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Heterologous biosynthesis of triterpenoid dammarenediol-II in engineered Escherichia coli

作者
Dashuai Li, Qiang Zhang, Zhijiang Zhou, Fanglong Zhao, Wenyu Lu
单位
Key Laboratory of System Bioengineering (Tianjin University), Ministry of Education; SynBio Research Platform, Collaborative Innovation Center of Chemical Science and Engineering (Tianjin)
杂志
Biotechnology Letters(2016)
DOI
10.1007/s10529-015-2032-9
所属领域
代谢工程
关键词
2,3-oxidosqualeneDammarenediol-IIEscherichia coliNADPH-cytochrome P450 reductaseSqualeneTriterpenoid
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解决的核心问题

在大肠杆菌中重建达玛烯二醇-II(dammarenediol-II)的异源生物合成途径,以获取达玛烷型四环人参皂苷的前体。

研究策略

采用合成生物学策略,在大肠杆菌中共表达来自酿酒酵母的角鲨烯合酶(SS)、来自酿酒酵母或甲基球菌的角鲨烯环氧化酶(SE)、来自拟南芥或酿酒酵母的NADPH-细胞色素P450还原酶(CPR),以及来自人参的达玛烯二醇-II合酶(DS),并通过共表达idi和ispA增强FPP前体供应,重建从IPP/DMAPP到达玛烯二醇-II的完整途径。

研究路线图

100%
研究问题:在大肠杆菌中异源合成达玛烯二醇-II
策略:合成生物学途径重建(共表达SS/SE/CPR/DS)
关键改造1:增强FPP前体供应(共表达idi+ispA)
关键改造2:截短SS(ScERG9)并筛选SE/CPR组合
关键改造3:导入人参DS并构建底盘菌株DS1/DS2
结果:DS1产量8.63 mg/L,DS2产量6.47 mg/L(25°C)
结论:首个在大肠杆菌中实现达玛烯二醇-II合成,可用于其他三萜生产
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核心内容

该研究通过合成生物学策略,在大肠杆菌BL21(DE3)中异源重构了达玛烯二醇-II的完整生物合成途径,以期获得达玛烷型人参皂苷的关键前体。研究共表达了酿酒酵母角鲨烯合酶(ScERG9)、甲基球菌角鲨烯环氧化酶(McSE)、拟南芥或酿酒酵母来源的NADPH-细胞色素P450还原酶(CPR)以及人参达玛烯二醇-II合酶(DS),同时共表达idi和ispA以增强FPP前体供应。结果显示,McSE与两种CPR的匹配均能成功催化2,3-氧化鲨烯生成,而酿酒酵母SE的截短形式则无法实现该步骤。在最优条件(25°C、pH 7.5、0.5 mM IPTG)下,两个工程菌株DS1和DS2分别产到达玛烯二醇-II 8.63 mg/L和6.47 mg/L,且25°C诱导的产量约为37°C时的2倍。该研究首次在大肠杆菌中实现了达玛烯二醇-II的异源合成,鉴定了两种新的CPR可作为角鲨烯环氧化酶的还原伴侣,并建立了两个通用底盘菌株,为其他三萜类化合物在大肠杆菌中的异源生产提供了可行平台。

创新点

['首次在大肠杆菌中实现2,3-氧化鲨烯和达玛烯二醇-II的异源生物合成。', '鉴定出两种新的可作为角鲨烯环氧化酶还原酶伴侣的CPR(拟南芥tAtCPR和酿酒酵母tScCPR),它们能与甲基球菌来源的McSE匹配并催化电子转移。', '建立了两个能生产达玛烯二醇-II的大肠杆菌底盘菌株DS1和DS2,可进一步用于其他三萜类化合物的生产。']

研究对象(9)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) ScERG9 (SS) 角鲨烯合酶(酿酒酵母) 催化 截短N端26个氨基酸,催化FPP生成角鲨烯
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) idi 异戊烯基二磷酸异构酶(大肠杆菌) 催化 催化IPP与DMAPP相互转化,增强前体供应
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) ispA 法尼基二磷酸合酶(大肠杆菌) 催化 催化IPP和DMAPP合成FPP,增强前体供应
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) t1ScERG1 角鲨烯环氧化酶(酿酒酵母,截短形式1) 催化 截短N端28个氨基酸,实验未能与CPR匹配产生2,3-氧化鲨烯
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) t2ScERG1 角鲨烯环氧化酶(酿酒酵母,截短形式2) 催化 截短N端55个氨基酸,实验未能与CPR匹配产生2,3-氧化鲨烯
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) McSE 角鲨烯环氧化酶(甲基球菌) 催化 密码子优化合成,与tAtCPR或tScCPR配合可产生2,3-氧化鲨烯
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) tAtCPR NADPH-细胞色素P450还原酶(拟南芥) 催化 截短N端45个氨基酸,作为McSE的还原伴侣,参与电子传递
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) tScCPR NADPH-细胞色素P450还原酶(酿酒酵母) 催化 截短N端33个氨基酸,作为McSE的还原伴侣,参与电子传递
Escherichia coli BL21(DE3) 三萜生物合成途径(异源) DS 达玛烯二醇-II合酶(人参) 催化 密码子优化合成,催化2,3-氧化鲨烯环化生成达玛烯二醇-II

关键发现

  1. 通过共表达截短N端26个氨基酸的酿酒酵母角鲨烯合酶(ScERG9)、甲基球菌角鲨烯环氧化酶(McSE)以及拟南芥或酿酒酵母的CPR,成功在大肠杆菌OSQ8和OSQ9菌株中检测到2,3-氧化鲨烯,而酿酒酵母SE的两种截短形式t1ScERG1和t2ScERG1与CPR组合均未产生2,3-氧化鲨烯。进一步导入人参达玛烯二醇-II合酶(DS)后,菌株DS1(含tAtCPR+McSE)和DS2(含tScCPR+McSE)均能产生达玛烯二醇-II。在最优条件下(25°C、pH 7.5、0.5 mM IPTG),DS1产量达8.63 mg/L,DS2达6.47 mg/L
  2. 25°C诱导时的产量约为37°C时的2倍。发酵上清液中未检测到达玛烯二醇-II、2,3-氧化鲨烯或角鲨烯。

研究结论

建立了两个大肠杆菌底盘菌株用于生产三萜类前体达玛烯二醇-II,该策略在引入不同氧化鲨烯环化酶(OSCs)后有望应用于其他三萜类化合物在大肠杆菌中的异源生产。