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CYP106A2 - a versatile biocatalyst with high potential for biotechnological production of selectively hydroxylated steroid and terpenoid compounds

作者
Daniela Schmitz, Simon Janocha, Flora Marta Kiss, Rita Bernhardt
单位
Department of Biochemistry, Saarland University, Campus B2.2, 66123 Saarbruecken, Germany
杂志
BBA - Proteins and Proteomics(2017)
DOI
10.1016/j.bbapap.2017.07.011
所属领域
代谢工程
关键词
CYP106A2P450protein engineeringsteroid hydroxylationterpenoid hydroxylationwhole-cell bioconversion
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解决的核心问题

如何利用CYP106A2实现甾体和萜类化合物的选择性羟基化,并提高其活性与选择性以满足工业生物技术生产需求?

研究策略

综述CYP106A2的底物谱、全细胞生物转化系统开发及蛋白质工程(理性设计与定向进化)方面的研究进展。

研究路线图

100%
核心问题:CYP106A2催化甾体/萜类选择性羟基化
策略:综述底物谱与全细胞系统及蛋白工程进展
关键改造1:底物谱扩展与新型羟化酶鉴定
关键改造2:全细胞转化系统构建与优化
关键改造3:蛋白质工程调控羟化选择性(15β→11α/6β等)
关键改造4:电子传递系统与辅因子再生强化
结果:产率/时空产率大幅提升、选择性显著改变
结论:有望替代化学法的绿色生物催化平台
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核心内容

CYP106A2是一种源自巨大芽孢杆菌的细胞色素P450单加氧酶,能够催化甾体和萜类化合物的选择性羟基化。本综述系统总结了该酶在底物谱扩展、全细胞生物转化系统开发以及蛋白质工程改造方面的研究进展。研究者建立了基于大肠杆菌和巨大芽孢杆菌的全细胞催化体系,其中大肠杆菌系统转化孕酮和睾酮的时空产率分别达到3.7 g/L/d和5.5 g/L/d,巨大芽孢杆菌体系中脱氢表雄酮的7β-羟基化选择性达90%,时空产率为2.7 g/L/d。通过运用FpR-Adx电子传递系统,初始反应速率提高33%;使用粗细胞提取物使反应活性提高6倍,总体产率提高18倍。蛋白质工程方面,突变体T89N/A395I将11α-羟基孕酮选择性从27.7%提升至80.9%,A243S突变使6β-羟基孕酮占比从野生型的8.7%升至82.7%。这些结果表明,结合全细胞催化与定向进化策略,CYP106A2已具备接近工业应用水平的催化性能,有望替代化学法实现甾体药物的绿色生物制造。

创新点

将CYP106A2鉴定为首个具有区域选择性的细菌烯丙基二萜羟化酶;扩展底物谱至三萜酸类;建立大肠杆菌和巨大芽孢杆菌全细胞系统;通过蛋白质工程改造将羟基化选择性从15β转变为11α、6β等。

研究对象(7)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli 甾体羟化 CYP106A2 CYP106A2 催化 重组表达CYP106A2,用于全细胞转化孕酮、睾酮、DOC等
Bacillus megaterium ATCC13368 甾体/萜类羟化 CYP106A2 CYP106A2 催化 天然宿主,表达CYP106A2转化DHEA、乳香酸等
Bacillus megaterium MS941 甾体/萜类羟化 CYP106A2 CYP106A2 催化 重组表达并共表达牛肾上腺电子传递蛋白,用于DHEA和环丙孕酮转化
Escherichia coli 电子传递 AdR 肾上腺皮质铁氧还蛋白还原酶 能量供给 来自牛肾上腺,为CYP106A2提供电子
Escherichia coli 电子传递 Adx4-108 肾上腺皮质铁氧还蛋白(截短型) 能量供给 截短型铁氧还蛋白,电子转移效率更高
Escherichia coli 电子传递 FpR 黄素蛋白还原酶 能量供给 来自大肠杆菌的替代还原酶,与Adx组成新型电子传递系统
Lactobacillus brevis 辅因子再生 LbADH 醇脱氢酶 能量供给 用于NADPH再生,提高全细胞转化效率

关键发现

  1. 大肠杆菌全细胞系统转化脱氧皮质酮(DOC)的转化率达1 mM/d,理论时空产率0.33 g/L/d
  2. 经优化后孕酮和睾酮的时空产率分别达3.7 g/L/d和5.5 g/L/d。使用粗细胞提取物使反应活性提高6倍,总体产率提高18倍。使用FpR-Adx电子传递系统使初始反应速率提高33%。在巨大芽孢杆菌中,DHEA的7β-羟基化选择性达90%,时空产率115 mg/L/h(2.7 g/L/d)。环丙孕酮醋酸盐在400 mL规模下转化率近完全,产物浓度0.43 g/L。突变体A395L使11α-羟基孕酮比例从9%提高到39%,9α-羟基孕酮从4%到20%
  3. 突变体T89N/A395I使11α-羟基孕酮选择性从27.7%提高到80.9%,产物8 mg/L
  4. 突变F165L/A395E/G397V使9α-羟基孕酮提高10倍
  5. 突变A243S使6β-羟基孕酮占82.7%(野生型8.7%)。最高催化效率(kcat/Km)达200×10^3 M^-1 s^-1
  6. 甾体羟化Vmax达400 nmol/min/nmol P450,萜烯约100 nmol/min/nmol P450。

研究结论

CYP106A2是一种具有广阔应用前景的多功能生物催化剂,通过蛋白质工程可有效改变其羟基化选择性,全细胞系统结合过程优化已接近工业规模要求,有望替代化学法用于甾体/萜类药物的绿色生产。