共 102 篇

Physiological and Molecular Characterization of an Oxidative Stress-Resistant Saccharomyces cerevisiae Strain Obtained by Evolutionary Engineering

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.822864 · 含路线图 · 有原文

核心问题:氧化胁迫是工业酵母发酵中的常见胁迫因素,会降低酵母生长、存活率和产量,然而其复杂分子机制尚不明确,且缺乏通过进化工程获得的氧化胁迫抗性酿酒酵母菌株。

关键发现:通过热脉冲预处理策略获得菌株H7具有最高氧化胁迫抗性,且对热、冻融、乙醇、铁、钴和盐等胁迫具有交叉抗性 等 6 条

代谢工程 Saccharomyces cerevisiaeadaptive laboratory evolutionevolutionary engineeringgenomic variantsheat preconditioningoxidative stress Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Overexpression of Two New Acyl-CoA:Diacylglycerol Acyltransferase 2-Like Acyl-CoA:Sterol Acyltransferases Enhanced Squalene Accumulation in Aurantiochytrium limacinum

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.822254 · 含路线图 · 有原文

核心问题:破译 Aurantiochytrium 中两个新的 DGAT2 类似蛋白(ASATs)的功能,并利用其过表达提高角鲨烯积累

关键发现:四个 DGAT2 类似蛋白 AlASATa、AlASATb、T66ASATa、T66ASATb 均具有 ASAT 活性,主要合成 SE(16:0) 和 SE(22:6),其中 b 型贡献更大。AlASATb 单敲除菌株中 SE(16:0) 仅在 T2 可检测到,SE(22:6) 产量在 T1 ... 等 2 条

代谢工程 Aurantiochytriumdiacylglycerol acyltransferasedocosahexaenoic acidsqualenesterol acyltransferasessteryl esters Aurantiochytrium lima... Aurantiochytrium lima... Aurantiochytrium lima...

Whole-genome assembly and analysis of a medicinal fungus: Inonotus hispidus

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.967135 · 含路线图 · 有原文

核心问题:首次对药用真菌粗毛纤孔菌(Inonotus hispidus)进行全基因组测序与组装,并系统注释其功能基因,揭示其药用价值的遗传基础。

关键发现:组装获得I. hispidus基因组大小为35,688,031 bp,包含30个contigs,平均contig长度1,189,601.03 bp,GC含量48.53%,N50为1,831,239 bp 等 7 条

基因组学 Inonotus hispidus (CG... Inonotus hispidus (CG... Inonotus hispidus (CG...

Identification of a Novel Metabolic Target for Bioactive Triterpenoids Biosynthesis in Ganoderma lucidum

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.878110 · 含路线图 · 有原文

核心问题:灵芝三萜是灵芝的重要活性成分,但含量低,限制了其工业应用,亟需新的代谢工程策略提高其生物合成量。

关键发现:GlbHLH5 cDNA全长1008 bp,编码约36.58 kDa蛋白。MeJA诱导4h后GlbHLH5表达量为对照的2倍,并显著提高三萜积累。过表达GlbHLH5使三株转基因灵芝的三萜含量分别提高45%、37%和21%,HMGR、SQS、LS表达量最高分别达野生型的3.16、3.23和2.62倍 等 2 条

代谢工程 Ganoderma triterpenoidsGlbHLH5 transcription factorRNA interferenceoverexpressionpositive transcriptional regulator 灵芝(Ganoderma lucidum ... 灵芝(Ganoderma lucidum ... 灵芝(Ganoderma lucidum ...

D-Allulose (D-Psicose) Biotransformation From Allitol by a Newly Found NAD(P)-Dependent Alcohol Dehydrogenase From Gluconobacter frateurii NBRC 3264 and the Enzyme Characterization

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.870168 · 含路线图 · 有原文

核心问题:传统D-阿洛酮糖生产主要依赖差向异构酶催化D-果糖转化,受热力学平衡限制,转化率仅约30%,且产物分离困难;本文旨在利用脱氢酶从allitol脱氢生成D-allulose,以突破热力学平衡限制并提高转化率。

关键发现:重组ADH可催化allitol生成D-allulose,分子量约36.5 kDa 等 6 条

代谢工程 D-alluloseGluconobacter frateurii NBRC 3264NAD(P)-dependent alcohol dehydrogenaseallitolbiotransformation Gluconobacter frateur... Escherichia coli BL21...

Reversible Hydrogenase Activity Confers Flexibility to Balance Intracellular Redox in Moorella thermoacetica

Frontiers in Microbiology · 2022 · 10.3389/fmicb.2022.897066 · 含路线图 · 有原文

核心问题:探究可逆氢酶活性如何平衡 Moorella thermoacetica 胞内氧化还原状态,以及 H2 补充对工程菌乙醇生产的影响,揭示 H2 混合营养策略在工程菌中的局限性。

关键发现:野生型添加 H2 后乙酸碳摩尔产率从 等 14 条

代谢工程 acetogenethanol productionhydrogen inhibitionhydrogen productionmetabolic engineeringmixotrophy Moorella thermoacetic... Moorella thermoacetic... Moorella thermoacetic...

Terpenoids and their gene regulatory networks in Opisthopappus taihangensis 'Taihang Mingzhu' as detected by transcriptome and metabolome analyses

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.1014114 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析'太行明珠'(Opisthopappus taihangensis 'Taihang Mingzhu')叶片及不同发育阶段花序中萜类芳香化合物的组成,及其生物合成相关基因与调控网络。

关键发现:共获得82,685个unigenes,其中43,901个获得注释 等 7 条

代谢工程 'Taihang Mingzhu'RNA-Seqmetabolitesterpenoidstranscriptome Opisthopappus taihang... Opisthopappus taihang... Opisthopappus taihang...

A High-Quality Reference Genome Sequence and Genetic Transformation System of Aralia elata

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.822942 · 含路线图 · 有原文

核心问题:龙牙楤木(Aralia elata)缺乏高质量参考基因组和遗传转化系统,限制了三萜皂苷生物合成途径关键基因的挖掘与功能验证。

关键发现:基因组大小为1.21 Gb,contig N50为51.34 Mb,共1,350条contig,最长100.88 Mb,GC含量36.13% 等 5 条

代谢工程 Aralia elataevolutionary analysisgenome assemblyterpenoid biosynthesis pathwaytransgenic system Aralia elata Aralia elata Aralia elata

Transcriptomic analysis of genes related to alkaloid biosynthesis and the regulation mechanism under precursor and methyl jasmonate treatment in Dendrobium officinale

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.941231 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析铁皮石斛中萜类吲哚生物碱(TIA)等生物碱在前体(色氨酸和断马钱子苷)及茉莉酸甲酯(MeJA)处理下的积累机制,通过转录组和WGCNA挖掘关键酶基因和转录因子。

关键发现:处理4小时后总生物碱含量从189 μg/g DW显著增至319 μg/g DW;RNA-Seq共获得32,727个unigenes,平均Q20 等 3 条

代谢工程 Dendrobium officinalealkaloid biosynthesismethyl jasmonateprecursorstranscriptome Dendrobium officinale... Dendrobium officinale... Dendrobium officinale...

Another level of complexity: The role of metabolic channeling and metabolons in plant terpenoid metabolism

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.954083 · 含路线图 · 有原文

核心问题:植物萜类代谢网络中多种途径竞争共同前体(如IPP/DMAPP、FPP、GGPP),如何通过代谢通道和代谢区室化(metabolons)调控代谢底物流向特定萜类产物,并应用于代谢工程以提高目标产物产量。

关键发现:拟南芥GGPPS11与GGR、PSY、SPS形成多酶复合物,通道GGPP向特定下游途径;水稻GRP将OsGGPPS1招募至类囊体膜,增强其催化效率并导向叶绿素合成 等 5 条

植物代谢工程 chlorophyllmembrane complexesmetabolic channelingmetabolic engineeringmetabolonsprenyltransferases 拟南芥 拟南芥 拟南芥

Genetic Manipulation of Biosynthetic Pathways in Mint

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.928178 · 含路线图 · 有原文

核心问题:通过遗传操作方法提高薄荷属植物精油(尤其是单萜类化合物薄荷醇和香芹酮)的产量并改善其组成,以满足工业和医药需求。

关键发现:过表达DXR使精油产量增加44%(1.5倍)(Mahmoud & Croteau, 2001 等 9 条

代谢工程 Menthagenetic manipulationisoprenoidmetabolic engineeringmetabolismmint Mentha × piperita Mentha × piperita Mentha × piperita

Combinatorial transient gene expression strategies to enhance terpenoid production in plants

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.1034893 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过组合瞬时表达策略提高植物中单萜沉香醇(linalool)和倍半萜木香烃内酯(costunolide)的产量

关键发现:所有选定的MEP和MVA途径基因在农杆菌浸润5天后均获得瞬时过表达,相对表达量较对照上调5.05-94.87倍(具体为DXS 等 13 条

代谢工程 MEPMVAagroinfiltrationcostunolidelinaloolterpenoid Nicotiana benthamiana Nicotiana benthamiana Nicotiana benthamiana

Hairy roots: An untapped potential for production of plant products

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.937095 · 含路线图 · 有原文

核心问题:植物天然产物结构复杂、含量低,化学合成成本高,微生物异源表达困难,导致商业供应不足;需要开发稳定、可规模化且能高效生产植物次生代谢物的生产平台。

关键发现:全球25%处方药来源于植物化合物,市场价值超300亿美元 等 3 条

植物生物技术/代谢工程 Catharanthus roseusbioreactorhairy rootmetabolic engineeringterpenoid indole alkaloid Catharanthus roseus h... Catharanthus roseus h... Catharanthus roseus h...

Cloning and Characterization of 1,8-Cineole Synthase (SgCINS) Gene From the Leaves of Salvia guaranitica Plant

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.869432 · 含路线图 · 有原文

核心问题:从蓝花鼠尾草(Salvia guaranitica)叶片中克隆并功能表征 1,8-桉叶素合酶基因 SgCINS,并验证其在转基因烟草中对棉铃虫(斜纹夜蛾)抗性的作用。

关键发现:SgCINS 基因完整 ORF 为 2263 bp,编码 731 个氨基酸,预测蛋白分子量 等 3 条

植物代谢工程 1,8-cineole synthase (SgCINS)Salvia guaraniticaSpodoptera littoralis (cotton leafworm)terpene synthase (TPS)transgenic Nicotiana tabacum Nicotiana tabacum(转基因烟草)

Functional analysis of Pogostemon cablin farnesyl pyrophosphate synthase gene and itsbinding transcription factor PcWRKY44 in regulating biosynthesis of patchouli alcohol

Frontiers in Plant Science · 2022 · 10.3389/fpls.2022.946629 · 含路线图 · 有原文

核心问题:广藿香中法尼基焦磷酸合酶(PcFPPS)及其结合转录因子PcWRKY44在广藿香醇生物合成中的功能与分子调控机制尚不清楚。

关键发现:PcFPPS基因开放阅读框长1050 bp,编码349个氨基酸,蛋白分子量40.11 kDa,定位于细胞质 等 6 条

代谢工程 PcFPPSPcWRKY44Pogostemon cablinbiosynthesispatchouli alcohol Pogostemon cablin (广藿香) Saccharomyces cerevis... Nicotiana tabacum (烟草...

Role of ROX1, SKN7, and YAP6 Stress Transcription Factors in the Production of Secondary Metabolites in Xanthophyllomyces dendrorhous

International Journal of Molecular Sciences · 2022 · 10.3390/ijms23169282 · 含路线图 · 有原文

核心问题:揭示应激相关转录因子ROX1、SKN7和YAP6在Xanthophyllomyces dendrorhous次级代谢产物(虾青素、类菌胞素和甾醇)生产中的调控作用及其与CYC8-TUP1复合物的关系。

关键发现:Δrox1菌株在葡萄糖下类胡萝卜素、菌孢素和甾醇产量显著降低 等 7 条

代谢工程 ROX1SKN7Xanthophyllomyces dendrorhousYAP6astaxanthinmycosporines Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den...

The stereochemical course of 2-methylisoborneol biosynthesis

Beilstein Journal of Organic Chemistry · 2022 · 10.3762/bjoc.18.82 · 含路线图 · 有原文

核心问题:确定2-甲基异冰片(2-methylisoborneol)生物合成中真正的立体化学途径中间体,究竟是(R)-2-甲基烯丙基二磷酸((R)-2-Me-LPP)还是(S)-2-Me-LPP。

关键发现:从(R)-2-Me-LPP与2MIBS孵育得到主要产物2-甲基异冰片(1),产率占总酶产物75%,副产物包括2-亚甲基莰烷(10, 13%)、2-甲基芳樟醇(6, 8%)、2-亚甲基葑烷(12, 2%)、2-甲基-2-莰烯(11, 1%)、2-甲基-α-萜品醇(9, 1%)、2-甲基月桂烯(7... 等 4 条

合成生物学 biosynthesisenantioselective synthesisenzyme mechanismsgas chromatographyterpenoids

Understanding the competing pathways leading to hydropyrene and isoelisabethatriene

Beilstein Journal of Organic Chemistry · 2022 · 10.3762/bjoc.18.97 · 含路线图 · 有原文

核心问题:理解hydropyrene synthase中hydropyrene和isoelisabethatriene竞争性产物生成途径的热力学与动力学机制,以及M75L突变如何改变产物分布。

关键发现:HP途径总放能-62.8 kcal/mol,IE途径总放能-34.4和-35.9 kcal/mol 等 6 条

合成生物学 diterpenesenzyme mechanismquantum mechanicsterpene synthasesthermodynamic and kinetic control Streptomyces clavulig... Streptomyces clavulig...

Downregulation of EHT1 and EEB1 in Saccharomyces cerevisiae Alters the Ester Profile of Wine during Fermentation

Journal of Microbiology and Biotechnology · 2022 · 10.4014/jmb.2201.01008 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何在不显著影响发酵性能的前提下,通过部分下调EHT1和EEB1来调节葡萄酒的酯类香气谱。

关键发现:在工业二倍体葡萄酒酵母EC1118中,单等位基因敲除使EHT1表达水平下降59%(Δeht1)和66%(Δeht1Δeeb1),EEB1下降51%(Δeeb1)和58%(Δeht1Δeeb1) 等 5 条

发酵工程 EEB1EHT1Fermentation estersdecrease of gene expression leveldiploid wine yeast EC1118 Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

DsLCYB Directionally Modulated β-Carotene of the Green Alga Dunaliella salina under Red Light Stress

Journal of Microbiology and Biotechnology · 2022 · 10.4014/jmb.2208.08044 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过调控杜氏盐藻中番茄红素β-环化酶(DsLCYB)基因的表达,定向提高β-胡萝卜素及其下游产物的积累,并探究红光胁迫下的调控作用。

关键发现:过表达DsLCYB使总类胡萝卜素含量最高达8.46 mg/g(红光下),较野生型(7.14 mg/g)提高约1.21倍(摘要提及最高1.26倍) 等 5 条

代谢工程 Dunaliella salinacarotenoidlycopene β cyclasetransgeneβ-Carotene Dunaliella salina Dunaliella salina Dunaliella salina