共 145 篇

The ArcBA Two-Component System of Escherichia coli Is Regulated by the Redox State of both the Ubiquinone and the Menaquinone Pool

Journal of Bacteriology · 2010 · 10.1128/JB.01156-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:揭示大肠杆菌ArcBA双组分系统感知氧气的分子机制,特别是醌池(泛醌和甲基萘醌)的氧化还原状态对ArcB激酶活性的体内调控作用。

关键发现:['ArcA-P与cydAB调控区DNA结合的Kd(0.5)约0.25 μM,而未磷酸化ArcA约4.5 μM 等 4 条

微生物生理学与代谢调控 ArcBA two-component systemEscherichia colimenaquinonemicroaerobiosisredox sensingubiquinone Escherichia coli K-12... Escherichia coli K-12... Escherichia coli K-12...

A UDP-HexNAc:Polyprenol-P GalNAc-1-P Transferase (WecP) Representing a New Subgroup of the Enzyme Family

Journal of Bacteriology · 2011 · 10.1128/JB.01441-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定并表征一种新的UDP-HexNAc:polyprenol-P GalNAc-1-P转移酶(WecP),该酶特异性转移GalNAc至Und-P,区别于已知的WecA酶(转移GlcNAc)。

关键发现:A. hydrophila AH-3 WecP是首个被证明催化UDP-GalNAc的GalNAc-1-P转移到Und-P的酶,不能利用UDP-GlcNAc。体外酶活测定显示,野生型膜部分对GalNAc的掺入比活为8±1 U/mg/min 等 5 条

微生物学 Aeromonas hydrophila ... Escherichia coli VW187 Salmonella enterica LT2

RegA Control of Bacteriochlorophyll and Carotenoid Synthesis in Rhodobacter capsulatus

Journal of Bacteriology · 2007 · 10.1128/JB.00853-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:确定 RegA 是否直接调控 Rhodobacter capsulatus 中细菌叶绿素和类胡萝卜素合成基因表达,并鉴定其结合位点。

关键发现:bchE::lacZ 在野生型 SB1003 中厌氧诱导表达比好氧高 4-5 倍,regA 突变株 MS01 中无厌氧诱导 等 3 条

代谢工程 RegARhodobacter capsulatusbacteriochlorophyllcarotenoidphotosynthesis gene regulationtwo-component system Rhodobacter capsulatus Rhodobacter capsulatus Rhodobacter capsulatus

Product-Mediated Regulation of Pentalenolactone Biosynthesis in Streptomyces Species by the MarR/SlyA Family Activators PenR and PntR

Journal of Bacteriology · 2013 · 10.1128/JB.02079-12 · 含路线图 · 有原文

核心问题:链霉菌中倍半萜抗生素 pentalenolactone 生物合成基因簇的转录调控机制尚不清楚,尤其是产物如何反馈调节其自身的生物合成。

关键发现:['PenR 在体外与 penR-gapN 和 penM-penH 两个间隔区结合,PntR 只与 pntR-gapR 间隔区结合 等 5 条

代谢工程 MarR/SlyA家族PenRPntRpentalenolactone倍半萜抗生素转录调控 Streptomyces exfoliat... Streptomyces arenae T... Streptomyces exfoliat...

GlpR Represses Fructose and Glucose Metabolic Enzymes at the Level of Transcription in the Haloarchaeon Halofexa volcanii

Journal of Bacteriology · 2010 · 10.1128/JB.00827-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在模式嗜盐古菌Haloferax volcanii中,DeoR/GlpR型转录因子GlpR是否作为糖代谢的全局调控因子,并阐明其在转录水平对果糖和葡萄糖代谢关键酶的调控机制。

关键发现:glpR与pfkB共转录形成glpR-pfkB操纵子,果糖或葡萄糖培养时该操纵子转录水平比仅甘油时高10-20倍(glpR >20倍±7,pfkB >10倍±3;葡萄糖时glpR >10倍±4)。 等 8 条

微生物学与代谢调控 Haloferax volcanii Haloferax volcanii Haloferax volcanii

Characterization of the Corynebacterium glutamicum ΔpimB' Δmgta Double Deletion Mutant and the Role of Mycobacterium tuberculosis Orthologues Rv2188c and Rv0557 in Glycolipid Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2009 · 10.1128/JB.01729-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:明确结核分枝杆菌糖基转移酶 Rv2188c 和 Rv0557 在糖脂生物合成中的真实功能,解决此前基于体外研究的功能注释混乱。

关键发现:构建的 C. glutamicum ΔpimB' ΔmgtA 双缺失突变体在指数期生长速率从 等 3 条

代谢工程 Corynebacterium glutamicumMycobacterium tuberculosisRv0557Rv2188cglycolipid biosynthesismannosyltransferase Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta... Corynebacterium gluta...

The Nonmevalonate Pathway of Isoprenoid Biosynthesis in Mycobacterium tuberculosis Is Essential and Transcriptionally Regulated by Dxs

Journal of Bacteriology · 2010 · 10.1128/JB.01402-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:明确结核分枝杆菌非甲羟戊酸(DOXP)途径中关键基因dxs1和gcpE的必需性,并揭示该途径的转录调控机制。

关键发现:dxs1和gcpE在野生型结核分枝杆菌中均无法敲除(各尝试40个转化子均无缺失突变体),而在引入互补拷贝的merodiploid背景下可获得染色体缺失(dxs1为20/40,gcpE为23/40) 等 5 条

代谢工程 DOXP pathwayMycobacterium tuberculosisisoprenoid biosynthesisnonmevalonate pathwaytranscriptional regulation Mycobacterium tubercu... Mycobacterium tubercu... Mycobacterium tubercu...

3-Hydroxy-3-Methylglutaryl-Coenzyme A (CoA) Synthase Is Involved in Biosynthesis of Isovaleryl-CoA in the Myxobacterium Myxococcus xanthus during Fruiting Body Formation

Journal of Bacteriology · 2006 · 10.1128/JB.00825-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在粘细菌黄色粘球菌(Myxococcus xanthus)中,异戊酰辅酶A(IV-CoA)除来自亮氨酸降解外,还存在一条从甲羟戊酸途径分支的替代生物合成途径。本文旨在验证HMG-CoA合酶(MvaS)是否参与该替代途径,并探究该途径在子实体形成中的生理功能及调控机制。

关键发现:双突变体DK5624(Δbkd mvaS::kan)中主要异位脂肪酸iso15:0含量从野生型的41.9%降至bkd单突变体的16.8%,再降至双突变体的3.8% 等 4 条

代谢工程 HMG-CoA synthaseIsovaleryl-CoAMyxococcus xanthusfruiting body formationiso-fatty acids Myxococcus xanthus DK... Myxococcus xanthus DK...

Biochemical Characterization of a Novel Indole Phenyltransferase from Streptomyces sp. SN-593

Journal of Bacteriology · 2010 · 10.1128/JB.01557-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从Streptomyces sp. SN-593中鉴定并表征催化吲哚环C-6位二甲基烯丙基转移的新型吲哚异戊烯基转移酶IptA;此酶此前在自然界中未见报道。

关键发现:['从Streptomyces sp. SN-593培养液中分离并鉴定了新化合物6-DMAI-3-carbaldehyde,10升培养物产量为4.2 mg 等 5 条

代谢工程 6-二甲基烯丙基吲哚吲哚异戊烯基转移酶基因组挖掘链霉菌隐蔽基因 Streptomyces sp. SN-593 E. coli BL21 Star (DE3)

Involvement of CarA/LitR and CRP/FNR Family Transcriptional Regulators in Light-Induced Carotenoid Production in Thermus thermophilus††

Journal of Bacteriology · 2011 · 10.1128/JB.01125-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明极端嗜热菌Thermus thermophilus中光诱导类胡萝卜素生物合成的转录调控机制,特别是CarA/LitR家族和CRP/FNR家族转录调控因子的作用。

关键发现:野生型菌株在光照下产生黄色类胡萝卜素,暗处几乎不产生 等 5 条

代谢工程 CRP/FNR family regulatorLitRThermus thermophiluscobalaminlight-induced carotenoid productiontranscriptional regulation Thermus thermophilus ... Thermus thermophilus Thermus thermophilus

The role and function of LitR, an AdoB12- bound light- sensitive regulator of Bacillus megaterium QM B1551, in the regulation of carotenoid production

Journal of Bacteriology · 10.1128/JB.02528-14 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明革兰氏阳性菌Bacillus megaterium QM B1551中AdoB12结合的光敏转录调控因子LitR在光诱导类胡萝卜素生产中的角色与功能

关键发现:['光照诱导B. megaterium QM B1551产生类胡萝卜素,ΔlitR突变体在黑暗和光照下均大量产生类胡萝卜素,表明LitR是负调控因子', 'AdoB12-LitR在黑暗下以四聚体形式存在(Mr约139,000),光照下解离为二聚体(Mr约89,000) 等 5 条

代谢工程 Bacillus megateriumLitR/CarH familyMerR family transcriptional regulatoradenosyl B12carotenoid Bacillus megaterium Q... Bacillus megaterium Q... Bacillus megaterium Q...

Two Genes Encoding New Carotenoid-Modifying Enzymes in the Green Sulfur Bacterium Chlorobium tepidum

Journal of Bacteriology · 2006 · 10.1128/JB.00766-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在绿硫细菌 Chlorobium tepidum 中,负责氯菌烯(chlorobactene)末端修饰(羟基化后的糖基化和酰基化)的酶基因尚未被鉴定,无法完整描述其类胡萝卜素生物合成途径。

关键发现:CT1987 编码 OH-氯菌烯葡萄糖基转移酶(CruC),其失活导致 OH-氯菌烯葡萄糖苷和 OH-氯菌烯葡萄糖苷月桂酸酯消失,但仍产生 OH-氯菌烯(550.4 Da)。CT0967 编码 OH-氯菌烯葡萄糖苷月桂酰转移酶(CruD),其失活导致 OH-氯菌烯葡萄糖苷月桂酸酯(894.6 ... 等 2 条

代谢工程 Chlorobium tepidumacyltransferasecarotenoidcomparative genomicsglucosyltransferase Chlorobium tepidum Chlorobium tepidum Chlorobium tepidum

Characterization of a Zinc-Containing Alcohol Dehydrogenase with Stereoselectivity from the Hyperthermophilic Archaeon Thermoococus guaymasensis

Journal of Bacteriology · 2011 · 10.1128/JB.01433-10 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从超嗜热古菌Thermococcus guaymasensis中分离表征一种含锌的NADP+依赖醇脱氢酶,揭示其在乙醇/乙偶姻生成中的生理作用及其在不对称合成中的应用潜力。

关键发现:纯化的TgADH为同源四聚体,亚基分子量40±1 kDa;基因长1095 bp,编码365 aa(成熟364 aa);每个亚基含0.9±0.03 g-atom锌,无结构锌。该酶最适氧化pH 等 3 条

酶工程 NADPH再生Thermococcus guaymasensis含锌醇脱氢酶立体选择性超嗜热古菌 Thermococcus guaymase...

Metabolic Flux Ratio Analysis of Genetic and Environmental Modulations of Escherichia coli Central Carbon Metabolism

Journal of Bacteriology · 1999 · 10.1128/JB.181.21.6679-6688.1999 · 含路线图 · 有原文

核心问题:应用新发展的代谢通量比(METAFoR)分析方法,研究遗传和环境扰动对大肠杆菌中心碳代谢通量分布和代谢途径活性的影响,检验代谢网络的鲁棒性与可塑性。

关键发现:氨限制恒化培养相比葡萄糖限制,PEP分子经至少一次转酮醇酶反应的比例降低50%,OAA来自PEP的厌氧回补比例从约40%增至约70%,而PEP来自OAA的比例显著下降 等 6 条

代谢工程 13C核磁共振METAFoR中心碳代谢代谢通量比分析大肠杆菌通量组 Escherichia coli KO20 Escherichia coli JM10... Escherichia coli KO20

Substrate Specificities and Availability of Fucosyltransferase and β-Carotene Hydroxylase for Myxol 2′-Fucoside Synthesis in Anabaena sp. Strain PCC 7120 Compared with Synechocystis sp. Strain PCC 6803

Journal of Bacteriology · 2008 · 10.1128/JB.01881-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:比较蓝藻 Anabaena sp. PCC 7120 与 Synechocystis sp. PCC 6803 中岩藻糖基转移酶和β-胡萝卜素羟化酶在 myxol 2'-岩藻糖苷合成中的底物特异性,阐明类胡萝卜素生物合成途径的种间差异。

关键发现:Anabaena wcaG 缺失突变体中,myxol 2'-鼠李糖苷占5%,4-酮基 myxol 2'-鼠李糖苷占2%,脱氧 myxol 2'-鼠李糖苷占1%,游离 myxol 占3% 等 3 条

代谢工程 myxol糖苷β-胡萝卜素羟化酶岩藻糖基转移酶类胡萝卜素生物合成蓝藻 Anabaena sp. PCC 7120 Synechocystis sp. PCC... Anabaena sp. PCC 7120

Complete Biosynthetic Pathway of the C50 Carotenoid Bacterioruberin from Lycopene in the Extremely Halophilic Archaeon Haloarcula japonica

Journal of Bacteriology · 2015 · 10.1128/JB.02523-14 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明极端嗜盐古菌 Haloarcula japonica 中 C50 类胡萝卜素细菌红素(bacterioruberin)从番茄红素(lycopene)合成的完整生物合成途径,并鉴定关键酶的功能。

关键发现:Δc0506 突变株仅积累番茄红素(保留时间19.4 min,λmax 443/469/500 nm,m/z 536),说明 c0506 编码双功能番茄红素延长酶/1,2-水合酶(LyeJ) 等 3 条

代谢工程 C50类胡萝卜素CrtDCruF嗜盐古菌生物合成途径细菌红素 Haloarcula japonica Haloarcula japonica Haloarcula japonica

Control of Acetic Acid Fermentation by Quorum Sensing via N-Acylhomoserine Lactones in Gluconacetobacter intermedius

Journal of Bacteriology · 2008 · 10.1128/JB.01698-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明Gluconacetobacter intermedius中N-酰基高丝氨酸内酯(AHL)介导的群体感应系统及其对氧化发酵(乙酸和葡萄糖酸发酵)的调控机制。

关键发现:G. intermedius NCI1051产生三种AHLs:N-癸酰基-L-高丝氨酸内酯(C10-AHL)、N-十二酰基-L-高丝氨酸内酯(C12-AHL)和单不饱和C12-AHL。ginI或ginR的破坏完全消除AHL产生。ginR激活ginI转录,ginA与ginI共转录。ginI、gi... 等 2 条

发酵工程 Gluconacetobacter intermediusN-酰基高丝氨酸内酯乙酸发酵群体感应葡萄糖酸发酵 Gluconacetobacter int... Gluconacetobacter int... Gluconacetobacter int...

The Mevalonate Pathway of Staphylococcus aureus

Journal of Bacteriology · 2009 · 10.1128/JB.01357-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:研究金黄色葡萄球菌中甲羟戊酸途径的调控机制及其对细胞代谢、细胞壁合成和毒力的影响。

关键发现:构建了RN4220spacmvaS、RN4220spacmvaA、RN4220spacmvaK三种突变株 等 9 条

代谢工程 Staphylococcus aureuscell wall stimulonisoprenoid biosynthesismevalonate pathwaytranscriptional profiling Staphylococcus aureus... Staphylococcus aureus... Staphylococcus aureus...

Cloning, Solubilization, and Characterization of Squalene Synthase from Thermosynechococcus elongatus BP-1

Journal of Bacteriology · 2008 · 10.1128/JB.01939-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从产藿烷的嗜热蓝藻 Thermosynechococcus elongatus BP-1 中获得可溶、有活性的细菌角鲨烯合酶(SQS),并对其进行克隆、纯化和生化表征,以填补细菌 SQS 研究的空白。

关键发现:重组 T. elongatus BP-1 SQS 在大肠杆菌中表达时主要形成包涵体,通过在裂解/纯化缓冲液中加入 20%~50% 甘油并降低表达温度至 30°C,获得占胞质总蛋白约 3%~6% 的可溶性活性酶 等 3 条

代谢工程 可溶化嗜热蓝藻法尼基焦磷酸藿烷生物合成角鲨烯合酶酶动力学 Thermosynechococcus e... Escherichia coli Rose... Bradyrhizobium japoni...

Biosynthesis of Isoprenoid Wax Ester in Marinobacter hydrocarbonoclasticus DSM 8798: Identification and Characterization of Isoprenoid Coenzyme A Synthetase and Wax Ester Synthases

Journal of Bacteriology · 2007 · 10.1128/JB.01932-06 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定并表征海洋细菌Marinobacter hydrocarbonoclasticus DSM 8798中以植醇为碳源合成异戊二烯蜡酯的关键酶,即异戊二烯CoA合成酶和蜡酯合酶。

关键发现:从M. hydrocarbonoclasticus DSM 8798中克隆了4个CoA合成酶(Acs1-Acs4)和4个蜡酯合酶(WS1-WS4),序列与M. aquaeolei VT8同源物同一性>97%。其中Acs2(与P. putida FadD有64%同源性)能特异性活化植烷酸生成植烷... 等 4 条

代谢工程 CoA synthetaseMarinobacter hydrocarbonoclasticusWS/DGATisoprenoid wax esterphytolwax ester synthase E. coli E. coli E. coli