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A phthalate family oxygenase reductase supports terpene alcohol oxidation by CYP238A1 from Pseudomonas putida KT2440

作者
Stephen Graham Bell, Laura French, Nicholas Huw Rees, Sophia Shuyi Cheng, Gail Preston, Luet-Lok Wong
单位
School of Chemistry and Physics, The University of Adelaide; Department of Chemistry, University of Oxford, Inorganic Chemistry Laboratory; Department of Plant Sciences, University of Oxford
杂志
Biotechnology and Applied Biochemistry(2013)
DOI
10.1002/bab.1084
所属领域
代谢工程 / 酶工程
关键词
CYPP450PFORelectron transferphthalate dioxygenase reductaseterpenes
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解决的核心问题

鉴定恶臭假单胞菌KT2440中CYP238A1(PP1955)的底物特异性及其天然电子传递伙伴,并解析该P450酶参与萜烯醇氧化的分子机制。

研究策略

将CYP238A1和另一个P450(PP1950)以及邻苯二甲酸家族氧还原酶(PP1957)在E. coli中异源表达、纯化,通过I型光谱位移筛选底物,利用PFOR重建体外单加氧酶活性,并构建E. coli全细胞氧化体系进行产物分离和结构鉴定。

研究路线图

研究问题:鉴定CYP238A1底物及天然电子传递伙伴
策略:异源表达与纯化PP1955/PP1950/PP1957
关键改造1:体外P450重建体系(CYP238A1+PFOR)
关键改造2:全细胞氧化体系(E. coli共表达)
结果1:底物筛选与结合常数(cis-nerolidol Kd=1.96μM)
结果2:PFOR支持NADH/NADPH驱动氧化速率提升
结果3:区域选择性羟基化生成9-羟基神经醇
结论:CYP238A1为萜烯醇单加氧酶,PFOR是新型电子传递伙伴
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核心内容

该研究鉴定并表征了恶臭假单胞菌KT2440中细胞色素P450酶CYP238A1(PP1955)的底物特异性和电子传递伙伴。作者在E. coli中异源表达纯化了CYP238A1及邻苯二甲酸家族氧还原酶(PFOR, PP1957),通过光谱筛选发现CYP238A1可结合多种单萜和倍半萜醇,其中cis-nerolidol诱导55%高自旋血红素,结合常数Kd为1.96 μM。体外重建实验表明PFOR能有效支持CYP238A1催化活性,在4 μM PFOR条件下cis-nerolidol的NADH氧化速率达170 nmol(nmol-P450)⁻¹min⁻¹,且CYP238A1以NADH或NADPH为电子供体将cis-和trans-nerolidol分别区域选择性羟基化为9-羟基产物,不攻击烯烃双键,耦联效率约20%。全细胞体系同样获得相同产物。该研究首次发现PFOR可作为非融合型电子传递蛋白支持CYP238A1催化萜烯醇氧化,揭示了P450电子传递链的新型组织形式,为萜烯醇生物转化提供了新酶元件。

创新点

首次发现邻苯二甲酸家族氧还原酶(PFOR, PP1957)可作为非融合型电子传递蛋白支持CYP238A1催化萜烯醇氧化;鉴定CYP238A1对cis/trans-nerolidol的区域选择性羟基化生成9-羟基神经醇;提出CYP238A1/PP1957可能代表一类新型的P450电子传递链组织形式。

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Pseudomonas putida KT2440 萜烯醇氧化代谢 PP1955 CYP238A1 催化 细胞色素P450酶,氧化cis/trans-nerolidol生成9-羟基产物,也能氧化farnesol
Pseudomonas putida KT2440 P450电子传递链 PP1957 PFOR (邻苯二甲酸家族氧还原酶) 能量供给 从NADH/NADPH接受电子并传递给CYP238A1,支持其单加氧酶活性
Pseudomonas putida KT2440 未知代谢途径 PP1950 PP1950 催化 另一个P450酶,经筛选未发现底物,与3-氯苯甲酸诱导相关
Escherichia coli BL21(DE3) 萜烯醇氧化代谢 PP1955 CYP238A1 催化 异源表达用于体外和全细胞氧化实验
Escherichia coli BL21(DE3) P450电子传递链 PP1957 PFOR (邻苯二甲酸家族氧还原酶) 能量供给 与CYP238A1共表达于pETDuet载体,构建全细胞氧化体系

关键发现

  1. CYP238A1可结合多种单萜和倍半萜醇,其中cis-nerolidol诱导55%高自旋血红素,结合常数Kd为1.96 ±
  2. 08 μM;farnesol诱导25%高自旋,Kd为9.0 ±
  3. 6 μM。在体外重建体系中,0.5 μM CYP238A1和1 μM PFOR条件下,cis-nerolidol的NADH氧化速率为45 ± 2 nmol(nmol-P450)-1 min-1,NADPH速率为37 ± 3 nmol(nmol-P450)-1 min-1;当PFOR浓度增至4 μM时,NADH和NADPH速率分别提高到170和160 nmol(nmol-P450)-1 min-1。farnesol的NADH消耗速率为58 ±
  4. 1 nmol(nmol-P450)-1 min-1。CYP238A1以NADH或NADPH为电子供体将cis-nerolidol和trans-nerolidol分别单一氧化为9-羟基-cis-nerolidol和9-羟基-trans-nerolidol,未攻击烯烃双键,耦联效率约20%。全细胞体系可产生相同产物。

研究结论

CYP238A1(PP1955)是恶臭假单胞菌KT2440中的萜烯醇单加氧酶,催化神经醇的C9位选择性羟基化;PP1957编码的PFOR可有效向CYP238A1传递电子,可能是其生理电子传递伙伴。该研究为利用P450系统进行萜烯醇生物转化提供了新元件和策略。

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