核心问题：地衣芽孢杆菌WX-02利用甘油作为唯一碳源的能力较弱，导致γ-聚谷氨酸（γ-PGA）产量不高，需要解析其甘油代谢途径并进行代谢工程改造以提高甘油利用效率和γ-PGA产量。
关键发现：基因敲除实验表明ΔglpK和ΔglpD突变株在好氧和厌氧条件下均不能利用甘油，而ΔgldA1、ΔgldA2和ΔdhaK突变株生长正常，说明GlpK途径是唯一功能性甘油分解途径。用P43、PytzE和PbacA启动子替换glpFK天然启动子后，突变株WX02-P43glpFK、WX02-Pytz...
核心问题：解析 Fusarium fujikuroi 中全局调控因子 Lae1 对次生代谢的基因组范围调控机制，并探索其与组蛋白乙酰转移酶 HAT1 的关联。
关键发现：微阵列分析显示 Lae1 影响 2452 个基因表达：Δlae1 中低氮下 242 个基因下调、241 个上调，高氮下 273 个上调、473 个下调；OE:LAE1 中高氮下 704 个上调、851 个下调。过表达 HAT1 使 Δlae1 的 GA 产量提高 7 倍，达到野生型的约 75%... 等 5 条
核心问题：如何提高内生真菌Paraconiothyrium SSM001中抗癌药物紫杉醇（Taxol）的产量，其关键在于增加萜类前体GGPP（香叶基香叶基二磷酸）的供应。
关键发现：外源饲喂IPP和GGPP分别使真菌Taxol产量提高3倍和5倍 等 3 条
核心问题：Oenococcus oeni在葡萄酒高乙醇浓度下苹果酸乳酸发酵（MLF）易停滞、不可靠的问题
关键发现：连续培养290天，乙醇浓度从0逐步升至15% (v/v)，生长速率从0.10 h⁻¹降至0.05 h⁻¹ 等 6 条
核心问题：提高宏基因组β-糖苷酶MeBglD2的热稳定性，以改善其在植物生物质糖化中的应用性能。
关键发现：野生型MeBglD2在56°C处理30min几乎完全失活，H8L、N59C、A295G单突变体分别保留13%、63%和61%活性 等 3 条
核心问题：全面表征新的细胞色素P450酶CYP109E1的底物谱，探索其催化他汀类（他汀前体compactin、前药lovastatin和simvastatin）及多种萜烯类化合物的氧官能化能力，特别是工业上重要的pravastatin生产。
关键发现：CYP109E1对simvastatin结合最强（Kd=4.7±1.8 μM），对compactin的Kd=84±13 μM，对lovastatin的Kd=9.6±3.5 μM 等 4 条
核心问题：阐明C. beijerinckii NRRL B-598中孢子形成与溶剂生成之间的调控关系，比较野生型与spo0A过表达突变株在产溶剂、产酸及关键基因表达上的差异。
关键发现：野生型在TYA和RCM培养基中丁醇产量分别为9.8 g/L和9.1 g/L（24小时） 等 6 条
核心问题：桧烯（sabinene）是一种重要的双环单萜，可作为香料、精细化学品和先进生物燃料，但目前缺乏经济可行的商业化生产方法。化学合成因复杂环结构困难，植物提取含量低且分离复杂，需开发微生物合成路线。
关键发现：大肠杆菌经MEP和MVA双途径结合GPP合酶与S. pomifera桧烯合酶，摇瓶产量82.18 mg/L，补料分批发酵达2.65 g/L（甘油得率3.49%） 等 5 条
核心问题：异戊二烯合酶（IspS）天然活性低，缺乏高通量筛选高活性IspS突变体的简单快速方法，限制了异戊二烯生物合成的工业化应用。
关键发现：FACS分析显示，添加10 μM DMAPP后，高荧光阳性细胞比例从34.9%降至21.7%（降低38%），最高eGFP荧光强度从10^5降至10^4 等 4 条
核心问题：探究酿酒酵母中三酰甘油合成的调控机制，并评估通过基因工程限制能量储存（糖原、三酰甘油、甾醇酯）是否能够提高乙醇生产效率。
关键发现：Dgalp表观Km为17.0±5.6 μM，表观Vmax为5.8±2 nmol/min/mg，相比Lptlp的Km低约3倍，Vmax低20倍 等 4 条
核心问题：Swertia japonica作为重要药用植物，缺乏基因组和转录组资源，其治疗性代谢产物（如獐牙菜苦苷、龙胆苦苷等）生物合成的分子基础不清楚。
关键发现：共获得约2.2 Gbp高质量clean reads（地上组织1,193,840,800 bp，根950,603,200 bp） 等 6 条
核心问题：在类胡萝卜素池有限的白色玉米品系中，通过表达拟南芥OR基因促进类胡萝卜素积累，并明确AtOR在不同遗传背景下增强类胡萝卜素积累的条件和机制。
关键发现：['在白色玉米M37W中过表达AtOR，最佳系OR2在30 DAP时总类胡萝卜素含量约为25 μg/g DW，比野生型提高32倍，且不改变类胡萝卜素组成。', 'OR2中玉米黄质、花药黄质、叶黄素、紫黄质分别增加约30倍、170倍、23倍和15倍。', '将OR2与低酮类胡萝卜素系KETO1杂... 等 2 条
核心问题：解析胡黄连（Picrorhiza kurroa）中picroside-I（P-I）生物合成的发育调控机制，识别不同形态发生阶段中参与P-I合成的关键基因，并探究温度、外植体和物种差异对P-I积累的影响。
关键发现：在P. kurroa中，P-I含量在脱分化阶段（CI和CM）从2.51 μg/mg降至不可检测水平，在再分化阶段（SP、MS、FD）逐渐回升，FD阶段由叶段和根段在15℃下分别达3.65和2.87 μg/mg。在FD阶段，7个基因（HMGR、PMK、DXPS、GS、G10H、DAHPS、PAL... 等 3 条
核心问题：生物活性松香烷二萜（如aethiopinone）在植物中产量极低，难以满足对其作用机制研究和药物开发的需求，需要建立高效的生产平台。
关键发现：在Salvia sclarea毛状根中，MeJA（100 μM）处理7天使aethiopinone含量达到9.72±0.08 mg/g DW（较对照0.38±0.07 mg/g DW增加25倍），产量为92.34±1.21 mg/L；Cor（0.1 μM）处理7天含量为2.57±0.15 mg... 等 3 条
核心问题：揭示耐盐藻Dunaliella bardawil在光胁迫下积累9-顺式β-胡萝卜素的分子机制，鉴定催化全反式β-胡萝卜素转化为9-顺式β-胡萝卜素的新型异构酶。
关键发现：从Dunaliella bardawil质体脂滴中鉴定到两个与水稻D27高度同源的蛋白9-cis-βC-ISO1和9-cis-βC-ISO2，与叶绿体蛋白相比，在油滴中富集6-17倍 等 5 条
核心问题：探究通过敲除类胡萝卜素分解代谢基因（OsCYP97A4、OsDSM2、OsCCD4a、OsCCD4b、OsCCD7）能否提高水稻胚乳中类胡萝卜素（尤其β-胡萝卜素）的积累。
关键发现：五个基因的敲除均未使水稻胚乳积累类胡萝卜素 等 5 条
核心问题：甘草（Glycyrrhiza uralensis）中缺乏CYP716A亚家族P450的鉴定，限制了对其三萜代谢途径的理解和甘草酸生物合成的工程改造。
关键发现：CYP716A179与苜蓿CYP716A12氨基酸一致性为86%；在组织培养葡萄茎中CYP716A179转录水平比完整根高约500倍；完整根中甘草次酸含量比组织培养葡萄茎高约1000倍（27260±1120 vs 等 3 条
核心问题：番茄组蛋白去乙酰化酶基因SIHDA3在果实成熟和类胡萝卜素积累中的功能及其调控机制尚未被实验阐明。
关键发现：SIHDA3 RNAi株系叶中表达量降低约90% 等 8 条
核心问题：丹参中丹参酮类二萜生物合成调控机制不明，缺乏有效提高丹参酮含量的转录因子。
关键发现：SmMYB9b过表达毛状根中总丹参酮含量达2.16±0.39 mg/g DW，为对照的2.2倍 等 3 条
核心问题：系统综述植物挥发性萜类化合物的多样功能、生物合成途径（MVA/MEP）、调控机制及其遗传工程改造策略，以促进其在作物保护、传粉吸引和药用萜类生产中的应用。
关键发现：萜类化合物超过40,000种，是最大的植物次生代谢物类群 等 4 条