共 49 篇

Methylerythritol Phosphate Pathway of Isoprenoid Biosynthesis

Annual Review of Biochemistry · 2013 · 10.1146/annurev-biochem-052010-100934 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析甲基赤藓醇磷酸(MEP)途径中酶的催化机制,并探讨基于MVA和MEP途径的微生物合成生物学应用,以解决异戊二烯类化合物生产困难的问题。

关键发现:MEP途径是细菌、绿藻和高等植物质体中合成异戊二烯前体IPP和DMAPP的主要途径 等 8 条

代谢工程/合成生物学 MEPMVAbiosynthesisenzyme mechanismisoprenoidsmetabolic engineering Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Large number of phosphotransferase genes in the Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 genome and the study on their evolution

BMC Bioinformatics · 2010 · 10.1186/1471-2105-11-S11-S9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:解析拜氏梭菌NCIMB 8052基因组中大量磷酸转移酶(PTS)基因的存在及其进化机制,并解释该菌株能更好利用果糖的分子基础。

关键发现:拜氏梭菌NCIMB 8052基因组中有47套PTS II基因,远多于除艰难梭菌外的其它梭菌(如丙酮丁醇梭菌14套、肉毒梭菌15套、产气荚膜梭菌14套、破伤风梭菌2套),仅艰难梭菌630有49套相近 等 3 条

代谢工程/合成生物学 ABE productionClostridium beijerinckiiPhosphotransferase systemfructose/mannose/sorbose familygenome evolutionhorizontal gene transfer Clostridium beijerinc... Clostridium beijerinc... Clostridium beijerinc...

Construction of Escherichia coli cell factories for crocin biosynthesis

Microbial Cell Factories · 2019 · 10.1186/s12934-019-1166-1 · 含路线图 · 有原文

核心问题:缺乏经济环保的藏红花素(crocin)生产方法,传统提取依赖藏红花柱头,成本高且破坏环境;需要构建微生物细胞工厂实现从简单碳源合成crocin。

关键发现:CsCCD2可催化zeaxanthin生成crocetin dialdehyde,而CsZCD和CaCCD2无活性;ALD8和ALD3可将crocetin dialdehyde氧化为crocetin,其中ALD8活性更高;最优菌株YL4(pCsCCD2-UGT94E5-UGT75L6,pTrc... 等 3 条

代谢工程/合成生物学 CrocetinCrocinEscherichia coliGlycosyltransferaseSaffron stigma E. coli YL4 E. coli YL4 E. coli YL4

Direct pathway cloning of the sodorifen biosynthetic gene cluster and recombinant generation of its product in E. coli

Microbial Cell Factories · 2019 · 10.1186/s12934-019-1080-6 · 含路线图 · 有原文

核心问题:天然产生菌Serratia plymuthica中sodorifen产量低且VOCs背景复杂,难以进行功能研究,需要建立高效异源生产系统并验证sodorifen生物合成基因簇(BGC)的功能。

关键发现:S. plymuthica WS3236基因组包含38个BGC,其中4.6 kb的sodA-D为候选sodorifen BGC 等 5 条

代谢工程/合成生物学 DiPaCGenome miningHeterologous expressionSerratia plymuthicaSodorifenTerpenes Escherichia coli BL21 Serratia plymuthica W... Serratia plymuthica 4...

Metabolic engineering Saccharomyces cerevisiae for de novo production of the sesquiterpenoid (+)-nootkatone

Microbial Cell Factories · 2020 · 10.1186/s12934-020-1295-6 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在酿酒酵母中实现(+)-nootkatone的从头生物合成,克服(+)-valencene前体供应不足和(+)-valencene选择性氧化为(+)-nootkatone效率低的问题。

关键发现:单独表达CnVS产生(+)-valencene 等 3 条

代谢工程/合成生物学 (+)-Nootkatone(+)-ValenceneDehydrogenasesSaccharomyces cerevisiaeSesquiterpene Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Reconstitution of the Costunolide Biosynthetic Pathway in Yeast and Nicotiana benthamiana

PLoS ONE · 2011 · 10.1371/journal.pone.0023255 · 含路线图 · 有原文

核心问题:costunolide生物合成途径中最后一步(由germacra-1(10),4,11(13)-trien-12-oic acid生成costunolide)对应的基因尚未被鉴定,且该途径在异源宿主中的重构尚未实现。

关键发现:TpGAS在酵母中产生germacrene A的活性约为菊苣CiGAS的3倍。在烟草中,线粒体靶向的mTpGAS使germacrene A产量比胞质cTpGAS高约15倍。酵母中共表达TpGAS、CiGAO和CiCOS时,在HEPES缓冲液(pH 等 5 条

代谢工程/合成生物学 CiCOSNicotiana benthamianacostunolidecytochrome P450germacrene A oxidasegermacrene A synthase Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis... Saccharomyces cerevis...

Combinatorial Engineering of 1-Deoxy-D-Xylulose 5-Phosphate Pathway Using Cross-Lapping In Vitro Assembly (CLIVA) Method

PLoS ONE · 2013 · 10.1371/journal.pone.0079557 · 含路线图 · 有原文

核心问题:缺乏快速、低成本、可一步组装多个大型DNA片段到质粒的方法,且难以系统探索代谢途径中多基因组合对目标产物产量的影响。

关键发现:CLIVA方法可在1-2天内完成大质粒组装,从7个模块成功组装21.6 kb质粒(含16个DXP途径基因),效率为2.0×10^3 cfu/μg input DNA。优化结果显示,MgCl2最佳浓度为2.5 mM 等 3 条

代谢工程/合成生物学 1-Deoxy-D-xylulose 5-phosphate pathwayCLIVADNA assemblyamorphadieneisoprenoidmetabolic engineering Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

Functional Characterization of the Xanthophyllomyces dendrorhous Farnesyl Pyrophosphate Synthase and Geranylgeranyl Pyrophosphate Synthase Encoding Genes That Are Involved in the Synthesis of Isoprenoid Precursors

PLoS ONE · 2014 · 10.1371/journal.pone.0096626 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明Xanthophyllomyces dendrorhous中从异戊烯基焦磷酸(IPP)和二甲基烯丙基焦磷酸(DMAPP)合成香叶基香叶基焦磷酸(GGPP)的关键酶学步骤,并评估FPS和crtE基因对类胡萝卜素(尤其是虾青素)生物合成的影响,为代谢工程改造提供靶点。

关键发现:FPS基因编码355个氨基酸(预测分子量40.24 kDa),crtE基因编码376个氨基酸(42.16 kDa) 等 6 条

代谢工程/合成生物学 Xanthophyllomyces dendrorhousastaxanthincarotenogenesisfarnesyl pyrophosphate synthasegeranylgeranyl pyrophosphate synthaseisoprenoid precursors Xanthophyllomyces den... Xanthophyllomyces den... Escherichia coli BL21

Diversifying Isoprenoid Platforms via Atypical Carbon Substrates and Non-model Microorganisms

Frontiers in Microbiology · 2021 · 10.3389/fmicb.2021.791089 · 含路线图 · 有原文

核心问题:传统微生物底盘(如大肠杆菌和酿酒酵母)在异戊二烯商业化生产中面临糖底物成本高、前体通量受限、中间产物反馈抑制等障碍,且非模式微生物虽有独特的碳源利用和耐受特性但遗传工具匮乏,如何协同模型与非模型微生物利用非典型碳底物(如C1化合物、木质纤维素)提高异戊二烯生产的商业可行性。

关键发现:综述中报道的关键数据包括:异戊烯醇最高产量10.8 g/L(Kang et al., 2019) 等 10 条

代谢工程/合成生物学 C1 metabolismisoprenoidsmetabolic engineeringnon-model organismssynthetic biologyterpenes Escherichia coli Escherichia coli Saccharomyces cerevisiae