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核心问题:奶酪乳清中乳糖利用率低,尤其是含盐乳清(可达6% NaCl)中缺乏能同时发酵乳糖和耐盐的酵母菌株,导致乳清废弃物造成环境污染。
关键发现:获得57个融合子,其中18个DNA含量高于亲本;SK-35的DNA含量为亲本K. lactis的1.87倍,SK-53为亲本S. cerevisiae的2.23倍;SK-1核直径0.00140 mm,显著高于亲本(K. lactis
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代谢工程
乙醇乳清乳糖乳酸克鲁维酵母原生质体融合酿酒酵母
Saccharomyces cerevis...
Kluyveromyces lactis ...
Kluyveromyces lactis ...
核心问题:识别丙酮丁醇梭菌从酸生成转向溶剂生成过程中特异性诱导的蛋白质,理解代谢转换的分子机制。
关键发现:在分析的130个蛋白中,溶剂生成期有52个蛋白合成增加超过2倍,34个蛋白降至不足酸生成期的一半;7个蛋白(spots 18, 28, 30, 36, 37, Adc I, 118)诱导超过10倍。乙酰乙酸脱羧酶(Adc)合成诱导率36.2倍,丰度增加10.9倍;DnaK合成诱导3.7倍,GroEL
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代谢工程
Clostridium acetobutylicumN-Terminal sequencingProteome analysisSolventogenesisTwo-dimensional electrophoresis
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
Clostridium acetobuty...
核心问题:芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸)及其衍生化合物的生物合成途径和调控机制
关键发现:在Aerobacter aerogenes中,L-苯丙氨酸(5×10^-3 M)对分支酸变位酶P同工酶抑制65%,对T同工酶抑制4%
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代谢工程
反馈抑制同工酶芳香族氨基酸生物合成莽草酸途径调控阻遏
Escherichia coli
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题:解析拟南芥CYP716A亚家族酶CYP716A1和CYP716A2对三萜骨架的氧化功能,并发现新颖的催化活性,为三萜类化合物的组合生物合成提供新酶。
关键发现:CYP716A1和CYP716A2均能催化α-amyrin、β-amyrin和lupeol的C-28羟基化,分别生成uvaol、erythrodiol和betulin
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代谢工程
22α-hydroxylationArabidopsis thalianaCYP716Acombinatorial biosynthesiscytochrome P450 monooxygenasetriterpenoids
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题:解析藤仓赤霉菌(Gibberella fujikuroi)中赤霉素生物合成的调控机制,包括光照、碳源(葡萄糖)和氮源(铵离子)如何影响赤霉素产量与相关酶活性。
关键发现:光照使类胡萝卜素合成增加300倍以上,kaurene合成增加438倍
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代谢工程
葡萄糖效应藤仓赤霉菌调控赤霉素铵抑制
Gibberella fujikuroi ...
Gibberella fujikuroi ...
Gibberella fujikuroi ...
核心问题:水稻胚乳缺乏维生素A原(β-胡萝卜素),导致以稻米为主食的人群维生素A缺乏症高发,需要通过基因工程在胚乳中建立β-胡萝卜素合成途径。
关键发现:获得黄色胚乳的转基因水稻,类胡萝卜素含量最高达1.6 μg/g胚乳(z11b系),接近2 μg/g的目标值
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代谢工程
β-胡萝卜素基因工程水稻胚乳类胡萝卜素生物合成维生素A金色大米
水稻 (Oryza sativa) 胚乳
水稻 (Oryza sativa) 胚乳
水稻 (Oryza sativa) 胚乳
核心问题:研究细菌角鲨烯环化酶中高度保守的 Gly600 残基对底物特异性的影响,探究原核环化酶能否通过单点缺失突变变为真核型环化酶,仅识别(3S)-2,3-氧化角鲨烯。
关键发现:ΔG600 突变体对角鲨烯 (1) 和 (3R)-2,3-氧化角鲨烯 (7) 的环化活性低于检测限 (<0.2%);对 (3S)-2,3-氧化角鲨烯 (4) 的转化率为 64%,总产物产率 32%,产物 10-15 的分布比为
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代谢工程
三萜环化环化酶角鲨烯酶
核心问题:解析IspH蛋白催化HMBPP还原脱水生成IPP和DMAPP的反应机制,验证C1位是否参与反应,区分两种机理模型。
关键发现:利用[1,1-2H2]-1(总产率34%)测定IspH动力学,未观察到一级KIE,动力学参数与天然底物1完全相同
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代谢工程
动力学反应机制同位素效应生物合成酶
核心问题:IspH蛋白催化的非甲羟戊酸途径最后一步反应——烯丙醇的还原性脱羟基——的结构与机制尚不清楚,需要阐明其催化机理、铁硫簇的作用以及构象变化的动态过程。
关键发现:IspH蛋白将HMBPP(6)转化为6:1的IPP与DMAPP混合物,而热力学平衡比为1:3
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代谢工程
IspH proteinLytB proteindeoxyxylulose phosphate pathwayiron-sulfur clustersisoprenoid biosynthesis
Escherichia coli
Aquifex aeolicus
Thermosynechocystis e...
核心问题:阐明LytB/IspH酶中[4Fe-4S]簇与底物及抑制剂结合的分子机制,为开发以MEP途径为靶点的新型抗菌药物提供结构基础。
关键发现:氨基类似物2对大肠杆菌LytB的IC50为0.15 μM,硫醇类似物3的IC50为0.21 μM,均优于已报道的3-丁炔基二磷酸(IC50=0.45 μM)
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代谢工程
Mössbauer spectroscopyinhibitorsironmetalloenzymessulfur
Escherichia coli
核心问题:萜烯合酶催化萜类化合物合成中的关键环化步骤,但其复杂的碳正离子环化机理使得理性设计几乎不可能,而传统GC-MS分析通量低,且缺乏针对环化活性的高通量筛选方法,严重限制了萜烯合酶的定向进化改造。
关键发现:合成底物3在25 mM NH4HCO3溶液中10 mM浓度下室温稳定至少10天
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代谢工程
directed evolutionhigh-throughput screeningprotein engineeringterpenesthermostability
Escherichia coli
Escherichia coli
Escherichia coli
核心问题:确定IspH催化HMBPP还原脱氧生成IPP/DMAPP的反应中间体究竟是ferraoxetane还是烯丙基阴离子(allyl anion)结构。
关键发现:[1-17O]-HMBPP实验中未观察到任何17O超精细信号,表明中间体不存在Fe-O键,排除ferraoxetane模型
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代谢工程
biosynthesisenzyme catalysisiron-sulfur cluster metalloproteinsterpenes
Aquifex aeolicus
核心问题:肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)作为工业2,3-丁二醇(2,3-BD)生产菌株,其2,3-BD产量仍有提升空间。本研究旨在通过过表达2,3-BD生物合成途径中的关键酶来增强碳通量、提高2,3-BD产量。
关键发现:KG-rs菌株(同时过表达ALS和AR)在葡萄糖批式发酵中2,3-BD产量比亲本菌株提高12%
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代谢工程
2,3-BDKlebsiella pneumoniaeacetoin reductaseacetolactate decarboxylaseacetolactate synthase
Klebsiella pneumoniae...
Klebsiella pneumoniae...
Klebsiella pneumoniae...
核心问题:验证MEP途径是否直接参与阿吗碱生物合成,并通过代谢工程改造MEP途径及下游途径提高长春花毛状根中阿吗碱的产量。
关键发现:过表达STR的转基因毛状根中阿吗碱含量为对照的2.1倍(0.44 mg/g DW vs 0.21 mg/g DW)
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代谢工程
Catharanthus roseusDXRMECSSTRalkaloidspathway engineering
Catharanthus roseus h...
Catharanthus roseus h...
Catharanthus roseus h...
核心问题:以酿酒酵母为模式菌株,解析脂质代谢与萜类生物合成的调控机制,并探索通过代谢工程手段提高萜类化合物产量的策略
关键发现:文章报道了具体产量数据:青蒿酸产量达100 mg/L
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代谢工程
Saccharomyces cerevisiaebiosynthesislipidsmetabolismterpenoids
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae
核心问题:研究茉莉酸甲酯(MJ)和水杨酸(SA)对过表达SmGGPPS的转基因丹参毛状根中丹参酮积累及生物合成基因表达的影响,探索进一步提高丹参酮产量的方法。
关键发现:水对照处理的总丹参酮含量为3.55~4.10 mg/g
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代谢工程
Salvia miltiorrhizabiosynthesiselicitorsmetabolic engineeringtanshinonestransgenic hairy roots
丹参(Salvia miltiorrhiz...
丹参(Salvia miltiorrhiz...
丹参(Salvia miltiorrhiz...
核心问题:青蒿素在黄花蒿中含量低(0.01%-0.5%干重),化学合成成本高,导致供应不足,急需提高黄花蒿青蒿素产量。
关键发现:青蒿素含量在转基因株系中为1.50-2.14 mg/g DW,是野生型(0.94 mg/g DW)的1.59-2.26倍
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代谢工程
Artemisia annua L.DBR2artemisinin biosynthesisoverexpression
Artemisia annua L.
Biotechnology and Applied Biochemistry · 2011
·
10.1002/bab.13
· 含路线图 · 有原文
核心问题:四倍体青蒿中青蒿素含量升高的分子机制尚不明确,需要解析多倍化如何影响青蒿素生物合成途径基因的表达,并探索提高青蒿素产量的方法。
关键发现:四倍体青蒿中青蒿素含量比二倍体提高39%-56%
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代谢工程
Artemisia annua L.colchicineflow cytometrygene expressionstomatatetraploid
Artemisia annua L.
Artemisia annua L.
Artemisia annua L.
核心问题:从枸杞中克隆β-胡萝卜素羟化酶基因(chyb)并验证其功能,以实现玉米黄质在大肠杆菌中的生物合成。
关键发现:克隆获得939 bp的chyb ORF,编码312个氨基酸的蛋白,分子量约34.8 kDa,理论pI为8.36
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代谢工程
Lycium barbarumcarotenoidszeaxanthinβ-carotene hydroxylase
Escherichia coli BL21...
Escherichia coli BL21...
核心问题:阐明单萜醇脱氢酶ADH2在青蒿中的组织特异性表达模式及其启动子调控机理,评估其对青蒿素生物合成的潜在影响。
关键发现:克隆了919 bp的ADH2启动子,预测TSS位于起始密码子上游54 bp,TATA-box位于-29~-24
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代谢工程
T形毛状体单萜合酶启动子活性腺毛萜类青蒿
青蒿 (Artemisia annua L.)
青蒿 (Artemisia annua L.)
青蒿 (Artemisia annua L.)