核心问题：系统梳理葡萄球菌属产生的生物活性次级代谢物（包括核糖体合成和翻译后修饰肽、非核糖体肽、萜烯和铁载体等）的化学多样性、生物合成途径、作用机制及工业化应用潜力，并探讨如何挖掘尚未表征的隐性生物合成基因簇。
关键发现：葡萄球菌可耐受 等 3 条
核心问题：研究2-甲基异冰片（2-MIB）生物合成相关Cnb蛋白的功能，尤其是它们在细胞内2-MIB保留中的作用。
关键发现：含cnbA-mtf-mtc-cnbB的大肠杆菌菌株细胞内2-MIB浓度为0.004 μg/ml/OD600，细胞外为0.0018 μg/ml/OD600 等 2 条
核心问题：传统分子生物学方法（如菌落PCR、限制酶切）检测质粒结构变化费时费力，无法实时监测生物生产过程中由质粒重组引起的细胞异质性。
关键发现：通过流式细胞术可在10和50 μM IPTG条件下区分三种GFP亚群（-GFP、+GFP、++GFP）。在100 mL培养中，10 μM IPTG时柠檬烯产量最高达530 mg/L，携带不正确质粒的亚群比例仅12% 等 2 条
核心问题：阐明红酵母Rhodosporidium kratochvilovae中乙酰-CoA合成酶同工酶RkACS1和RkACS2在类胡萝卜素和脂质生物合成中的不同生理功能及调控机制，为优化乙酰-CoA衍生物的生产提供靶点。
关键发现：RkACS1缺失使乙酸积累增加34.65%（38.70→52.11 mg/L），乙酰-CoA水平降低34.62%（698.34→456.55 nmol/mg），类胡萝卜素含量降低20.22%（4.45→3.55 mg/g DCW），但总脂增加140.68%（6.12→14.73% DCW）、总... 等 3 条
核心问题：验证拟南芥中计算预测的PSY基因异构体是否具有真实的八氢番茄红素合酶活性，揭示TAIR数据库代表模型的准确性。
关键发现：PCR未能从拟南芥cDNA中扩增出编码AtPSY^extra的序列 等 4 条
核心问题：阐明TksMYC2转录因子调控Taraxacum属植物中天然橡胶、倍半萜内酯及其他次生代谢物生物合成的分子机制。
关键发现：过表达TksMYC2的Tks-15系中TksMYC2表达量为野生型的3.3倍，Tb-2和Tb-18系分别为6.4和7.6倍 等 9 条
核心问题：生物燃料生产成本高、经济可行性差，需要寻找提高其经济竞争力的策略，例如在高粱中同时生产高价值萜类产品。
关键发现：生物能源高粱干物质产量约35 Mg/ha，纤维素36-38%，半纤维素25-29%，木质素8-9%；角质层蜡质回收量约100-200 kg/ha，萜类占角质层碳沉积约40%，叶表面负载量为8.0±0.8 μg/cm²；通过Tau分析（t>0.9）和表达筛选（茎表皮≥20 TPM、叶中部>10 ... 等 4 条
核心问题：印度药用植物精油化学成分及相关数据分散在文献中，缺乏系统化、区域专属且FAIR兼容的数据库，限制了精油产量与组成优化、质量标准制定及治疗和香氛应用研究。
关键发现：sCentInDB收录554种印度药用植物、2170个精油化学谱（植物部位水平）、3420种化学物质、471个植物部位-治疗用途关联、120个植物部位-气味关联和218个植物部位-颜色关联。精油谱共涉及815种精油（样本扩展后2170个），其中叶片是最大提取部位（266种植物）。化学物质以萜类...
核心问题：解析甲羟戊酸(MVA)途径受扰动后，丹参中其他生物学过程如何协同响应的分子机制，及转录因子在此过程中的调控枢纽作用。
关键发现：LOV处理后，各时间点(2、4、6、8、10、12h)分别鉴定出748、228、239、434、887和1661个差异表达基因(DEGs) 等 5 条
核心问题：探究长春花（Catharanthus roseus）中DELLA和GID1基因的鉴定及其对长春碱前体vindoline生物合成的潜在调控作用
关键发现：VIGS沉默CrDELLA使未成熟叶中T3O、T3R、NMT、D4H表达显著下降20-30%（p分别为0.03、0.01、0.02、0.008），成熟叶中D4H下降45%（p=0.02） 等 2 条
核心问题：芳樟醇传统植物提取成本高、产量低、受季节性制约，需要寻找可持续、经济的微生物生产方法，利用低成本甜菜汁作为碳源。
关键发现：工程菌E. coli W(pZR1464)通过共表达LinS和DXP操纵子，以甜菜汁为唯一碳源，72h累积产生141.6 μmol芳樟醇 等 5 条
核心问题：解析奇楠种质（Aquilaria sinensis）中倍半萜合酶基因AsSS15的分子特征与创伤诱导表达特性，阐明其在沉香倍半萜生物合成中的作用。
关键发现：AsSS15基因全长1812 bp，编码603个氨基酸，蛋白分子量69.16 kDa，等电点5.92 等 8 条
核心问题：食品废弃物（FW）成分多变且含有乳酸等抑制物，阻碍其作为第二代原料用于新型生物表面活性剂（bola sophoroside）的稳定生产。
关键发现：52批FW组成变异：pH均值3.95±0.19，DM%均值19.71±2.85%，蛋白均值22.43±16.64 g/L，乳酸均值35.04±7.86 g/L（范围12.30–52.34 g/L），葡萄糖释放均值28.55±8.79 g/L。24批FW均支持S. bombicola生长和bol... 等 5 条
核心问题：产油酵母的独特代谢机制和遗传工具开发相对滞后，限制了其作为可持续生物制造底盘的高效利用
关键发现：产油酵母脂质可积累至细胞干重的85% 等 10 条
核心问题：如何将兼性化能自养菌 Cupriavidus necator H16 优化为好氧 C1（CO2、甲酸、甲醇、CO 等）生物转化平台宿主，以实现高效的碳固定与产物合成。
关键发现：['C. necator H16 在有机酸、CO2/H2 和甲酸上的最大比生长速率分别为 等 10 条
核心问题：在大肠杆菌中实现异戊烯基柚皮素（PN）化合物的从头生物合成，需要克服两个关键瓶颈：细胞内DMAPP前体供应不足，以及植物来源膜结合型异戊烯基转移酶在大肠杆菌中表达困难。
关键发现：在96孔板筛选中，12种组合能够从葡萄糖从头产生PN，最佳菌株E. coli M-PAR-121:EcDXS（表达CloQ和柚皮素途径）产生3'-PN 等 3 条
核心问题：在海洋硅藻 Phaeodactylum tricornutum 中异源生产 β-蒎烯，探讨叶绿体 MEP 途径与胞质 MVA 途径哪个更能为单萜合成提供前体，并比较附加体表达与随机染色体整合对产量的影响。
关键发现：['叶绿体定位的附加体表达（EE_CTP_AgPinS）最高 β-蒎烯产量为 等 5 条
核心问题：利用细菌共培养策略缓解啤酒糟半纤维素水解液中毒性化合物对产2,3-丁二醇和乙偶姻的抑制作用，避免传统脱毒步骤。
关键发现：共培养（P. polymyxa + Rhodococcus sp.）的糖消耗速率为1.01 g/L·h，高于P. polymyxa单培养的0.88 g/L·h 等 4 条
核心问题：异戊烯醇（3-甲基-3-丁烯-1-醇）是航空燃料前体，但其对底盘菌株Pseudomonas putida KT2440的毒性限制了产量、速率和得率，需要提高菌株对异戊烯醇的耐受性以实现高效生产。
关键发现：进化菌株在8 g/L异戊烯醇下可稳健生长（最高比生长速率约0.2~0.25 h^-1），而起始菌株无法生长。在4 g/L异戊烯醇下，所有进化分离株的平均生长速率提高1.8倍（约0.50 h^-1），滞后时间从约1小时降至几乎为零。TALE实验经历约143-353代，累计细胞分裂数达1.33×1... 等 3 条
核心问题：目前微生物细胞工厂研究通常局限于少数模式菌株（如CEN.PK2-1C），这些菌株并非针对特定工业过程进行优化，导致目标产物产量偏低。本研究旨在利用酿酒酵母种内遗传多样性，筛选更优底盘菌株用于柠檬烯生产，并探究不同底盘菌株是否需要定制化的代谢工程策略。
关键发现：在300 mM柠檬烯筛选浓度下，921株酿酒酵母中仅431株（46%）生长OD600>1.0，模式菌株CEN.PK2-1C、S288C、W303均无法生长 等 4 条