核心问题：如何通过基因改造使 Enterococcus faecalis 具备高效生产生物乙醇的能力，克服乳酸菌天然偏向乳酸发酵的问题。
关键发现：野生型 E. faecalis JH2-2 以葡萄糖为碳源时乙醇产量为 等 7 条
核心问题：如何提高三孢布拉霉（Blakeslea trispora）发酵生产β-胡萝卜素的产量，并阐明花生四烯酸（AA）的调控机制。
关键发现：添加0.4 g/L花生四烯酸并在发酵36 h时加入，β-胡萝卜素产量达690 mg/L，比对照提高73% 等 4 条
核心问题：丁醇对微生物发酵的毒性限制了其产量，需要提高产溶剂梭菌的丁醇耐受性以改善ABE发酵性能。
关键发现：过表达groESL、grpE、htpG均显著提高丁醇耐受性：在2% (v/v)丁醇处理2 h后，存活率分别为45%、25%、56%（野生型和载体对照无法存活）；在1% (v/v)丁醇处理6 h后，存活率分别为12%、16%、15%（对照<0.1%）。丁醇产量方面，pT::groESL在MS-M... 等 5 条
核心问题：在重组大肠杆菌中利用化学限定培养基高效生产β-胡萝卜素，解决复合培养基难以达到高细胞浓度和产量不足的问题
关键发现：在补料分批培养中，使用补充氨基酸的化学限定培养基，细胞质量为34 g/l，β-胡萝卜素浓度达2470 mg/l，特定含量为72 mg/g细胞，生产率为77 mg/l·h，分别比复合培养基提高6%、43%、33%和25%。在摇瓶培养中，加入8种最佳氨基酸的化学限定培养基产量为990 mg/l，分...
核心问题：克隆并表征肺炎克雷伯氏菌XJ-Li的meso-2,3-丁二醇脱氢酶，揭示其酶学特性，为其在2,3-丁二醇生物合成及手性化合物合成中的应用提供基础。
关键发现：重组meso-2,3-丁二醇脱氢酶经纯化复性后，还原乙偶姻活性为218 U/mg，氧化meso-2,3-丁二醇活性为66 U/mg 等 4 条
核心问题：三孢布拉霉中两个关键类胡萝卜素合成基因（ipi和carG）的全长cDNA未知，且其在异源宿主中的功能及对β-胡萝卜素产量提升的作用有待验证。
关键发现：克隆获得ipi（ORF 624 bp，编码207 aa，24.1 kDa）和carG（ORF 963 bp，编码320 aa，36.6 kDa）全长cDNA 等 5 条
核心问题：利用重组β-葡萄糖苷酶高效转化主要人参皂苷Re和Rg1为稀有人参皂苷Rg2和Rh1，克服传统酶选择性和产率低的问题。
关键发现：bgp1基因全长为2496 bp，编码831个氨基酸，属于糖苷水解酶家族3 等 5 条
核心问题：高组成型基因表达导致细胞代谢失衡，限制了2-甲基-1-丙醇的产量
关键发现：最佳IPTG诱导时间为9.5 h，最佳诱导剂量为300 μM。在优化条件下，携带诱导途径的菌株BSUAL-03最高产2-甲基-1-丙醇达3.83±0.46 g/L，比组成型途径菌株BSUL04高约60% 等 3 条
核心问题：鼠尾草属植物次生代谢产物（尤其是萜类和酚类）具有重要药用价值，但野外资源因环境、生态和气候限制而短缺，难以满足需求。
关键发现：S. officinalis毛状根迷迭香酸积累量达31 mg/g DW，显著高于成熟植株根、体外芽或细胞悬浮培养 等 9 条
核心问题：如何通过敲除中心碳代谢基因和过表达MEP途径关键基因，提高大肠杆菌异源合成番茄红素的产量，并阐明其内在机制。
关键发现：zwf敲除使番茄红素产量提高至2.52 mg/g DCW，相对对照(1.09 mg/g DCW)提高130%以上 等 4 条
核心问题：野生型Xanthophyllomyces dendrorhous虾青素生物量含量低，难以满足工业生物过程需求，需提高其虾青素积累量。
关键发现：野生型在YPD中总类胡萝卜素164 μg/g干重，虾青素119 μg/g干重 等 5 条
核心问题：在肺炎克雷伯菌中过表达乙醛脱氢酶（ALDH）虽然可促进3-羟基丙酸（3-HP）生成，但NAD+作为辅因子耗尽后3-HP停止积累，需通过NAD+再生解决辅因子供应不足问题。
关键发现：三种NAD+再生酶（NADH氧化酶、NADH脱氢酶、GPD1）的体外活性分别为58、45和36 U/mg，均高于对照菌株的32 U/mg 等 5 条
核心问题：如何提高 Citrobacter freundii 从甘油生产 3-羟基丙醛的产量
关键发现：筛选获得突变株 HPAO-1，在 5% (v/v) 甘油和培养体积/摇瓶体积为 1:12.5 时，其 3-羟基丙醛产量比亲株 ATCC 8090 高 13 倍以上（P > 等 6 条
核心问题：酿酒酵母缺乏菊粉酶基因，无法直接利用菊粉进行乙醇发酵，需要引入外源外切菊粉酶以改善菊粉底物的乙醇生产效率。
关键发现：表达C. kutaonensis外切菊粉酶基因的菌株JZ1C-inuCK最高胞外菊粉酶活性为3.46 U/ml，而JZ1C-inuKM为2.73 U/ml，宿主JZ1C为1.08 U/ml。以200 g菊粉/l发酵时，JZ1C-inuCK、JZ1C-inuKM和JZ1C的最高乙醇产量分别为0....
核心问题：异戊二烯前体IPP和DMAPP在天然宿主中供应不足，限制了大肠杆菌中异戊二烯类化合物的高效生产，需要发现新的遗传靶标以增强前体供应。
关键发现：初始工程菌株HMS174(DE3) pACLYC/pJF678（含dxs2_SAV和idi_BS）番茄红素产量为18.5 mg/L，比对照高15.4倍 等 10 条
核心问题：类视黄醇在细胞内不稳定、易降解，需要原位萃取保护产品，同时需要选择适合的萃取相以降低成本并可直接用于化妆品等领域。
关键发现：在正构烷烃中，正癸烷产量最高（72 h达134 mg/L），细胞比生产力5.9 mg/L/OD 等 4 条
核心问题：解决大肠杆菌无法直接利用纤维二糖的问题，通过同时引入水解和磷酸解机制提高纤维二糖利用率，并实现纤维二糖与木糖的同步共发酵，避免分解代谢物阻遏。
关键发现：在72h厌氧发酵中，空载体对照几乎不消耗纤维二糖 等 5 条
核心问题：如何利用安全经济的乙酸作为诱导剂提高灵芝中灵芝酸（GA）的产量，并揭示其分子机制。
关键发现：乙酸（5-8 mM）显著增加灵芝酸（GA）积累。响应面优化后，在8.21 mM乙酸和22.68 h诱导条件下，GA含量达5.52 mg/100 mg干重，比对照（2.1 mg/100 mg）提高105%（约2.6倍）。乙酸诱导下，羊毛甾醇从18.6增至47.1 μg/g DW，角鲨烯从8.9增... 等 2 条
核心问题：传统方法从蛇根木（Rauwolfia serpentina）获取药用萜类吲哚生物碱（如利血平、阿吗碱等）存在生长周期长（18-36个月）、产量低（利血平0.03-0.034% DW）和破坏野生资源等问题，需要开发快速、可控、可放大的体外生产体系。
关键发现：A4菌株诱导的蛇根木毛状根利血平含量为0.0064%–0.088%干重（DW），而田间栽培18–24个月的品种（cim-sheel）利血平含量为0.03%–0.034% DW 等 4 条
核心问题：通过RNAi沉默SmCPS，验证其在丹参酮生物合成中的关键酶功能，并探究其表达水平与丹参酮积累的关系。
关键发现：SmCPS转录水平降至对照的26% 等 4 条