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A single oxidosqualene cyclase produces the seco-triterpenoid α-onocerin

作者
Aldo Almeida, Lemeng Dong, Bekzod Khakimov, Jean-Etienne Bassard, Tessa Moses, Frederic Lota, Alain Goossens, Giovanni Appendino, Søren Bak
单位
Department of Plant and Environmental Science, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, DK-1871 Frederiksberg C, Denmark; Department of Food Science, University of Copenhagen, Rolighedsvej 16, DK-1958 Frederiksberg C, Denmark; Ghent University, Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics, Technologiepark 927, 9052 Ghent, Belgium; VIB Center for Plant Systems Biology, Technologiepark 927, 9052 Ghent, Belgium; Dipartimento di Scienze del Farmaco, Università del Piemonte Orientale, Novara, Italy
杂志
Plant Physiology(2017)
DOI
10.1104/pp.17.01369
所属领域
代谢工程
关键词
convergent evolutioncyclizationprotein-protein interactionssqualene epoxidaseα-onocerin
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解决的核心问题

阐明仅存在于亲缘关系很远的石松属和芒柄花属植物中的8,14-断环三萜α-onocerin在Ononis spinosa中的生物合成机制,特别是鉴定催化其环化的酶及与角鲨烯环氧酶的互作关系。

研究策略

通过转录组分析发掘候选OSC和SQE基因;利用本氏烟草瞬时表达和erg7敲除酵母GIL77异源表达验证功能;通过系统发育分析、同源建模与分子对接、荧光寿命成像(FLIM)和RT-qPCR研究进化关系、催化机制和蛋白互作。

研究路线图

100%
研究问题
α-onocerin生物合成机制
策略
转录组+异源表达+多组学分析
关键改造
发现OsONS1单酶催化SDO环化
关键改造
OsSQE1/OsSQE2互作增强产量
结果
OsONS1+OsSQE1产量提升20倍
结果
FLIM证明特异蛋白互作
结果
酵母验证&分子对接阐明机制
结论
趋同进化&OsSQE2为主要伴侣
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核心内容

该研究阐明了刺芒柄花中8,14-断环三萜α-onocerin的生物合成机制。通过转录组分析发掘候选氧化角鲨烯环化酶和角鲨烯环氧酶基因,利用本氏烟草瞬时表达和erg7敲除酵母异源表达验证功能,结合系统发育分析、同源建模与分子对接、荧光寿命成像和RT-qPCR研究催化机制与蛋白互作。结果发现,单个环化酶OsONS1即可从角鲨烯-2,3;22,23-二氧化物合成α-onocerin,与石松中需两个环化酶分步催化不同,表明该途径为趋同进化。OsONS1与OsSQE1共表达使产量提高近20倍,与OsSQE2共表达提高7.5倍;荧光寿命成像证实OsONS1与两种角鲨烯环氧酶均存在特异互作,且与OsSQE2互作更强。分子对接显示底物与催化残基D482结合能为-11.84 kcal/mol。转录分析表明OsSQE2可能是体内主要互作伴侣。该研究揭示了单酶催化断环三萜合成的全新机制,为异源生产α-onocerin提供了关键基因资源。

创新点

首次证明Ononis spinosa中单个氧化角鲨烯环化酶OsONS1即可从角鲨烯-2,3;22,23-二氧化物合成α-onocerin,不同于Lycopodium clavatum需LcLCC和LcLCD两个环化酶分步催化;揭示α-onocerin通路在两种植物中趋同进化;发现OsONS1与OsSQE1/OsSQE2发生特异蛋白-蛋白互作,且OsSQE可显著提高α-onocerin产量。

研究对象(7)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Ononis spinosa α-onocerin(8,14-断环三萜)生物合成 OsONS1 OsONS1 催化 氧化角鲨烯环化酶;可将角鲨烯-2,3;22,23-二氧化物(SDO)环化为α-onocerin;与OsSQE1共表达产量提升约20倍。
Ononis spinosa α-onocerin(8,14-断环三萜)生物合成 OsONS2 OsONS2 催化 与OsONS1高度相似,存在SNP差异;单独表达产痕量α-onocerin,与OsSQE2共表达产量提高4.3倍。
Ononis spinosa 三萜/甾醇前体合成 OsSQE1 OsSQE1 催化 角鲨烯环氧酶,催化角鲨烯生成SDO;与OsONS1共表达使α-onocerin产量提高近20倍,并与OsONS1存在蛋白互作。
Ononis spinosa 三萜/甾醇前体合成 OsSQE2 OsSQE2 催化 角鲨烯环氧酶;与OsONS1/OsONS2共表达分别提高α-onocerin产量7.5/4.3倍;FLIM显示与OsONS1互作强于OsSQE1,且转录水平与OsONSs共表达。
Lycopodium clavatum α-onocerin生物合成 LcLCC LcLCC 催化 将SDO环化为双环pre-α-onocerin;需与LcLCD共同表达才能在烟草中产生α-onocerin。
Lycopodium clavatum α-onocerin生物合成 LcLCD LcLCD 催化 将pre-α-onocerin环化为α-onocerin;与LcLCC及OsSQE共表达时产量比OsONS1+OsSQE1组合低3倍。
Saccharomyces cerevisiae GIL77 α-onocerin生物合成 OsONS1 OsONS1 催化 GIL77为lanosterol synthase (erg7)敲除菌株,积累SDO;表达OsONS1验证了α-onocerin的产生。

关键发现

  1. α-onocerin仅在Ononis spinosa根部积累
  2. 水培根中25天时含量为0.0019±0.0003 ng/mg鲜重,35天为0.099±0.018 ng/mg,45天达峰0.45±0.04 ng/mg
  3. 土培根35天约0.18±0.07 ng/mg,45天为0.56±0.19 ng/mg。毛状根Ohry1和Ohry2产量分别为0.007±0.002和0.029±0.004 ng/mg鲜重,后者比45天水培根低约15倍。OsONS1和OsONS2单独表达仅产痕量α-onocerin(0.0007±0.0001和0.0009±0.0001 ng/mg鲜重)
  4. 与OsSQE2共表达分别提高7.5倍和4.3倍,与OsSQE1共表达使OsONS1产量提高近20倍,且比OsONS1+OsSQE2组合高约2.5倍。L. clavatum的LcLCC/LcLCD必须同时表达才在烟草中产生α-onocerin,且产量比OsONS1+OsSQE1组合低3倍。OsONS1在GIL77酵母菌株中表达可产生α-onocerin。分子对接显示pre-α-onocerin与催化残基D482的结合能分别为-11.84 kcal/mol(羟基端)和-2.32 kcal/mol(环氧端)。FLIM显示OsONS1与OsSQE1和OsSQE2均存在特异互作,且与OsSQE2的互作更强
  5. RT-qPCR表明OsSQE1转录本在根中比OsSQE2低三个数量级,OsSQE2从根基部到叶片下降72倍,OsONSs从根基部到叶片下降约1400倍。

研究结论

在Ononis spinosa中,单个OSC OsONS1即可利用角鲨烯-2,3;22,23-二氧化物合成α-onocerin,与Lycopodium clavatum的双环化酶体系不同,表明α-onocerin途径为趋同进化。OsSQE1和OsSQE2通过与OsONS1互作并提高SDO供给来增强α-onocerin产量;转录共表达及FLIM数据提示OsSQE2可能是OsONS1在体内的主要互作伴侣。