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Controlled Oxidation of Remote sp3 C-H Bonds in Artemisinin via P450 Catalysts with Fine-Tuned Regio- and Stereoselectivity

作者
Kaidong Zhang, Brian M. Shafer, Matthew D. Demars, II, Harry A. Stern, Rudi Fasan
单位
Department of Chemistry, University of Rochester, Rochester, New York 14627, United States
杂志
Journal of the American Chemical Society(2012)
DOI
10.1021/ja3073462
所属领域
生物催化
关键词
C-H oxidationP450artemisininprotein engineeringregioselectivitystereoselectivity
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解决的核心问题

如何高效开发具有精细区域和立体选择性的P450催化剂,实现对复杂分子(青蒿素)中远程未活化sp3 C-H键的定向羟基化。

研究策略

采用三层策略:第一层对P450 BM3第一壳层活性位点残基进行定点饱和突变;第二层利用高通量P450指纹图谱筛选功能独特的变体;第三层通过指纹图谱多元线性回归预测青蒿素反应性,从而聚焦少量候选酶进行实验验证。

研究路线图

100%
研究问题:远程sp3 C-H键定向羟基化
策略:三层筛选+P450指纹图谱
关键改造①:活性位点饱和突变
关键改造②:高通量P450指纹图谱
关键改造③:多元线性回归预测
结果:高选择性变体IV-H4、II-H10等
结论:高效C-H键定向羟基化体系
应用:7(R)-氟青蒿素合成
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核心内容

本研究以青蒿素中远程未活化sp3 C–H键的选择性羟基化为目标,开发了一套系统性P450催化剂工程策略。该方法首先对P450 BM3第一壳层活性位点残基进行定点饱和突变,随后利用高通量P450指纹图谱筛选功能独特的变体,并通过指纹图谱与多元线性回归的关联预测青蒿素反应性,从而显著缩小候选酶范围,仅需测试75个变体即可获得高选择性催化剂。从12,500个重组体中筛选出522个功能独特的变体,其中基于预测排名前50的变体中78%具有青蒿素羟基化活性,平均总周转数达323。关键变体IV-H4和II-H10分别实现了C7位100%的区域和立体选择性羟基化(S构型TTN 362,R构型TTN 270),而X-E12和X-F11对C6a位选择性达94%和92%。制备规模反应中产物分离产率超过90%,并获得0.26–0.41克产物。进一步通过化学酶法将7(S)-羟基青蒿素经DAST氟化(产率82%)合成了7(R)-氟青蒿素及其衍生物。该工作大幅减少了筛选工作量,为复杂天然产物的精准C–H官能化提供了高效工具,并开辟了合成新型青蒿素类抗疟药物的途径。

创新点

1. 将P450指纹图谱与多元线性回归结合,实现了对结构不相关底物(青蒿素)的反应性预测;2. 仅测试75个P450变体即获得高选择性催化剂,大幅减少筛选工作量;3. 实现了C7位绝对区域选择性和立体互补(S/R),以及C6a位高区域选择性(94%);4. 通过化学酶法合成了C7位氟代的临床抗疟药物衍生物。

研究对象(6)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) 青蒿素羟基化(体外P450催化) CYP102A1 (P450 BM3) 变体FL#62 FL#62 催化 起始酶,无选择性,约340 TTN,产物分布83% 7(S)-OH, 10% 7(R)-OH, 7% 6a-OH
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) 青蒿素羟基化(体外P450催化) CYP102A1 (P450 BM3) 变体IV-H4 IV-H4 催化 绝对7(S)-羟基化选择性(100%),TTN 362,耦合效率71.4%
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) 青蒿素羟基化(体外P450催化) CYP102A1 (P450 BM3) 变体II-H10 II-H10 催化 绝对7(R)-羟基化选择性(100%),TTN 270,耦合效率12.8%
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) 青蒿素羟基化(体外P450催化) CYP102A1 (P450 BM3) 变体X-E12 X-E12 催化 6a-羟基化选择性94%,TTN 113,耦合效率45.1%
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) 青蒿素羟基化(体外P450催化) CYP102A1 (P450 BM3) 变体X-F11 X-F11 催化 6a-羟基化选择性92%,TTN 376,耦合效率56.3%
Escherichia coli(DH5α用于克隆和表达) NADPH辅因子再生 ptdh PTDH(亚磷酸脱氢酶) 能量供给 热稳定亚磷酸脱氢酶,以亚磷酸钠为牺牲还原剂,用于NADPH再生

关键发现

FL#62能以约340 TTN羟基化青蒿素,但选择性差(产物83% 7(S)-OH, 10% 7(R)-OH, 7% 6a-OH)。从12,500个重组中筛选出1,950个有活性、522个功能独特的变体(占4.1%)。基于指纹预测的排名前50变体中78%(39/50)具有青蒿素羟基化活性,平均323 TTN,其中IIC3的TTN达602。变体IV-H4对7(S)-羟基化达到100%区域和立体选择性(TTN 362),II-H10对7(R)-羟基化达到100%选择性(TTN 270),X-E12对6a-羟基化选择性94%(TTN 113),X-F11选择性92%(TTN 376)。制备规模反应中,IV-H4、II-H10、X-F11分别支持485、350和376 TTN,产物分离产率>90%(0.26-0.41 g)。通过DAST氟化7(S)-羟基青蒿素得到7(R)-氟青蒿素(产率82%),进而合成7(R)-氟青蒿甲醚和7(R)-氟青蒿酸酯。

研究结论

本研究展示了一种系统化策略,通过第一壳层诱变、高通量P450指纹和指纹驱动的反应性预测,快速开发了具有精细区域和立体选择性的P450催化剂,实现对青蒿素C7和C6a位未活化sp3 C-H键的选择性羟基化,并在制备级规模和高产率下完成。该方法极大减少了筛选工作量,并为合成新一类青蒿素抗疟药物提供了工具。