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Presence of protein production enhancers results in significantly higher methanol-induced protein production in Pichia pastoris

作者
Loknath Gidijala, Stefan Uthoff, Sebastiaan J. van Kampen, Alexander Steinbüchel, Raymond M. D. Verhaert
单位
ProteoNic BV, Leiden, The Netherlands; Institut für Molekulare Mikrobiologie und Biotechnologie, Westfälische Wilhelms-Universität Münster, Germany; Hubrecht Institute, KNAW and University Medical Center Utrecht, The Netherlands; Environmental Sciences Department, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia
杂志
Microbial Cell Factories(2018)
DOI
10.1186/s12934-018-0961-4
所属领域
代谢工程
关键词
Gene expressionPichia pastorisRecombinant protein productionYeastYield enhancement
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解决的核心问题

提高毕赤酵母(Pichia pastoris)中重组蛋白的生产产量,通过引入转录和翻译增强元件。

研究策略

在AOX1启动子上下游引入转录增强子(UNA1、UNA2)和翻译增强子(UNB,即修饰的5'UTR),构建表达盒,结合多拷贝筛选(zeocin抗性)和信号肽序列优化,并在微量培养和16L生物反应器中进行验证。

研究路线图

100%
研究问题:毕赤酵母重组蛋白产量低
策略:组合转录+翻译增强元件
关键改造:构建UNall表达盒
关键改造:多拷贝筛选(zeocin)
关键改造:信号肽序列优化
结果:微滴板产量验证
结果:多拷贝菌株FAE产量提升12.2倍
结果:16L发酵hIL8产量3g/L(10倍)
结论:UNall元件助力工业化生产
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核心内容

该研究在毕赤酵母中系统评估了转录增强子(UNA1、UNA2)与翻译增强子(修饰的5'UTR,UNB)对甲醇诱导重组蛋白产量的影响,并首次将三者组合为UNall元件。通过构建含不同增强元件组合的表达盒,结合zeocin抗性筛选多拷贝菌株及信号肽序列优化,在微滴板和16L生物反应器中验证了产量提升效果。结果表明,单拷贝UNall表达盒使阿魏酸酯酶A(FAE)产量较无元件对照提高约3倍;经2.0 mg/mL zeocin筛选的多拷贝UNall菌株,FAE产量达到单拷贝参考菌株的12.2倍。信号肽C端EAEA序列仅在单拷贝菌株中使产量提高2倍。人白细胞介素8(hIL8)在微滴板中UNall菌株产量为0.30 g/L,对照为0.18 g/L;放大至16L生物反应器后,UNall菌株hIL8产量约3 g/L,较参考菌株提高10倍,且从微滴板到发酵罐的放大过程中,UNall菌株产量提升幅度(超过10倍)远高于参考菌株(仅2倍)。这证实UNall元件在多拷贝筛选和工业发酵条件下均能稳定提高重组蛋白产量,为毕赤酵母工业化生产提供了有效的表达增强工具。

创新点

首次将转录增强子UNA1/UNA2与5'UTR修饰UNB组合成UNall元件,在微滴板和放大发酵中显著提高重组蛋白产量;多拷贝筛选下产量进一步提升。

研究对象(7)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路(AOX1启动子调控) AOX1 酒精氧化酶AOX1 催化 甲醇诱导启动子的来源基因,参与甲醇代谢第一步
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 faeA 阿魏酸酯酶A (FaeA) 催化 重组表达的目标酶,来自Aspergillus niger
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 hIL8 人白细胞介素8 (hIL8) 调控 重组表达的目标蛋白,细胞因子,此处作为分泌蛋白产物
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 MFA α-交配因子前导序列 (α-mating factor pre-pro leader) 转运 分泌信号肽,引导蛋白分泌到胞外
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 UNA1 调控 PAOX1上游激活序列(Adr1p结合位点三拷贝)
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 UNA2 调控 来自中国仓鼠的转录增强序列
Pichia pastoris GS115 甲醇代谢通路 UNB 调控 修饰的5'UTR序列,替代AOX1天然5'UTR以增强翻译

关键发现

  1. 单拷贝UNall表达盒使阿魏酸酯酶A(FAE)产量较无元件对照提高约3倍
  2. 经2.0 mg/mL zeocin筛选的多拷贝UNall菌株,FAE产量达到单拷贝参考菌株的12.2倍(参考多拷贝为7.9倍)
  3. 信号肽C端EAEA序列在单拷贝菌株中使产量提高2倍,但在多拷贝菌株中无显著差异
  4. 人白细胞介素8(hIL8)在微滴板中UNall菌株产量为0.30 g/L,对照为0.18 g/L
  5. 在16 L生物反应器中,UNall菌株hIL8产量约3 g/L,较参考菌株提高10倍;从微滴板放大到发酵罐,参考菌株产量仅提高2倍,而UNall菌株提高超过10倍。

研究结论

本研究表明,将转录增强子UNA1、UNA2和5'UTR修饰UNB组合成UNall元件能有效提高毕赤酵母重组蛋白产量,且在多拷贝和工业发酵条件下优势保持,为工业化重组蛋白生产提供了新的工具。