10.1128/JB.182.4.891-897.2000 · 含路线图 · 有原文

核心问题:克隆并表征同时具有甲羟戊酸和非甲羟戊酸途径的链霉菌CL190中的1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶(DXP合酶),以阐明其在非甲羟戊酸途径中的作用及酶学性质,并为理解该途径的限速步骤提供动力学参数。

关键发现:克隆的dxs基因编码631个氨基酸,预测分子量68 kDa 等 8 条

代谢工程 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthaseStreptomycesisopentenyl diphosphatemevalonate pathwaynonmevalonate pathway Streptomyces sp. stra... Escherichia coli

Engineering a Homo-Ethanol Pathway in Escherichia coli: Increased Glycolytic Flux and Levels of Expression of Glycolytic Genes during Xylose Fermentation

Journal of Bacteriology · 2001 · 10.1128/JB.183.10.2979-2988.2001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析工程菌E. coli KO11在木糖厌氧发酵中生长速率和糖酵解通量显著高于亲本菌株B的分子机制,探究引入同型乙醇途径对木糖分解代谢基因表达的影响。

关键发现:KO11最大比生长速率为0.224/h,约为亲本B的1.3倍 等 6 条

代谢工程 Escherichia coliZymomonas mobilisadhBgene arrayglycolytic fluxhomo-ethanol pathway Escherichia coli B (A... Escherichia coli B (A... Escherichia coli B (A...

Role of Feedback Regulation of Pantothenate Kinase (CoaA) in Control of Coenzyme A Levels in Escherichia coli

Journal of Bacteriology · 2003 · 10.1128/JB.185.11.3410-3415.2003 · 含路线图 · 有原文

核心问题:研究大肠杆菌泛酸激酶(CoaA)的反馈抑制在控制辅酶A(CoA)水平中的关键作用,通过构建反馈抗性突变体验证其生理意义。

关键发现:CoaA[R106A]保留约54%的野生型催化活性(比活350 vs 650 nmol/min/μg),CoaA[H177Q]保留6%,CoaA[F247V]保留25% 等 2 条

代谢工程 CoaAEscherichia colicoenzyme Afeedback regulationpantothenate kinasesite-directed mutagenesis Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

The lytB Gene of Escherichia coli Is Essential and Specifies a Product Needed for Isoprenoid Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2001 · 10.1128/JB.183.24.7403-7407.2001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明大肠杆菌lytB基因的功能,并验证其是否参与异戊二烯(类异戊二烯)生物合成以及是否为必需基因。

关键发现:lytB基因对大肠杆菌生存是必需的,缺失导致细胞裂解 等 7 条

代谢工程 DOXP pathwayEscherichia coliessential geneisoprenoid biosynthesislytBnonmevalonate pathway Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Enterococcus faecalis Acetoacetyl-Coenzyme A Thiolase/3-Hydroxy-3-Methylglutaryl-Coenzyme A Reductase, a Dual-Function Protein of Isopentenyl Diphosphate Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2002 · 10.1128/JB.184.8.2116-2122.2002 · 含路线图 · 有原文

核心问题:肠球菌中甲羟戊酸途径的关键酶mvaE基因是否编码真正的双功能蛋白(乙酰乙酰辅酶A硫解酶和HMG-CoA还原酶),以及该双功能酶的酶学性质。

关键发现:mvaE基因产物为83.5 kDa(计算86,496 Da),在E. faecalis、E. faecium和E. hirae中以单一多肽形式存在。纯化蛋白纯度>95%,产量平均10 mg/L。乙酰乙酰辅酶A硫解酶活性:合成最适pH 等 4 条

代谢工程 Enterococcus faecalisHMG-CoA reductaseacetoacetyl-CoA thiolaseisopentenyl diphosphatemevalonate pathwaymvaE Enterococcus faecalis Enterococcus faecalis Enterococcus faecium

GcpE Is Involved in the 2-C-Methyl-D-Erythritol 4-Phosphate Pathway of Isoprenoid Biosynthesis in Escherichia coli

Journal of Bacteriology · 2001 · 10.1128/JB.183.8.2411-2416.2001 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明大肠杆菌MEP途径中gcpE基因的功能,验证其参与异戊二烯生物合成的MEP途径

关键发现:gcpE基因敲除突变株(wt ΔgcpE)仅在外源补充100 μM mevalonate时才能生长,与dxr敲除突变株(wt Δdxr)行为一致 等 5 条

代谢工程 Escherichia coliGcpEMEP pathwayfosmidomycingene deletionisoprenoid biosynthesis Escherichia coli K-12... Escherichia coli K-12 Saccharomyces cerevis...

Novel Medium-Chain Prenyl Diphosphate Synthase from the Thermoacidophilic Archaeon Sulfolobus solfaticus

Journal of Bacteriology · 2002 · 10.1128/JB.184.3.615-620.2002 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从嗜热酸古菌Sulfolobus solfataricus基因组中鉴定一个功能未知的仿(all-E)型异戊烯基二磷酸合酶同源基因,确定其产物链长和生物学功能。

关键发现:编码281个氨基酸的蛋白,计算分子量32,274 Da(SDS-PAGE约32 kDa) 等 5 条

代谢工程 Escherichia coli BL21... Sulfolobus solfataricus

Inactivation of sll1556 in Synechocystis Strain PCC 6803 Impairs Isoprenoid Biosynthesis from Pentose Phosphate Cycle Substrates In Vitro

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.14.4685-4693.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明集胞藻PCC 6803中sll1556基因在类异戊二烯生物合成中的作用,特别是其是否参与戊糖磷酸循环底物向类异戊二烯前体的转化,以及是否存在非经典的MEP途径分支。

关键发现:敲除sll1556后,突变体(Δsll1556)在体外不能利用果糖-6-磷酸(FR6P)、甘油醛-3-磷酸(GA3P)和葡萄糖-6-磷酸(GL6P)刺激[14C]IPP掺入类异戊二烯,而野生型可被这些底物刺激;②加入重组Sll1556蛋白可恢复突变体上清中的合成能力,且FR6P的刺激作用相当于... 等 3 条

代谢工程 IPP异构酶sll1556基因戊糖磷酸循环类异戊二烯生物合成集胞藻PCC 6803 Synechocystis sp. PCC...

Genetic Dissection of the Light-Inducible carQRS Promoter Region of Myxococcus xanthus

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.23.7836-7846.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析Myxococcus xanthus光诱导carQRS启动子的最小功能区域和关键序列元件,阐明其光依赖性转录调控机制。

关键发现:最小光诱导启动子位于-145至+40之间(-165至+66片段具有完整活性) 等 8 条

代谢工程 ECF σ因子光诱导启动子分析类胡萝卜素生物合成黄色粘球菌 Myxococcus xanthus Myxococcus xanthus Myxococcus xanthus

Antisense RNA Downregulation of Coenzyme A Transferase Combined with Alcohol-Aldehyde Dehydrogenase Overexpression Leads to Predominantly Alcohologenic Clostridium acetobutylicum Fermentations

Journal of Bacteriology · 2003 · 10.1128/JB.185.12.3644-3653.2003 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过代谢工程提高Clostridium acetobutylicum丁醇/丙酮比例,同时避免因下调丙酮途径而导致的丁醇产量下降。

关键发现:与仅表达反义RNA的824(pCTFB1AS)相比,824(pAADB1)的丁醇产量提高约2.8倍并恢复到质粒对照水平 等 6 条

代谢工程 Alcohol-aldehyde dehydrogenaseAntisense RNAButanol/acetone ratioClostridium acetobutylicumCoenzyme A transferaseMetabolic engineering Clostridium acetobuty... Clostridium acetobuty... Clostridium acetobuty...

Transcriptional Analysis of spo0A Overexpression in Clostridium acetobutylicum and Its Effect on the Cell's Response to Butanol Stress

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.7.1959-1971.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明spo0A过表达对丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutylicum)的转录组影响,并揭示其在丁醇胁迫响应中的作用机制。

关键发现:824(pMSPOA)总溶剂产量250 mM(137 mM丁醇、90 mM丙酮、23 mM乙醇),对照824(pIMP1)为248 mM(150 mM丁醇、77 mM丙酮、21 mM乙醇) 等 2 条

代谢工程 spo0A丁醇耐受性丙酮丁醇梭菌孢子形成溶剂生成转录组分析 Clostridium acetobuty... Clostridium acetobuty... Clostridium acetobuty...

The Reaction Center H Subunit Is Not Required for High Levels of Light-Harvesting Complex 1 in Rhodospirillum rubrum Mutants

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.17.5585-5595.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:反应中心 H 亚基(puhA 编码)是否对光合细菌 Rhodospirillum rubrum 中 LH1 复合物的高水平形成及光合膜的形成是必需的?

关键发现:在 M 培养基中,S1 来源的 puhA 缺失突变体(SPUHK1、SPUHK2)LH1 吸收峰为野生型的 93% 和 71%;在 M2S 培养基中,S1 和 G9 突变体 LH1 水平分别降至野生型的 32-38% 和 26-32%;在 M2SF 培养基中,SPUHK1、SPUHK2、GPU... 等 3 条

合成生物学 Rhodospirillum rubrumcarotenoidslight-harvesting complex 1photosynthetic membranepuhAreaction center H subunit Rhodospirillum rubrum S1 Rhodospirillum rubrum G9 Rhodospirillum rubrum S1

Genetic Manipulation of Carotenoid Biosynthesis in the Green Sulfur Bacterium Chlorobium tepidum

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.16.5210-5220.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定绿色硫细菌Chlorobium tepidum中类胡萝卜素生物合成相关基因,并阐明类胡萝卜素的生物合成途径及其生理功能。

关键发现:通过基因失活鉴定出6个类胡萝卜素合成基因:crtB(CT1386,八氢番茄红素合酶)、crtP(CT0807,八氢番茄红素脱饱和酶)、crtQ(CT1414,ζ-胡萝卜素脱饱和酶)、crtU(CT0323,γ-胡萝卜素脱饱和酶)、crtC(CT0301,类胡萝卜素1',2'-水合酶)、crtH... 等 6 条

代谢工程 Chlorobium tepidumcarotenoid biosynthesischlorosomegene inactivationgreen sulfur bacteria Chlorobium tepidum Chlorobium tepidum Chlorobium tepidum

Functional Analysis of All Aminotransferase Proteins Inferred from the Genome Sequence of Corynebacterium glutamicum

Journal of Bacteriology · 2005 · 10.1128/JB.187.22.7639-7646.2005 · 含路线图 · 有原文

核心问题:对谷氨酸棒杆菌基因组预测的20个氨基转移酶蛋白进行系统的功能鉴定,以明确其在氨基酸合成和代谢中的具体作用。

关键发现:IlvE以L-谷氨酸为氨基供体时,对2-氧代-3-甲基戊酸、2-氧代异己酸、2-氧代异戊酸和2-氧代丁酸的比活分别为9.6、13.9、13.7和4.3 μmol min−1 mg−1 等 8 条

代谢工程 Corynebacterium glutamicumamino acid synthesisaminotransferasegenome analysispyridoxal-5'-phosphate Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta...

Slr1293 in Synechocystis sp. Strain PCC 6803 Is the C-3',4' Desaturase (CrtD) Involved in Myxoxanthophyll Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.17.5621-5628.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中由slr1293编码的蛋白功能,验证其是否为myxoxanthophyll生物合成所需的C-3',4'脱饱和酶(CrtD)。

关键发现:在高光强下,myxoxanthophyll占Synechocystis sp. PCC 6803总类胡萝卜素的四分之一以上。 等 6 条

代谢工程 CrtDSlr1293Synechocystis sp. PCC 6803carotenoid biosynthesisdesaturasemyxoxanthophyll Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Escherichia coli (BL2...

Light-Induced Carotenogenesis in Streptomyces coelicolor A3(2): Identification of an Extracytoplasmic Function Sigma Factor That Directs Photodependent Transcription of the Carotenoid Biosynthesis Gene Cluster

Journal of Bacteriology · 2005 · 10.1128/JB.187.5.1825-1832.2005 · 含路线图 · 有原文

核心问题:天蓝色链霉菌A3(2)中光诱导类胡萝卜素生物合成的调控机制不明,尤其是负责光依赖性转录的sigma因子未被鉴定。

关键发现:S. coelicolor A3(2)在蓝光(400-460 nm)诱导下产生类胡萝卜素(包括isorenieratene和β-胡萝卜素),光强约2.4 μmol s^-1 m^-2 等 8 条

代谢工程 ECF sigma因子LitS光诱导类胡萝卜素生成光调控天蓝色链霉菌A3(2)类胡萝卜素生物合成基因簇 Streptomyces coelicol... Streptomyces coelicol... Streptomyces coelicol...

Genetic Analysis of Photosynthesis in Rhodospirillum centenum

Journal of Bacteriology · 1991 · 10.1128/jb.173.13.4163-4170.1991 · 含路线图 · 有原文

核心问题:开发Rhodospirillum centenum的遗传操作系统,分离并鉴定参与光合作用(包括细菌叶绿素a合成、类胡萝卜素合成、反应中心组装、电子传递和氧调控)的突变体,从而开展该物种光合作用的遗传分析。

关键发现:共分离到38个细菌叶绿素a(Bchl a)合成突变体,覆盖从原卟啉IX到Bchl a八步反应中的七步:其中9个突变体(FY023等)阻断镁螯合酶/甲基转移酶步骤并积累原卟啉IX 等 6 条

微生物遗传学 Rhodospirillum centenum光合作用突变体类胡萝卜素细菌叶绿素生物合成遗传分析 Rhodospirillum centenum Rhodospirillum centenum Rhodospirillum centenum