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Purification and Characterization of Alcohol Dehydrogenase Reducing N-Benzyl-3-Pyrrolidinone from Geotrichum capitatum

作者
Keiko Yamada-Onodera, Masato Fukui, Yoshiki Tani
单位
Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science and Technology
杂志
Journal of Bioscience and Bioengineering(2007)
DOI
10.1263/jbb.103.174
所属领域
发酵工程
关键词
(S)-N-benzyl-3-pyrrolidinol productionGeotrichum capitatumN-benzyl-3-pyrrolidinol dehydrogenaseN-benzyl-3-pyrrolidinone reductaseoptically pure (S)-N-benzyl-3-pyrrolidinol
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解决的核心问题

高效、高立体选择性地合成药物中间体(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇;化学合成条件苛刻且伴随副反应,需要开发酶法生物催化路线。

研究策略

从Geotrichum capitatum JCM 3908中筛选具有N-苄基-3-吡咯烷酮还原活性的醇脱氢酶,通过静息细胞和纯酶催化还原N-苄基-3-吡咯烷酮,并完成酶的纯化、分子特征、底物特异性和动力学表征。

研究路线图

100%
研究问题:高效合成(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇
策略:筛选产酶菌株并催化还原
关键改造1:菌株筛选+静息细胞催化
关键改造2:酶纯化与特性表征
结果1:产率>99.9%,e.e.>99.9%
结果2:纯化940倍;Km及底物谱广泛
结果3:同源二聚体78kDa;Zn2+等抑制
结论:NAD+依赖型ADH可作手性生物催化剂
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核心内容

从真菌Geotrichum capitatum JCM 3908中筛选并纯化出一种NAD⁺依赖型醇脱氢酶,该酶能够高效、高立体选择性地还原N-苄基-3-吡咯烷酮,生成药物中间体(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇。研究首先利用静息细胞催化30 mM底物,28小时内产物产率和光学纯度均超过99.9%;随后通过940倍纯化获得目标酶,总收率0.2%。该酶为同源二聚体,分子量约78 kDa,还原N-苄基-3-吡咯烷酮的Km为0.13 mM,氧化对应醇的Km为8.47 mM,底物谱较广且对环己酮、正戊醛活性更高,但Zn²⁺、Hg²⁺等金属离子及p-氯汞苯甲酸可强烈抑制其活性。该酶在辅因子偏好、分子结构和动力学性质上与已知细菌来源同类酶存在显著差异,是首个来自真核生物的N-苄基-3-吡咯烷酮还原酶,为手性醇的绿色合成提供了新的生物催化剂选择。

创新点

首次从真核生物(Geotrichum capitatum)中纯化得到N-苄基-3-吡咯烷酮还原酶;首次报道了(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇脱氢酶活性;该酶与已知细菌来源的同类酶在辅因子偏好、分子结构、底物谱和动力学性质上均有显著差异。

研究对象(1)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Geotrichum capitatum JCM 3908 (S)-N-苄基-3-吡咯烷醇生物转化 N-苄基-3-吡咯烷醇脱氢酶(NAD+依赖型醇脱氢酶) 催化 将N-苄基-3-吡咯烷酮还原为(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇,e.e.>99.9%

关键发现

  1. 静息细胞反应以30 mM N-苄基-3-吡咯烷酮为底物,28 h内生成(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇,产率>99.9%,对映体过量(e.e.)>99.9%
  2. 纯化获得N-苄基-3-吡咯烷醇脱氢酶,纯化倍数940倍,总收率0.2%
  3. 酶为同源二聚体,分子量约78 kDa(亚基39和41 kDa)
  4. 还原N-苄基-3-吡咯烷酮的Km为0.13 mM(NADH为0.87 mM),氧化(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇的Km为8.47 mM(NAD+为0.79 mM)
  5. 底物谱广泛,对环己酮、正戊醛等的相对活性分别为212%和277%
  6. 对2-己醇的氧化活性为(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇的11倍
  7. Zn2+、Hg2+、Cu2+、Ni2+及p-氯汞苯甲酸强烈抑制酶活性。

研究结论

从Geotrichum capitatum JCM 3908中纯化的NAD+依赖型醇脱氢酶能够高效立体选择性还原N-苄基-3-吡咯烷酮生成(S)-N-苄基-3-吡咯烷醇,具有与已知细菌酶不同的特性,可作为手性化合物合成的重要生物催化剂。