共 23 篇

Directed Evolution of Subtilisin E into a Highly Active and Guanidinium Chloride- and Sodium Dodecylsulfate-Tolerant Protease

ChemBioChem · 2012 · 10.1002/cbic.201100714 · 含路线图 · 有原文

核心问题:提高枯草杆菌蛋白酶E(Subtilisin E)对离液盐盐酸胍(GdmCl)和去污剂十二烷基硫酸钠(SDS)的耐受性,以满足诊断试剂盒中细胞裂解和DNA提取的应用需求。

关键发现:获得最优变体SeSaM1-5(S62I/A153V/G166S/I205V),在1 M GdmCl中半衰期从<2 min提升至4.7 h(活性提高330%),在0.5% SDS中提升至2.7 h 等 5 条

蛋白质工程 SDSchaotolerantdirected evolutionguanidinium chlorideprotein modelssubtilisin E Bacillus subtilis WB600 Bacillus subtilis WB600 Bacillus subtilis WB600

Serial increase in the thermal stability of 3-isopropylmalate dehydrogenase from Bacillus subtilis by experimental evolution

Protein Science · 1998 · 10.1002/pro.5560070319 · 含路线图 · 有原文

核心问题:枯草芽孢杆菌3-异丙基苹果酸脱氢酶(IPMDH)热稳定性差,在高温下易失活,需要在不依赖三维结构信息的情况下提高其热稳定性。

关键发现:获得三个逐步氨基酸替换:T308I、I95L、M292I,使菌株在70°C下仍能亮氨酸自养生长 等 9 条

蛋白质工程 3-异丙基苹果酸脱氢酶嗜热栖热菌整合载体系统热稳定性进化分子工程 Thermus thermophilus ... Escherichia coli JA221 Thermus thermophilus ...

Elucidating the exact role of engineered CRABPII residues for the formation of a retinal protonated Schiff base

Proteins · 2009 · 10.1002/prot.22495 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明工程化CRABPII残基在视黄醛质子化席夫碱形成中的精确作用,特别是Lys132、Tyr134、Arg111和Glu121四个残基在亚胺形成和质子化中的角色。

关键发现:野生型CRABPII对全反式视黄酸的结合亲和力为2.0±1.2 nM 等 8 条

蛋白质工程 Burgi-Dunitz angleSchiff basecellular retinoic acid binding proteinordered water networkrhodopsin protein mimic Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Site-Directed Mutagenesis of Histidine-90 in Escherichia coli L-Threonine Dehydrogenase Alters Its Substrate Specificity

Archives of Biochemistry and Biophysics · 1998 · 10.1006/abbi.1997.0501 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明大肠杆菌L-苏氨酸脱氢酶(TDH)中His-90残基在催化中的作用及其对底物特异性的影响。

关键发现:野生型TDH的kcat为17.5 s^-1,Km(Thr)为3.03 mM;H90R、H90N、H90A突变体的kcat分别降至1.99、2.13、1.34 s^-1,Km(Thr)分别升至31.2、328、417 mM。突变体H90A的过渡态稳定化能降低6.6 kcal/mol。底物特异性方... 等 4 条

蛋白质工程 enzyme active siteprotein isolation and purificationsite-directed mutagenesissteady-state kineticssubstrate specificity Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Functional Expression of the Uncomplexed Serum Retinol-binding Protein in Escherichia coli: Ligand Binding and Reversible Unfolding Characteristics

Journal of Molecular Biology · 1993 · 10.1006/jmbi.1993.1194 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何在大肠杆菌中功能性表达未结合配体的血清视黄醇结合蛋白,并研究其配体结合与折叠稳定性

关键发现:重组RBP产量约0.15 mg/L培养物(A550=1.3) 等 5 条

蛋白质工程 E. coli secretionRBPlipocalin familyprotein foldingretinoic acid Escherichia coli JM83 Escherichia coli JM83 Escherichia coli JM83

Adding a positive charge at residue 46 of Drosophila alcohol dehydrogenase increases cofactor specificity for NADP+

FEBS Letters · 1994 · 10.1016/0014-5793(94)01234-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:果蝇乙醇脱氢酶(ADH)天然偏好NAD+而非NADP+,如何通过蛋白质工程改变其辅因子特异性,使其对NADP+的亲和力与催化效率显著提高。

关键发现:A46R突变体对NADP+的Km降低2.5倍(0.23 mM vs 野生型3.09 mM),kcat提高约2.5倍(1.9 s-1 vs 等 5 条

蛋白质工程 Drosophila ADHNADP+ binding to ADHSteroid and prostaglandin dehydrogenase Escherichia coli Escherichia coli

Recombinant expression of Intreplicacin from the scorpion Vaejovis intrepidus and its effect on skeletal ryanodine receptors

BBA - General Subjects · 2017 · 10.1016/j.bbagen.2017.01.032 · 含路线图 · 有原文

核心问题:蝎毒中钙调素(calcins)来源有限,化学合成繁琐且需要正确折叠,重组表达常需手动氧化,难以高效获得有活性的重组钙调素。本论文旨在建立一种无需手动氧化即能获得有活性重组 Intreplicacin 的异源表达方法,并验证其对骨骼肌 ryanodine 受体(RyR1)的药理活性。

关键发现:重组 Intreplicacin 以剂量依赖方式激活骨骼肌 RyR1,表观 Kd = 等 13 条

蛋白质工程 IntreplicacinScorpionVaejovis intrepiduscalcinryanodine receptorsarcoplasmic reticulum Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Engineering of a proteolytically stable human β2-adrenergic receptor/maltose-binding protein fusion and production of the chimeric protein in Escherichia coli and baculovirus-infected insect cells

Journal of Biotechnology · 2000 · 10.1016/S0168-1656(99)00216-3 · 含路线图 · 有原文

核心问题:人类β2-肾上腺素受体是一种高度疏水的G蛋白偶联受体,难以异源表达、纯化和结晶。需要设计一种蛋白水解稳定的融合蛋白,以便在细菌和昆虫细胞中高效生产并纯化该受体用于功能与结构研究。

关键发现:['E. coli中最高产量约3 pmol/mg粗膜蛋白,经蔗糖密度梯度离心后内膜炎性蛋白中达6 pmol/mg膜蛋白', 'E. coli中[3H]CGP-12177饱和结合KD=96±9 pM;竞争结合Ki:alprenolol 等 4 条

蛋白质工程 Fusion proteinHuman β2-adrenergic receptorMaltose-binding proteinMembrane protein purificationProteolytic stability Escherichia coli (XL1... Escherichia coli Spodoptera frugiperda...

A Chimeric Inorganic Pyrophosphatase Derived from Escherichia coli and Thermus thermophilus Has an Increased Thermostability

Biochemistry · 1999 · 10.1021/bi981445r · 含路线图 · 有原文

核心问题:探索决定无机焦磷酸酶热稳定性的关键因素,并通过随机嵌合酶法构建具有增强热稳定性的嵌合酶。

关键发现:Tth PPase在37°C的比活性为498 units/mg,E. coli PPase为1210 units/mg 等 3 条

蛋白质工程 Escherichia coliThermus thermophilusinorganic pyrophosphataserandom chimeragenesisthermostability Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21... Escherichia coli BL21...

Engineering a Rhodopsin Protein Mimic

Journal of the American Chemical Society · 2006 · 10.1021/ja058591m · 含路线图 · 有原文

核心问题:视紫红质中波长调节(opsin shift)的分子机制尚未阐明,且膜蛋白难以进行生物物理研究,缺乏彩色色素的3D结构,限制了对波长调节理论的验证。

关键发现:野生型CRABPII结合全反式视黄醛(RT)的Kd=6600 nM,λmax=377 nm;R132K:Y134F:R111L:T54V:L121E(KFLEV)突变体结合RT的Kd=2.7 nM,λmax=446 nm(pH 等 3 条

蛋白质工程 CRABPII波长调节蛋白质工程视紫红质模拟视黄醛质子化席夫碱 E. coli E. coli E. coli

In vivo and in vitro folding of a recombinant metalloenzyme, phosphomannose isomerase

Biochemical Journal · 1996 · 10.1042/bj3180437 · 含路线图 · 有原文

核心问题:重组金属酶磷酸甘露糖异构酶在大肠杆菌中异源表达时大量形成包涵体,可溶性活性蛋白得率低,需要提高可溶蛋白产量并理解体内外折叠机制。

关键发现:重组PMI在E.coli中最高表达量达总蛋白的30%,其中90%以包涵体形式存在 等 7 条

蛋白质工程 inclusion bodymolecular chaperonephosphomannose isomeraseprotein foldingzinc Escherichia coli stra... Escherichia coli Escherichia coli

Expression, characterization and engineered specificity of rat epididymal retinoic acid-binding protein

Biochemical Journal · 1998 · 10.1042/bj3340155 · 含路线图 · 有原文

核心问题:确定大鼠附睾视黄酸结合蛋白(ERABP)配体特异性的结构决定因素,并尝试通过工程改造改变其配体结合特异性。

关键发现:野生型ERABP仅结合视黄酸,表观解离常数Kd为0.9±0.2×10^-6 M 等 2 条

蛋白质工程 定点突变脂笼蛋白视黄酸结合蛋白视黄醇视黄醛配体特异性 Escherichia coli TOPP2 Escherichia coli TOPP2 Escherichia coli

The Carboxyl-terminal Region of the Geranylgeranyl Diphosphate Synthase is Indispensable for the Stabilization of the Region Involved in Substrate Binding and Catalysis

Journal of Biochemistry · 2007 · 10.1093/jb/mvm162 · 含路线图 · 有原文

核心问题:GGPS的C末端区域对其底物结合和催化活性稳定的作用机制尚不清楚

关键发现:野生型GGPS与Δ-4、Δ-8、Δ-12突变体的比活比值为1.0:0.84:0.26:0.0015 等 7 条

蛋白质工程 carotenoiddeletion mutantsgeranylgeranyl diphosphate synthaseprenyltransferasestructure and activity Escherichia coli JM10... Escherichia coli BL21...

Influence of mutations of Val226 on the catalytic rate of haloalkane dehalogenase

Protein Engineering · 1997 · 10.1093/protein/10.1.53 · 含路线图 · 有原文

核心问题:非催化残基Val226通过与Trp125和Phe172的相互作用如何影响卤代烷脱卤酶催化速率,尤其是限速的卤离子释放步骤;能否通过改变Val226侧链大小而不直接突变催化残基来调节酶活性。

关键发现:Val226Ala和Val226Leu突变体对1,2-二溴乙烷的催化速率比野生型高2.5倍 等 3 条

蛋白质工程 conformational changehaloalkane dehalogenasepre-steady state kineticsproduct exportprotein engineering Escherichia coli BL21... Escherichia coli JM101 Escherichia coli BW313

Improved folding of apo-retinol-binding protein in the periplasm of Escherichia coli: positive influences of dsbC coexpression and of an amino acid exchange in the vitamin A binding site

Protein Engineering · 1998 · 10.1093/protein/11.7.601 · 含路线图 · 有原文

核心问题:重组apo-RBP在大肠杆菌周质中折叠效率低,产生非天然二硫键异构体,产量低

关键发现:DsbC共表达使可溶性RBP产量增加约2倍(相对于不含dsbC的对照),并消除非天然二硫键异构体 等 2 条

蛋白质工程 bacterial expressiondisulphide bond isomersligand bindingmolecular modellingprotein-disulphide isomerase Escherichia coli JM83 Escherichia coli JM83

The dimerization of Pseudomonas putida cytochrome P450cam : practical consequences and engineering of a monomeric enzyme

Protein Engineering · 1997 · 10.1093/protein/10.12.1357 · 含路线图 · 有原文

核心问题:细胞色素P450cam通过分子间二硫键形成二聚体,导致酶在储存和操作中(尤其高浓度下)出现麻烦,影响实验解析。

关键发现:野生型P450cam二聚化速率常数k=1.09×10^-3 mM^-1 h^-1(4°C),1.1 mM样品8天内约20%转化为二聚体 等 3 条

蛋白质工程 cytochrome P450camdimerdisulfidemonoooxygenasemutagenesis Pseudomonas putida Escherichia coli Escherichia coli

Decreasing the stability and changing the substrate specificity of the Bacillus stearothermophilus alcohol dehydrogenase by single amino acid replacements

Protein Engineering · 1998 · 10.1093/protein/11.10.925 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明嗜热脂肪芽孢杆菌乙醇脱氢酶热稳定性的分子基础,并探究单个氨基酸替换对其稳定性和底物特异性的影响

关键发现:野生型ADH-hT在75°C保温30min后仍保留75%活性,而Glu11Lys、Pro242Ala和双突变体在75°C下50%失活时间分别为30、26和18min 等 3 条

蛋白质工程 alcohol dehydrogenaseexpressionsite-directed mutagenesisthermal adaptation Escherichia coli RB791 Escherichia coli RB791 Escherichia coli RB791

The effect of proline insertions on the thermostability of a barley α-glucosidase

Protein Engineering · 2002 · 10.1093/protein/15.1.29 · 含路线图 · 有原文

核心问题:大麦α-葡萄糖苷酶热稳定性不足,限制了其在工业乙醇生产中高温淀粉糖化(65-73°C)过程中的应用效率。

关键发现:大麦α-葡萄糖苷酶热稳定性最低,55°C处理10分钟后仅保留10%活性 等 4 条

蛋白质工程 Hordeum vulgarealpha-glucosidasemaltaseproline insertionstarch degradationthermostability Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115 Pichia pastoris GS115

Nuclear receptor engineering based on novel structure activity relationships revealed by farnesyl pyrophosphate

Protein Engineering, Design and Selection · 2010 · 10.1093/protein/gzq056 · 含路线图 · 有原文

核心问题:FPP作为混杂核受体配体,其激活不同核受体的结构基础不清楚,难以理性设计改变配体特异性的核受体突变体

关键发现:FPP激活核受体需满足:LBP体积在300-430 ų之间(激活组为300-400 ų,非激活组通常为400-850 ų) 等 3 条

蛋白质工程 farnesyl pyrophosphatenuclear receptorsprotein engineeringrational designstructure-activity relationships HeLa细胞 HeLa细胞 HeLa细胞