核心问题：利用深度转录组测序解析长春花中萜类吲哚生物碱（TIA）生物合成途径相关基因及其组织特异性表达，为植物源药物生产提供基因资源。
关键发现：该研究共生成约3.43亿条高质量reads，经组装与合并后获得59,220条unigenes，平均长度1284 bp，N50为2115 bp 等 2 条
核心问题：异戊二烯类化合物结构复杂，很多只能依赖天然提取，成本高且风险大；通过微生物发酵生产也面临产量和效率瓶颈。本文旨在开发一种体外酶促平台，高效合成异戊二烯前体异戊烯基焦磷酸（IPP）和二磷酸甲羟戊酸（DPM），从而为异戊二烯类药物和燃料的商业化生产提供替代途径。
关键发现：['在标准单锅反应中，约98%的乙酸被转化为DPM。', '高浓度条件下，从乙酸出发合成DPM和IPP的产量分别达到22 g/L和18 g/L，转化率分别为63%和69%。', '从(R/S)-甲羟戊酸出发合成DPM和IPP的产量分别达到42 g/L和35 g/L，转化率分别为73%和77%。...
核心问题：如何将PmRab7和VP28两种蛋白展示在毕赤酵母细胞表面，并保持其结合活性，以便用于口服给药保护虾免受WSSV感染。
关键发现：成功在毕赤酵母细胞表面展示mPmRab7和pVP28 等 6 条
核心问题：缺乏可靠的萜烯合酶活性高通量筛选方法，因为其底物和产物通常无色、结构多样且易挥发，严重限制了萜烯合酶的定向进化和突变分析。
关键发现：该方法可检测TXS（二萜合酶）、TEAS（倍半萜合酶）、GES（单萜合酶）及FDS变体的活性 等 6 条
核心问题：阐明Xanthophyllomyces dendrorhous中从异戊烯基焦磷酸（IPP）和二甲基烯丙基焦磷酸（DMAPP）合成香叶基香叶基焦磷酸（GGPP）的关键酶学步骤，并评估FPS和crtE基因对类胡萝卜素（尤其是虾青素）生物合成的影响，为代谢工程改造提供靶点。
关键发现：FPS基因编码355个氨基酸（预测分子量40.24 kDa），crtE基因编码376个氨基酸（42.16 kDa） 等 6 条
核心问题：利用光合蓝细菌可持续生产角鲨烯，并鉴定蓝细菌中参与角鲨烯合成与代谢的关键酶（角鲨烯hopene环化酶和角鲨烯合酶）。
关键发现：失活shc基因的Δshc菌株在稳定期角鲨烯含量为0.67±0.102 mg OD750^-1 L^-1，野生型仅为0.0093±0.0031 mg OD750^-1 L^-1，积累量提高超过70倍 等 5 条
核心问题：青蒿素生物合成产量有限，需要提高其积累水平；内源茉莉酸（JA）对青蒿素合成的调控作用尚不明确。
关键发现：转基因青蒿中AaAOC表达量提高1.6-5.2倍 等 9 条
核心问题：解析毕赤酵母（Komagataella phaffii）在典型甲醇补料分批培养中，外源蛋白（人胰蛋白酶原）表达和甲醇适应延迟的分子机制，发现细胞质氧化还原失衡导致翻译停滞，而非此前认为的分泌应激/UPR。
关键发现：试管培养中，3拷贝TRY1菌株上清胰蛋白酶原表达量约为1拷贝菌株的50%，且HAC1表达较1拷贝高3-4倍。补料分批培养中，TRY1-3菌株甲醇添加后至少24h内几乎无生物量增加 等 4 条
核心问题：解析植物抗毒素capsidiol对两种寄主范围不同的疫霉菌（Phytophthora infestans和Phytophthora capsici）的差异敏感性，及其与寄主范围一致性的关系。
关键发现：P. infestans在capsidiol浓度为50 μM时生长受抑，120 μM完全抑制 等 6 条
核心问题：如何快速获得稳定遗传和稳定表达的β-胡萝卜素合成转基因水稻纯合系，避免多代自交选育的耗时问题
关键发现：从23个阳性转化株的花药培养获得790株绿苗，其中390株PCR阳性 等 5 条
核心问题：海南粗榧（Cephalotaxus hainanensis）是一种濒危植物，含有多种抗癌活性代谢物，但缺乏分子信息，其生物碱代谢途径尚未表征，限制了通过代谢工程开发利用其药用次生代谢物。
关键发现：测序获得51,442,422条短序列读长（总计5,195,684,622个核苷酸），从头组装得到39,416条unigenes，平均长度1,089.78 bp，总组装大小42,954,608 bp（约45.8 Mbp），最大unigene为8,604 bp，最小为351 bp 等 2 条
核心问题：如何通过组合调控多个胁迫响应基因（抑制ESK1及过表达CBF/ICE1）来显著提高植物抗旱性，并评估其效应与代价。
关键发现：siRNA抑制ESK1后，大多数株系基因表达降低约50%以上 等 7 条
核心问题：在产类胡萝卜素酵母Xanthophyllomyces dendrorhous中，细胞色素P450还原酶(CrtR)基因突变后菌株仍然存活，说明存在替代的P450电子供体。本文旨在鉴定和表征CBR-CYB5通路是否作为替代电子供体参与麦角固醇和类胡萝卜素生物合成。
关键发现：本研究鉴定到两个CBR基因（CBR.1和CBR.2）和一个CYB5基因。CBR.1基因ORF 870 bp，编码289 aa（31.48 kDa） 等 6 条
核心问题：比较兼性甲基营养菌Methylobacterium extorquens PA1与模式菌株AM1在遗传和表型上的差异，验证AM1数十年积累的甲基营养代谢知识是否适用于基因组更加精简、未经长期实验室驯化的PA1，并评估PA1作为替代模式菌株的可行性。
关键发现：PA1与AM1共有4260个编码序列（氨基酸同一性>30%），90个已知甲基营养基因中62个同一性>99%，其余28个≥95% 等 11 条
核心问题：如何系统筛选影响转基因烟草细胞悬浮培养中生物量积累和香叶醇产量的关键培养参数，避免单因素实验的局限性。
关键发现：蔗糖、装液量和接种量对香叶醇产量有正效应，主要通过促进细胞生长实现 等 5 条
核心问题：验证拟南芥转录因子CPC和GL3能否在番茄中调控花青素生物合成，并解析其作用机制。
关键发现：获得10个T2转基因番茄株系，其中8个35S::CPC和3个GL3::GL3纯合系 等 2 条
核心问题：鉴定丹参不同组织中的microRNA及其靶基因，揭示它们在丹参酮生物合成中的调控作用。
关键发现：共鉴定到452个已知miRNA（对应589个pre-miRNA）和40个新miRNA（对应24个pre-miRNA） 等 5 条
核心问题：确定甘蓝型油菜中六个PSY基因是否均编码功能性八氢番茄红素合酶，并评估其作为油料作物类胡萝卜素代谢工程转基因候选基因的潜力。
关键发现：六个B. napus PSY蛋白序列一致性为87.3%-98.8%，去除转运肽后为91.6%-99.4% 等 4 条
核心问题：土壤盐渍化和干旱胁迫严重影响苜蓿等作物的产量和品质，亟需开发兼具多重非生物胁迫耐受性和更高营养价值的苜蓿品种。
关键发现：共获得11个转基因苜蓿株系，其中SOR2、SOR3、SOR8的IbOr表达量最高。MV诱导氧化胁迫24 h后，SOR2/3/8的离子渗漏率分别为32%、22.8%、31.7%，显著低于非转基因对照的68.2%。250 mM NaCl处理7天，SOR株系叶绿素含量仅降低21%–25%，而对照降低... 等 2 条
核心问题：解析海洋链霉菌Streptomyces sp. CNQ-509中ABBA异戊烯基转移酶的多样性，发现具有宽泛底物特异性的新型生物催化酶，并阐明其在萜类杂合天然产物生物合成中的作用。
关键发现：基因组测序获得7,998,446 bp的草图序列，平均覆盖度87.7倍，GC含量73.1%，预测6,412个编码序列。鉴定到8个ABBA异戊烯基转移酶基因（AA958_30735, AA958_18620, AA958_24325, AA958_24270, AA958_12625, AA95... 等 2 条