核心问题：阐明棉花δ-cadinene合成酶（CDN1-C1）催化法尼基二磷酸（FDP）和橙花叔基二磷酸（NDP）环化生成倍半萜的机理，以及该酶对底物FDP高保真、对NDP产多样的分子基础。
关键发现：CDN1-C1将(1RS)-[1-2H](E,E)-FDP环化为>98% [5-2H]和[11-2H]CDN 等 7 条
核心问题：甜叶菊叶片中甜菊糖苷（SGs）和其他labdane型二萜类化合物的生物合成途径及空间分布尚不清楚，特别是不同叶片组织（毛状体与叶肉细胞）中的代谢分工和特异性基因表达。
关键发现：['甜菊糖苷（SGs）主要积累在去毛状体叶片组织（L-T）中，而在毛状体（T）中几乎检测不到 等 12 条
核心问题：如何利用基因组测序技术（NGS）加速植物代谢途径，特别是次生代谢物生物合成与调控途径的发现与解析。
关键发现：Eucalyptus grandis含有113个萜烯合酶（TS）而Physcomitrella patens仅2个 等 8 条
核心问题：野生型OR蛋白促进类胡萝卜素积累能力有限，而自然突变体BoOR_MUT携带有大反转座子插入且导致矮化，难以应用；需要开发一种简单有效的突变OR来大幅度提高植物类胡萝卜素（特别是β-胡萝卜素）含量。
关键发现：AtOR或SbOR过表达使愈伤组织总类胡萝卜素提高至多2倍 等 3 条
核心问题：如何通过基因工程手段有效降低植物体内活性赤霉素含量，从而在不影响基本生长发育的前提下实现植株矮化，以培育适合农业和园艺应用的矮化品种。
关键发现：转基因矮化莴苣植株的下胚轴长度减少约60%（0.99 cm vs 野生型2.44 cm），节间长度减少约70%（0.10 cm vs 等 6 条
核心问题：解析药用植物丹参中二萜合酶（diTPS）家族的功能多样性及其进化驱动力，阐明多个二萜代谢途径（如丹参酮、赤霉素、ent-13-epi-manoyl oxide）的分子基础。
关键发现：SmCPS1与SmCPS2均能催化GGPP生成CPP，但SmCPS1的Km=0.54 μM，SmCPS2的Km=0.95 μM，SmCPS1的kcat比SmCPS2高18倍以上 等 6 条
核心问题：三萜皂苷生物合成途径中调控相关基因表达的转录因子未知，特别缺乏茉莉酸信号下游的特异性调控因子。
关键发现：TSAR1和TSAR2在烟草原生质体中分别使HMGR1启动子活性提高9倍和28倍 等 6 条
核心问题：在肉质果实作物（番茄）中，叶片衰老的遗传调控是否能够延长光合作用活跃期、增加源器官碳输出，并最终提高果实产量和营养品质，尚不清楚。
关键发现：['在番茄基因组中鉴定出三个AtORE1直系同源基因SIORE1S02、SIORE1S03和SIORE1S06，三者均受乙烯、黑暗、茉莉酸、水杨酸或盐等衰老诱导处理上调表达。', 'SlmiR164可直接切割SIORE1S03和SIORE1S06转录本，并间接调控SIORE1S02 等 4 条
核心问题：Catharanthus roseus中抗癌生物碱长春碱和长春新碱的生物合成途径具有复杂的细胞特异性区室化，晚期步骤发生在特化的叶肉细胞（异形细胞）中，但这些细胞数量稀少，难以分离，限制了途径的完整解析和工程改造。
关键发现：FACS成功分离出纯度约90%的异形细胞群，每个操作日可回收约50,000个异形细胞和数十倍更多的普通叶肉细胞 等 4 条
核心问题：如何在植物中实现高水平的非天然三萜（botryococcene）及其甲基化衍生物的生产，并利用不同亚细胞区室（细胞质与叶绿体）的工程改造来探究植物三萜代谢的内在调控机制和辅因子分布。
关键发现：叶绿体靶向表达SSL1-3+tpFPS的烟草中botryococcene最高积累量达544 μg/g FW（平均269 μg/g FW），是细胞质靶向（平均3.5 μg/g FW）的约90倍 等 6 条
核心问题：如何通过遗传改造提高非禾本科植物木质素的p-香豆酰化水平至禾本科植物水平，并评估其对木质素结构和碱溶性的影响。
关键发现：BdPMT1/wt和BdPMT2/wt株系细胞壁中p-香豆酸释放量达7.84-13.36 mg/g CW，而WT仅0.01-0.02 mg/g 等 6 条
核心问题：解析药用植物碎米桠（Isodon rubescens）中二萜合酶基因家族的组成与功能，阐明ent-kaurene二萜和normal-CPP介导的二萜生物合成途径及其化学多样性的进化机制。
关键发现：转录组测序获得27,248,946条reads，组装出60,483条contigs（平均长度886 bp） 等 10 条
核心问题：在具有生物精炼潜力的烟草树（Nicotiana glauca）中生产高价值非内源性酮类胡萝卜素（如虾青素、角黄素），并阐明其积累与亚细胞区室化机制。
关键发现：转基因N. glauca叶片和花中总类胡萝卜素约0.5%干重，其中非内源性酮/羟基类胡萝卜素在叶和花中分别占0.3%和0.48% 等 7 条
核心问题：类胡萝卜素生物合成基因的转录调控机制尚不清楚，尤其是番茄红素β-环化酶（LCYb）基因的转录调控。
关键发现：CsMADS6编码257个氨基酸蛋白，分子量29.64 kDa，pI 9.37 等 6 条
核心问题：定量解析植物细胞中MVA和MEP两条异戊二烯生物合成途径对多萜醇的贡献，并监测渗透胁迫下两条途径的协同变化。
关键发现：渗透胁迫（0.3 M山梨醇）下，主导多萜醇（Dol-14-17）的MEP途径贡献从对照的11-12个异戊二烯单元增加至13-15个，且Dol-14和Dol-15达到约100% MEP来源 等 5 条
核心问题：探究咖啡酰莽草酸酯酶（CSE）在杨树木质素生物合成中的作用，并评估下调CSE是否可作为改善木质纤维素生物质糖化效率的策略。
关键发现：CSE下调导致木质素沉积最多降低25%（Klason法，hpCSE#2），纤维素相对含量增加8%-13% 等 7 条
核心问题：雷公藤二萜类化合物（如雷公藤甲素）生物合成途径不明确且天然来源供应不足
关键发现：不定根培养基中二萜类化合物约占总检出峰面积的77% 等 7 条
核心问题：阐明仅存在于亲缘关系很远的石松属和芒柄花属植物中的8,14-断环三萜α-onocerin在Ononis spinosa中的生物合成机制，特别是鉴定催化其环化的酶及与角鲨烯环氧酶的互作关系。
关键发现：α-onocerin仅在Ononis spinosa根部积累 等 5 条
核心问题：外源基因在禾本科植物中表达水平低，需要有效的增强元件
关键发现：在35S启动子驱动下，Sh1第一内含子使CAT活性提高11~91倍（玉米中31~91倍，黍属中23~28倍，狼尾草属中12倍） 等 6 条
核心问题：探究诱导型HMGR酶活性是否对烟草细胞悬浮培养物中倍半萜（capsidiol）的积累是必需的，并解析不同激发子处理对倍半萜生物合成途径关键酶活性的影响。
关键发现：纤维素酶（0.1 μg/mL）处理烟草细胞培养物后，capsidiol 产量最高达 等 13 条