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Combinatorial Biosynthesis of Carotenoids in a Heterologous Host: A Powerful Approach for the Biosynthesis of Novel Structures

作者
Gerhard Sandmann
杂志
ChemBioChem(2002)
DOI
10.1002/1439-7633(20020703)3:7<629::AID-CBIC629>3.0.CO;2-5
所属领域
合成生物学
关键词
antioxidantscarotenoidscarotogenic genesmetabolic engineeringterpenoids
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解决的核心问题

稀有或新型类胡萝卜素的结构多样性与可用性有限,需要异源表达和组合生物合成来生产,并解决前体供应不足的问题。

研究策略

以大肠杆菌为异源宿主,组合表达来自细菌、真菌和植物的不同类胡萝卜素合成基因,利用酶的区域选择性识别底物,产生多种天然或新型类胡萝卜素;同时通过过表达dxs、dxr、idi、pps等基因进行代谢工程,增强萜类前体供应。

研究路线图

目标:生产新型类胡萝卜素
异源宿主:大肠杆菌
组合表达多种来源合成基因
利用酶区域选择性识别底物
代谢工程增强前体供应
关键改造:基因shuffling
产生新结构(13个共轭双键)
产量显著提高
结论:按需定制目标分子的平台
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创新点

1) 利用组合生物合成策略在大肠杆菌中生产了多种前所未有的类胡萝卜素结构(如1-羟基化无环结构,最多含13个共轭双键);2) 通过基因shuffling修饰八氢番茄红素脱氢酶,获得引入6个双键的突变酶;3) 代谢工程改造MEP途径显著提高类胡萝卜素产量。

研究对象(29)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtM diapophytoene synthase 催化 C30链合成,底物FPP
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtN diapophytoene desaturase 催化 C30链合成,底物diapophytoene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtE GGPP synthase 催化 C40链合成,底物FPP生成GGPP
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtB phytoene synthase 催化 GGPP生成phytoene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 pds phytoene desaturase (CrtP/Pds) 催化 生成poly-cis ζ-carotene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtIEC phytoene desaturase 催化 底物phytoene,产物neurosporene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtIECU phytoene desaturase 催化 底物phytoene,产物all-trans lycopene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 al-1 phytoene desaturase Al-1 催化 底物phytoene,产物3,4-didehydrolycopene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtQa ζ-carotene desaturase 催化 底物ζ-carotene,产物all-trans lycopene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtQb ζ-carotene desaturase 催化 底物ζ-carotene,产物poly-cis lycopene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtH carotene isomerase 催化 poly-cis lycopene异构化为all-trans lycopene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtD 3,4-carotene desaturase 催化 底物hydroxyneurosporene,产物demethylspheroidene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtY lycopene β-cyclase 催化 lycopene生成β-carotene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 lyc-e lycopene ε-cyclase 催化 lycopene生成δ-carotene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtZ β-carotene hydroxylase 催化 β-carotene生成zeaxanthin
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 zep zeaxanthin epoxidase 催化 zeaxanthin生成violaxanthin
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtA spheroidene ketolase 催化 spheroidene生成spheroidenone
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtW/bkt β-carotene ketolase 催化 β-carotene生成canthaxanthin
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtO β-carotene ketolase 催化 β-carotene生成echinenone
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtC hydratase 催化 neurosporene生成1-hydroxyneurosporene
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtX glycosylase 催化 zeaxanthin生成zeaxanthin diglucoside
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtEb lycopene elongase 催化 lycopene生成flavuxanthin/nonalfavuxanthin
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtYe-crtYf decaprenoxanthin synthase 催化 flavuxanthin生成decaprenoxanthin
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtBY bifunctional phytoene synthase/lycopene cyclase 催化 来自Xanthophyllomyces dendrorhous,兼有八氢番茄红素合成和番茄红素环化活性
Escherichia coli 萜类前体生物合成 dxs 1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase 催化 MEP途径,底物甘油醛/丙酮酸生成1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸
Escherichia coli 萜类前体生物合成 dxr 1-deoxyxylulose-5-phosphate reductoisomerase 催化 MEP途径,生成2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸
Escherichia coli 萜类前体生物合成 idi isopentenyl pyrophosphate isomerase 催化 IPP与DMAPP互变
Escherichia coli 萜类前体生物合成 pps phosphoenolpyruvate synthase 催化 丙酮酸生成磷酸烯醇式丙酮酸,影响前体平衡
Escherichia coli 类胡萝卜素生物合成 crtRc putative phytoene desaturase 催化 来自Rhodobacter capsulatus,与其他基因组合产生氢化β-胡萝卜素

关键发现

['已鉴定的天然类胡萝卜素超过600种。', '八氢番茄红素脱氢酶的脱氢产物可具有2至5个额外双键。', '通过组合生物合成,获得的1-羟基化无环类胡萝卜素具有最多13个共轭双键。', '对来自两种Erwinia的八氢番茄红素脱氢酶基因进行shuffling,得到的重组酶可引入6个双键(野生型为4个)。', '过表达dxs、dxr、idi和pps可提高类胡萝卜素产量(原文无具体数值,但可写“显著提高”)。']

研究结论

大肠杆菌作为类胡萝卜素异源生产系统能提供结构多样的类胡萝卜素,有助于研究结构-抗氧化活性关系;组合生物合成有望按需定制目标分子;通过代谢工程可增加产量,但膜上类胡萝卜素沉积可能成为限制因素,未来可通过增加膜量或建立类似质体小球的结构来扩展储存能力。

源文件 10.1002%1439-7633(20020703)3:7<629::AID-CBIC629>3.0.CO;2-5.md · 29760 字符 · 抽取模型 deepseek-v4-flash · 21311 token