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Biotransformation of Quinovic Acid Glycosides by Microbes: Direct Conversion of the Ursane to the Oleanane Triterpene Skeleton by Nocardia sp. NRRL 5646

作者
Zhi-Hong Cheng, Bo-Yang Yu, Geoffrey A. Cordell, Sheng-Xiang Qiu
单位
Department of Complex Prescription of TCM, China Pharmaceutical University, Nanjing 210038, People's Republic of China; Department of Medicinal Chemistry and Pharmacognosy, University of Illinois at Chicago, 833 South Wood Street, Chicago, Illinois 60612; Department of Chemistry, Box 1134, Washington University, One Brookings Drive, St. Louis, Missouri 63130
杂志
Organic Letters(2005)
DOI
10.1021/ol048787b
所属领域
发酵工程
关键词
Nocardia sp.三萜骨架重排奎诺酸糖苷生物转化甲基迁移
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解决的核心问题

利用微生物Nocardia sp.对奎诺酸糖苷进行生物转化,实现糖基水解及三萜骨架的甲基迁移重排,将熊果烷型结构直接转化为齐墩果烷型结构。

研究策略

以Nocardia sp. NRRL 5646为生物催化剂,对奎诺酸糖苷及其类似物进行两阶段发酵生物转化;通过制备规模分离、ESI-LC/MS和2D-NMR鉴定产物结构;利用不同糖苷底物考察糖基水解和甲基迁移的底物特异性。

研究路线图

100%
研究问题:微生物生物转化实现熊果烷型→齐墩果烷型
策略:Nocardia sp. NRRL 5646两阶段发酵转化糖苷底物
关键改造1:糖基水解(D-葡萄糖/6-脱氧-D-葡萄糖)
关键改造2:甲基迁移导致骨架重排
结果:化合物1→2(40%)和3(20%);6→2和3;4/5转化慢
结果:含L-鼠李糖的7/8仅部分脱糖,2不转化为3
结论:脱糖+甲基迁移连续过程,突破骨架转化难点
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核心内容

利用Nocardia sp. NRRL 5646作为生物催化剂,研究对奎诺酸糖苷类化合物进行了两阶段发酵转化,并通过ESI-LC/MS和2D-NMR对产物进行结构鉴定。研究发现该菌株可在120小时内将底物1转化为熊果烷型产物2(产率40%)和齐墩果烷型产物3(产率20%),首次实现了微生物介导的三萜骨架甲基迁移重排,将熊果烷型直接转化为齐墩果烷型,该转化在有机合成中难以实现。实验表明该菌对D-葡萄糖和6-脱氧-D-葡萄糖糖基无选择性,但对含L-鼠李糖的底物仅能部分脱糖;C-28酯糖苷裂解相对较慢,且单独的2在240小时内不转化为3,提示脱糖与甲基迁移可能是连续且具有糖基特异性的过程。该发现揭示了Nocardia兼具糖苷酶与异构酶活性,为拓展三萜糖苷化学多样性及糖苷结构鉴定提供了新途径。

创新点

首次发现Nocardia sp.可以将熊果烷型三萜骨架通过甲基迁移直接转化为齐墩果烷型骨架,这是有机合成难以实现的反应;首次报道Nocardia对三萜糖苷的生物转化;揭示该菌对糖基类型的选择性,为糖苷结构鉴定提供新方法。

研究对象(2)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
Nocardia sp. NRRL 5646 三萜糖苷去糖基化 糖苷酶(推测) 催化 负责裂解糖苷键,对D-葡萄糖和6-脱氧-D-葡萄糖具有活性,对L-鼠李糖无活性
Nocardia sp. NRRL 5646 三萜骨架异构化 异构酶(推测) 催化 负责甲基迁移,将熊果烷型转化为齐墩果烷型,且该反应需在脱糖后连续进行

关键发现

  1. Nocardia sp. NRRL 5646可将化合物1在120 h内转化为2(产率40%)和3(产率20%)
  2. 化合物6同样被转化,表明对D-葡萄糖和6-脱氧-D-葡萄糖无选择性
  3. 化合物4和5在240 h时也转化为2和3,但C-28酯糖苷裂解较慢
  4. 含L-鼠李糖的7和8不能被完全脱糖,仅产生部分脱糖产物(如m/z 655 [M+Na-162]+等)
  5. 单独的2在240 h内不转化为3。

研究结论

Nocardia sp.具有糖苷酶和异构酶活性,能够裂解三萜糖苷的糖链并诱导甲基迁移,将熊果烷型转化为齐墩果烷型。脱糖和甲基迁移可能是连续过程,且糖基特异性。该发现有望用于拓展三萜糖苷的化学多样性。