核心问题：炎症性肠病（IBD）缺乏满意的治疗方法，需开发新的预防策略。本研究旨在通过基因工程提高益生菌地衣芽孢杆菌的脱落酸（ABA）产量，并验证其对DSS诱导结肠炎的预防效果。
关键发现：Bl-cyp菌株在Nfb培养基中培养48h的ABA浓度达95 μg/mL，显著高于Bl（26.5 μg/mL）和Bl-pET28a（26 μg/mL） 等 5 条
核心问题：长春花中SPL转录因子家族及miR156a/SPL模块对萜类吲哚生物碱（TIA）生物合成的调控作用尚不清楚，本研究旨在系统鉴定CrSPL基因家族并揭示其与Cro-miR156a在长春碱等TIA合成调控中的功能，为提升TIA产量提供理论依据。
关键发现：鉴定出14个CrSPL基因，分布于6条连锁群 等 5 条
核心问题：分析一点红（Emilia sonchifolia）中肝毒性成分senkirkine生物合成途径的关键酶及其调控网络，为降低毒性、平衡药效与安全提供基础。
关键发现：对一点红根、茎、叶、花的代谢组分析共检测到91个差异代谢物，归属10类生物碱，其中吡咯里西啶生物碱占13% 等 3 条
核心问题：解析冬凌草（Isodon rubescens）中冬凌草甲素（oridonin）生物合成的关键基因，尤其是响应茉莉酸甲酯（MeJA）诱导的基因，从而揭示冬凌草甲素积累的调控机制。
关键发现：组装获得43,115个unigenes，其中11,253个为差异表达基因 等 14 条
核心问题：尚不清楚 Atractylodes lancea 中 bHLH 转录因子在萜类生物合成中的调控机制，特别是 AlbHLH3 的功能角色。
关键发现：['通过 PacBio SMRT 测序获得 6,560,183 条 subreads，产生 352,632 条 CCS，其中 250,071 条 FLNC，128,515 条 consensus sequences，FLNC/CCS 比例为 等 3 条
核心问题：桑黄（Sanghuangporus baumii）三萜类化合物天然产量低，生物合成途径认知不足，限制其药理应用。
关键发现：1 mM Mn2+使桑黄菌丝生物量增加0.42 g/L（达4.46±0.04 g/L） 等 6 条
核心问题：从非模式植物Daphniphyllum macropodum中发现和表征萜类生物合成酶，探索其未被充分研究的萜类代谢多样性与潜在的新型三萜/生物碱合成关联。
关键发现：转录组BUSCO完整度94.6%（1527/1614） 等 13 条
核心问题：揭示miRNA在芳樟醇型樟树（Cinnamomum camphora）单萜生物合成中的转录后调控作用，特别是对芳樟醇生物合成的调控机制
关键发现：共鉴定199个已知miRNA和200个新miRNA 等 5 条
核心问题：猕猴桃等木本植物遗传转化效率低、耗时长，限制了CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用，进而影响基因功能研究和遗传改良。
关键发现：建立了以叶柄为外植体的农杆菌介导转化体系，在MS+2.0mg/L 6-BA+0.2mg/L NAA+10mg/L Hyg条件下，3个月内获得抗性苗 等 5 条
核心问题：西洋参中尚未建立形成层分生细胞（CMC）培养体系，传统脱分化细胞（DDC）培养存在次生代谢物产量低、细胞生长慢、性能不稳定等问题，限制人参皂苷的可持续工业化生产。
关键发现：CMC中人参皂苷Rg1、Rb1、Re、Rd含量分别比DDC高3.18、2.96、3.58、1.91倍 等 3 条
核心问题：水杨酸（SA）诱导红豆杉中紫杉醇积累的分子机制尚不清楚，特别是SA响应性R2R3-MYB转录因子如何调控紫杉醇生物合成基因表达的网络尚未阐明。
关键发现：TcMYB73受0.25 mM SA诱导8.83倍，3 h时达14.32倍峰值；过表达TcMYB73使10-DAB、baccatin III和紫杉醇含量分别提高2.38倍、2.87倍和1.79倍（10-DAB: 等 4 条
核心问题：解析广藿香（Pogostemon cablin）中广藿香醇生物合成的转录调控机制，鉴定参与植物激素信号响应并调控广藿香醇积累的关键转录因子。
关键发现：激素处理显著改变广藿香转录组，共获得154,779个unigenes（N50=1058） 等 5 条
核心问题：Phaffia rhodozyma中虾青素合成产量低，传统诱变育种效率低且遗传不稳定，代谢通路与调控机制复杂，缺乏理性改造靶点。
关键发现：虾青素抗氧化活性为维生素C的65倍 等 12 条
核心问题：K. phaffii现有常用强启动子多依赖甲醇诱导（如P_AOX1）或与生长偶联（如P_GAP），缺乏生长去偶联且甲醇非依赖的强启动子，限制了重组蛋白高效生产；同时，对生长去偶联的PDH启动子（HSP12基因上游352bp）的序列-功能关系缺乏了解，需要系统工程改造以提升其强度并解析调控机制。
关键发现：半理性block-scanning产生的152个PDH启动子变体，eGFP荧光水平为亲本启动子的10-150% 等 6 条
核心问题：灵芝酸产量低是应用瓶颈，环境变化如何通过能量代谢影响其生物合成的机制尚不清楚。
关键发现：热激、氮限制、MeJA和SA处理使GA含量分别增加170.5%、46.3%、52.4%和50.7%，ATP含量分别下降60.0%、67.0%、74.5%和52.0% 等 7 条
核心问题：如何利用Rhodotorula toruloides从废弃物流中可持续地合成和提取高附加值代谢物（脂质和类胡萝卜素），并系统阐明其代谢途径、影响因素、基因工程策略及提取方法。
关键发现：['R. toruloides可积累高达70%干重的脂质。', '蓝光照射使类胡萝卜素含量提高70%；光照4000 lx使脂质含量提高40%。', '1.0 M Na+和0.1 M K+使β-胡萝卜素产量提高60%。', '4.0% w/v NaCl使脂质合成提高71.3%。', 'pH 等 3 条
核心问题：系统综述细菌来源的基础类胡萝卜素（番茄红素、β-胡萝卜素、β-隐黄质、玉米黄质、角黄素、虾青素）的生物制造进展与生物学应用，强调细菌作为细胞工厂的潜力。
关键发现：天然色素市场预计2026-2033年复合年增长率为4.5%，而合成染料为4.2%。细菌培养周期通常约4天，而藻类（如C. minutissima）需30天。类胡萝卜素数据库已收录1204种，其中324种来自细菌，251种为细菌独有。优化后的产量示例：Kocuria sp. RAM1总类胡萝卜素... 等 12 条
核心问题：桦木酸（BA）和齐墩果酸（OA）等三萜类化合物主要依赖植物提取和化学合成，存在效率低、过程复杂、环境污染等问题，亟需开发可持续的微生物合成平台。
关键发现：ZBS49天然产BA 等 3 条
核心问题：青蒿素天然产量低且面临恶性疟原虫耐药性，威胁疟疾消除，需要整合生物生产创新和耐药管理策略。
关键发现：2023年全球疟疾约2.63亿例、59.7万人死亡 等 5 条
核心问题：阐明真菌Stachybotrys sp. CPCC 401591中苯基螺内酰胺（PSDs）类meroterpenoid生物合成的分子基础，特别是负责其合成的基因簇及生物合成途径。
关键发现：通过全基因组测序获得38.44 Mb非冗余碱基，组装的276个scaffold中鉴定到独特的meroterpenoid基因簇psd，其中psdA编码的NR-PKS与已知蛋白一致性>74.69%。基因敲除实验获得ΔpsdA-16突变株，诊断PCR显示ZeoR引物产生1300 bp和1392 bp... 等 3 条