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Transcriptional regulation of secondary metabolism

作者
Kevin M. Davies, Kathy E. Schwinn
单位
New Zealand Institute for Crop & Food Research Limited, Private Bag 11600, Palmerston North, New Zealand
杂志
Functional Plant Biology(2003)
DOI
10.1071/FP03062
所属领域
代谢工程
关键词
MYBbHLH次生代谢花青素苯丙烷途径转录因子转录调控
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解决的核心问题

植物次生代谢物的生物合成主要受转录水平调控,但除苯丙烷途径外,其他次生代谢途径的转录因子及其调控机制尚不明确。

研究策略

系统综述已有研究,重点分析苯丙烷途径中花青素、原花青素等类黄酮生物合成的转录调控网络(MYB-bHLH-WD40复合体及顺式元件),并总结色氨酸、萜类吲哚生物碱、类胡萝卜素等途径的调控研究进展。

研究路线图

100%
植物次生代谢转录调控
机制不明确
系统综述
苯丙烷及其他途径
关键改造:
MYB-bHLH-WD40调控复合体
关键发现1:
苯丙烷途径光调控机制
关键发现2:
TIA途径JERE与ORCA调控
关键发现3:
MYB负调控与异源表达验证
转录调控是次生代谢核心
基因工程可行且有效
其他途径调控因子待发现
基因组学加速研究
结论:
TF基因可用于代谢工程
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核心内容

该文系统综述了植物次生代谢途径的转录调控机制,重点聚焦苯丙烷途径中花青素与原花青素生物合成的调控网络。研究指出,MYB-bHLH-WD40转录因子复合体是该途径的核心调控元件,其中拟南芥TT2/TT8/TTG1复合体可特异性激活BANYULS基因从而控制种皮原花青素积累,TT2的空间表达变异性大于TT8,提示其提供关键调控。光诱导的CHS基因启动子中,MYB识别元件与ACGT元件协同作用,后者可被多种bZIP蛋白结合。在长春花中,AP2/ERF转录因子ORCA2和ORCA3通过结合JERE顺式元件激活萜类吲哚生物碱合成基因转录。转基因实验验证了调控因子的应用潜力:玉米C1和Lc在番茄等异源物种中表达可显著提高花青素产量并实现高黄酮醇积累;过表达金鱼草AmMYB308则使木质素含量大幅降低。此外,拟南芥atr1D和atr2D突变体可使色氨酸水平升高并增强AS41等基因转录。该综述表明转录调控是次生代谢的关键控制点,已鉴定的转录因子可作为基因工程工具改良植物代谢产物含量,但萜类、类胡萝卜素等其他途径的直接调控因子仍有待发现。

创新点

首次系统总结了花青素和原花青素生物合成中MYB-bHLH-WD40转录因子复合体的调控作用;提出了利用已鉴定的转录因子基因工程改造植物次生代谢产物含量与分布的策略,并讨论了异源表达中的环境依赖性表型差异。

研究对象(40)

底盘细胞代谢通路基因蛋白功能说明
植物 苯丙烷途径 PAL PAL 催化 苯丙氨酸解氨酶,催化苯丙烷途径第一步
植物 苯丙烷途径 C4H C4H 催化 肉桂酸-4-羟化酶,催化苯丙烷途径第二步
植物 苯丙烷途径 4CL 4CL 催化 4-香豆酸辅酶A连接酶
植物 类黄酮生物合成 CHS CHS 催化 查尔酮合酶,类黄酮途径入口酶
植物 类黄酮生物合成 CHI CHI 催化 查尔酮异构酶
植物 类黄酮生物合成 F3H F3H 催化 黄烷酮3-羟化酶
植物 花青素生物合成 DFR DFR 催化 二氢黄酮醇4-还原酶
植物 花青素生物合成 ANS ANS 催化 花青素合酶
Vitis vinifera 花青素生物合成 UFGT UFGT 催化 UDP-葡萄糖:类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶,葡萄浆果成熟时花青素合成的关键步骤
植物 类黄酮生物合成 FLS FLS 催化 黄酮醇合酶,与花青素合成分支分开调控
植物 类黄酮生物合成 FNS FNS 催化 黄酮合酶
Arabidopsis thaliana 原花青素生物合成 BANYULS BANYULS 催化 编码黄烷-3-醇合成的第一个关键酶,受TT2/TT8调控
植物 苯丙烷途径 ACO ACO 催化 脂酰辅酶A氧化酶,产生乙酰-CoA用于类黄酮前体
Arabidopsis thaliana 色氨酸生物合成 AS41 AS41 催化 邻氨基苯甲酸合酶α亚基,受ATR1调控
Arabidopsis thaliana 色氨酸生物合成 ASB ASB 催化 邻氨基苯甲酸合酶β亚基,多个ASB基因受环境信号诱导
Catharanthus roseus 萜类吲哚生物碱 Str STR 催化 异胡豆苷合酶,TIA途径关键酶,其启动子含JERE
Zea mays 花青素生物合成 Bronze2 BRONZE2 转运 谷胱甘肽-S-转移酶,参与花青素向液泡的转运
Zea mays 花青素生物合成 C1 C1 调控 MYB转录因子,与bHLH蛋白R/B协作激活花青素基因
Zea mays 花青素生物合成 Pl PL 调控 MYB转录因子,C1/Pl家族成员,在植物组织中调控花青素
Zea mays 花青素生物合成 P P 调控 MYB转录因子,调控CHS和DFR,不依赖bHLH
Zea mays 花青素生物合成 R R 调控 bHLH转录因子,R/B家族,与C1协作
Zea mays 花青素生物合成 B B 调控 bHLH转录因子,R/B家族
Zea mays 花青素生物合成 Lc LC 调控 bHLH转录因子,R家族成员,异源表达可诱导花青素
Zea mays 花青素生物合成 Sn SN 调控 bHLH转录因子,光诱导、组织特异性
Zea mays 花青素生物合成 In IN 调控 bHLH蛋白,Intensifier1,可能起抑制作用,产生截短蛋白竞争性抑制
Zea mays 花青素生物合成 Vp1 VP1 调控 B3结构域转录因子,直接上调C1基因,通过Sph顺式元件
Antirrhinum majus 花青素生物合成 ROSEA1 ROSEA1 调控 MYB转录因子,强色素产生
Antirrhinum majus 花青素生物合成 ROSEA2 ROSEA2 调控 MYB转录因子,较弱色素产生
Antirrhinum majus 花青素生物合成 VENOSA VENOSA 调控 MYB转录因子,仅在叶脉上方表皮细胞产生色素
Antirrhinum majus 花青素生物合成 DELILA DELILA 调控 bHLH转录因子,在花瓣裂片和管部均活跃
Antirrhinum majus 花青素生物合成 MUTABILIS MUTABILIS 调控 bHLH转录因子,仅在花瓣裂片活跃
Antirrhinum majus 类黄酮生物合成 AmMYB305 AMMYB305 调控 MYB转录因子,结合并激活P-box,调控CHI和F3H
Antirrhinum majus 类黄酮生物合成 AmMYB340 AMMYB340 调控 MYB转录因子,与AmMYB305功能重叠,激活CHI,磷酸化影响结合亲和力
Antirrhinum majus 苯丙烷途径 AmMYB308 AMMYB308 调控 MYB转录因子,过表达降低木质素和HCA衍生物
Antirrhinum majus 苯丙烷途径 AmMYB330 AMMYB330 调控 MYB转录因子,过表达降低木质素和HCA衍生物
Arabidopsis thaliana 苯丙烷途径 AtMYB4 ATMYB4 调控 MYB转录因子,负调控C4H,突变体芥子酸酯增加、UV-B耐受性增强
Arabidopsis thaliana 苯丙烷途径 AtMYB21 ATMYB21 调控 MYB转录因子,受COP1调控,过表达激活PAL
Arabidopsis thaliana 苯丙烷途径 PAP1 PAP1 (AtMYB75) 调控 MYB转录因子,激活花青素和苯丙烷基因
Arabidopsis thaliana 苯丙烷途径 PAP2 PAP2 (AtMYB90) 调控 MYB转录因子,与PAP1功能冗余
Arabidopsis thaliana 原花青素生物合成 TT2 TT2 调控 R2R3 MYB转录因子,控制种皮中原花青素积累,需要TT8互作

关键发现

  1. ['苯丙烷途径的转录调控是次生代谢的主要控制点,光诱导的CHS基因启动子包含LRU(光响应单元),其中MYB识别元件(MRE)和ACGT元件(ACE)协同作用,ACE可被多种bZIP蛋白(如CPRF1、HY5)结合。', 'JERE是长春花Str基因启动子中一个24-bp的茉莉酸与激发子响应顺式元件,AP2/ERF转录因子ORCA2和ORCA3通过结合JERE激活TIA生物合成基因转录。', '拟南芥atmyb4突变体中C4H转录水平升高,芥子酸酯含量增加,UV-B耐受性增强
  2. AtMYB4转录本在UV-B暴露后24小时内显著下降。', '在转基因烟草中过量表达AmMYB308或AmMYB330导致木质素和羟基肉桂酸衍生物水平大幅降低,表明MYB蛋白可作为苯丙烷途径的负调控因子。', '玉米C1和Lc异源表达可上调白三叶、矮牵牛、烟草和番茄中的花青素产量,并在番茄中实现高黄酮醇积累,验证了转录因子基因在异源物种中调控次生代谢的可行性。', '拟南芥TT2/TT8/TTG1形成调控复合体,特异性激活原花青素生物合成基因BANYULS,从而控制种皮中原花青素的积累
  3. TT2表达的空间与时间变异性大于TT8,提示TT2提供关键调控。', '在Catharanthus roseus中,ORCA3结合JERE激活Str等TIA生物合成基因,ORCA2受MeJA和激发子诱导,而CrBPF-1通过茉莉酸非依赖途径响应激发子,表明存在多条调控分支。', '色氨酸生物合成中,ATR1(MYB)和ATR2(bHLH)的显性突变(atr1D、atr2D)可导致色氨酸水平升高,并增强AS41等基因的转录,双突变体表型叠加,表明MYB和bHLH通过独立途径发挥作用。']

研究结论

转录调控是植物次生代谢途径最关键的调控环节,苯丙烷途径(尤其是花青素和原花青素合成)的MYB-bHLH-WD40调控网络已被较深入阐明;鉴定到的转录因子基因可作为工具,通过基因工程调控植物次生代谢产物的含量和分布,已在转基因植物中验证有效。然而,其他主要次生代谢途径(如萜类、类胡萝卜素、芥子油苷等)的直接转录调控因子仍待发现,基因组学手段将加速该领域进展。