核心问题：探究乙烯和铜（Cu）对长春花（Catharanthus roseus）萜类吲哚生物碱（TIA）生物合成途径多个关键基因转录表达的调控作用及其交互机制，揭示ERF与MPK转录因子在此过程中的角色。
关键发现：乙烯处理后，TIA途径基因总体表达（Q值）呈标准正态分布，峰值出现在15-30 μM乙烯利（ethrel）处理，且成熟前叶片Q值高于未成熟叶、成熟叶和根 等 4 条
核心问题：探究在Withania somnifera（睡茄）毛状根中共表达病原真菌激发子蛋白β-cryptogein基因后，代谢流从醉茄内酯（withasteroid）生物合成转向苯丙烷类积累的现象及其分子机制。
关键发现：正常毛状根中21天时withaferin A含量为0.989 μg/mg DW，withanolide A为1.765 μg/mg DW 等 3 条
核心问题：胡黄连（Picrorhiza kurrooa）中苦苷类化合物具有重要药理活性，但其生物合成途径尚不清楚，尤其是作为细胞色素P450酶关键氧化还原伴侣的NADPH-细胞色素P450还原酶（CPR）未被鉴定。本研究旨在从胡黄连中克隆并功能表征PkCPR，以理解其在苦苷生物合成中的调节作用，并为代谢...
关键发现：从胡黄连中获得了全长cDNA，长2679 bp，包含2133 bp的开放阅读框，编码710个氨基酸（理论分子量78.6 kDa，pI 5.45）。重组PkCPR在大肠杆菌BL21(DE3)中表达并纯化，GST融合蛋白分子量104.5 kDa 等 6 条
核心问题：从西洋参（Panax quinquefolius）中克隆并鉴定达玛烯二醇合酶基因（PqDS），并通过在酵母中与细胞色素P450基因PqD12H异源共表达，实现原人参二醇的体外生产。
关键发现：克隆的PqDS基因全长2319 bp，ORF为2310 bp，编码769个氨基酸，预测分子量88.4 kDa 等 2 条
核心问题：缺乏硅藻质体（叶绿体）高效基因表达系统，无法利用质体作为亚细胞宿主生产重组蛋白。
关键发现：质体转化效率约为每1000个微藻细胞产生1个转化克隆（5×10^3转化体/5×10^6细胞/0.4μg DNA），比核转化系统高100倍 等 6 条
核心问题：模式硅藻三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）缺乏靶向基因敲降工具，需验证人工miRNA能否有效实现基因功能下调。
关键发现：成功获得四个独立转化株系（amiR-PtT1、T2、T5、T9），均检测到成熟amiRNA表达 等 4 条
核心问题：首次从西洋参中克隆并鉴定原人参三醇合酶（protopanaxadiol 6-hydroxylase）基因CYP6H，并验证其在人参皂苷生物合成中的功能。
关键发现：克隆的CYP6H基因ORF为1410 bp，编码469个氨基酸（分子量53.2 kDa），与PgCYP716A53v2和PnCYP450的氨基酸序列相似性分别为96.59%和95.31%。酵母异源表达后，在外源添加protopanaxadiol的条件下检测到protopanaxatriol生成... 等 2 条
核心问题：3-羟基丙酸（3-HP）的毒性限制了其以甘油为底物的大肠杆菌发酵生产，需要筛选对3-HP耐受且能高效生产的宿主菌株。
关键发现：在25 g/L 3-HP存在下，E. coli C、K12和W的比生长速率分别为0.58、0.56和0.51 h^-1，而DF40仅为0.16 h^-1 等 4 条
核心问题：研究过氧化氢（H2O2）诱导的氧化应激对三孢布拉霉（Blakeslea trispora）在β-胡萝卜素生物合成过程中的细胞响应机理，即氧化应激如何提高β-胡萝卜素产量。
关键发现：在摇瓶培养第3天添加40 μM H2O2，培养6天后β-胡萝卜素产量从140.1 mg/L提高到193.5 mg/L，增加约38% 等 6 条
核心问题：发酵过程中氧化胁迫严重损害酵母细胞，影响发酵效率和产品质量，需要提高酿酒酵母对过氧化氢（H2O2）引起的氧化胁迫的耐受性。
关键发现：分离出spt15-5和taf25-3两个突变株。在2.5 mM H2O2下，两突变株比对照C1/C2生长提高约10倍 等 4 条
核心问题：在粘质沙雷氏菌H30中，meso-2,3-丁二醇脱氢酶（budC编码）的失活并未完全消除2,3-丁二醇的生成，说明存在其他类似酶参与该过程。本研究旨在鉴定并表征参与2,3-丁二醇形成的甘油脱氢酶（GDH），以解释这一现象。
关键发现：gldA基因ORF长1101 bp，编码366个氨基酸，与S. marcescens Db11同源性95%（氨基酸97%）。粗酶液比活力10.48 U/mg，纯化后为20.75 U/mg，纯化倍数1.98。最适pH：还原(3S/3R)-乙酰乳酸和氧化meso-2,3-丁二醇及甘油为pH 等 3 条
核心问题：如何通过多种代谢工程策略协同提高大肠杆菌中辅酶Q8的产量
关键发现：阻断menA基因使CoQ8含量从0.31 mg/g DCW提高到0.56 mg/g DCW（提高81%），产量从0.59 mg/L提高到1.04 mg/L 等 5 条
核心问题：筛选对1-丁醇具有高耐受性的酵母菌株，解析其耐受性机制，为生物丁醇发酵提供优良菌株及基因靶点。
关键发现：在90株酿酒酵母中，最耐受菌株S. cerevisiae DBVPG1788、DBVPG6044和YPS128可耐受4% 1-丁醇，而S. uvarum和S. castelli对3% 1-丁醇敏感 等 4 条
核心问题：实现IFTase在毕赤酵母中的高效分泌表达，探索以PFLD1启动子替代PAOX1启动子的可行性，为DFA III工业化生产提供基础。
关键发现：最大IFTase活性62.72 U/mL（甲醇和甲胺盐酸盐共诱导），是野生型菌株的3.2倍 等 7 条
核心问题：如何在不引入任何外源DNA序列的前提下，通过精确无缝插入强启动子PGK1p过表达ATF1基因，以提高中国白酒酵母的乙酸酯产量并保持遗传安全性
关键发现：工程菌CLX14-P的ATF1 mRNA水平较亲本提高40倍，AATase酶活提高5倍 等 4 条
核心问题：利用工业酿酒酵母IR-2的单倍体菌株，通过交配育种构建能高效发酵木糖的二倍体菌株，并评估野生型XDH与工程化NADP+依赖型XDH（ARSdR）对木糖发酵的影响。
关键发现：分离的单倍体ENB2004和ENB3002木酮糖消耗速率分别为0.50和0.81 g/L/h，杂交菌株ENB4003为0.73 g/L/h，乙醇产率0.43 g/g。在YPX培养基（21 g/L木糖）中，SE12、MA-R5、MA-R4在72h分别产生5.80、5.65、4.82 g/L乙醇，... 等 3 条
核心问题：缺乏高效、高对映选择性的(R)-特异性羰基还原酶用于生产手性药物中间体(R)-CHBE，现有酶产量或对映选择性不足，且催化过程耗时、难以工业化。
关键发现：['LEK以NADPH为辅因子，对COBE的酶活为0.178 U/mg，相对活性90.7%，Km值为37.01 mM，Kcat为9.96 μmol/min，Kcat/Km为0.27 μmol/mM/min', '突变体S209G和W28A的摩尔转化率分别为99.0%和87.9%，均高于野生型L...
核心问题：木质纤维素水解液中的乙酸、甲酸等弱酸抑制酵母生长和乙醇发酵，影响生物乙醇生产效率。需要阐明脯氨酸对弱酸胁迫的作用机制并评估其应用潜力。
关键发现：25 mM乙酸显著降低酵母代谢输出 等 3 条
核心问题：异戊二烯前体IPP和DMAPP在天然宿主中供应不足，限制了大肠杆菌中异戊二烯类化合物的高效生产，需要发现新的遗传靶标以增强前体供应。
关键发现：初始工程菌株HMS174(DE3) pACLYC/pJF678（含dxs2_SAV和idi_BS）番茄红素产量为18.5 mg/L，比对照高15.4倍 等 10 条
核心问题：传统方法从蛇根木（Rauwolfia serpentina）获取药用萜类吲哚生物碱（如利血平、阿吗碱等）存在生长周期长（18-36个月）、产量低（利血平0.03-0.034% DW）和破坏野生资源等问题，需要开发快速、可控、可放大的体外生产体系。
关键发现：A4菌株诱导的蛇根木毛状根利血平含量为0.0064%–0.088%干重（DW），而田间栽培18–24个月的品种（cim-sheel）利血平含量为0.03%–0.034% DW 等 4 条