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Screening and breeding of high taxol producing fungi by genome shuffling

作者
ZHAO Kai, PING WenXiang, ZHANG LiNa, LIU Jun, LIN Yan, JIN Tao, ZHOU DongPo
单位
Laboratory of Microbiology, College of Life Science, Heilongjiang University, Harbin 150080, China
杂志
Science in China Series C: Life Sciences(2008)
DOI
10.1007/s11427-008-0037-5
所属领域
发酵工程
关键词
genome shufflingprotoplast fusiontaxoltaxol-producing fungi
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解决的核心问题

紫杉醇产生菌产量低,难以满足工业化生产需求,需开发高效的菌种选育方法以提高紫杉醇产量。

研究策略

以Nodulisporium sylviforme为出发菌株,采用基因组改组技术,通过多亲本原生质体融合和多轮重组,结合制霉菌素抗性筛选及发酵产物TLC/HPLC/LC-MS分析,选育高产紫杉醇菌株。

研究路线图

100%
研究问题
紫杉醇产生菌产量低
核心策略
基因组改组育种
出发菌株
Nodulisporium sylviforme
原生质体制备
多亲本灭活处理
多轮基因组改组
PEG融合+筛选
关键改造
制霉菌素抗性筛选
产物验证
TLC/HPLC/LC-MS
关键结果
四轮改组获F4-26等
产量516.37 μg/L
结论
基因组改组有效提高
紫杉醇产量
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核心内容

以紫杉醇产生菌Nodulisporium sylviforme为对象,针对其产量低、难以满足工业化需求的问题,研究采用基因组改组技术进行菌种选育。通过热灭活、UV及UV+LiCl不同方式处理亲本原生质体以避免同一位点损伤,结合制霉菌素抗性筛选压力,经四轮多亲本原生质体融合与重组,获得三株遗传稳定的高产菌株F4-17、F4-26和F4-70,其紫杉醇产量分别为487.93、516.37和496.74 μg/L。其中最优菌株F4-26的产量较起始菌株NCEU-1(314.07 μg/L)提高64.41%,较亲本菌株(356.80–392.63 μg/L)提高31.52%–44.72%。融合条件优化为35% PEG6000、90 s融合时间及0.01 mol/L CaCl2,融合率由(12.8±0.6)%提升至(15.4±0.7)%,LC-MS确认产物为紫杉醇([M+H]+ m/z 854.92)。结果表明基因组改组能显著提升紫杉醇产量且菌株遗传稳定,为微生物发酵生产紫杉醇提供了优良菌株,并首次验证了该技术在真菌育种中的有效性。

创新点

首次将基因组改组应用于紫杉醇产生菌育种;采用不同灭活方法(热灭活、UV、UV+LiCl)处理不同亲本原生质体,避免同一位点损伤;利用制霉菌素抗性作为筛选压力提高筛选效率。

研究对象(3)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Nodulisporium sylviforme NCEU-1 紫杉醇生物合成 催化 经多轮诱变筛选获得的起始出发菌株,紫杉醇产量314.07 μg/L
Nodulisporium sylviforme HD100-23, UV40-19, UL50-6 紫杉醇生物合成 催化 第一轮基因组改组的三个亲本菌株,紫杉醇产量分别为356.80、376.38、392.63 μg/L
Nodulisporium sylviforme F4-26 紫杉醇生物合成 催化 经四轮基因组改组获得的高产菌株,紫杉醇产量516.37 μg/L,比亲本提高31.52%-44.72%

关键发现

  1. 经四轮基因组改组获得三株遗传稳定的高产紫杉醇菌株F4-17、F4-26和F4-70,产量分别为487.93、516.37和496.74 μg/L
  2. 其中F4-26产量为516.37 μg/L,比起始菌株NCEU-1(314.07 μg/L)高64.41%,比亲本菌株(356.80-392.63 μg/L)高31.52%-44.72%
  3. 优化融合条件为35% PEG6000、90 s融合时间、0.01 mol/L CaCl2,融合率从(12.8±0.6)%提高至(15.4±0.7)%
  4. LC-MS确认产物为紫杉醇([M+H]+ m/z 854.92)。

研究结论

基因组改组可显著提高紫杉醇产生菌的产量,获得的高产菌株遗传稳定,为紫杉醇的微生物发酵生产提供优良菌株,并首次证明了该技术在真菌育种中的有效性。