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Accumulation of Squalene in a Microalga Chlamydomonas reinhardtii by Genetic Modification of Squalene Synthase and Squalene Epoxidase Genes

作者
Masataka Kajikawa, Seiko Kinohira, Akira Ando, Miki Shimoyama, Misako Kato, Hideya Fukuzawa
单位
Graduate School of Biostudies, Kyoto University; Graduate School of Humanities and Science, Ochanomizu University
杂志
PLoS ONE(2015)
DOI
10.1371/journal.pone.0120446
所属领域
代谢工程
关键词
Chlamydomonas reinhardtiiartificial microRNAsqualenesqualene epoxidasesqualene synthaseterbinafine
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解决的核心问题

微藻中角鲨烯合成与积累的分子机制未知,缺乏有效遗传改造策略,需要在模式绿藻莱茵衣藻中鉴定并功能表征角鲨烯合酶(SQS)和角鲨烯环氧酶(SQE)基因,通过遗传改造提高角鲨烯产量。

研究策略

从莱茵衣藻基因组中鉴定出CrSQS和CrSQE基因,分别在大肠杆菌和酵母erg1突变体中验证其酶活;通过瞬时表达分析亚细胞定位;在莱茵衣藻中过表达CrSQS、利用人工microRNA敲低CrSQE,以及共转化CrSQS过表达和CrSQE敲低,检测菌株角鲨烯和甾醇含量及生长状况。

研究路线图

100%
核心问题:微藻角鲨烯积累机制不明
策略:鉴定CrSQS/CrSQE并验证功能
异源验证:大肠杆菌与酵母表达酶活
改造1:过表达CrSQS(内质网定位)
改造2:amiRNA敲低CrSQE(内质网定位)
结果1:过表达未累积角鲨烯,特比萘芬毒副明显
结果2:敲低CrSQE使角鲨烯积累至0.9-1.1 μg/mg
结果3:共转化未增效,MEP途径反馈上调
结论:部分敲低CrSQE是有效策略,可结合MEP增强
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核心内容

从莱茵衣藻基因组鉴定出角鲨烯合酶(CrSQS)与角鲨烯环氧酶(CrSQE)基因,分别在大肠杆菌和酵母erg1突变体中验证了其酶学功能,并通过瞬时表达证明二者均定位于内质网。在此基础上对莱茵衣藻进行遗传改造:过表达CrSQS使转录水平提升3至4倍,14C-FPP向角鲨烯的转化速率提高1.6至1.7倍,但未检测到角鲨烯积累;利用人工microRNA部分敲低CrSQE(表达量降低59%至76%)则使角鲨烯积累至0.9至1.1微克每毫克干重(约2.3至2.7纳摩尔每毫克),且未见生长抑制,同时MEP途径基因CrCMK表达上调2.2至4.9倍。将CrSQS过表达与CrSQE敲低共转化并未显著提升角鲨烯含量。结果表明,部分抑制角鲨烯环氧酶是驱动莱茵衣藻积累角鲨烯的有效策略,而单独增强合酶活性受下游代谢瓶颈限制,未来可结合MEP途径强化以进一步提高产量。

创新点

['首次在莱茵衣藻中功能表征角鲨烯合酶和角鲨烯环氧酶', '利用人工microRNA部分敲低CrSQE实现角鲨烯积累而不抑制生长', '通过共定位实验证明CrSQS和CrSQE均定位于内质网']

研究对象(5)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Chlamydomonas reinhardtii 角鲨烯/甾醇生物合成途径 CrSQS 角鲨烯合酶 催化 过表达增强FPP转化为角鲨烯,但未引起角鲨烯积累
Chlamydomonas reinhardtii 角鲨烯/甾醇生物合成途径 CrSQE 角鲨烯环氧酶 催化 部分敲低使角鲨烯积累至0.9-1.1 μg/mg干重
Chlamydomonas reinhardtii MEP途径 CrCMK 4-二磷酸胞苷-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶 催化 CrSQE敲低后表达上调2.2-4.9倍
Saccharomyces cerevisiae 角鲨烯/甾醇生物合成途径 CrSQE 角鲨烯环氧酶 催化 异源表达互补erg1突变体KLN1的生长缺陷
Escherichia coli 角鲨烯/甾醇生物合成途径 CrSQS 角鲨烯合酶 催化 重组表达验证酶活性

关键发现

['CrSQS在大肠杆菌中重组表达具有角鲨烯合酶活性,催化14C-FPP转化为角鲨烯,需NADPH和Mg2+/Mn2+', 'CrSQE在酵母erg1突变体中表达可恢复ergosterol合成,证明具有角鲨烯环氧酶功能', 'CrSQS过表达株系中CrSQS表达量提高3-4倍,14C-FPP向角鲨烯转化速率提高1.6-1.7倍,但角鲨烯未检测到积累', '50 mg/L特比萘芬处理使角鲨烯积累达18.7 nmol/mg干重,100 mg/L时下游甾醇总量减少72%,150 mg/L时细胞白化', 'CrSQE敲低株系中CrSQE表达量降低59-76%,角鲨烯积累至0.9-1.1 μg/mg细胞干重(2.3-2.7 nmol/mg),无生长抑制', 'CrSQE敲低株系中MEP途径基因CrCMK表达上调2.2-4.9倍', 'CrSQS过表达与CrSQE敲低共转化株系中角鲨烯含量未显著高于单独CrSQE敲低株系']

研究结论

部分敲低CrSQE是提高莱茵衣藻角鲨烯产量的有效策略,而单独过表达CrSQS不足以增加角鲨烯积累,未来可结合MEP途径增强以进一步提高产量。