核心问题：揭示MVA和MEP途径在丹参毛状根细胞生长和丹参酮生物合成中的不同作用，以及两条途径之间的交叉对话（crosstalk）
关键发现：10 μM MEV使毛状根生长降低34%，150 μM FOS使生长降低15% 等 6 条
核心问题：解析里氏木霉中Hog1型丝裂原活化蛋白激酶Tmk3的生理功能，特别是其在高渗抗性、细胞壁完整性维持和纤维素酶生产调控中的作用。
关键发现：Δtmk3菌株在0.5 M NaCl条件下停止生长，而亲本菌株可在0.9 M NaCl下生长 等 7 条
核心问题：探究拟南芥转录因子AtDREB1A在大豆中过表达导致严重矮化表型的分子机制，特别是其与赤霉素（GA）生物合成途径的关系。
关键发现：转基因大豆株高较野生型降低79.91%和80.05%，节间长度仅为野生型的19.58%和22.08% 等 4 条
核心问题：解析茶树（Melaleuca alternifolia）叶片精油产量定量变异的分子调控机制，特别是MEP（甲基赤藓醇磷酸）通路基因转录丰度与单萜/倍半萜积累的关系。
关键发现：总萜烯产量范围39.4-122.3 mg/g DM（平均75.5 mg/g DM） 等 8 条
核心问题：理解 Zymomonas mobilis ZM4 在乙醇胁迫下的分子响应机制，为菌株改良和代谢工程提供理论基础。
关键发现：添加47 g/L乙醇使ZM4生长速率从0.47±0.008 h^-1降至0.31±0.01 h^-1 等 7 条
核心问题：缺乏对枯草芽孢杆菌中萜类途径基因系统级调控的认识，以及如何利用转录组数据预测异戊二烯产量。
关键发现：萜类基因分为两个与异戊二烯产量呈相反相关的亚群：dxs、ispD、yhfS、pksG和mmgA与产量正相关（dxs Spearman相关系数0.63），而ispH、ispF、heps、uppS、ispE、dxr与产量负相关（第一组条件下相关系数<-0.6）。基于213个差异表达基因的PLSR模...
核心问题：转基因木质素改良杨树对外生菌根真菌定殖与群落多样性的潜在影响，及其与树木生物量和营养状况的关系尚不清楚。
关键发现：一年生杨树外生菌根定殖率为58%–86%（CAD L22最低58%，CAD L18最高86%），两年生时几乎全部根尖被定殖（约99%–100%） 等 8 条
核心问题：从大豆中克隆并鉴定一个新型单萜合酶基因GmNES，该酶特异利用橙花基二磷酸（NPP）而非香叶基二磷酸（GPP）合成单萜橙花醛，并探究其在植物防御中的生态功能。
关键发现：GmNES基因编码565个氨基酸的蛋白，分子量66 kDa，pI 5.6 等 4 条
核心问题：胡萝卜中番茄红素β-环化酶1（DcLcyb1）在类胡萝卜素合成中的功能及其对类胡萝卜素基因表达的调控作用
关键发现：DcLcyb1定位于质体，异源互补表明其具有番茄红素β-环化酶活性 等 4 条
核心问题：研究茶树黄酮醇合成关键酶DFR和ANR的过表达对植物发育及生物胁迫耐受性的影响，以期提高黄酮含量和抗氧化能力，并改善农艺性状。
关键发现：CsDFR和CsANR过表达转基因烟草比对照提前约10-15天开花，各株系开花时间分别为：D-01 86天、D-15 95天、D-17 86天、A-05 90天、A-08 88天、A-27 85天，而对照为105天。总黄酮含量从对照的39.8 mg QE/g DW提高至47.63-69.77 ... 等 4 条
核心问题：提高甘蓝型油菜对土壤中植酸态有机磷的利用效率，并在种子中积累活性植酸酶，以改善植物磷营养和单胃动物的植酸磷生物有效性。
关键发现：转基因株系P3、P11（phyA）和a18（appA）在缺磷条件下根系分泌植酸酶活性显著高于野生型 等 6 条
核心问题：Clostridium thermocellum是生物乙醇生产的重要候选菌株，但其低乙醇耐受性严重限制工业应用。本研究旨在通过系统代谢组学揭示其乙醇耐受机制。
关键发现：细胞糊精（cellodextrin）在WT、ET0、ET3中的相对含量分别为55.59±3.93、108.35±15.26和40.89±16.76 mg/g（以聚合度4计），ET0显著高于WT，且外源添加cellodextrin使ET株最高生物量提高约5-10%；NAD水平在ET3中较ET0降... 等 3 条
核心问题：淫羊藿属植物中参与黄酮类生物合成途径调控的R2R3-MYB转录因子尚不明确，导致对该药用植物中活性成分及花色形成的分子调控机制认识不足。
关键发现：EsMYBA1的ORF长714 bp，编码237个氨基酸 等 2 条
核心问题：缺乏快速、低成本、可一步组装多个大型DNA片段到质粒的方法，且难以系统探索代谢途径中多基因组合对目标产物产量的影响。
关键发现：CLIVA方法可在1-2天内完成大质粒组装，从7个模块成功组装21.6 kb质粒（含16个DXP途径基因），效率为2.0×10^3 cfu/μg input DNA。优化结果显示，MgCl2最佳浓度为2.5 mM 等 3 条
核心问题：阐明铜绿假单胞菌脂肪酸降解途径中的脂酰辅酶A合成酶（FadD）同源物，确定除已知fadD1/fadD2外参与脂肪酸活化的额外基因及其在感染中的功能。
关键发现：从11个候选基因中鉴定出4个新的fadD同源基因（PA1617、PA2893、PA3860、PA3924） 等 6 条
核心问题：缺乏纤维素结合模块（CBM）的GHF12家族内切葡聚糖酶如何识别并结合纤维素底物
关键发现：ThEG3晶体结构分辨率2.07 Å，R_factor=18.2%，R_free=22.4% 等 9 条
核心问题：解析除虫菊（Tanacetum cinerariifolium）中倍半萜内酯（STLs）的生物合成途径，尤其是从法尼基二磷酸（FDP）经germacrene A、germacratrien-12-oic acid（GAA）到costunolide及C7-C8型STLs的关键酶促步骤。
关键发现：454测序获得484,392条reads，平均400 bp，装配成27,317个contigs和144,825条singletons；TcGAS与Tanacetum parthenium的GAS有95%氨基酸相似性，TcGAO与Cichorium intybus的GAO有88%相似性，TcCO... 等 3 条
核心问题：揭示甲基茉莉酸（MeJA）诱导灵芝酸生物合成的调控机制，筛选并解析响应MeJA的差异表达基因及其在发育阶段中的作用。
关键发现：用64对引物共获得3910个转录片段，其中919个（23.5%）在MeJA诱导下差异表达（703个上调、216个下调）。对458个TDF测序得到390条可靠序列，90个注释为已知功能 等 2 条
核心问题：阐明檀香（Santalum album）中檀香醇和佛手柑醇生物合成的关键氧化步骤，特别是催化檀香烯和佛手柑烯羟化反应的细胞色素P450酶，并为通过异源代谢工程生产檀香油成分奠定基础。
关键发现：檀香油约90%由α-、β-、epi-β-檀香醇和α-exo-佛手柑醇组成 等 7 条
核心问题：常见的Embden-Meyerhof通路（EMP）与MEP组合时，EMP会产生不平衡的丙酮酸和3-磷酸甘油醛（G3P），限制了异戊二烯的合成。需要寻找更高效的MEP前体供给模块。
关键发现：仅表达ispS的E. coli BW25113 (DE3)异戊二烯产量低于4 mg/L 等 3 条