Dual role for phenylalanine 178 during catalysis by aristolochone synthase
- 作者
- Silvia Forcat, Rudolf K. Allemann
- 单位
- School of Chemistry, University of Birmingham, Edgbaston, Birmingham, UK B15 2TT
- 杂志
- Chemical Communications(2004)
- DOI
- 10.1039/b407932a
- 所属领域
- 酶工程
- 关键词
- 阅读原文
- 查看 PDF 原文
解决的核心问题
解析aristolochone synthase活性位点中Phe178残基在催化FPP环化生成aristolochone过程中的具体功能
研究策略
通过定点突变将Phe178分别替换为Tyr(ASF178Y)和Val(ASF178V),测定突变酶的稳态动力学参数,并利用GC-MS分析产物分布,结合野生型酶行为推断Phe178的作用
核心内容
该研究通过定点突变解析了aristolochone合成酶(AS)活性位点Phe178残基在催化法尼基焦磷酸(FPP)环化生成aristolochone过程中的双重功能。作者将Phe178分别替换为酪氨酸(ASF178Y)和缬氨酸(ASF178V),测定稳态动力学参数并结合GC-MS分析产物分布。结果显示,野生型AS催化产生约92% aristolochone和8% germacrene A;ASF178Y产物分布相近(86.4% aristolochone),但kcat降低约30倍;ASF178V则催化效率进一步下降约两个数量级,kcat/KM仅为1.88 s⁻¹ M⁻¹,且产物谱显著改变,aristolochone降至10.8%,germacrene A增至54.1%,并出现多种副产物。实验表明,Phe178的π系统在两步关键反应中发挥双重作用:首先稳定FPP环化至germacrene A过程中C1和C11上的正电荷,随后通过稳定eudesmane阳离子C2正电荷并诱导1,2-氢迁移促进其转化为aristolochone。该残基对产物专一性的精细控制至关重要,缺失将导致环化受阻和去质子化异常。
创新点
首次揭示Phe178在aristolochone synthase催化的两步关键反应中承担双重作用:既稳定FPP环化至germacrene A过程中C1和C11上的正电荷,又促进eudesmane阳离子向aristolochone转化时C2正电荷的稳定及1,2-氢迁移
研究对象(3)
| 底盘细胞 | 代谢通路 | 基因 | 蛋白 | 功能 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|
| Escherichia coli BL21(DE3)pLysS | 倍半萜生物合成(FPP环化生成aristolochone) | AS(aristolochone synthase) | Aristolochone synthase (AS) | 催化 | 来自Penicillium roqueforti的倍半萜环化酶,野生型,含关键残基Tyr92、Trp334和Phe178 |
| Escherichia coli BL21(DE3)pLysS | 倍半萜生物合成(FPP环化生成aristolochone) | ASF178Y(AS突变体) | ASF178Y突变体蛋白 | 催化 | Phe178被酪氨酸替换,产物谱与野生型相近但催化效率降低 |
| Escherichia coli BL21(DE3)pLysS | 倍半萜生物合成(FPP环化生成aristolochone) | ASF178V(AS突变体) | ASF178V突变体蛋白 | 催化 | Phe178被缬氨酸替换,导致产物多样性增加,产生selinene类和farnesene类副产物 |
关键发现
- 野生型AS催化产生约92% aristolochone、约8% germacrene A及少量valencene。ASF178Y产物分布类似(86.4% aristolochone、10.7% germacrene A、2.7% valencene),但kcat降低约30倍,KM=5.1 μM,催化效率kcat/KM=196.1 s^-1 M^-1。ASF178V催化效率进一步降低约两个数量级,kcat=2.1×10^-5 s^-1,KM=11.2 μM,kcat/KM=1.88 s^-1 M^-1,产物显著改变:aristolochone仅10.8%,germacrene A达54.1%,valencene
- 2%,α-selinene
- 7%,β-selinene
- 1%,selina-4,11-diene
- 1%,(E)-β-farnesene
- 2%,(E,E)-α-farnesene
- 7%。实验表明Phe178缺失导致farnesyl阳离子环化受阻及eudesmane阳离子去质子化异常
研究结论
Phe178在aristolochone synthase催化中起双重作用:其π系统与底物及中间体正电荷相互作用,首先在FPP环化生成germacrene A时稳定C1和C11上的正电荷,随后促进eudesmane阳离子通过稳定C2正电荷和诱导1,2-氢迁移转化为aristolochone,同时对精细控制产物专一性至关重要