共 67 篇
核心问题:在集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803中,基因sll0033的功能此前未知,该基因被推测可能参与类胡萝卜素合成中顺式到反式异构化,但缺乏直接证据。
关键发现:在LAHG条件下,crtH突变体积累的类胡萝卜素中,顺式番茄红素异构体占总类胡萝卜素的约72%(10%+60%+2%),顺式神经孢烯占15%,全反式ζ-胡萝卜素占10%
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代谢工程
Carotene isomeraseCyanobacteriaPhotoisomerizationSynechocystis sp. PCC 6803cis-LycopenecrtH
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:蓝藻中是否存在完整的光呼吸C2循环?细菌型甘油酸途径是否参与以及两者如何协同代谢2-磷酸乙醇酸?
关键发现:['在集胞藻PCC 6803基因组中鉴定到编码植物型C2循环和细菌型甘油酸途径全部酶的基因,包括两个PGP、两个GCL、两个HPR等。', '重组蛋白Syn-GlcD(57 kD)和Syn-SHMT(50 kD)均具有活性
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植物代谢
2-磷酸乙醇酸代谢C2循环光呼吸甘油酸途径蓝藻集胞藻PCC 6803
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:阐明拟南芥NDC1和集胞藻ndbB缺失导致脱甲基叶绿醌积累而不产生叶绿醌的分子机制,确定维生素K1生物合成中是否存在由II型NAD(P)H脱氢酶催化的脱甲基萘醌环还原步骤。
关键发现:共表达分析显示拟南芥NDC1与MENG共享超过50%的top500共表达基因(水稻为54%),而NDC1与VTE1仅共享30%(水稻11%)
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代谢工程
II型NAD(P)H脱氢酶NDC1叶绿醌拟南芥维生素K1生物合成集胞藻
拟南芥 (Arabidopsis thal...
拟南芥
集胞藻 (Synechocystis sp...
核心问题:有效将光合作用固定的碳和还原力重定向到萜烯生物合成途径,实现光合产萜烯用于生物燃料和化学品。
关键发现:异养系统中,大肠杆菌MEP途径产紫杉二烯约1000 mg/L,产红没药烯>900 mg/L,柠檬烯400 mg/L,蒎烯32 mg/L
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代谢工程
MEPadvanced biofuelhydrocarbonphotosynthesisterpenoid
Escherichia coli
Escherichia coli
Saccharomyces cerevisiae
核心问题:如何在光合生物中高效合成天然及新-至-天然萜类化合物,解决植物天然产物产量低、来源稀缺、化学合成困难等问题,并探索组合生物合成与激活沉默代谢以创造新型萜类结构。
关键发现:番茄中表达两种藻类基因使酯化虾青素积累高达16.1 mg/g
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代谢工程 / 合成生物学
combinatorial biosynthesisconjugatesgenome editingheterologous biosynthesismetabolic engineeringspecialized metabolism
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana
Nicotiana benthamiana
核心问题:如何通过遗传工程手段提高集胞藻PCC 6803中玉米黄质等类胡萝卜素的产量,并实现无抗生素标记的基因替换。
关键发现:过表达crtR使玉米黄质含量比野生型提高2.5倍(0.39→0.98 μg/ml/OD730),β-胡萝卜素和echinone含量降低约2倍;过表达crtP和crtB使myxoxanthophyll和玉米黄质含量增加约50%-60%(myxoxanthophyll
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代谢工程
psbAII启动子代谢工程基因敲除基因过表达玉米黄质类胡萝卜素
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:鉴定蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002中myxoxanthophyll(myxol-2' fucoside)生物合成途径中负责类胡萝卜素ψ末端修饰的酶和基因,并澄清此前关于slr1293和sll0254功能的争议。
关键发现:从Synechococcus sp. PCC 7002中纯化并鉴定出myxol-2' fucoside,分子量为730 Da。
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代谢工程
CruFCruGSynechococcus sp. PCC 7002myxoxanthophyll类胡萝卜素生物合成
Synechococcus sp. PCC...
Synechococcus sp. PCC...
Synechococcus sp. PCC...
核心问题:在大肠杆菌甲萘醌生物合成中,尚未确定从1,4-二羟基-2-萘甲酰辅酶A(DHNA-CoA)水解为1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的酶,尽管YbgC与已知的Slr0204同源,但缺乏该水解活性。
关键发现:YbgC对DHNA-CoA无水解活性,催化效率<6.0 M^-1·s^-1
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微生物学
DHNA-CoAEscherichia coliYdiIhotdog fold thioesterasemenaquinone biosynthesis
Escherichia coli
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题:阐明Synechococcus sp. PCC 7002中芳香族类胡萝卜素synechoxanthin的生物合成途径,并鉴定参与该途径的关键基因(cruE和cruH)及其功能。
关键发现:Synechococcus sp. PCC 7002中synechoxanthin是主要类胡萝卜素,占总类胡萝卜素的15%以上
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代谢工程
CruECruHSynechococcus sp. PCC 7002aromatic carotenoidbiosynthesiscyanobacteria
Synechococcus sp. PCC...
Synechococcus sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:比较蓝藻 Anabaena sp. PCC 7120 与 Synechocystis sp. PCC 6803 中岩藻糖基转移酶和β-胡萝卜素羟化酶在 myxol 2'-岩藻糖苷合成中的底物特异性,阐明类胡萝卜素生物合成途径的种间差异。
关键发现:Anabaena wcaG 缺失突变体中,myxol 2'-鼠李糖苷占5%,4-酮基 myxol 2'-鼠李糖苷占2%,脱氧 myxol 2'-鼠李糖苷占1%,游离 myxol 占3%
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代谢工程
myxol糖苷β-胡萝卜素羟化酶岩藻糖基转移酶类胡萝卜素生物合成蓝藻
Anabaena sp. PCC 7120
Synechocystis sp. PCC...
Anabaena sp. PCC 7120
核心问题:阐明集胞藻PCC 6803中sll1556基因在类异戊二烯生物合成中的作用,特别是其是否参与戊糖磷酸循环底物向类异戊二烯前体的转化,以及是否存在非经典的MEP途径分支。
关键发现:敲除sll1556后,突变体(Δsll1556)在体外不能利用果糖-6-磷酸(FR6P)、甘油醛-3-磷酸(GA3P)和葡萄糖-6-磷酸(GL6P)刺激[14C]IPP掺入类异戊二烯,而野生型可被这些底物刺激;②加入重组Sll1556蛋白可恢复突变体上清中的合成能力,且FR6P的刺激作用相当于...
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代谢工程
IPP异构酶sll1556基因戊糖磷酸循环类异戊二烯生物合成集胞藻PCC 6803
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:鉴定蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中由slr1293编码的蛋白功能,验证其是否为myxoxanthophyll生物合成所需的C-3',4'脱饱和酶(CrtD)。
关键发现:在高光强下,myxoxanthophyll占Synechocystis sp. PCC 6803总类胡萝卜素的四分之一以上。
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代谢工程
CrtDSlr1293Synechocystis sp. PCC 6803carotenoid biosynthesisdesaturasemyxoxanthophyll
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Escherichia coli (BL2...
核心问题:如何通过计算模型设计基因敲除策略,使蓝细菌在光合自养条件下实现生物燃料(乙醇、异丁醇)的高产合成并与生长强制耦合,同时保持夜间维持代谢可行。
关键发现:线性电子流(LEF)产生的ATP/NADPH比约1.28(9 ATP/7 NADPH),而生物量合成至少需1.51,乙醇合成仅需1.17(7 ATP/6 NADPH),异丁醇为1.0(12 ATP/12 NADPH)。在简化网络中,共找到100803个乙醇相关基本模式,最大乙醇产量0.0416...
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代谢工程
BiofuelsCyanobacteriaMetabolic engineeringMinimal cut setsPhotosynthesisSynechocystis sp. PCC 6803
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:集胞藻光合自养生长时乙酰-CoA碳通量低,限制了正丁醇等发酵产物的合成,需要遗传和营养手段提高乙酰-CoA水平。
关键发现:氮饥饿使JA02的比丁醇产量提高达3倍,乙酰-CoA水平增加2倍
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代谢工程
BiofuelButanolCyanobacteriaMetabolic engineeringPhosphoketolaseStarvation
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:蓝藻中萜类生物合成途径碳通量低,需要识别并下调与目标萜类生产竞争的代谢通路,以提高异源萜类(异戊二烯、红没药烯)的产量。
关键发现:在异戊二烯生产中,crtE、chlP、thiG、ilvG、ccmA和gpi基因敲低后,诱导条件下异戊二烯产量(每细胞)显著高于对照
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代谢工程
Antisense RNABisaboleneIsopreneMetabolic engineeringSynechocystis sp. PCC 6803Terpenoids
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:降低微藻/蓝藻生物燃料生产成本,特别是收获成本(可占生物燃料总成本50%)、营养供给和油脂提取成本高的问题
关键发现:烟曲霉/葡萄糖培养物在24小时絮凝效率达86%,48小时达97%
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代谢工程
BiofuelBioremediationFlocculationFungiGenetic modificationRenewable energy
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:直链生物燃料在能量密度、吸湿性、低温性能等方面存在不足,支链生物燃料具有更高的辛烷值、更好的低温流动性和更低的浊点,但它们的生物合成与调控机制尚不清晰,且产量较低,难以经济规模化生产。本综述旨在系统总结微生物合成支链生物燃料(包括支链短链醇/酯、末端支链长链脂肪酸及其衍生物、内部支链脂肪酸)的...
关键发现:酿酒酵母中过表达KDC和Adh6p并敲除PDC1,异丁醇产量达143 mg/L,比野生型高13倍
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代谢工程
Advanced biofuelsBranched alcoholsBranched fatty acidsBranched fuelsCyclopropane fatty acid
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题:常规通量平衡分析无法描述蓝藻在光暗周期下的时间动态代谢,尤其是代谢物积累/消耗的昼夜变化以及不同时段生物量前体的合成差异。
关键发现:未加转录组约束时,预测生物量产生通量为0.03 hr^-1,对应倍增时间22.8小时
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代谢工程
Synechocystis代谢模型固氮昼夜节律蓝藻通量平衡分析
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:利用光合蓝细菌可持续生产角鲨烯,并鉴定蓝细菌中参与角鲨烯合成与代谢的关键酶(角鲨烯hopene环化酶和角鲨烯合酶)。
关键发现:失活shc基因的Δshc菌株在稳定期角鲨烯含量为0.67±0.102 mg OD750^-1 L^-1,野生型仅为0.0093±0.0031 mg OD750^-1 L^-1,积累量提高超过70倍
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代谢工程
Synechocystisbiofuelcyanobacteriaisoprenoidsqualenesqualene hopene cyclase
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...
核心问题:类胡萝卜素生物合成途径中各个酶促步骤在蓝藻(Synechocystis sp. PCC 6803)中的亚细胞定位尚不清楚,尤其是CrtQ和CrtO在质膜与类囊体膜中的分布未知。
关键发现:PM1的类胡萝卜素/蛋白比最高,TM和PM2中类胡萝卜素含量分别仅为PM1的16%和11%
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代谢工程
Carotenoid biosynthesisCrtOCrtQPlasma membraneSubcellular localizationSynechocystis sp. PCC 6803
Synechocystis sp. PCC...
Synechocystis sp. PCC...