共 67 篇

Identification of a Gene Required for cis-to-trans Carotene Isomerization in Carotenogenesis of the Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803

Plant and Cell Physiology · 2001 · 10.1093/pcp/pce167 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803中,基因sll0033的功能此前未知,该基因被推测可能参与类胡萝卜素合成中顺式到反式异构化,但缺乏直接证据。

关键发现:在LAHG条件下,crtH突变体积累的类胡萝卜素中,顺式番茄红素异构体占总类胡萝卜素的约72%(10%+60%+2%),顺式神经孢烯占15%,全反式ζ-胡萝卜素占10% 等 2 条

代谢工程 Carotene isomeraseCyanobacteriaPhotoisomerizationSynechocystis sp. PCC 6803cis-LycopenecrtH Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

The Plant-Like C2 Glycolate Cycle and the Bacterial-Like Glycerate Pathway Cooperate in Phosphoglycolate Metabolism in Cyanobacteria

Plant Physiology · 2006 · 10.1104/pp.106.082982 · 含路线图 · 有原文

核心问题:蓝藻中是否存在完整的光呼吸C2循环?细菌型甘油酸途径是否参与以及两者如何协同代谢2-磷酸乙醇酸?

关键发现:['在集胞藻PCC 6803基因组中鉴定到编码植物型C2循环和细菌型甘油酸途径全部酶的基因,包括两个PGP、两个GCL、两个HPR等。', '重组蛋白Syn-GlcD(57 kD)和Syn-SHMT(50 kD)均具有活性 等 2 条

植物代谢 2-磷酸乙醇酸代谢C2循环光呼吸甘油酸途径蓝藻集胞藻PCC 6803 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

A Dedicated Type II NADPH Dehydrogenase Performs the Penultimate Step in the Biosynthesis of Vitamin K1 in Synechocystis and Arabidopsis

The Plant Cell · 2015 · 10.1105/tpc.15.00103 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明拟南芥NDC1和集胞藻ndbB缺失导致脱甲基叶绿醌积累而不产生叶绿醌的分子机制,确定维生素K1生物合成中是否存在由II型NAD(P)H脱氢酶催化的脱甲基萘醌环还原步骤。

关键发现:共表达分析显示拟南芥NDC1与MENG共享超过50%的top500共表达基因(水稻为54%),而NDC1与VTE1仅共享30%(水稻11%) 等 7 条

代谢工程 II型NAD(P)H脱氢酶NDC1叶绿醌拟南芥维生素K1生物合成集胞藻 拟南芥 (Arabidopsis thal... 拟南芥 集胞藻 (Synechocystis sp...

Photosynthetic terpene hydrocarbon production for fuels and chemicals

Plant Biotechnology Journal · 2015 · 10.1111/pbi.12343 · 含路线图 · 有原文

核心问题:有效将光合作用固定的碳和还原力重定向到萜烯生物合成途径,实现光合产萜烯用于生物燃料和化学品。

关键发现:异养系统中,大肠杆菌MEP途径产紫杉二烯约1000 mg/L,产红没药烯>900 mg/L,柠檬烯400 mg/L,蒎烯32 mg/L 等 8 条

代谢工程 MEPadvanced biofuelhydrocarbonphotosynthesisterpenoid Escherichia coli Escherichia coli Saccharomyces cerevisiae

Synthetic biology for production of natural and new-to-nature terpenoids in photosynthetic organisms

The Plant Journal · 2016 · 10.1111/tpj.13138 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何在光合生物中高效合成天然及新-至-天然萜类化合物,解决植物天然产物产量低、来源稀缺、化学合成困难等问题,并探索组合生物合成与激活沉默代谢以创造新型萜类结构。

关键发现:番茄中表达两种藻类基因使酯化虾青素积累高达16.1 mg/g 等 6 条

代谢工程 / 合成生物学 combinatorial biosynthesisconjugatesgenome editingheterologous biosynthesismetabolic engineeringspecialized metabolism Nicotiana benthamiana Nicotiana benthamiana Nicotiana benthamiana

Increased Production of Zexanthin and Other Pigments by Application of Genetic Engineering Techniques to Synechocystis sp. Strain PCC 6803

Applied and Environmental Microbiology · 2000 · 10.1128/AEM.66.1.64-72.2000 · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过遗传工程手段提高集胞藻PCC 6803中玉米黄质等类胡萝卜素的产量,并实现无抗生素标记的基因替换。

关键发现:过表达crtR使玉米黄质含量比野生型提高2.5倍(0.39→0.98 μg/ml/OD730),β-胡萝卜素和echinone含量降低约2倍;过表达crtP和crtB使myxoxanthophyll和玉米黄质含量增加约50%-60%(myxoxanthophyll 等 3 条

代谢工程 psbAII启动子代谢工程基因敲除基因过表达玉米黄质类胡萝卜素 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

The Biosynthetic Pathway for Myxol-2' Fucoside (Myxoxanthophyll) in the Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain PCC 7002

Journal of Bacteriology · 2009 · 10.1128/JB.00050-09 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定蓝藻Synechococcus sp. PCC 7002中myxoxanthophyll(myxol-2' fucoside)生物合成途径中负责类胡萝卜素ψ末端修饰的酶和基因,并澄清此前关于slr1293和sll0254功能的争议。

关键发现:从Synechococcus sp. PCC 7002中纯化并鉴定出myxol-2' fucoside,分子量为730 Da。 等 6 条

代谢工程 CruFCruGSynechococcus sp. PCC 7002myxoxanthophyll类胡萝卜素生物合成 Synechococcus sp. PCC... Synechococcus sp. PCC... Synechococcus sp. PCC...

Identification of a Hotdog Fold Thioesterase Involved in the Biosynthesis of Menaquinone in Escherichia coli

Journal of Bacteriology · 2013 · 10.1128/JB.00141-13 · 含路线图 · 有原文

核心问题:在大肠杆菌甲萘醌生物合成中,尚未确定从1,4-二羟基-2-萘甲酰辅酶A(DHNA-CoA)水解为1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的酶,尽管YbgC与已知的Slr0204同源,但缺乏该水解活性。

关键发现:YbgC对DHNA-CoA无水解活性,催化效率<6.0 M^-1·s^-1 等 6 条

微生物学 DHNA-CoAEscherichia coliYdiIhotdog fold thioesterasemenaquinone biosynthesis Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli

The Biosynthetic Pathway for Synechoxanthin, an Aromatic Carotenoid Synthesized by the Euryhaline, Unicellular Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain PCC 7002

Journal of Bacteriology · 2009 · 10.1128/JB.00985-08 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明Synechococcus sp. PCC 7002中芳香族类胡萝卜素synechoxanthin的生物合成途径,并鉴定参与该途径的关键基因(cruE和cruH)及其功能。

关键发现:Synechococcus sp. PCC 7002中synechoxanthin是主要类胡萝卜素,占总类胡萝卜素的15%以上 等 5 条

代谢工程 CruECruHSynechococcus sp. PCC 7002aromatic carotenoidbiosynthesiscyanobacteria Synechococcus sp. PCC... Synechococcus sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Substrate Specificities and Availability of Fucosyltransferase and β-Carotene Hydroxylase for Myxol 2′-Fucoside Synthesis in Anabaena sp. Strain PCC 7120 Compared with Synechocystis sp. Strain PCC 6803

Journal of Bacteriology · 2008 · 10.1128/JB.01881-07 · 含路线图 · 有原文

核心问题:比较蓝藻 Anabaena sp. PCC 7120 与 Synechocystis sp. PCC 6803 中岩藻糖基转移酶和β-胡萝卜素羟化酶在 myxol 2'-岩藻糖苷合成中的底物特异性,阐明类胡萝卜素生物合成途径的种间差异。

关键发现:Anabaena wcaG 缺失突变体中,myxol 2'-鼠李糖苷占5%,4-酮基 myxol 2'-鼠李糖苷占2%,脱氧 myxol 2'-鼠李糖苷占1%,游离 myxol 占3% 等 3 条

代谢工程 myxol糖苷β-胡萝卜素羟化酶岩藻糖基转移酶类胡萝卜素生物合成蓝藻 Anabaena sp. PCC 7120 Synechocystis sp. PCC... Anabaena sp. PCC 7120

Inactivation of sll1556 in Synechocystis Strain PCC 6803 Impairs Isoprenoid Biosynthesis from Pentose Phosphate Cycle Substrates In Vitro

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.14.4685-4693.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:阐明集胞藻PCC 6803中sll1556基因在类异戊二烯生物合成中的作用,特别是其是否参与戊糖磷酸循环底物向类异戊二烯前体的转化,以及是否存在非经典的MEP途径分支。

关键发现:敲除sll1556后,突变体(Δsll1556)在体外不能利用果糖-6-磷酸(FR6P)、甘油醛-3-磷酸(GA3P)和葡萄糖-6-磷酸(GL6P)刺激[14C]IPP掺入类异戊二烯,而野生型可被这些底物刺激;②加入重组Sll1556蛋白可恢复突变体上清中的合成能力,且FR6P的刺激作用相当于... 等 3 条

代谢工程 IPP异构酶sll1556基因戊糖磷酸循环类异戊二烯生物合成集胞藻PCC 6803 Synechocystis sp. PCC...

Slr1293 in Synechocystis sp. Strain PCC 6803 Is the C-3',4' Desaturase (CrtD) Involved in Myxoxanthophyll Biosynthesis

Journal of Bacteriology · 2004 · 10.1128/JB.186.17.5621-5628.2004 · 含路线图 · 有原文

核心问题:鉴定蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中由slr1293编码的蛋白功能,验证其是否为myxoxanthophyll生物合成所需的C-3',4'脱饱和酶(CrtD)。

关键发现:在高光强下,myxoxanthophyll占Synechocystis sp. PCC 6803总类胡萝卜素的四分之一以上。 等 6 条

代谢工程 CrtDSlr1293Synechocystis sp. PCC 6803carotenoid biosynthesisdesaturasemyxoxanthophyll Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Escherichia coli (BL2...

Cyanobacterial biofuels: new insights and strain design strategies revealed by computational modeling

Microbial Cell Factories · 2014 · 10.1186/s12934-014-0128-x · 含路线图 · 有原文

核心问题:如何通过计算模型设计基因敲除策略,使蓝细菌在光合自养条件下实现生物燃料(乙醇、异丁醇)的高产合成并与生长强制耦合,同时保持夜间维持代谢可行。

关键发现:线性电子流(LEF)产生的ATP/NADPH比约1.28(9 ATP/7 NADPH),而生物量合成至少需1.51,乙醇合成仅需1.17(7 ATP/6 NADPH),异丁醇为1.0(12 ATP/12 NADPH)。在简化网络中,共找到100803个乙醇相关基本模式,最大乙醇产量0.0416... 等 2 条

代谢工程 BiofuelsCyanobacteriaMetabolic engineeringMinimal cut setsPhotosynthesisSynechocystis sp. PCC 6803 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Genetic and nutrient modulation of acetyl-CoA levels in Synechocystis for n-butanol production

Microbial Cell Factories · 2015 · 10.1186/s12934-015-0355-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:集胞藻光合自养生长时乙酰-CoA碳通量低,限制了正丁醇等发酵产物的合成,需要遗传和营养手段提高乙酰-CoA水平。

关键发现:氮饥饿使JA02的比丁醇产量提高达3倍,乙酰-CoA水平增加2倍 等 2 条

代谢工程 BiofuelButanolCyanobacteriaMetabolic engineeringPhosphoketolaseStarvation Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Mapping competitive pathways to terpenoid biosynthesis in Synechocystis sp. PCC 6803 using an antisense RNA synthetic tool

Microbial Cell Factories · 2023 · 10.1186/s12934-023-02040-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:蓝藻中萜类生物合成途径碳通量低,需要识别并下调与目标萜类生产竞争的代谢通路,以提高异源萜类(异戊二烯、红没药烯)的产量。

关键发现:在异戊二烯生产中,crtE、chlP、thiG、ilvG、ccmA和gpi基因敲低后,诱导条件下异戊二烯产量(每细胞)显著高于对照 等 4 条

代谢工程 Antisense RNABisaboleneIsopreneMetabolic engineeringSynechocystis sp. PCC 6803Terpenoids Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Lipid production in association of filamentous fungi with genetically modified cyanobacterial cells

Biotechnology for Biofuels · 2015 · 10.1186/s13068-015-0364-2 · 含路线图 · 有原文

核心问题:降低微藻/蓝藻生物燃料生产成本,特别是收获成本(可占生物燃料总成本50%)、营养供给和油脂提取成本高的问题

关键发现:烟曲霉/葡萄糖培养物在24小时絮凝效率达86%,48小时达97% 等 4 条

代谢工程 BiofuelBioremediationFlocculationFungiGenetic modificationRenewable energy Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Biosynthesis, regulation, and engineering of microbially produced branched biofuels

Biotechnology for Biofuels · 2019 · 10.1186/s13068-019-1424-9 · 含路线图 · 有原文

核心问题:直链生物燃料在能量密度、吸湿性、低温性能等方面存在不足,支链生物燃料具有更高的辛烷值、更好的低温流动性和更低的浊点,但它们的生物合成与调控机制尚不清晰,且产量较低,难以经济规模化生产。本综述旨在系统总结微生物合成支链生物燃料(包括支链短链醇/酯、末端支链长链脂肪酸及其衍生物、内部支链脂肪酸)的...

关键发现:酿酒酵母中过表达KDC和Adh6p并敲除PDC1,异丁醇产量达143 mg/L,比野生型高13倍 等 2 条

代谢工程 Advanced biofuelsBranched alcoholsBranched fatty acidsBranched fuelsCyclopropane fatty acid Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae Saccharomyces cerevisiae

A diurnal flux balance model of Synechocystis sp. PCC 6803 metabolism

PLoS Computational Biology · 2019 · 10.1371/journal.pcbi.1006692 · 含路线图 · 有原文

核心问题:常规通量平衡分析无法描述蓝藻在光暗周期下的时间动态代谢,尤其是代谢物积累/消耗的昼夜变化以及不同时段生物量前体的合成差异。

关键发现:未加转录组约束时,预测生物量产生通量为0.03 hr^-1,对应倍增时间22.8小时 等 2 条

代谢工程 Synechocystis代谢模型固氮昼夜节律蓝藻通量平衡分析 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Production of Squalene in Synechocystis sp. PCC 6803

PLoS ONE · 2014 · 10.1371/journal.pone.0090270 · 含路线图 · 有原文

核心问题:利用光合蓝细菌可持续生产角鲨烯,并鉴定蓝细菌中参与角鲨烯合成与代谢的关键酶(角鲨烯hopene环化酶和角鲨烯合酶)。

关键发现:失活shc基因的Δshc菌株在稳定期角鲨烯含量为0.67±0.102 mg OD750^-1 L^-1,野生型仅为0.0093±0.0031 mg OD750^-1 L^-1,积累量提高超过70倍 等 5 条

代谢工程 Synechocystisbiofuelcyanobacteriaisoprenoidsqualenesqualene hopene cyclase Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...

Subcellular Localization of Carotenoid Biosynthesis in Synechocystis sp. PCC 6803

PLoS ONE · 2015 · 10.1371/journal.pone.0130904 · 含路线图 · 有原文

核心问题:类胡萝卜素生物合成途径中各个酶促步骤在蓝藻(Synechocystis sp. PCC 6803)中的亚细胞定位尚不清楚,尤其是CrtQ和CrtO在质膜与类囊体膜中的分布未知。

关键发现:PM1的类胡萝卜素/蛋白比最高,TM和PM2中类胡萝卜素含量分别仅为PM1的16%和11% 等 6 条

代谢工程 Carotenoid biosynthesisCrtOCrtQPlasma membraneSubcellular localizationSynechocystis sp. PCC 6803 Synechocystis sp. PCC... Synechocystis sp. PCC...