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Overproduction of geraniol by enhanced precursor supply in Saccharomyces cerevisiae

作者
Jidong Liu, Weiping Zhang, Guocheng Du, Jian Chen, Jingwen Zhou
单位
Key Laboratory of Industrial Biotechnology, Ministry of Education and School of Biotechnology, Jiangnan University; School of Light industry and Food Engineering, Guangxi University
杂志
Journal of Biotechnology(2013)
DOI
10.1016/j.jbiotec.2013.10.017
所属领域
代谢工程
关键词
GeraniolMetabolic engineeringMevalonate pathwayMonoterpeneSaccharomyces cerevisiae
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解决的核心问题

酿酒酵母缺乏高效的单萜合成能力,甲羟戊酸途径通量弱,GPP前体供应不足,导致香叶醇产量低,且关键限速步骤不明确。

研究策略

在酿酒酵母中引入香叶醇合酶,通过过表达截短的HMG-CoA还原酶(tHMG1)、IPP异构酶(IDI1)、tRNA生物合成负调控因子MAF1以及FPPS突变体ERG20K197G,逐步增强甲羟戊酸途径通量并重新分配GPP/FPP合成,提高香叶醇前体GPP的供给。

研究路线图

100%
问题:酿酒酵母香叶醇产量低,MVA途径通量弱、GPP前体不足
策略:引入香叶醇合酶并增强MVA途径前体供给
改造①:密码子优化GES1 & 基因组整合表达
改造②:过表达tHMG1增强MVA通量
改造③:过表达IDI1(限速酶)
改造④:过表达MAF1减少DMAPP分流
改造⑤:ERG20K197G重分配GPP/FPP
结果:产量提升至36.04 mg/L(约70倍)
结论:IDI1是关键限速酶;MVA通量供给仍是主要瓶颈
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核心内容

本研究以酿酒酵母CEN.PK2-1C为底盘,系统代谢工程改造甲羟戊酸途径以提升单萜香叶醇产量。首先引入香叶醇合酶,经密码子优化和基因组整合后产量由0.52 mg/L提至0.73 mg/L。随后逐级过表达截短HMG-CoA还原酶tHMG1、IPP异构酶IDI1、tRNA合成负调控因子MAF1及FPPS突变体ERG20K197G,发现多拷贝过表达IDI1使产量达1.62 mg/L,较单拷贝整合提高约65%,证实IDI1为主要限速酶。组合过表达IDI1与tHMG1后产量升至6.77 mg/L,进一步增加MAF1使产量翻倍,最终引入ERG20K197G实现GPP/FPP通量再分配,产量达36.04 mg/L,较初始菌株提高近70倍。鲨烯浓度随改造逐步上升至对照的40.3倍,表明碳流大部分仍导向FPP分支。该工作明确了IDI1的关键限速作用,验证了MAF1通过减少DMAPP向tRNA分流来增强GPP供给的新策略,但甲羟戊酸途径整体通量仍是进一步提升单萜产量的主要瓶颈。

创新点

['首次系统鉴定了IPP异构酶(IDI1)为酿酒酵母香叶醇生物合成的限速酶', '发现过表达tRNA生物合成负调控因子MAF1可通过减少DMAPP向tRNA方向分流来增加GPP合成', '组合过表达ERG20K197G突变体实现GPP/FPP合成通量的重新分配,大幅提高香叶醇产量']

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Saccharomyces cerevisiae CEN.PK2-1C 单萜(香叶醇)生物合成 GES1/coGES1 geraniol synthase(香叶醇合酶) 催化 来自罗勒(Ocimum basilicum),催化GPP生成香叶醇;密码子优化版本coGES1表达效果更好
Saccharomyces cerevisiae CEN.PK2-1C 甲羟戊酸途径 tHMG1 截短的3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMG-CoA reductase) 催化 截短形式可绕过固醇反馈抑制,增强甲羟戊酸途径通量
Saccharomyces cerevisiae CEN.PK2-1C 甲羟戊酸途径 IDI1 异戊烯基二磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase) 催化 催化IPP异构化为DMAPP,是香叶醇生物合成的限速酶;多拷贝过表达优于单拷贝
Saccharomyces cerevisiae CEN.PK2-1C tRNA生物合成调控(影响甲羟戊酸途径DMAPP分配) MAF1 Maf1p(tRNA生物合成负调控因子) 调控 过表达MAF1抑制tRNA合成,减少DMAPP向tRNA方向分流,使更多DMAPP用于GPP合成
Saccharomyces cerevisiae CEN.PK2-1C 甲羟戊酸途径(GPP/FPP合成) ERG20K197G 法尼基二磷酸合酶突变体(Farnesyl diphosphate synthase, FPPS) 催化 K197G突变使FPPS释放更多GPP,增强GPP池并重新分配GPP/FPP合成

关键发现

  1. 野生型香叶醇合酶表达产量仅0.52 mg/L
  2. 密码子优化(coGES1)提高40.4%至0.73 mg/L
  3. 基因组整合coGES1比游离表达提高26.9%
  4. 过表达tHMG1使产量达到1.57 mg/L(比对照JN04高1.38倍)
  5. 多拷贝过表达IDI1产量为1.62 mg/L(提高1.45倍),而单拷贝基因组整合仅0.98 mg/L(提高50%),证明IDI1是限速酶
  6. 组合过表达IDI1和tHMG1使产量升至6.77 mg/L
  7. 进一步过表达MAF1使产量增加102%
  8. 最终组合ERG20K197G使产量达到36.04 mg/L。鲨烯浓度相对JN04的倍数变化:JN05为2.8倍,JN06为6.0倍,JN07为0.6倍,JN08为16.4倍,JN09为24.9倍,JN10为40.3倍。

研究结论

通过代谢工程改造酿酒酵母甲羟戊酸途径可显著提高香叶醇产量,IDI1是关键的限速酶,过表达MAF1和ERG20K197G是有效策略,但甲羟戊酸途径的前体供给仍是进一步提升单萜产量的主要瓶颈。