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Improvement of oxidative stress tolerance in Saccharomyces cerevisiae through global transcription machinery engineering

作者
Hongwei Zhao, Jingyuan Li, Beizhong Han, Xuan Li, Jingyu Chen
单位
College of Food Science and Nutritional Engineering, China Agricultural University, Beijing, China; Laboratory of Renewable Resources Engineering, Purdue University, West Lafayette, IN, USA; Department of Agricultural and Biological Engineering, Purdue University, West Lafayette, IN, USA; College of Food Science and Engineering, Qingdao Agricultural University, Qingdao, China
杂志
Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology(2014)
DOI
10.1007/s10295-014-1421-8
所属领域
代谢工程
关键词
BiofuelInhibitorsOxidative stressSaccharomyces cerevisiaeTranscription factors
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解决的核心问题

发酵过程中氧化胁迫严重损害酵母细胞,影响发酵效率和产品质量,需要提高酿酒酵母对过氧化氢(H2O2)引起的氧化胁迫的耐受性。

研究策略

采用全局转录机器工程(gTME),对转录因子SPT15和TAF25进行易错PCR随机突变,构建质粒突变文库并转化至酿酒酵母BY4741,通过H2O2梯度筛选获得氧化胁迫耐受性显著提高的突变株。

研究路线图

100%
研究问题:氧化胁迫损害酵母发酵效率
策略:全局转录机器工程(gTME)易错PCR随机突变
关键改造:突变转录因子SPT15(Tbp)与TAF25
突变体特征:spt15-5(5aa替换) taf25-3(6aa替换)
结果:耐受力大幅提升,生长提高11–14倍
生理机制:ROS降低52–89%,CAT/SOD活性显著提高
发酵性能:提前12h进入对数期,产率提高25.5%
序列分析:Spt15截短蛋白,两因子多位点替换
结论:gTME重塑氧化防御,提升工业发酵效率与经济性
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核心内容

该研究通过全局转录机器工程(gTME)策略,对酿酒酵母BY4741的转录因子SPT15和TAF25进行易错PCR随机突变,构建突变文库并经H2O2梯度筛选,获得了氧化胁迫耐受性显著提升的突变株spt15-5和taf25-3。在2.5 mM H2O2胁迫下,两突变株生长量较对照提高约10倍,其中taf25-3在3.0 mM H2O2时OD600最大提升13.76倍;休克实验中2.0 mM H2O2处理2小时后存活率约为对照的100倍。突变株胞内ROS水平显著低于对照,过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性均明显升高。发酵实验中,taf25-3较对照提前12小时进入对数期,72小时乙醇浓度达44.45 g/L(对照36.65 g/L),体积产率提高25.5%。结果表明,通过随机突变一般转录因子引入氨基酸替换,可有效重塑酵母的氧化防御系统,为提升工业发酵效率提供了可行途径。

创新点

首次将gTME应用于开发氧化耐受酵母菌株;通过随机突变转录因子SPT15和TAF25,获得在中等H2O2浓度下生长大幅提升的突变株;揭示了转录因子氨基酸替换可重塑细胞氧化防御系统。

研究对象(2)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
酿酒酵母 BY4741 氧化应激防御 SPT15 TATA结合蛋白(Tbp) 调控 突变产生截短蛋白,含5个氨基酸替换(S136R, K138I, R141G, G147R, K167N),提高氧化耐受性
酿酒酵母 BY4741 氧化应激防御 TAF25 Taf(II)25 (Taf25) 调控 TFIID复合体组分,含6个氨基酸替换(D106Y, R108Q, Q158R, P160T, K180I, L188P),提高氧化耐受性和发酵性能

关键发现

  1. 分离出spt15-5和taf25-3两个突变株。在2.5 mM H2O2下,两突变株比对照C1/C2生长提高约10倍
  2. 在2.0–3.5 mM H2O2范围内,spt15-5和taf25-3的OD600最大分别提高11.2倍(2.5 mM)和13.76倍(3.0 mM)。休克实验中,2.0 mM H2O2处理2 h后突变株存活约100倍于对照,6.0 mM时约10倍。细胞内ROS水平:对照C3比spt15-5和taf25-3分别高52.86%和89.36%。在2.0 mM H2O2胁迫下,spt15-5和taf25-3的CAT活性分别为7.67和6.84 U/mg prot,对照C3为4.97
  3. SOD活性分别为128.24和155.36 U/mg prot,对照为92.65。发酵实验中,taf25-3比对照C3提前12小时进入对数期,72 h时乙醇浓度达44.45 g/L(对照36.65 g/L),乙醇体积产率提高25.5%
  4. 葡萄糖消耗速率分别为1.76和1.35 g/(L·h)。

研究结论

通过gTME对一般转录因子Spt15和Taf25进行氨基酸替换,可有效改变酿酒酵母的氧化防御系统,提高其对H2O2诱导氧化胁迫的耐受性和发酵效率,有望使工业乙醇发酵更高效、经济。