共 107 篇
核心问题:分析 Yarrowia lipolytica 中高度同源的赤藓糖还原酶(ER)同源基因在渗透胁迫下对赤藓醇、甘露醇和阿拉伯醇合成的影响,确定关键基因及基因家族的功能冗余,并探索通过基因敲除将碳流从赤藓醇转向其他多元醇的可能性。
关键发现:敲除8个ER同源基因(D8菌株)使赤藓醇合成降低91%,甘露醇合成增加53%,阿拉伯醇合成增加近8倍(相比对照菌株)。D8菌株96 h时赤藓醇、甘露醇和阿拉伯醇产量分别为3.34 g/L、6.72 g/L和9.28 g/L,而对照菌株阿拉伯醇产量为1.17 g/L
等 4 条
代谢工程
Yarrowia lipolytica
Yarrowia lipolytica
Yarrowia lipolytica
核心问题:解析大麻素生物合成限速酶CsPT1和CsPT4基因启动子的激素调控机制,以及水杨酸对大麻素合成途径基因表达的调节作用。
关键发现:CsPT1和CsPT4在雌花中高表达,CsPT4启动子活性在腺毛中较强
等 7 条
代谢工程
Cannabis sativa
Cannabis sativa
Cannabis sativa
核心问题:利用随机诱变提高模式硅藻三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)的岩藻黄素含量,并系统评估突变体表型在6个月内的稳定性,探索不同诱变剂(UV、EMS、X射线)的效果。
关键发现:['EMS诱变菌株E2F13在4个月时达到最大岩藻黄素含量,为野生型的135±10%,即提高35%', 'UV和EMS处理在6个月内均产生显著高于野生型的岩藻黄素,但所有方法产生的突变体均在6个月内回复到野生型表型', 'X射线处理即使在最大强度1000 Gy下仍产生不稳定的表型,且死亡率仅6...
代谢工程
Phaeodactylum tricorn...
核心问题:皂苷escin对酵母具有毒性,阻碍了利用工程酵母工业规模生产escin皂苷;需要找到对escin具有高耐受性的酵母宿主菌株。
关键发现:野生型BY4741在YPD培养基中escin的MIC为150 μg/mL,在CSM培养基中为63 μg/mL(后者降低2.4倍)
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代谢工程
Saccharomyces cerevisiaeergosterolescinlipidome mutantsaponinsterol C-5 desaturase
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题:大豆中8个HMGR基因(GmHMGR1-GmHMGR8)在植物生长发育和异戊二烯生物合成中的功能尚不清楚,尤其是MVA和MEP通路之间的相互作用。
关键发现:LOV处理后大豆株高分别降低35.25%和53.89%(0.5和1.0 μM),主根长度分别缩短48.23%和70.31%,侧根数量减少超过37.10%
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代谢工程
HMGR大豆异戊二烯生物合成根发育洛伐他汀甲羟戊酸途径
Glycine max (大豆)
Glycine max (大豆)
Glycine max (大豆)
核心问题:灵芝属药用真菌中直接调控灵芝酸(三萜类)生物合成基因表达的转录因子尚不清楚,缺乏高质量的基因组注释信息也限制了转录因子调控机制的研究。
关键发现:灵芝基因组组装总长49.15 Mb,N50为2.33 Mb,GC含量55.87%,预测13,125个蛋白编码基因。DAP-seq共鉴定到2271个SREBP结合位点,其中75.9%位于转录起始位点2 kb内
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代谢工程
Ganoderic acidsGanoderma lingzhiLipid metabolismSREBPTranscription factorTriterpenoid biosynthesis
灵芝 (Ganoderma lingzhi)
灵芝 (Ganoderma lingzhi)
灵芝 (Ganoderma lingzhi)
核心问题:在肠杆菌科(尤其是 Salmonella enterica 和 Escherichia coli)中缺乏可诱导、可调、正交的人工转录因子(ATFs)工具,难以精确控制基因表达以用于基础研究和生物技术应用。
关键发现:在 Salmonella 中,删除 araBAD 并组成型表达 araE(PproA)后,PBAD 驱动的基因表达增强约4.5-6.5倍。
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合成生物学
CRISPR/dCas9EnterobacteriaceaeEscherichia coliSalmonellaarabinose-inducibleartificial transcription factors
Salmonella enterica s...
Salmonella enterica s...
Escherichia coli
核心问题:当归根部重要的药用活性成分(苯酞类、香豆素类、木脂素类、萜类等)的生物合成途径及其分子机制尚不清楚,缺乏高质量参考基因组限制了相关研究和遗传改良。
关键发现:基因组组装大小为2.16 Gb,contig N50为4.96 Mb,scaffold N50为198.27 Mb,覆盖估计基因组的99.8%
等 5 条
代谢工程
基因组多组学当归生物合成苯酞类萜类
当归 (Angelica sinensis...
当归 (Angelica sinensis...
当归 (Angelica sinensis...
核心问题:解析Termitomyces真菌中drimenol型倍半萜的分离、生物合成及抗菌活性,并探索其在白蚁共生关系中的作用
关键发现:蘑菇挥发物中以倍半萜为主,drimenol为其中一种
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合成生物学
Termitomyces sp. T153
Escherichia coli BL21...
Termitomyces sp. T153...
核心问题:丝状真菌来源的苔色酸-倍半萜杂合类meroterpenoids的结构、真菌来源、生物活性和生物合成途径缺乏系统总结
关键发现:自1968年从Ascochyta viciae发现ascochlorin以来,共鉴定71个苔色酸-倍半萜杂合类化合物。化合物1在10 μM时对Jurkat细胞增殖抑制率为71.43%
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合成生物学
antitumorascochlorinbiosynthesisfilamentous fungihDHODHorsellinic acid
Aspergillus oryzae NSAR1
Acremonium egyptiacum
Acremonium egyptiacum
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America · 2023
·
10.1073/pnas.2214119120
· 含路线图 · 有原文
核心问题:微拟球藻中叶黄素循环如何在光保护与光利用效率之间权衡,以及如何通过遗传改造优化这一权衡以提高生物量生产力
关键发现:研究发现:1) 在Nannochloropsis中,强光(1000 μmol photons m^-2 s^-1)诱导zeaxanthin积累,2小时内持续增加;在极端光强(4000 μmol photons m^-2 s^-1)下zeaxanthin占VAZ池的60%,表明其具有巨大的紫黄质储备。
等 5 条
代谢工程
microalgaenonphotochemical quenchingphotobioreactorphotosynthesis engineeringxanthophyll cycle
Nannochloropsis gaditana
Nannochloropsis gaditana
Nannochloropsis gaditana
核心问题:阐明删除储藏脂质合成基因(DGA1、DGA2、LRO1和ARE1)对解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)细胞生理和调控的影响
关键发现:['氮限制下,Q4菌株的细胞干重(CDW)和脂质含量分别比野生型降低33%和32%,脂质产量降低37%
等 5 条
代谢工程
Fat free Yarrowia lipolyticaFatty acid toxicityLipid classesLipotoxicityQ4 strain
Yarrowia lipolytica (...
Yarrowia lipolytica (...
Yarrowia lipolytica (...
核心问题:羧基营养型产乙酸菌如何通过代谢策略缓解一氧化碳的毒性,并在高可变底物通量下维持高效生长和产物生成。
关键发现:CODH催化CO氧化速率估算为3.63×10^-15 mol/s,而CO最大扩散速率约为2.3×10^-15 mol/s,两者同数量级,表明CO进入细胞后即刻被解毒。在C. autoethanogenum连续培养中,乙醇生成速率随稀释速率(生长速率)增加而线性增加,转录组显示中心碳代谢基因表达...
等 2 条
代谢工程 / 发酵工程
Clostridium autoethanogenumWood-Ljungdahl pathwaycarbon monoxide toxicitycarboxydotrophic acetogensgas fermentationoverflow metabolism
Clostridium autoethan...
Clostridium autoethan...
Clostridium autoethan...
核心问题:玉米籽粒中类胡萝卜素含量低,特别是β-胡萝卜素(维生素A原)不足,本文旨在解析玉米PTOX位点在类胡萝卜素生物合成中的作用,并探索通过基因工程提高玉米营养品质的可行性。
关键发现:EMS突变体Zmptox1-1中鉴定到G→A突变导致ZmPTOX1 W186提前终止
等 2 条
代谢工程
albescent1biofortificationcaroteneprovitamin A
玉米 (Zea mays L.)
玉米 (Zea mays L.)
玉米 (Zea mays L.)
核心问题:如何在不引起组成性生长抑制的前提下,通过外源小分子可诱导地激活ABA信号通路,从而提高植物抗旱性
关键发现:虚拟筛选鉴定出磺胺类激动剂SB,100μM SB可使AtPYL5/AtPYL10抑制HAB1活性>75%,但对PYL1家族仅约50%
等 4 条
合成生物学
ABA受体CsPYL1iSB09化学遗传学干旱胁迫蛋白质工程
Citrus sinensis
Arabidopsis thaliana
Arabidopsis thaliana
核心问题:植物三萜类化合物中柠檬苦素生物合成所涉及的复杂骨架重构(如C环开环、甲基迁移)的酶促机制尚不清楚,关键酶基因未被鉴定。
关键发现:组装了M. azedarach基因组(约230 Mbp,14条伪染色体)
等 5 条
代谢工程
Citrus sinensisMelia azedarachacyltransferasecytochrome P450limonoidsscaffold remodeling
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana
核心问题:进一步提高极端嗜热古菌Pyrococcus furiosus发酵产乙醇的温度,将工程化乙醇生产的最高温度从85°C提升至95°C,并利用一氧化碳氧化驱动乙醇合成。
关键发现:在95°C下,过表达AdhF的菌株在20-L发酵罐中乙醇产量达到12 mM,乙醇/乙酸比为0.9
等 8 条
代谢工程
CO dehydrogenasePyrococcus furiosusarchaeabioethanolcarbon monoxideethanol
Pyrococcus furiosus
Pyrococcus furiosus
Pyrococcus furiosus
核心问题:橄榄油品质受基因型和环境等多种因素影响,传统的育种周期长,需要快速鉴定与油品质相关的关键基因和代谢通路,以缩短品种筛选时间并提高油品质。
关键发现:从39个橄榄转录组实验中筛选出4个理想实验进行meta分析。比较S1 vs S2(C1)鉴定出1472个差异表达基因(DEGs),其中155个为新基因
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代谢工程
Meta-analysisOil qualityOleic acidOliveOlive oilRNA-Seq
橄榄(Olea europaea)
橄榄(Olea europaea)
橄榄(Olea europaea)
核心问题:在生物乙醇生产中,5-羟甲基糠醛(HMF)作为主要副产物严重抑制微生物发酵,需鉴定酿酒酵母中与HMF耐受性相关的基因,以提升乙醇发酵菌株的耐受性。
关键发现:筛选出294个与HMF耐受相关的基因(202个敏感基因和92个耐受基因)
等 4 条
发酵工程
5-HydroxymethylfurfuralSIW14Saccharomyces cerevisiaeTolerance
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
Saccharomyces cerevis...
核心问题:全球变暖导致的水分短缺严重影响蔬菜作物产量和品质;芹菜中β-胡萝卜素丰富,但其MYB转录因子在类胡萝卜素代谢和干旱响应中的调控机制尚不清楚。
关键发现:AgMYB5 ORF长588 bp,编码196个氨基酸,预测分子量22.65 kDa,pI 10.44
等 8 条
代谢工程
Abscisic acidAgMYB5CeleryDrought toleranceY2Hβ-carotene
芹菜 (Apium graveolens ...
拟南芥 (Arabidopsis thal...
拟南芥 (Arabidopsis thal...