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Characterization and site-directed mutation of a novel aldo-keto reductase from Loddermyces elongisporus NRRL YB-4239 with high production rate of ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate

作者
Qiuyan Wang, Tingting Ye, Zhuanzhuan Ma, Rong Chen, Tian Xie, Xiaopu Yin
单位
College of Material, Chemistry and Chemical Engineering, Hangzhou Normal University; College of Life and Environmental Sciences, Hangzhou Normal University; Medical College, Hangzhou Normal University
杂志
Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology(2014)
DOI
10.1007/s10295-014-1502-8
所属领域
代谢工程
关键词
Aldo-keto reductaseAsymmetric reductionEthyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate
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解决的核心问题

缺乏高效、高对映选择性的(R)-特异性羰基还原酶用于生产手性药物中间体(R)-CHBE,现有酶产量或对映选择性不足,且催化过程耗时、难以工业化。

研究策略

通过基因组数据库挖掘从Loddermyces elongisporus中发现新型醛酮还原酶LEK,结合序列比对、保守催化基序分析和3D分子模型模拟进行筛选;对关键氨基酸进行定点突变改善催化性能;构建基于葡萄糖脱氢酶(GDH)的辅酶再生系统实现高效生物转化。

研究路线图

100%
缺乏高效(R)-选择性羰基还原酶
基因组数据库挖掘新酶LEK
序列比对及3D分子模拟筛选
定点突变获得W28A与S209G
构建GDH辅酶再生系统
S209G转化率99%,Km降至6.05
双质粒共表达:转化率100%,e.e.>99%
产率56.51 mmol/L/H(最高报道)
LEK突变体高效合成(R)-CHBE,具工业潜力
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核心内容

本研究从Loddermyces elongisporus NRRL YB-4239基因组中发掘出一种新型醛酮还原酶LEK,该酶以NADPH为辅因子,催化4-氯乙酰乙酸乙酯(COBE)不对称还原生成手性药物中间体(R)-CHBE。通过序列比对和3D分子模型分析,对关键氨基酸进行定点突变,获得两个催化性能显著改善的突变体S209G和W28A。动力学分析显示,突变体S209G的Km值由野生型的37.01 mM降至6.05 mM,摩尔转化率从78.0%提升至99.0%。进一步构建基于葡萄糖脱氢酶的辅酶再生系统,将分别携带LEK S209G和GDH的E. coli细胞共培养,在51.8 mM COBE底物条件下实现100%转化率,对映选择性大于99%,产率高达56.51 mmol/L/H,为当时报道的(R)-CHBE不对称生物转化最高水平。此外,研究发现Mn²⁺可将LEK活性提升至181.8%,而Fe³⁺和Cu²⁺完全抑制酶活。该研究提供了一种高效制备光学纯(R)-CHBE的生物催化路线,定点突变策略也为其他醛酮还原酶的改造提供了参考。

创新点

['从Loddermyces elongisporus NRRL YB-4239中发掘出新型醛酮还原酶LEK', '通过定点突变获得两个催化性能显著改善的突变体W28A和S209G', '构建双质粒共表达辅酶再生系统,使(R)-CHBE的产率达到目前报道的最高水平']

研究对象(4)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli BL21 (DE3) 不对称还原合成(R)-CHBE LEK (LELG_05392) 醛酮还原酶 LEK 催化 来源于Loddermyces elongisporus NRRL YB-4239,催化COBE不对称还原为(R)-CHBE,e.e.>99%
Escherichia coli BL21 (DE3) 不对称还原合成(R)-CHBE LEK (S209G突变体) 醛酮还原酶 LEK S209G 催化 定点突变体,摩尔转化率99.0%,Km=6.05 mM,e.e.>99%
Escherichia coli BL21 (DE3) 不对称还原合成(R)-CHBE LEK (W28A突变体) 醛酮还原酶 LEK W28A 催化 定点突变体,摩尔转化率87.9%,Km=14.08 mM,e.e.>99%
Escherichia coli BL21 (DE3) 辅酶再生 gdh 葡萄糖脱氢酶 GDH 能量供给 来自Bacillus subtilis,催化葡萄糖氧化再生NADPH,为LEK提供还原力

关键发现

['LEK以NADPH为辅因子,对COBE的酶活为0.178 U/mg,相对活性90.7%,Km值为37.01 mM,Kcat为9.96 μmol/min,Kcat/Km为0.27 μmol/mM/min', '突变体S209G和W28A的摩尔转化率分别为99.0%和87.9%,均高于野生型LEK的78.0%,Km值分别为6.05 mM和14.08 mM,显著低于野生型37.01 mM', '使用分别携带pETLEKS209G和pETGDH的E. coli细胞构建辅酶再生系统,在51.8 mM COBE条件下转化率达100%,e.e.>99%,产率高达56.51 mmol/L/H,为已报道的(R)-CHBE不对称生物转化最高产率', '使用共表达质粒pETDuet-LEKS209G-GDH时,12.3 mM COBE转化率100%,22.2 mM COBE转化率95%,但产率仅6.03 mmol/L/H,因双质粒共表达水平低(约10%)', 'Mn2+、Li+、Ca2+分别提高LEK活性至181.8%、125.4%、121.8%,Fe3+和Cu2+完全抑制酶活性']

研究结论

LEK是一种新型的(R)-选择性醛酮还原酶,通过定点突变S209G和W28A显著提高了底物亲和力和转化率。利用E. coli分别表达LEKS209G和GDH构建的辅酶再生系统能够高效合成光学纯(R)-CHBE,产率高达56.51 mmol/L/H,对映选择性>99%,具有工业应用潜力。